EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000002264 (Gene tree)
Gene ID: 100582385
Gene Symbol: POLR1A
Alias: DKFZP586M0122|FLJ21915|RPA1|RPO1-4
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 78203 bases
Position: chr14:70928918-71007120
Accession: 100582385
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000003002	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	1.3e-91	1	1
ENSNLEP00000026934	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	4.3e-68	1	1
ENSNLEP00000026934	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	6.9e-20	1	1
ENSNLEP00000003002	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	1.1e-19	1	1
ENSNLEP00000003002	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	1.4e-70	1	1
ENSNLEP00000003002	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	3.5e-36	1	1
ENSNLEP00000003002	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	2.1e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000044131	POLR1A-202	1824	-	ENSNLEP00000026934	607 (aa)	-	A0A2I3G4F4
ENSNLET00000003154	POLR1A-201	5154	XM_003268764	ENSNLEP00000003002	1717 (aa)	XP_003268812	G1QPY5

Gene Model

Click here to download ENSNLEG00000002264's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNLEG00000002264's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000002264	POLR1A	63	33.333	ENSNLEG00000009460	-	53	36.517

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	96.181	ENSG00000068654	POLR1A	100	96.181	Homo_sapiens
ENSNLEG00000002264	POLR1A	68	67.088	ENSAPOG00000017945	polr1a	99	67.340	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	88.773	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	90.881	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	61.800	ENSACIG00000022147	polr1a	100	61.534	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.922	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	66.246	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000002264	POLR1A	95	73.611	ENSAPEG00000016105	polr1a	98	73.611	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	64.175	ENSATEG00000016773	polr1a	100	64.269	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	86	70.889	ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	70.671	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000002264	POLR1A	99	68.067	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	67.202	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	92.303	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	92.014	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	60.436	ENSACLG00000020541	polr1a	100	60.103	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000002264	POLR1A	85	61.163	ENSAMXG00000011553	-	96	61.163	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	88.201	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	88.201	Bos_taurus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	99	37.598	WBGene00012999	rpoa-1	98	37.786	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	92.130	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	92.130	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	88.619	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	88.722	Canis_familiaris
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	88.422	ENSCAFG00020014752	POLR1A	100	88.524	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	86.736	ENSCHIG00000018204	POLR1A	99	88.129	Capra_hircus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	87.796	ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	87.507	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000002264	POLR1A	97	82.136	ENSCAPG00000010132	POLR1A	100	81.986	Cavia_aperea
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	86.590	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	86.647	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	92.824	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	92.824	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	95.602	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	95.602	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	86.728	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	86.555	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	95.486	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	95.486	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	99	72.764	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	72.864	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000002264	POLR1A	71	43.656	ENSCING00000007684	-	99	40.331	Ciona_intestinalis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	99	45.944	ENSCSAVG00000007184	-	91	54.715	Ciona_savignyi
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	92.713	ENSCANG00000031785	POLR1A	100	92.713	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	96	89.666	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	89.666	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000002264	POLR1A	85	85.822	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	84.084	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	60.219	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	60.161	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	62.721	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	63.264	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	65.170	ENSDARG00000098375	polr1a	100	64.764	Danio_rerio
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	81.650	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	81.708	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	85.895	ENSDORG00000008298	Polr1a	100	85.953	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000002264	POLR1A	85	46.916	FBgn0019938	RpI1	99	41.782	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000002264	POLR1A	72	100.000	ENSETEG00000000412	-	72	100.000	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000002264	POLR1A	88	58.333	ENSEBUG00000005667	-	99	58.333	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	90.104	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	90.104	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	90.104	ENSECAG00000036306	-	100	90.153	Equus_caballus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	90.104	ENSECAG00000030510	-	100	90.153	Equus_caballus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	90.104	ENSECAG00000010092	POLR1A	100	90.153	Equus_caballus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	81	95.745	ENSEEUG00000000676	POLR1A	81	95.556	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	65.280	ENSELUG00000012769	polr1a	99	65.167	Esox_lucius
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	89.757	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	89.583	Felis_catus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	99	69.056	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	69.213	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	86.821	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	86.358	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	60.312	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	60.311	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	58.531	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	58.362	Gadus_morhua
ENSNLEG00000002264	POLR1A	90	68.694	ENSGALG00000038160	-	99	68.694	Gallus_gallus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.048	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	62.335	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.182	ENSGACG00000018791	polr1a	100	63.182	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	89	73.260	ENSGAGG00000004984	-	96	79.772	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	96.238	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	96.238	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000002264	POLR1A	89	63.818	ENSHBUG00000020021	polr1a	99	63.818	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	87.052	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	87.110	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	86.801	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	86.859	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	60.505	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	60.550	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	64.306	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	63.647	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	99	85.235	ENSSTOG00000012580	POLR1A	99	85.408	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	85.401	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	85.401	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	64.046	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	63.573	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	95	66.226	ENSLBEG00000015401	polr1a	99	65.974	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000002264	POLR1A	53	76.471	ENSLACG00000003218	polr1a	100	76.471	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	68.696	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	68.409	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	87.615	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	87.730	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	95.544	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	95.544	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	95.428	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	95.428	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	95.486	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	95.486	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	94.850	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	94.850	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	65.107	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	64.702	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	64.245	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	64.018	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000002264	POLR1A	99	67.436	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	67.436	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000002264	POLR1A	92	85.607	ENSMAUG00000008497	Polr1a	100	85.292	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	90.515	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	90.226	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	85.303	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	85.418	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.353	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	63.295	Mola_mola
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	73.506	ENSMODG00000009335	POLR1A	100	73.161	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	64.014	ENSMALG00000013363	polr1a	100	63.381	Monopterus_albus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	83.689	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	83.401	Mus_caroli
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	83.919	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	83.631	Mus_musculus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	84.496	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	84.265	Mus_pahari
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	82.483	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	82.557	Mus_spretus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	88.831	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	88.947	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	87.680	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	87.507	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	86.233	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	86.175	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.720	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	64.134	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000002264	POLR1A	74	86.350	ENSMEUG00000011665	-	75	86.350	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000002264	POLR1A	99	80.832	ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	80.774	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	87.341	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	87.168	Octodon_degus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	64.496	ENSONIG00000015895	polr1a	100	64.553	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	54	72.372	ENSOANG00000015713	-	100	74.046	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	88.722	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	88.722	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.343	ENSORLG00000008753	polr1a	99	63.091	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	62.154	ENSORLG00020020726	polr1a	99	61.729	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000002264	POLR1A	96	74.468	ENSORLG00015016071	polr1a	99	74.444	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000002264	POLR1A	82	60.714	ENSOMEG00000019310	-	94	61.538	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	89.178	ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	89.178	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	87.868	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	87.926	Ovis_aries
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	95.891	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	95.891	Pan_paniscus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	89.699	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	89.525	Panthera_pardus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	89.158	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	88.985	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	95.833	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	95.833	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	95.486	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	95.486	Papio_anubis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	94	76.389	ENSPKIG00000005468	polr1a	99	76.389	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNLEG00000002264	POLR1A	87	68.488	ENSPSIG00000009321	-	99	68.824	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	54	67.380	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.380	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	85.994	ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	86.225	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNLEG00000002264	POLR1A	95	78.087	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	77.650	Phascolarctos_cinereus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.552	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	63.668	Poecilia_formosa
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.741	ENSPLAG00000021389	polr1a	100	63.857	Poecilia_latipinna
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	61.995	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	62.248	Poecilia_mexicana
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.552	ENSPREG00000002389	polr1a	100	63.689	Poecilia_reticulata
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	95.428	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	95.428	Pongo_abelii
ENSNLEG00000002264	POLR1A	88	96.000	ENSPCAG00000011582	POLR1A	88	96.000	Procavia_capensis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	90.052	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	89.821	Propithecus_coquereli
ENSNLEG00000002264	POLR1A	95	93.015	ENSPVAG00000012674	POLR1A	95	92.226	Pteropus_vampyrus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	64.245	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	64.018	Pundamilia_nyererei
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	65.420	ENSPNAG00000019223	polr1a	99	65.832	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	85.648	ENSRNOG00000009545	Polr1a	100	85.476	Rattus_norvegicus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	94.850	ENSRBIG00000028335	POLR1A	100	94.850	Rhinopithecus_bieti
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	94.792	ENSRROG00000031473	POLR1A	100	94.792	Rhinopithecus_roxellana
ENSNLEG00000002264	POLR1A	99	35.862	YOR341W	RPA190	99	36.100	Saccharomyces_cerevisiae
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	91.956	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	91.956	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	72.555	ENSSHAG00000014739	POLR1A	100	71.748	Sarcophilus_harrisii
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	65.726	ENSSFOG00015019716	polr1a	100	65.215	Scleropages_formosus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.970	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	64.269	Scophthalmus_maximus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	64.977	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	65.014	Seriola_dumerili
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.134	ENSSLDG00000024095	polr1a	100	63.112	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	74	88.000	ENSSARG00000003136	-	76	88.000	Sorex_araneus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	68.764	ENSSPUG00000004215	POLR1A	97	74.029	Sphenodon_punctatus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	63	70.975	ENSSPAG00000016341	polr1a	94	70.975	Stegastes_partitus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	82	90.126	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	90.091	Sus_scrofa
ENSNLEG00000002264	POLR1A	99	68.150	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	67.853	Taeniopygia_guttata
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	62.156	ENSTRUG00000002210	polr1a	99	61.940	Takifugu_rubripes
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	58.992	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	58.992	Tetraodon_nigroviridis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	69	100.000	ENSTBEG00000008646	POLR1A	70	100.000	Tupaia_belangeri
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	84.673	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	84.442	Tursiops_truncatus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	85	86.957	ENSUAMG00000012158	-	94	87.909	Ursus_americanus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	88.194	ENSUMAG00000006700	POLR1A	100	88.137	Ursus_maritimus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	88.446	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	88.548	Vulpes_vulpes
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	66.513	ENSXETG00000001952	polr1a	100	69.306	Xenopus_tropicalis
ENSNLEG00000002264	POLR1A	79	61.602	ENSXCOG00000007112	-	99	58.271	Xiphophorus_couchianus
ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	63.573	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	62.986	Xiphophorus_maculatus