EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000007467 (Gene tree)
Gene ID: 100590888
Gene Symbol: SRPRA
Alias: SR-alpha|SRP-alpha|SRPR|Sralpha
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8696 bases
Position: chr15:9008819-9017514
Accession: 100590888
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000030281	SRP54	PF00448.22	1.8e-47	1	1
ENSNLEP00000031656	SRP54	PF00448.22	2e-47	1	1
ENSNLEP00000009087	SRP54	PF00448.22	2.1e-47	1	1
ENSNLEP00000030281	SRP54_N	PF02881.19	1.1e-08	1	1
ENSNLEP00000031656	SRP54_N	PF02881.19	1.2e-08	1	1
ENSNLEP00000009087	SRP54_N	PF02881.19	1.3e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000047078	SRPRA-202	2799	XM_003253517	ENSNLEP00000031656	608 (aa)	XP_003253565	A0A2I3GK36
ENSNLET00000037221	SRPRA-203	1743	-	ENSNLEP00000030281	580 (aa)	-	A0A2I3GG38
ENSNLET00000009522	SRPRA-201	1869	-	ENSNLEP00000009087	622 (aa)	-	G1R7B5

Gene Model

Click here to download ENSNLEG00000007467's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNLEG00000007467's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.672	ENSG00000182934	SRPRA	95	99.672	Homo_sapiens
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.840	ENSAPOG00000017588	srpra	99	65.284	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.044	ENSAMEG00000000117	SRPRA	99	93.060	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	65.760	ENSACIG00000021588	srpra	99	63.190	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.624	ENSAOCG00000018884	srpra	99	65.438	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.464	ENSAPEG00000022286	srpra	99	62.047	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000007467	SRPRA	83	86.984	ENSATEG00000023578	srpra	92	86.728	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	78.125	ENSAPLG00000016079	SRPRA	100	78.289	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	77.147	ENSACAG00000000108	SRPRA	99	73.994	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	98.851	ENSANAG00000020346	SRPRA	95	98.851	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.934	ENSACLG00000000518	srpra	99	64.571	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	64.763	ENSAMXG00000009975	srpra	99	61.875	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.377	ENSBTAG00000014105	SRPRA	95	97.377	Bos_taurus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	49.410	WBGene00009521	F38A1.8	99	47.167	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	98.851	ENSCJAG00000008752	SRPRA	95	98.851	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	96.672	ENSCAFG00000010474	SRPRA	99	93.060	Canis_familiaris
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	96.716	ENSCAFG00020010608	SRPRA	99	92.744	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	96.557	ENSCHIG00000012423	SRPRA	95	96.557	Capra_hircus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	80	99.162	ENSTSYG00000005187	SRPRA	96	99.162	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	89.934	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	98.496	Cavia_aperea
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.697	ENSCPOG00000014976	SRPRA	95	97.697	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	98.686	ENSCCAG00000025602	SRPRA	95	98.686	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.343	ENSCATG00000039354	SRPRA	95	99.343	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	98.684	ENSCLAG00000016839	SRPRA	95	98.684	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.343	ENSCSAG00000002271	SRPRA	95	99.343	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	61	98.980	ENSCHOG00000010015	-	73	98.980	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	78.029	ENSCPBG00000011128	SRPRA	99	74.961	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	58.703	ENSCING00000008954	-	99	55.692	Ciona_intestinalis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	58.387	ENSCSAVG00000005602	-	99	56.703	Ciona_savignyi
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	98.194	ENSCANG00000032337	SRPRA	95	98.194	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.368	ENSCGRG00001017670	Srpr	95	97.368	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.368	ENSCGRG00000009892	Srpr	95	97.368	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.624	ENSCSEG00000002374	srpra	99	64.734	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.772	ENSCVAG00000019881	srpra	99	65.244	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.614	ENSDARG00000061124	srpra	99	63.359	Danio_rerio
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	95.455	ENSDNOG00000010821	SRPRA	96	95.455	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.697	ENSDORG00000016719	Srpr	95	97.697	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	51.294	FBgn0010391	Gtp-bp	99	49.922	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	92.659	ENSETEG00000013956	SRPRA	99	88.871	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000007467	SRPRA	56	80.923	ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	96.066	ENSEASG00005022980	SRPRA	99	91.811	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	96.230	ENSECAG00000014692	SRPRA	95	96.230	Equus_caballus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	86.460	ENSEEUG00000007920	SRPRA	99	82.132	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	68.006	ENSELUG00000017643	srpra	99	65.331	Esox_lucius
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.049	ENSFCAG00000011274	-	95	97.049	Felis_catus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	79	95.851	ENSFCAG00000030894	-	94	95.851	Felis_catus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	77.162	ENSFALG00000005048	SRPRA	96	77.162	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	98.849	ENSFDAG00000016229	SRPRA	95	98.849	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.190	ENSFHEG00000016959	srpra	99	63.927	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.374	ENSGMOG00000013244	srpra	99	65.211	Gadus_morhua
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	78.734	ENSGALG00000030759	SRPRA	99	75.311	Gallus_gallus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.986	ENSGAFG00000000453	srpra	99	64.373	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.721	ENSGACG00000006550	srpra	99	64.019	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	79.321	ENSGAGG00000021157	SRPRA	99	75.734	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.507	ENSGGOG00000012962	SRPRA	95	99.507	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.774	ENSHBUG00000000119	srpra	99	64.417	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.697	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.697	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.508	ENSHCOG00000010749	srpra	99	64.414	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	65.260	ENSIPUG00000000867	srpra	99	65.041	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	98.030	ENSSTOG00000009897	SRPRA	95	98.030	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.039	ENSJJAG00000020272	Srpr	99	93.049	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.717	ENSKMAG00000002280	srpra	99	65.356	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.294	ENSLBEG00000009608	srpra	99	64.832	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	69.643	ENSLACG00000017781	SRPRA	99	67.083	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.562	ENSLOCG00000002733	srpra	99	63.499	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	95.246	ENSLAFG00000010252	SRPRA	99	91.339	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.507	ENSMFAG00000032606	SRPRA	95	99.507	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.507	ENSMMUG00000007938	SRPRA	95	99.507	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.343	ENSMNEG00000030709	SRPRA	95	99.343	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.343	ENSMLEG00000043404	SRPRA	95	99.343	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.403	ENSMAMG00000000473	srpra	99	63.470	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.934	ENSMZEG00005013432	srpra	99	64.571	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000007467	SRPRA	98	78.182	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	78.347	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.697	ENSMAUG00000015648	Srpr	95	97.697	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.537	ENSMICG00000015981	SRPRA	95	97.537	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.697	ENSMOCG00000008311	Srpr	95	97.697	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.345	ENSMMOG00000005019	srpra	99	63.467	Mola_mola
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	89.836	ENSMODG00000004576	-	99	85.647	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.624	ENSMALG00000011343	srpra	99	65.138	Monopterus_albus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.368	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	95	97.368	Mus_caroli
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.368	ENSMUSG00000032042	Srpr	95	97.368	Mus_musculus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.533	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	95	97.533	Mus_pahari
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	92.656	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	96	92.656	Mus_spretus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	96.880	ENSMPUG00000006626	SRPRA	99	92.902	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	94.910	ENSMLUG00000017334	SRPRA	99	91.009	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.204	ENSNGAG00000015686	Srpr	99	93.207	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.093	ENSNBRG00000017311	srpra	99	64.769	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	89.931	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	90.500	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	90.328	ENSOPRG00000013160	SRPRA	99	86.614	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	96.875	ENSODEG00000004730	SRPRA	99	92.891	Octodon_degus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.560	ENSONIG00000005324	srpra	99	64.571	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	98.686	ENSOCUG00000017057	SRPRA	95	98.686	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	85	86.349	ENSORLG00000014676	srpra	99	65.224	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.258	ENSORLG00020009240	srpra	99	65.224	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.258	ENSORLG00015015405	srpra	99	65.379	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.909	ENSOMEG00000005872	srpra	99	65.224	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.862	ENSOGAG00000008926	SRPRA	95	97.862	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	93.924	ENSOARG00000012397	SRPRA	99	91.523	Ovis_aries
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.672	ENSPPAG00000030813	SRPRA	95	99.672	Pan_paniscus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.049	ENSPPRG00000001542	SRPRA	95	97.049	Panthera_pardus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	96.885	ENSPTIG00000006989	SRPRA	95	96.885	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.672	ENSPTRG00000028360	SRPRA	95	99.672	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.507	ENSPANG00000010858	SRPRA	95	99.507	Papio_anubis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	65.854	ENSPKIG00000016106	srpra	99	63.608	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNLEG00000007467	SRPRA	98	77.176	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	77.340	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.955	ENSPMGG00000001393	srpra	99	65.123	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.862	ENSPEMG00000018279	Srpr	95	97.862	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	60.514	ENSPMAG00000009559	srpra	99	58.204	Petromyzon_marinus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	89.836	ENSPCIG00000010207	SRPRA	99	86.299	Phascolarctos_cinereus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.038	ENSPFOG00000003114	srpra	99	65.805	Poecilia_formosa
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.984	ENSPLAG00000007323	srpra	99	65.805	Poecilia_latipinna
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.038	ENSPMEG00000015658	srpra	99	65.805	Poecilia_mexicana
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	68.196	ENSPREG00000004937	srpra	99	65.145	Poecilia_reticulata
ENSNLEG00000007467	SRPRA	88	99.348	ENSPPYG00000004045	SRPRA	99	98.684	Pongo_abelii
ENSNLEG00000007467	SRPRA	62	99.225	ENSPCAG00000003801	-	60	99.225	Procavia_capensis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.701	ENSPCOG00000025726	SRPRA	95	97.701	Propithecus_coquereli
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	96.388	ENSPVAG00000000993	SRPRA	99	92.429	Pteropus_vampyrus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.934	ENSPNYG00000012371	srpra	99	64.571	Pundamilia_nyererei
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	64.480	ENSPNAG00000013476	srpra	99	63.761	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.862	ENSRNOG00000010543	Srpra	95	97.862	Rattus_norvegicus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.179	ENSRBIG00000008702	SRPRA	95	99.179	Rhinopithecus_bieti
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.016	ENSRROG00000029494	SRPRA	95	99.016	Rhinopithecus_roxellana
ENSNLEG00000007467	SRPRA	74	38.075	YDR292C	-	76	38.075	Saccharomyces_cerevisiae
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	98.851	ENSSBOG00000035892	SRPRA	95	98.851	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	90.864	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.532	Sarcophilus_harrisii
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	64.754	ENSSFOG00015008837	srpra	99	63.265	Scleropages_formosus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	64.532	ENSSMAG00000002783	srpra	99	62.074	Scophthalmus_maximus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.188	ENSSDUG00000013920	srpra	99	63.307	Seriola_dumerili
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.188	ENSSLDG00000008601	srpra	93	64.067	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	82	90.456	ENSSARG00000012434	SRPRA	80	90.664	Sorex_araneus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	77.435	ENSSPUG00000018221	SRPRA	99	74.068	Sphenodon_punctatus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.083	ENSSPAG00000005103	srpra	99	64.275	Stegastes_partitus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.209	ENSSSCG00000015227	SRPRA	99	93.218	Sus_scrofa
ENSNLEG00000007467	SRPRA	99	75.248	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	75.248	Taeniopygia_guttata
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	65.794	ENSTRUG00000006856	srpra	99	64.000	Takifugu_rubripes
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	63.376	ENSTNIG00000010316	srpra	99	61.985	Tetraodon_nigroviridis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	96.393	ENSTTRG00000001558	SRPRA	95	96.393	Tursiops_truncatus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	96.885	ENSUAMG00000005510	SRPRA	99	92.913	Ursus_americanus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	98	90.501	ENSUMAG00000002269	SRPRA	99	88.655	Ursus_maritimus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	76	99.225	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	99.225	Vicugna_pacos
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	96.880	ENSVVUG00000020094	SRPRA	99	92.902	Vulpes_vulpes
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	61.342	ENSXETG00000003920	srpra	99	59.293	Xenopus_tropicalis
ENSNLEG00000007467	SRPRA	84	87.937	ENSXCOG00000001286	srpra	99	60.289	Xiphophorus_couchianus
ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.197	ENSXMAG00000028401	srpra	99	65.131	Xiphophorus_maculatus