EuRBPDB

Description
Ensembl ID
ENSNLEG00000006094 (Gene tree)
Gene ID
100583305
Gene Symbol
DDX39B
Alias
-
Full Name
DExD-box helicase 39B
Gene Type
protein_coding
Species
Nomascus_leucogenys
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
11742 bases
Position
chr1a:76327181-76338922
Accession
100583305
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein ID
Domain
Pfam ID
E-value
Domain number
Total number
ENSNLEP00000007389DEADPF00270.291.5e-1811
Transcripts
Transcript ID
Name
Length
RefSeq ID
Protein ID
Length
RefSeq ID
UniportKB ID
ENSNLET00000007754DDX39B-2011065XM_012503200ENSNLEP00000007389354 (aa)XP_012358654G1R2G7
Gene Model
Pathways
Pathway ID
Pathway Name
Source
nle03013RNA transportKEGG
nle03015mRNA surveillance pathwayKEGG
nle03040SpliceosomeKEGG
Protein-Protein Interaction (PPI)
Paralogs
Ensembl ID
Gene Symbol
Coverage
Identiy
Paralog
Gene Symbol
Coverage
Identiy
ENSNLEG00000006094DDX39B6232.420ENSNLEG00000027059-8932.420
ENSNLEG00000006094DDX39B7131.873ENSNLEG00000034508-9631.873
ENSNLEG00000006094DDX39B7131.227ENSNLEG00000029325-5831.227
ENSNLEG00000006094DDX39B8034.507ENSNLEG00000007372DDX65834.507
ENSNLEG00000006094DDX39B9291.732ENSNLEG00000013515DDX39A7691.732
ENSNLEG00000006094DDX39B7130.888ENSNLEG00000007461DDX255330.888
ENSNLEG00000006094DDX39B6834.583ENSNLEG00000000571-8334.583
ENSNLEG00000006094DDX39B8235.052ENSNLEG00000006633EIF4A28536.940
ENSNLEG00000006094DDX39B7034.400ENSNLEG00000003605DDX475434.400
ENSNLEG00000006094DDX39B7132.061ENSNLEG00000016042DDX19A5932.061
ENSNLEG00000006094DDX39B7132.271ENSNLEG00000029784-8132.271
ENSNLEG00000006094DDX39B7536.940ENSNLEG00000015595EIF4A36436.940
ENSNLEG00000006094DDX39B8233.106ENSNLEG00000009547EIF4A17133.106
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Orthologs
Ensembl ID
Gene Symbol
Coverage
Identiy
Ortholog
Gene Symbol
Coverage
Identiy
Species
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.467ENSG00000198563DDX39B95100.000Homo_sapiens
ENSNLEG00000006094DDX39B9999.291ENSAMEG00000009508DDX39B8099.291Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000006094DDX39B7996.071ENSACIG00000004534ddx39b6596.071Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000006094DDX39B8195.088ENSATEG00000012366ddx39b6695.088Anabas_testudineus
ENSNLEG00000006094DDX39B10073.193ENSACAG00000012240DDX39B10073.193Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000006094DDX39B8199.649ENSANAG00000030372DDX39B10075.467Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000006094DDX39B9993.310ENSACLG00000018759ddx39b8393.310Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000006094DDX39B10095.789ENSAMXG00000017837ddx39b8395.789Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.467ENSBTAG00000014490DDX39B10075.467Bos_taurus
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.467ENSCJAG00000003152DDX39B10075.467Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000006094DDX39B8199.649ENSCAFG00000000509DDX39B9299.649Canis_familiaris
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.234ENSCAFG00020020530DDX39B10075.234Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.467ENSCHIG00000004579DDX39B10075.467Capra_hircus
ENSNLEG00000006094DDX39B8199.649ENSTSYG00000010226-10075.467Carlito_syrichta
ENSNLEG00000006094DDX39B10083.509ENSTSYG00000029741-7481.893Carlito_syrichta
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.234ENSCAPG00000010066DDX39B10075.234Cavia_aperea
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.234ENSCPOG00000002335DDX39B10075.234Cavia_porcellus
ENSNLEG00000006094DDX39B8199.649ENSCCAG00000027897DDX39B10075.467Cebus_capucinus
ENSNLEG00000006094DDX39B9994.366ENSCATG00000043709DDX39B8494.366Cercocebus_atys
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.234ENSCLAG00000014555DDX39B10075.234Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000006094DDX39B9975.059ENSCSAG00000008517DDX39B10075.059Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000006094DDX39B77100.000ENSCPBG00000014671-100100.000Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000006094DDX39B8199.649ENSCANG00000041217DDX39B10075.467Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000006094DDX39B8081.690ENSCGRG00001021916-6981.690Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000006094DDX39B8195.486ENSDARG00000036069ddx39b6695.486Danio_rerio
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.467ENSDNOG00000010215DDX39B10075.467Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000006094DDX39B10088.221ENSDORG00000004985Ddx39b10088.221Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000006094DDX39B8558.824ENSETEG00000009649DDX39B8758.824Echinops_telfairi
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.467ENSEASG00005017156DDX39B10075.467Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.467ENSECAG00000007750DDX39B10075.467Equus_caballus
ENSNLEG00000006094DDX39B8195.439ENSELUG00000017904ddx39b6695.439Esox_lucius
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.234ENSFCAG00000004497DDX39B10075.234Felis_catus
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.234ENSFDAG00000011074DDX39B10075.234Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000006094DDX39B8199.306ENSGAGG00000001300-7399.306Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000006094DDX39B8199.649ENSGGOG00000005989DDX39B10075.467Gorilla_gorilla
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ENSNLEG00000006094DDX39B10074.766ENSHGLG00100011850DDX39B10074.766Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000006094DDX39B10095.088ENSIPUG00000015733DDX39B7995.088Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.000ENSSTOG00000012838DDX39B10075.000Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.234ENSJJAG00000005660-10075.234Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000006094DDX39B5980.488ENSLBEG00000017177-6080.488Labrus_bergylta
ENSNLEG00000006094DDX39B9979.643ENSLBEG00000012254ddx39b8279.643Labrus_bergylta
ENSNLEG00000006094DDX39B10099.298ENSLACG00000002110DDX39B8299.298Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.234ENSLAFG00000014202DDX39B10075.234Loxodonta_africana
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ENSNLEG00000006094DDX39B10075.467ENSMAUG00000008059Ddx39b10075.467Mesocricetus_auratus
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ENSNLEG00000006094DDX39B10099.293ENSOGAG00000028850-8399.293Otolemur_garnettii
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ENSNLEG00000006094DDX39B8199.649ENSPPRG00000001913DDX39B10075.234Panthera_pardus
ENSNLEG00000006094DDX39B10074.299ENSPTIG00000017669DDX39B10074.299Panthera_tigris_altaica
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ENSNLEG00000006094DDX39B10075.467ENSPCIG00000017572DDX39B10075.467Phascolarctos_cinereus
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.467ENSPPYG00000016433DDX39B10075.467Pongo_abelii
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ENSNLEG00000006094DDX39B10098.592ENSTBEG00000003721DDX39B8398.592Tupaia_belangeri
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ENSNLEG00000006094DDX39B10097.183ENSUAMG00000027335DDX39B8397.183Ursus_americanus
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ENSNLEG00000006094DDX39B6298.592ENSVPAG00000009167-6298.592Vicugna_pacos
ENSNLEG00000006094DDX39B10075.234ENSVVUG00000019518DDX39B9975.234Vulpes_vulpes
ENSNLEG00000006094DDX39B9485.985ENSXETG00000002498ddx39b7885.985Xenopus_tropicalis