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Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000001502 (Gene tree)
Gene ID: 100579999
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 67645 bases
Position: chr10:97260412-97328056
Accession: 100579999
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000047391	ResIII	PF04851.15	7.7e-08	1	1
ENSNLEP00000038009	ResIII	PF04851.15	1.1e-07	1	1
ENSNLEP00000001892	ResIII	PF04851.15	1.1e-07	1	1
ENSNLEP00000028937	ResIII	PF04851.15	1.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000048422	SBNO1-203	3969	-	ENSNLEP00000038009	1322 (aa)	-	A0A2I3H336
ENSNLET00000002001	SBNO1-202	4044	XM_012509776	ENSNLEP00000001892	1347 (aa)	XP_012365230	G1QLS6
ENSNLET00000034309	SBNO1-201	4074	-	ENSNLEP00000028937	1357 (aa)	-	A0A2I3GCB5
ENSNLET00000050442	SBNO1-204	3675	-	ENSNLEP00000047391	1224 (aa)	-	A0A2I3HV82

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000001502	SBNO1	75	56.014	ENSNLEG00000001305	SBNO2	75	55.655

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	95.833	ENSG00000139697	SBNO1	100	95.833	Homo_sapiens
ENSNLEG00000001502	SBNO1	83	80.451	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	77.730	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.054	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	94.054	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	74.035	ENSACIG00000008088	sbno1	99	73.232	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	74.643	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	72.382	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	74.643	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	72.382	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	76.715	ENSATEG00000006667	sbno1	99	73.039	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	89.614	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	88.442	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	88.304	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	86.006	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.842	ENSANAG00000029958	-	100	94.842	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	73.035	ENSACLG00000024913	sbno1	99	73.280	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	82.583	ENSAMXG00000019473	sbno1	99	76.425	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	95.479	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	94.253	Bos_taurus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.975	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	97.709	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	95.697	ENSCAFG00000007503	SBNO1	100	94.194	Canis_familiaris
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	94.558	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	94.959	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	94.177	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	94.959	Capra_hircus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.768	ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	94.768	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000001502	SBNO1	97	94.101	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	94.638	Cavia_aperea
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.386	ENSCPOG00000008109	SBNO1	100	93.869	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	95.368	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	95.504	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	94.959	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	95.310	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.307	ENSCLAG00000008995	SBNO1	100	93.733	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000001502	SBNO1	85	95.596	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	95.596	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	97	98.049	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	94.321	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	89.770	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	88.299	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	91.787	ENSCANG00000042688	-	100	91.715	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.543	ENSCGRG00001017470	Sbno1	100	93.543	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.543	ENSCGRG00000004756	Sbno1	100	93.543	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.224	ENSCSEG00000011919	sbno1	99	72.561	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.583	ENSCVAG00000007038	sbno1	99	73.105	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	81.641	ENSDARG00000099080	sbno1	99	76.500	Danio_rerio
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	96.633	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	97.533	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	88.530	ENSDORG00000015261	Sbno1	95	88.256	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000001502	SBNO1	93	100.000	ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000001502	SBNO1	75	86.869	ENSEBUG00000013823	sbno1	85	86.869	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000001502	SBNO1	55	97.608	ENSEASG00005012595	-	92	98.368	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.544	ENSECAG00000006127	SBNO1	100	94.544	Equus_caballus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	81	97.549	ENSEEUG00000003793	SBNO1	81	91.395	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	82.975	ENSELUG00000002886	sbno1	99	74.947	Esox_lucius
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	94.468	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	94.468	Felis_catus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	89.466	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	88.514	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	92.391	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	93.869	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.404	ENSFHEG00000007360	sbno1	99	72.957	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	96	76.514	ENSGMOG00000018229	sbno1	100	75.114	Gadus_morhua
ENSNLEG00000001502	SBNO1	90	89.854	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	89.846	Gallus_gallus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.763	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	73.913	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000001502	SBNO1	96	76.277	ENSGACG00000015633	sbno1	99	75.532	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	89.126	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	88.716	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	96.458	ENSGGOG00000015000	SBNO1	100	95.761	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	68.172	ENSHBUG00000011910	sbno1	99	68.510	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.180	ENSHGLG00000014165	-	100	93.180	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000001502	SBNO1	93	79.804	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	75.502	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	81.676	ENSIPUG00000015830	Sbno1	93	82.574	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.547	ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	94.547	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.754	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	93.754	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.271	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	73.493	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	76.703	ENSLBEG00000007623	sbno1	99	73.147	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	78.777	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.854	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	84.405	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	78.977	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.252	ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	93.252	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	95.765	ENSMFAG00000031429	SBNO1	100	95.765	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	95.833	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	95.833	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.898	ENSMLEG00000033260	SBNO1	100	93.898	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	76.715	ENSMAMG00000005473	sbno1	99	72.849	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	89.688	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	89.764	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000001502	SBNO1	54	97.579	ENSMAUG00000004834	-	100	97.134	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	95.068	ENSMICG00000006573	-	99	97.490	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.386	ENSMOCG00000009390	Sbno1	100	93.386	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.714	ENSMMOG00000008691	sbno1	94	75.714	Mola_mola
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	91.020	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	91.020	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	74.147	ENSMALG00000001056	sbno1	99	72.498	Monopterus_albus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	93.175	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	100	97.436	Mus_caroli
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	93.602	ENSMUSG00000038095	Sbno1	100	97.436	Mus_musculus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	93.746	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	100	97.134	Mus_pahari
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	93.386	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	100	97.436	Mus_spretus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.329	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	94.329	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.898	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	93.898	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.472	ENSNGAG00000012620	Sbno1	100	94.472	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	73.128	ENSNBRG00000019189	sbno1	99	73.372	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000001502	SBNO1	62	96.774	ENSMEUG00000008768	-	93	89.873	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	90.603	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	90.531	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.543	ENSODEG00000009997	SBNO1	100	93.543	Octodon_degus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.271	ENSONIG00000015348	sbno1	99	72.893	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	93.741	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	93.741	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	79.134	ENSORLG00000001593	sbno1	94	79.134	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	74.910	ENSORLG00020015216	sbno1	99	71.890	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	74.910	ENSORLG00015002726	sbno1	99	71.890	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.136	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	72.443	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000001502	SBNO1	54	94.251	ENSOGAG00000010781	-	100	94.127	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	93.970	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	93.970	Ovis_aries
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	96.594	ENSPPAG00000024635	SBNO1	100	95.652	Pan_paniscus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	94.468	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	94.468	Panthera_pardus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.185	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	94.185	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	96.594	ENSPTRG00000005597	SBNO1	100	95.726	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	95.905	ENSPANG00000011640	SBNO1	100	95.905	Papio_anubis
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	78.378	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	77.587	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNLEG00000001502	SBNO1	94	85.548	ENSPSIG00000009256	-	100	85.614	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	88.700	ENSPSIG00000009572	-	100	87.850	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.180	ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	93.180	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	91.382	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	90.883	Phascolarctos_cinereus
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.763	ENSPFOG00000005069	sbno1	99	73.282	Poecilia_formosa
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.763	ENSPLAG00000015015	sbno1	99	73.315	Poecilia_latipinna
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.763	ENSPMEG00000021212	sbno1	99	73.319	Poecilia_mexicana
ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.404	ENSPREG00000017746	sbno1	99	72.950	Poecilia_reticulata
ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	95.474	ENSPPYG00000005084	SBNO1	100	95.474	Pongo_abelii
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ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.326	ENSPCOG00000024277	SBNO1	100	94.326	Propithecus_coquereli
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