EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000003655 (Gene tree)
Gene ID: 100595504
Gene Symbol: SRPRB
Alias: APMCF1|SR-beta
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 23210 bases
Position: chr8:17206327-17229536
Accession: 100595504
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000047420	MMR_HSR1	PF01926.23	9.9e-08	1	1
ENSNLEP00000004418	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000004651	SRPRB-201	2838	XM_003265241	ENSNLEP00000004418	271 (aa)	XP_003265289	G1QTZ8
ENSNLET00000050055	SRPRB-202	609	-	ENSNLEP00000047420	202 (aa)	-	A0A2I3HV49

Gene Model

Click here to download ENSNLEG00000003655's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNLEG00000003655's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000003655	SRPRB	64	30.233	ENSNLEG00000030124	ARL14	68	30.882

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	98.155	ENSG00000144867	SRPRB	100	98.155	Homo_sapiens
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	96.310	ENSANAG00000028236	SRPRB	100	96.310	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	92.251	ENSBTAG00000044075	SRPRB	92	92.251	Bos_taurus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	96.310	ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	96.310	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	92.251	ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.251	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.144	ENSCHIG00000019717	SRPRB	100	91.144	Capra_hircus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	99	91.481	ENSTSYG00000031948	SRPRB	100	91.144	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000003655	SRPRB	99	84.074	ENSCPOG00000030107	SRPRB	100	83.764	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	94.096	ENSCCAG00000033027	SRPRB	100	94.096	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	98.524	ENSCATG00000033438	SRPRB	100	98.524	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	90.775	ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	90.775	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	98.524	ENSCSAG00000010699	SRPRB	100	98.524	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	85.978	ENSCHOG00000011792	SRPRB	100	85.978	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000003655	SRPRB	99	81.111	ENSCANG00000043327	SRPRB	100	80.812	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.144	ENSCGRG00001018121	Srprb	100	91.144	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000003655	SRPRB	95	91.860	ENSCGRG00000014367	Srprb	99	91.860	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000003655	SRPRB	99	90.741	ENSDNOG00000032146	SRPRB	100	90.406	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	92	80.000	ENSDORG00000000764	Srprb	85	88.584	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	92.989	ENSEASG00005003967	SRPRB	100	92.989	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	92.989	ENSECAG00000036666	SRPRB	100	92.989	Equus_caballus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.144	ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	91.144	Felis_catus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.513	ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	91.513	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	99.010	ENSGGOG00000027849	SRPRB	100	99.010	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.513	ENSHGLG00000016818	SRPRB	100	91.513	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.513	ENSHGLG00100018893	SRPRB	100	91.513	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000003655	SRPRB	99	84.815	ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.502	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	98.524	ENSMFAG00000039758	SRPRB	100	98.524	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	98.524	ENSMMUG00000008918	SRPRB	100	98.524	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	98.524	ENSMNEG00000032832	SRPRB	100	98.524	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	98.524	ENSMLEG00000035589	SRPRB	100	98.524	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.513	ENSMAUG00000021695	Srprb	100	91.513	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	94.465	ENSMICG00000048959	SRPRB	100	94.465	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	96	85.328	ENSMODG00000018493	SRPRB	97	85.328	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	90.037	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	100	90.037	Mus_caroli
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	90.037	ENSMUSG00000032553	Srprb	100	90.037	Mus_musculus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	90.406	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	100	90.406	Mus_pahari
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	90.775	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	100	90.775	Mus_spretus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.513	ENSMPUG00000009687	SRPRB	100	91.513	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000003655	SRPRB	99	90.000	ENSNGAG00000024311	-	100	89.668	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	90.775	ENSODEG00000018092	SRPRB	100	90.775	Octodon_degus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	92.989	ENSOCUG00000007623	SRPRB	100	92.989	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	93.727	ENSOGAG00000005243	SRPRB	100	93.727	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000003655	SRPRB	85	89.565	ENSOARG00000008412	SRPRB	92	93.151	Ovis_aries
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	99.010	ENSPPAG00000023940	SRPRB	100	99.010	Pan_paniscus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.144	ENSPPRG00000023305	SRPRB	100	91.144	Panthera_pardus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.144	ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.144	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	99.010	ENSPTRG00000015413	SRPRB	100	99.010	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	97.786	ENSPANG00000023015	SRPRB	100	97.786	Papio_anubis
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.144	ENSPEMG00000017954	Srprb	100	91.144	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	97.786	ENSPPYG00000014115	SRPRB	100	97.786	Pongo_abelii
ENSNLEG00000003655	SRPRB	99	81.481	ENSPCAG00000013823	SRPRB	100	81.181	Procavia_capensis
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.144	ENSPVAG00000011319	SRPRB	100	91.144	Pteropus_vampyrus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	98.515	ENSRBIG00000027819	SRPRB	100	98.515	Rhinopithecus_bieti
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	98.515	ENSRROG00000030536	SRPRB	100	98.515	Rhinopithecus_roxellana
ENSNLEG00000003655	SRPRB	90	93.956	ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	94.527	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	89.668	ENSSARG00000012943	SRPRB	100	89.668	Sorex_araneus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	90.406	ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	90.406	Sus_scrofa
ENSNLEG00000003655	SRPRB	93	90.514	ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	Tupaia_belangeri
ENSNLEG00000003655	SRPRB	99	84.444	ENSTTRG00000007802	SRPRB	100	84.133	Tursiops_truncatus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.144	ENSUAMG00000018135	SRPRB	100	91.144	Ursus_americanus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	90.775	ENSUMAG00000015817	SRPRB	100	90.775	Ursus_maritimus
ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	92.251	ENSVVUG00000005707	SRPRB	100	92.251	Vulpes_vulpes