EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000005057 (Gene tree)
Gene ID: 100591310
Gene Symbol: APOBEC2
Alias: ARCD1|ARP1
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12715 bases
Position: chr17:4646563-4659277
Accession: 100591310
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000006126	APOBEC_N	PF08210.11	5.4e-51	1	1
ENSNLEP00000006126	APOBEC_C	PF05240.14	2.2e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000006441	APOBEC2-201	2940	XM_003266309	ENSNLEP00000006126	224 (aa)	XP_003266357	G1QYV5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	80	32.222	ENSNLEG00000015215	-	84	30.409
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	79	34.595	ENSNLEG00000028392	APOBEC3C	93	34.595
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	77	35.593	ENSNLEG00000001917	AICDA	86	33.523

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	99.554	ENSG00000124701	APOBEC2	100	99.554	Homo_sapiens
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	96	55.093	ENSAPOG00000019390	apobec2b	69	59.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	83.333	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	76	83.333	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	55.729	ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	55.656	ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	54.795	ENSAOCG00000023355	apobec2b	69	59.686	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	97	53.670	ENSAOCG00000003291	apobec2a	77	57.732	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	54.795	ENSAPEG00000004591	apobec2b	69	59.686	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	96	53.917	ENSAPEG00000003630	apobec2a	77	57.732	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	59.686	ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.686	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	54.545	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	84	83.158	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	93	76.995	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	66.071	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	77.778	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	98.214	ENSANAG00000026993	APOBEC2	100	98.214	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	60.209	ENSACLG00000007634	APOBEC2	69	60.209	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	80	52.778	ENSACLG00000026736	-	97	52.778	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	96	50.901	ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	97	58.065	ENSAMXG00000015966	apobec2b	75	58.411	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	91.071	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	72	91.071	Bos_taurus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	97.321	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	97.321	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	94.643	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	100	94.643	Canis_familiaris
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	95.089	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	100	95.089	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	92.411	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	100	92.411	Capra_hircus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	95.595	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	100	95.595	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	92.417	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	93	92.417	Cavia_aperea
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	92.417	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	93	92.417	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	97.768	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	100	97.768	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	96.429	ENSCATG00000010691	APOBEC2	100	96.429	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	90.351	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	93	93.365	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	98.661	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	100	98.661	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	80	94.444	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	100	94.444	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	83	80.749	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	95	76.777	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	98.214	ENSCANG00000035072	APOBEC2	100	98.214	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	91.964	ENSCGRG00001014983	Apobec2	100	91.964	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	91.964	ENSCGRG00000007835	Apobec2	100	91.964	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	57.592	ENSCSEG00000000690	-	69	57.592	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	56.109	ENSCSEG00000020201	apobec2a	75	59.585	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	56.306	ENSCVAG00000012342	apobec2b	75	59.420	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	61.658	ENSDARG00000018881	apobec2a	76	59.809	Danio_rerio
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	95	58.065	ENSDARG00000113992	apobec2b	77	58.962	Danio_rerio
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	65.502	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	100	64.629	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	91.266	ENSDORG00000006447	Apobec2	92	93.839	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	90.047	ENSETEG00000000624	APOBEC2	92	90.047	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	93.750	ENSEASG00005002937	APOBEC2	100	93.750	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	93.750	ENSECAG00000006576	APOBEC2	100	93.750	Equus_caballus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	90.179	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	100	90.179	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	57.292	ENSELUG00000003736	apobec2a	69	55.721	Esox_lucius
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	93.304	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	100	93.304	Felis_catus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	84	66.842	ENSFALG00000003910	APOBEC2	94	62.911	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	90.667	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	100	90.667	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	63.351	ENSFHEG00000005492	apobec2b	79	63.351	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	56.021	ENSGMOG00000006819	apobec2b	76	56.021	Gadus_morhua
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	80	61.111	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	61.111	Gadus_morhua
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	82.199	ENSGALG00000003226	APOBEC2	95	77.103	Gallus_gallus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	62.827	ENSGAFG00000007634	apobec2b	60	62.827	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	58.031	ENSGACG00000009663	apobec2b	83	58.031	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	58.031	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	58.031	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	83	80.214	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.943	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	97.391	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	100	97.391	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	58.549	ENSHBUG00000015890	apobec2a	75	58.549	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	54.955	ENSHBUG00000005993	apobec2b	69	60.733	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	91.469	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	93	91.469	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	91.469	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	93	91.469	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	60.622	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	71	60.622	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	52.679	ENSHCOG00000020319	apobec2a	78	56.784	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	97	52.968	ENSIPUG00000017355	apobec2a	54	57.949	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	95	56.682	ENSIPUG00000013784	Apobec2	78	57.547	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	93.304	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	100	93.304	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	89.286	ENSJJAG00000009733	Apobec2	100	89.286	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	56.109	ENSKMAG00000020631	apobec2b	69	60.526	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	55.708	ENSLBEG00000009422	-	66	58.639	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	53.571	ENSLBEG00000025214	apobec2a	83	54.976	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	62.555	ENSLACG00000015985	APOBEC2	89	66.029	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	90	61.692	ENSLOCG00000012415	apobec2b	71	61.692	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	95.735	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	100	94.196	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	98.661	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	100	98.661	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	98.661	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	100	98.661	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	98.661	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	100	98.661	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	98.661	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	100	98.661	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	57.014	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	68	61.257	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	56.818	ENSMAMG00000023685	apobec2a	74	60.104	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	60.209	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	69	60.209	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	58.031	ENSMZEG00005005240	-	94	54.651	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	82.199	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	94	81.768	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	92.857	ENSMAUG00000011016	Apobec2	100	92.857	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	92.857	ENSMICG00000043339	APOBEC2	100	92.857	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	93.304	ENSMOCG00000001904	Apobec2	100	93.304	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	52	46.552	ENSMMOG00000009531	-	65	46.491	Mola_mola
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	95	53.991	ENSMMOG00000008681	apobec2b	76	54.808	Mola_mola
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	87.946	ENSMODG00000013090	APOBEC2	95	90.431	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	58.247	ENSMALG00000020523	apobec2a	76	58.247	Monopterus_albus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	59.162	ENSMALG00000013779	APOBEC2	72	59.162	Monopterus_albus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	90.625	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	100	90.625	Mus_caroli
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	90.625	ENSMUSG00000040694	Apobec2	100	90.625	Mus_musculus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	91.071	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.071	Mus_pahari
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	91.469	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	90	91.905	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	91.943	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	91	91.905	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	92.857	ENSNGAG00000013717	Apobec2	100	92.857	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	54.955	ENSNBRG00000018806	apobec2b	66	57.488	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	59.375	ENSNBRG00000021776	apobec2a	75	59.375	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	87.946	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	95	90.000	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	91.667	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	100	92.544	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	93.365	ENSODEG00000016183	APOBEC2	92	93.365	Octodon_degus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	95	56.808	ENSONIG00000012289	apobec2b	74	57.971	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	60.104	ENSONIG00000004644	-	75	60.104	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	77	86.628	ENSOANG00000000824	APOBEC2	98	83.978	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	92.952	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	100	92.952	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	95	53.302	ENSORLG00000010752	apobec2a	86	53.333	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	59.162	ENSORLG00000022372	APOBEC2	69	59.162	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	59.686	ENSORLG00020006164	APOBEC2	69	59.686	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	95	53.302	ENSORLG00020004153	apobec2a	86	53.333	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	95	53.302	ENSORLG00015021781	apobec2a	86	53.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	60.209	ENSORLG00015022089	-	69	60.209	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	51.802	ENSOMEG00000001311	apobec2a	83	54.412	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	60.733	ENSOMEG00000015449	APOBEC2	76	60.733	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	94.196	ENSOGAG00000002632	APOBEC2	100	94.196	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	91.964	ENSOARG00000000820	APOBEC2	100	91.964	Ovis_aries
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ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	93.304	ENSPPRG00000008530	APOBEC2	100	93.304	Panthera_pardus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	92.417	ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	92.857	Panthera_tigris_altaica
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ENSNLEG00000005057	APOBEC2	97	59.447	ENSPKIG00000004741	apobec2b	68	64.249	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	72.646	ENSPSIG00000013480	APOBEC2	97	72.646	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	57.207	ENSPMGG00000004044	apobec2a	81	58.852	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	58.639	ENSPMGG00000002686	APOBEC2	55	58.639	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	93.333	ENSPEMG00000005724	Apobec2	100	91.518	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	58.447	ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	62.827	Poecilia_formosa
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	58.447	ENSPLAG00000002074	apobec2b	76	62.827	Poecilia_latipinna
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	58.447	ENSPMEG00000017537	apobec2b	69	62.827	Poecilia_mexicana
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	57.078	ENSPREG00000020060	apobec2b	60	61.257	Poecilia_reticulata
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ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	95.288	ENSPCAG00000011433	APOBEC2	100	95.288	Procavia_capensis
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	95.089	ENSPCOG00000026935	APOBEC2	100	95.089	Propithecus_coquereli
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ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	60.733	ENSPNYG00000016747	apobec2b	69	60.733	Pundamilia_nyererei
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	86	58.031	ENSPNAG00000010382	apobec2a	71	57.732	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	93	58.962	ENSPNAG00000013666	apobec2b	75	58.962	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	91.518	ENSRNOG00000012303	Apobec2	100	91.518	Rattus_norvegicus
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ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	97.768	ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	97.768	Rhinopithecus_roxellana
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	97.768	ENSSBOG00000028496	APOBEC2	100	97.768	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	85.714	ENSSHAG00000017771	APOBEC2	95	88.095	Sarcophilus_harrisii
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	78	50.000	ENSSFOG00015005437	-	71	50.000	Scleropages_formosus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	60.274	ENSSFOG00015022920	apobec2	68	64.249	Scleropages_formosus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	60.209	ENSSMAG00000005110	APOBEC2	73	56.190	Scophthalmus_maximus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	97	56.221	ENSSMAG00000001011	apobec2a	56	60.104	Scophthalmus_maximus
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ENSNLEG00000005057	APOBEC2	80	74.725	ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.956	Sphenodon_punctatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	51.570	ENSSPAG00000016299	-	77	56.477	Stegastes_partitus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	98	55.251	ENSSPAG00000005253	apobec2b	69	60.209	Stegastes_partitus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	91.964	ENSSSCG00000036018	APOBEC2	100	91.964	Sus_scrofa
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	99	70.796	ENSTGUG00000018533	APOBEC2	95	73.709	Taeniopygia_guttata
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ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	54.502	ENSTRUG00000009123	apobec2a	76	57.513	Takifugu_rubripes
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	59.162	ENSTNIG00000015038	apobec2b	70	59.162	Tetraodon_nigroviridis
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	95.536	ENSTBEG00000003553	APOBEC2	100	95.536	Tupaia_belangeri
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	90.179	ENSTTRG00000013392	APOBEC2	100	90.179	Tursiops_truncatus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	86.404	ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	88.571	Ursus_americanus
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ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	96.667	ENSVVUG00000026617	APOBEC2	100	94.643	Vulpes_vulpes
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	50.420	ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	Xenopus_tropicalis
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	62.304	ENSXCOG00000007398	apobec2b	73	62.304	Xiphophorus_couchianus
ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	62.304	ENSXMAG00000008134	apobec2b	68	62.304	Xiphophorus_maculatus