EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000006451 (Gene tree)
Gene ID: 100607619
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10726 bases
Position: chr1a:76786125-76796850
Accession: 100607619
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000034852	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.2e-36	1	1
ENSNLEP00000007867	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.5e-36	1	1
ENSNLEP00000034852	DEAD	PF00270.29	2.6e-16	1	1
ENSNLEP00000007867	DEAD	PF00270.29	3e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000057292	SKIV2L-201	210	-	ENSNLEP00000046480	69 (aa)	-	A0A2I3HSH8
ENSNLET00000008242	SKIV2L-202	3648	XM_012503026	ENSNLEP00000007867	1215 (aa)	XP_012358480	G1R3U5
ENSNLET00000054433	SKIV2L-203	3369	-	ENSNLEP00000034852	1122 (aa)	-	A0A2I3GUD4

Gene Model

Click here to download ENSNLEG00000006451's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNLEG00000006451's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	86	34.995	ENSNLEG00000001494	MTREX	91	34.995

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	95.253	ENSG00000204351	SKIV2L	98	100.000	Homo_sapiens
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	61.040	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	61.340	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.592	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	98	91.443	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	59.614	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.000	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.991	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.147	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.831	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	61.147	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.577	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	60.806	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	63.801	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	64.861	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	94.156	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	92.261	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.942	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.116	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	58.781	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.894	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.687	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	98	91.606	Bos_taurus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	85	43.619	WBGene00008502	skih-2	80	45.960	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	93.805	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	93.805	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.510	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	98	91.361	Canis_familiaris
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.429	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	98	91.280	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.687	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	98	91.606	Capra_hircus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.361	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	98	91.117	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	89.042	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	98	89.205	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	93.725	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	93.478	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	94.610	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	94.610	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	90.302	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	98	90.220	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	94.288	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	94.288	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	84	65.046	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	92	65.052	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	93	52.130	ENSCING00000005576	-	99	50.425	Ciona_intestinalis
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	94.911	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	94.585	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	90.635	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	98	90.554	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.143	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	60.806	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.319	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	60.467	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.730	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	59.791	Danio_rerio
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	90	94.087	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	88	94.087	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	93	44.995	FBgn0039117	tst	97	44.061	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	75	88.432	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	88.432	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	89	55.585	ENSEBUG00000013680	-	95	55.913	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	94	91.990	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	91.990	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	94	91.033	ENSECAG00000021823	SKIV2L	94	91.645	Equus_caballus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	56	97.628	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	97.628	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.395	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	65.940	Esox_lucius
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.789	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	98	91.721	Felis_catus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	86.942	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	98	87.186	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.430	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.579	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	59.032	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	59.087	Gadus_morhua
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	85	59.694	ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	59.878	Gallus_gallus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.589	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	60.740	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.743	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	59.806	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	53	74.372	ENSGAGG00000015556	SKIV2L	81	73.813	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	95.334	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	95.043	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.863	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.035	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	88.771	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	98	89.015	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	86.168	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	98	86.412	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	58.776	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.020	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.539	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	59.694	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	91.519	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	98	91.606	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	60	60.244	ENSLACG00000002986	-	61	60.202	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	90.747	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	98	90.747	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	94.529	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	94.087	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	94.449	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	94.000	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	94.449	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.000	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	94.690	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	94.690	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.304	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.452	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.863	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.035	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	67	57.743	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	51.559	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	89.457	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	98	89.538	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	92.013	ENSMICG00000046331	SKIV2L	98	91.932	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	89.233	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	89.396	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.789	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	60.944	Mola_mola
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	85.795	ENSMODG00000015052	SKIV2L	98	85.981	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.289	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.265	Monopterus_albus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	90.309	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	98	90.228	Mus_caroli
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	90.472	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	98	90.391	Mus_musculus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	89.739	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	98	89.658	Mus_pahari
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	90.147	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	98	90.065	Mus_spretus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.184	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	98	91.035	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	90.260	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	98	90.260	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.144	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	60.616	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	80	92.920	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	77	92.920	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.280	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	98	91.198	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	89.042	ENSODEG00000017516	SKIV2L	98	89.042	Octodon_degus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	61.272	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.595	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.558	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	98	91.558	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.783	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	60.936	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.623	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	60.856	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.383	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	60.533	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.929	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	60.922	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.071	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	98	91.071	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	86.089	ENSOARG00000002411	-	98	85.930	Ovis_aries
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	94.640	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	94.640	Pan_paniscus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	92.163	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	98	91.932	Panthera_pardus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.755	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	98	91.524	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	95.575	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	95.304	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	93.515	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	93.515	Papio_anubis
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.477	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	59.696	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.693	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	59.918	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	90.635	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	98	90.554	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	85.245	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	98	85.425	Phascolarctos_cinereus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.430	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	60.579	Poecilia_formosa
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.478	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.628	Poecilia_latipinna
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.510	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	60.660	Poecilia_mexicana
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	93	65.628	ENSPREG00000002277	skiv2l	96	65.628	Poecilia_reticulata
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	94.690	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	94.690	Pongo_abelii
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	77	93.421	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	93.421	Procavia_capensis
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	92.828	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	98	92.747	Propithecus_coquereli
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	90.260	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	98	90.260	Pteropus_vampyrus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.080	ENSPNYG00000017853	skiv2l	98	65.904	Pundamilia_nyererei
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	60.418	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	60.596	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	90.635	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	98	90.554	Rattus_norvegicus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	92.016	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	92.016	Rhinopithecus_bieti
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	94.690	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	94.690	Rhinopithecus_roxellana
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	94	38.226	YLR398C	-	93	38.226	Saccharomyces_cerevisiae
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	93.805	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	93.805	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	84.831	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	98	83.955	Sarcophilus_harrisii
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.763	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	60.995	Scleropages_formosus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.319	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.467	Scophthalmus_maximus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.686	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	60.838	Seriola_dumerili
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.569	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.723	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	61.094	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	61.199	Sphenodon_punctatus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	95	60.101	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.340	Stegastes_partitus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	91.761	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	98	91.769	Sus_scrofa
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	93	56.121	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.985	Takifugu_rubripes
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.646	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.611	Tetraodon_nigroviridis
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	93	90.294	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	90.294	Tupaia_belangeri
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	86.553	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	98	86.471	Tursiops_truncatus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	92.000	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	98	91.850	Ursus_americanus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	94	91.990	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	91.990	Ursus_maritimus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.769	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	98	91.687	Vulpes_vulpes
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	57.143	ENSXETG00000010932	skiv2l	98	57.304	Xenopus_tropicalis
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.772	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	60.926	Xiphophorus_couchianus
ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.398	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	60.548	Xiphophorus_maculatus