EuRBPDB

Description

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNGAG00000022455 (Gene tree)
Gene ID: 103733861
Gene Symbol: Twistnb
Alias: 2810024J17Rik|D16Wsu83e
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Nannospalax_galili
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8087 bases
Position: chrKL198816.1:1032131-1040217
Accession: 103733861
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNGAP00000024098	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	1.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNGAT00000029802	-	603	XM_008832740	ENSNGAP00000024098	201 (aa)	XP_008830962	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ngi03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	85.427	ENSG00000105849	TWISTNB	59	85.427	Homo_sapiens
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	87.940	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	51	87.940	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNGAG00000022455	Twistnb	91	61.957	ENSACAG00000011817	TWISTNB	93	61.957	Anolis_carolinensis
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	83.920	ENSANAG00000026418	TWISTNB	59	83.920	Aotus_nancymaae
ENSNGAG00000022455	Twistnb	90	58.564	ENSAMXG00000035868	twistnb	55	58.564	Astyanax_mexicanus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	85.427	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	59	85.427	Bos_taurus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	83.417	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	59	83.417	Callithrix_jacchus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	86.935	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	57	86.935	Canis_familiaris
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	86.935	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	54	86.935	Canis_lupus_dingo
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.422	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	58	84.422	Capra_hircus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	85.930	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	58	85.930	Carlito_syrichta
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	85.930	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	59	85.930	Cavia_porcellus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	83.417	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	59	83.417	Cebus_capucinus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.422	ENSCATG00000035621	TWISTNB	59	84.422	Cercocebus_atys
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.422	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	59	84.422	Chinchilla_lanigera
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.422	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	59	84.422	Chlorocebus_sabaeus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	88	76.136	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	55	76.136	Chrysemys_picta_bellii
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.925	ENSCANG00000038759	TWISTNB	59	84.925	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	91.500	ENSCGRG00001000499	Twistnb	61	91.500	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	86.500	ENSDNOG00000006438	-	60	86.500	Dasypus_novemcinctus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.422	ENSDORG00000007795	Twistnb	62	84.422	Dipodomys_ordii
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	88.442	ENSEASG00005021702	TWISTNB	57	88.442	Equus_asinus_asinus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	88.442	ENSECAG00000014563	TWISTNB	57	88.442	Equus_caballus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	89.000	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	60	89.000	Felis_catus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	85.427	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	59	85.427	Fukomys_damarensis
ENSNGAG00000022455	Twistnb	96	58.333	ENSFHEG00000013318	twistnb	52	58.333	Fundulus_heteroclitus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	97	56.186	ENSGAFG00000018309	twistnb	52	56.186	Gambusia_affinis
ENSNGAG00000022455	Twistnb	84	57.143	ENSGACG00000006425	twistnb	64	57.143	Gasterosteus_aculeatus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	85.427	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	59	85.427	Gorilla_gorilla
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	83.920	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	59	83.920	Heterocephalus_glaber_female
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	83.920	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	59	83.920	Heterocephalus_glaber_male
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	88.442	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	55	88.442	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	88.945	ENSJJAG00000015887	Twistnb	62	88.945	Jaculus_jaculus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	90	67.778	ENSLACG00000010508	TWISTNB	51	67.778	Latimeria_chalumnae
ENSNGAG00000022455	Twistnb	91	65.027	ENSLOCG00000011399	twistnb	57	64.398	Lepisosteus_oculatus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	87.500	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	60	87.500	Loxodonta_africana
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.925	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	59	84.925	Macaca_fascicularis
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.925	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	58	84.925	Macaca_mulatta
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	83.920	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	59	83.920	Macaca_nemestrina
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.925	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	59	84.925	Mandrillus_leucophaeus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	85.930	ENSMICG00000036489	TWISTNB	60	85.930	Microcebus_murinus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	90.452	ENSMOCG00000003458	Twistnb	61	90.452	Microtus_ochrogaster
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	89.000	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	60	89.000	Mus_caroli
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	88.500	ENSMUSG00000020561	Twistnb	61	88.500	Mus_musculus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	88.500	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	61	88.500	Mus_pahari
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	89.000	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	61	89.000	Mus_spretus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	88.945	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	56	88.945	Mustela_putorius_furo
ENSNGAG00000022455	Twistnb	87	83.333	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	56	83.333	Myotis_lucifugus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	90	88.398	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	53	88.398	Nomascus_leucogenys
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.422	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	57	84.422	Ochotona_princeps
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	85.930	ENSODEG00000007222	TWISTNB	59	85.930	Octodon_degus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.925	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	58	84.925	Otolemur_garnettii
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.422	ENSOARG00000009803	TWISTNB	58	84.422	Ovis_aries
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	85.427	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	59	85.427	Pan_paniscus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	89.000	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	61	89.000	Panthera_pardus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	81	91.975	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	55	91.975	Panthera_tigris_altaica
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	85.427	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	59	85.427	Pan_troglodytes
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.422	ENSPANG00000015736	TWISTNB	59	84.422	Papio_anubis
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	60.101	ENSPKIG00000025635	twistnb	55	60.101	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNGAG00000022455	Twistnb	85	75.882	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	51	75.882	Phascolarctos_cinereus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	83.417	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	59	83.417	Pongo_abelii
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	85.930	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	59	85.930	Propithecus_coquereli
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	83.500	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	58	83.500	Pteropus_vampyrus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	90	56.906	ENSPNAG00000011956	twistnb	50	56.906	Pygocentrus_nattereri
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	90.000	ENSRNOG00000010750	Twistnb	62	90.000	Rattus_norvegicus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.422	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	58	84.422	Rhinopithecus_bieti
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.422	ENSRROG00000040155	TWISTNB	59	84.422	Rhinopithecus_roxellana
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	82.412	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	59	82.412	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNGAG00000022455	Twistnb	80	63.125	ENSSFOG00015012788	twistnb	50	63.125	Scleropages_formosus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	98	53.000	ENSSMAG00000012792	twistnb	51	53.000	Scophthalmus_maximus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	92	65.761	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	61	65.761	Sphenodon_punctatus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	92	56.383	ENSSPAG00000005871	twistnb	51	56.383	Stegastes_partitus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	87.940	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	59	87.940	Sus_scrofa
ENSNGAG00000022455	Twistnb	75	72.185	ENSTGUG00000002645	TWISTNB	100	72.185	Taeniopygia_guttata
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	53.535	ENSTNIG00000017778	twistnb	59	53.535	Tetraodon_nigroviridis
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	87.940	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	59	87.940	Tupaia_belangeri
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	87.437	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	59	87.437	Ursus_americanus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	86.935	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	59	86.935	Ursus_maritimus
ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	86.935	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	58	86.935	Vulpes_vulpes
ENSNGAG00000022455	Twistnb	96	58.333	ENSXCOG00000020199	twistnb	53	58.081	Xiphophorus_couchianus