EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000005210 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 47013 bases
Position: chr19:31876136-31923148
Accession: 100606135
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000006310	GTP_EFTU	PF00009.27	4.3e-45	1	1
ENSNLEP00000024298	GTP_EFTU	PF00009.27	4.4e-45	1	1
ENSNLEP00000006310	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.7e-12	1	1
ENSNLEP00000024298	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.7e-12	1	1
ENSNLEP00000006310	EFG_IV	PF03764.18	3.3e-23	1	1
ENSNLEP00000024298	EFG_IV	PF03764.18	3.4e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000032662	EFTUD2-201	2925	-	ENSNLEP00000024298	974 (aa)	-	M3ZC61
ENSNLET00000006632	EFTUD2-202	2919	XM_012497608	ENSNLEP00000006310	972 (aa)	XP_012353062	G1QZD9

Gene Model

Click here to download ENSNLEG00000005210's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNLEG00000005210's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	72	34.511	ENSNLEG00000002981	-	91	35.277
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	51	30.986	ENSNLEG00000004176	GFM1	60	30.986

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.087	ENSG00000108883	EFTUD2	97	98.087	Homo_sapiens
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.223	ENSAPOG00000002433	eftud2	97	90.011	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.981	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	97	97.981	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	86.610	ENSACIG00000009096	eftud2	97	86.397	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	84	87.668	ENSAOCG00000023385	eftud2	96	87.668	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.329	ENSAPEG00000003321	eftud2	97	90.117	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.648	ENSATEG00000000457	eftud2	97	90.436	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	92.340	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	97	92.340	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	95.855	ENSACAG00000007637	EFTUD2	97	95.855	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSANAG00000025320	EFTUD2	97	98.193	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.223	ENSACLG00000001296	eftud2	97	90.011	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.641	ENSAMXG00000000568	eftud2	97	89.535	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.662	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	97	97.662	Bos_taurus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	68.466	WBGene00001166	eftu-2	97	68.254	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	97	98.193	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.981	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	97	97.981	Canis_familiaris
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	97	97.479	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	97	97.981	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.662	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	97	97.662	Capra_hircus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.768	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	97	97.768	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.131	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	97	97.131	Cavia_aperea
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.131	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	97	97.131	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	97	98.193	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSCATG00000035809	EFTUD2	97	98.193	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.024	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	97	97.024	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	97	98.193	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	91	85.327	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	85.327	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.812	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	97	96.812	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	75.742	ENSCING00000009372	-	97	75.742	Ciona_intestinalis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	76.076	ENSCSAVG00000004985	-	98	79.352	Ciona_savignyi
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSCANG00000026557	EFTUD2	97	98.193	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.662	ENSCGRG00001009904	Eftud2	97	97.662	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.662	ENSCGRG00000003825	Eftud2	97	97.662	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.798	ENSCSEG00000016775	eftud2	97	89.586	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.223	ENSCVAG00000012537	eftud2	97	90.011	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.066	ENSDARG00000012261	eftud2	97	89.160	Danio_rerio
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.556	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	97	97.556	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.556	ENSDORG00000011566	Eftud2	97	97.556	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	73.411	FBgn0039566	CG4849	97	72.881	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	88	99.346	ENSETEG00000005678	EFTUD2	89	99.346	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	73	95.767	ENSEBUG00000004047	-	94	87.553	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.981	ENSEASG00005010321	EFTUD2	97	97.981	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.981	ENSECAG00000019363	EFTUD2	90	97.981	Equus_caballus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	80	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	88	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	88.842	ENSELUG00000017169	eftud2	97	88.842	Esox_lucius
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.875	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	97	97.875	Felis_catus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.068	ENSFALG00000007551	EFTUD2	97	96.068	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.343	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	97	97.343	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.329	ENSFHEG00000013479	eftud2	97	90.117	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.160	ENSGMOG00000014277	eftud2	97	89.586	Gadus_morhua
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.174	ENSGALG00000000988	EFTUD2	97	96.656	Gallus_gallus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.011	ENSGAFG00000002263	eftud2	97	89.904	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.692	ENSGACG00000009163	eftud2	97	89.479	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	97	98.193	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.117	ENSHBUG00000023546	eftud2	99	89.831	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.918	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	97	96.918	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.918	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	97	96.918	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	88.948	ENSHCOG00000017689	eftud2	97	88.948	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.267	ENSIPUG00000023182	Eftud2	97	89.904	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	94.652	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	97	94.855	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	92	97.569	ENSJJAG00000018268	Eftud2	97	97.569	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.011	ENSKMAG00000021027	eftud2	97	89.798	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	95	89.968	ENSLBEG00000005875	eftud2	99	89.752	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	92.455	ENSLACG00000012918	EFTUD2	97	92.994	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.117	ENSLOCG00000011460	eftud2	97	90.117	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.450	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	97	97.450	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	97	98.193	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	97	98.193	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	97	98.193	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	97	98.193	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.648	ENSMAMG00000022190	eftud2	98	90.436	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.223	ENSMZEG00005022885	eftud2	97	90.011	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.182	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	97	96.182	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.662	ENSMAUG00000021178	Eftud2	97	97.662	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSMICG00000016592	EFTUD2	97	98.193	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.768	ENSMOCG00000009039	-	97	97.768	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	91	80.112	ENSMOCG00000017653	-	90	80.112	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	84	93.651	ENSMMOG00000020811	eftud2	96	93.651	Mola_mola
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.768	ENSMODG00000011347	EFTUD2	97	97.768	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	84	91.819	ENSMALG00000014501	eftud2	96	91.819	Monopterus_albus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.450	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	97	97.450	Mus_caroli
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.450	ENSMUSG00000020929	Eftud2	97	97.450	Mus_musculus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.450	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	97	97.450	Mus_pahari
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.450	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	97	97.450	Mus_spretus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	97	97.260	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	91	97.260	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.981	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	97	97.981	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.662	ENSNGAG00000017834	Eftud2	97	97.662	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.117	ENSNBRG00000020081	eftud2	97	89.904	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	92	97.790	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	93	97.790	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.373	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	97	89.373	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.706	ENSODEG00000018041	-	97	96.706	Octodon_degus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	89	79.549	ENSODEG00000003385	-	96	79.549	Octodon_degus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.223	ENSONIG00000000912	eftud2	97	90.011	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.981	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	97	97.981	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.798	ENSORLG00000003109	eftud2	97	89.798	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.692	ENSORLG00020009865	eftud2	97	89.692	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.692	ENSORLG00015002611	eftud2	97	91.432	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	95.855	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	97	95.855	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.662	ENSOARG00000009078	EFTUD2	94	97.662	Ovis_aries
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.087	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	97	98.087	Pan_paniscus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.981	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	97	97.981	Panthera_pardus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.981	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	97	97.981	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.087	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	97	98.087	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	ENSPANG00000021284	EFTUD2	97	98.193	Papio_anubis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	92	95.259	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	95.259	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	82.147	ENSPMGG00000007281	eftud2	97	82.147	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.662	ENSPEMG00000005129	Eftud2	97	97.662	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.875	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	97	97.875	Phascolarctos_cinereus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.011	ENSPFOG00000008515	eftud2	97	89.904	Poecilia_formosa
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.011	ENSPLAG00000010393	eftud2	97	89.904	Poecilia_latipinna
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.011	ENSPMEG00000005087	eftud2	97	89.904	Poecilia_mexicana
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.706	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	97	96.706	Pongo_abelii
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	92	97.459	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	93	97.459	Procavia_capensis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.087	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	97	98.087	Propithecus_coquereli
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	93.092	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	97	93.092	Pteropus_vampyrus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.117	ENSPNYG00000012448	eftud2	97	89.904	Pundamilia_nyererei
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.904	ENSPNAG00000012490	eftud2	97	90.436	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.450	ENSRNOG00000002818	Eftud2	97	97.450	Rattus_norvegicus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.087	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	97	98.087	Rhinopithecus_bieti
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.087	ENSRROG00000042925	EFTUD2	97	98.087	Rhinopithecus_roxellana
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	34.057	YKL173W	SNU114	96	33.730	Saccharomyces_cerevisiae
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	97	97.382	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	98	97.382	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	93	96.913	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	97	97.795	Sarcophilus_harrisii
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.586	ENSSFOG00015023272	eftud2	97	89.586	Scleropages_formosus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.011	ENSSMAG00000010174	eftud2	97	89.798	Scophthalmus_maximus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.329	ENSSDUG00000022675	eftud2	97	90.117	Seriola_dumerili
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.436	ENSSLDG00000001595	eftud2	97	90.223	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.054	ENSSARG00000008664	EFTUD2	97	89.054	Sorex_araneus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	95.749	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	97	95.749	Sphenodon_punctatus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.436	ENSSPAG00000016235	eftud2	96	90.223	Stegastes_partitus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.768	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	97	97.768	Sus_scrofa
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	84	95.255	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	95.255	Taeniopygia_guttata
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.373	ENSTRUG00000016422	eftud2	97	89.160	Takifugu_rubripes
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	84.762	ENSTNIG00000005346	eftud2	97	84.444	Tetraodon_nigroviridis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	92.349	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	97	92.349	Tupaia_belangeri
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	91	100.000	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	87	96.235	Tursiops_truncatus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.819	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	97	96.819	Ursus_americanus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.981	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	97	97.981	Ursus_maritimus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	84	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	85	100.000	Vicugna_pacos
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.981	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	97	97.981	Vulpes_vulpes
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	93	91.951	ENSXETG00000003394	eftud2	95	93.919	Xenopus_tropicalis
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.011	ENSXMAG00000008494	eftud2	97	89.904	Xiphophorus_maculatus