EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000000990 (Gene tree)
Gene ID: 100587634
Gene Symbol: PTRHD1
Alias: C2orf79|LOC391356
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3147 bases
Position: chr19:24727952-24731098
Accession: 100587634
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000001157	PTH2	PF01981.16	8.3e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000001224	PTRHD1-201	591	XM_003270586	ENSNLEP00000001157	140 (aa)	XP_003270634	G1QJR2

Gene Model

Click here to download ENSNLEG00000000990's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNLEG00000000990's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	98.571	ENSG00000184924	PTRHD1	100	98.571	Homo_sapiens
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	100	58.268	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	86.429	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	86.429	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	58.268	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	100	58.268	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	100	58.268	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	59.843	ENSATEG00000019199	ptrhd1	100	59.843	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	96.429	ENSANAG00000019089	PTRHD1	100	96.429	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	59.055	ENSACLG00000000814	ptrhd1	100	59.055	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	89	58.871	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	55.396	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	88.571	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	100	88.571	Bos_taurus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	81	44.737	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	45.161	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	96.429	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	96.429	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	92.143	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	100	92.143	Canis_familiaris
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	87.857	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	100	87.857	Capra_hircus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	92.857	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	100	92.857	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	85.714	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	100	85.714	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	96.429	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	100	96.429	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	97.857	ENSCATG00000033690	PTRHD1	100	97.857	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	89.286	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	97	89.286	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	98.571	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	100	98.571	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	96	75.556	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	97	75.556	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	91	64.844	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	91	64.844	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	52.586	ENSCING00000019647	-	97	52.586	Ciona_intestinalis
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	97.143	ENSCANG00000034444	PTRHD1	100	97.143	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	88.571	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	66	88.571	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	88.571	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	100	88.571	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	59.375	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	100	59.375	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	100	58.268	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSDARG00000016122	ptrhd1	100	58.268	Danio_rerio
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	88.571	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	93	88.571	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	99	87.770	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	99	87.770	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	52.586	FBgn0038446	CG14903	97	52.586	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	60	84.524	ENSETEG00000001615	-	100	84.524	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	92	65.891	ENSETEG00000009379	-	96	65.891	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	60.345	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	99	61.151	ENSEASG00005001302	-	99	58.273	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	90.714	ENSECAG00000017730	PTRHD1	100	90.714	Equus_caballus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	96	63.704	ENSECAG00000005314	-	93	60.000	Equus_caballus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	84.286	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	100	84.286	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	57.480	ENSELUG00000003837	ptrhd1	100	57.480	Esox_lucius
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	89.286	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	100	89.286	Felis_catus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	88.571	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	100	88.571	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	100	58.268	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	61.207	ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	Gallus_gallus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	100	58.268	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	89	56.349	ENSGACG00000006743	ptrhd1	98	56.349	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	66.929	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	100	66.929	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	98.413	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	100	98.413	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	59.055	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	100	59.055	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	85.714	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	100	85.714	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	86.429	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	100	86.429	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	91	86.614	ENSHGLG00100004341	-	93	86.614	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	57.812	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	100	57.812	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	56.034	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	97	56.034	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	91.429	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	100	91.429	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	92	92.248	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	98	89.706	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	81	56.637	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	56.637	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	100	58.268	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	82	60.345	ENSLACG00000018052	PTRHD1	100	58.268	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	89	58.065	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	96	58.065	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	88.571	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	100	88.571	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	97.143	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	100	97.143	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	97.143	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	100	97.143	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	97.143	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	100	97.143	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	95.714	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	100	95.714	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	55.906	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	100	55.906	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	59.055	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	100	59.055	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	87.143	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	100	87.143	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	92.857	ENSMICG00000001578	PTRHD1	100	92.857	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	88.571	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	88.571	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	57.480	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	100	57.480	Mola_mola
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	94	73.485	ENSMODG00000015895	PTRHD1	94	73.485	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	55.906	ENSMALG00000003471	ptrhd1	100	55.906	Monopterus_albus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	89.286	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	100	89.286	Mus_caroli
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	89.286	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	89.286	Mus_musculus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	89.286	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	100	89.286	Mus_spretus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	87.857	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	100	87.857	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	86.429	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	100	86.429	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	87.857	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	100	87.857	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	59.055	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	100	59.055	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	55	72.727	ENSMEUG00000010482	-	93	72.727	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	85.000	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	100	85.000	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	90.000	ENSODEG00000007805	PTRHD1	97	90.000	Octodon_degus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	96	57.778	ENSONIG00000015722	ptrhd1	99	57.778	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	83.571	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	100	83.571	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	56.410	ENSORLG00000028768	ptrhd1	98	56.410	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	57.265	ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	57.265	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	56.410	ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.410	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	56.250	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	100	56.250	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	85.714	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	100	85.714	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	88.571	ENSOARG00000018052	PTRHD1	100	88.571	Ovis_aries
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	98.571	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	100	98.571	Pan_paniscus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	89.286	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	100	89.286	Panthera_pardus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	89.286	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	100	89.286	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	98.571	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	100	98.571	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	97.857	ENSPANG00000006781	PTRHD1	100	97.857	Papio_anubis
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	98	54.745	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	83	58.065	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	60.345	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	100	59.843	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	75	59.048	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	91	58.621	Petromyzon_marinus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	73.810	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	100	73.810	Phascolarctos_cinereus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	96	57.778	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	95	57.778	Poecilia_formosa
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	58.268	Poecilia_latipinna
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	100	58.268	Poecilia_mexicana
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSPREG00000017624	ptrhd1	100	58.268	Poecilia_reticulata
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	95.714	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	100	95.714	Pongo_abelii
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	86.429	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	100	86.429	Procavia_capensis
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	92.857	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	100	92.857	Propithecus_coquereli
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	89.286	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	100	89.286	Pteropus_vampyrus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	59.055	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	100	59.055	Pundamilia_nyererei
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	87	58.197	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	95	58.197	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	87.143	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	100	87.143	Rattus_norvegicus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	97.857	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	100	97.857	Rhinopithecus_bieti
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	97.857	ENSRROG00000029627	PTRHD1	100	97.857	Rhinopithecus_roxellana
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	96.429	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	100	96.429	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	70.000	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	91	70.000	Sarcophilus_harrisii
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	56.897	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	Scleropages_formosus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	57.759	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	100	57.031	Scophthalmus_maximus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	91	59.375	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	85	59.375	Seriola_dumerili
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	59.843	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	100	59.843	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	84	70.940	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	95	68.504	Sphenodon_punctatus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	58.268	Stegastes_partitus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	97	63.235	ENSSSCG00000040441	-	100	63.235	Sus_scrofa
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	87	58.197	ENSTGUG00000015169	-	89	58.197	Taeniopygia_guttata
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	55.906	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	100	55.906	Takifugu_rubripes
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	Tetraodon_nigroviridis
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	80.000	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	100	80.000	Tursiops_truncatus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	87.857	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	100	87.857	Ursus_americanus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	88.571	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	100	88.571	Vicugna_pacos
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	63.492	ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	63.504	Xenopus_tropicalis
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	100	58.268	Xiphophorus_couchianus
ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	100	58.268	Xiphophorus_maculatus