EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000008059 (Gene tree)
Gene ID: 101179291
Gene Symbol: MSI2
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 440439 bases
Position: chr14:7771520-8211958
Accession: 101179291
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000034679	RRM_1	PF00076.22	4.3e-30	1	2
ENSNLEP00000034679	RRM_1	PF00076.22	4.3e-30	2	2
ENSNLEP00000009843	RRM_1	PF00076.22	1.1e-29	1	2
ENSNLEP00000009843	RRM_1	PF00076.22	1.1e-29	2	2
ENSNLEP00000026224	RRM_1	PF00076.22	1.4e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000042494	MSI2-203	804	XM_004090323	ENSNLEP00000026224	267 (aa)	XP_004090371	A0A2I3G215
ENSNLET00000060114	MSI2-202	663	-	ENSNLEP00000034679	220 (aa)	-	A0A2I3GTK5
ENSNLET00000010317	MSI2-201	936	-	ENSNLEP00000009843	311 (aa)	-	G1R9F3
ENSNLET00000045545	MSI2-204	594	-	ENSNLEP00000044303	197 (aa)	-	A0A2I3HKX5

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000008059	MSI2	81	40.230	ENSNLEG00000014918	HNRNPA2B1	82	40.230
ENSNLEG00000008059	MSI2	73	41.772	ENSNLEG00000017659	HNRNPA1	71	40.476
ENSNLEG00000008059	MSI2	65	35.065	ENSNLEG00000032459	-	76	39.474
ENSNLEG00000008059	MSI2	72	30.769	ENSNLEG00000026620	-	61	30.769
ENSNLEG00000008059	MSI2	75	38.690	ENSNLEG00000031828	-	68	35.648
ENSNLEG00000008059	MSI2	73	41.772	ENSNLEG00000010858	-	90	35.789
ENSNLEG00000008059	MSI2	75	36.145	ENSNLEG00000029989	-	91	32.990
ENSNLEG00000008059	MSI2	71	38.686	ENSNLEG00000034681	-	89	38.621
ENSNLEG00000008059	MSI2	76	41.139	ENSNLEG00000008518	HNRNPA0	73	37.383
ENSNLEG00000008059	MSI2	75	46.243	ENSNLEG00000008600	HNRNPD	65	46.857
ENSNLEG00000008059	MSI2	51	43.860	ENSNLEG00000028027	-	89	43.860
ENSNLEG00000008059	MSI2	73	35.714	ENSNLEG00000034545	-	74	36.145
ENSNLEG00000008059	MSI2	68	42.105	ENSNLEG00000028393	-	97	42.105
ENSNLEG00000008059	MSI2	73	42.405	ENSNLEG00000028401	-	68	39.286
ENSNLEG00000008059	MSI2	73	46.154	ENSNLEG00000036146	-	57	44.444
ENSNLEG00000008059	MSI2	70	41.667	ENSNLEG00000001563	DAZAP1	50	41.667
ENSNLEG00000008059	MSI2	59	39.683	ENSNLEG00000027238	-	72	42.857
ENSNLEG00000008059	MSI2	83	31.579	ENSNLEG00000009512	TARDBP	66	31.818
ENSNLEG00000008059	MSI2	73	39.490	ENSNLEG00000027151	-	69	36.406
ENSNLEG00000008059	MSI2	73	35.714	ENSNLEG00000033890	-	62	35.122
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	66.351	ENSNLEG00000015636	MSI1	99	59.021
ENSNLEG00000008059	MSI2	70	49.265	ENSNLEG00000015775	-	95	43.889
ENSNLEG00000008059	MSI2	73	40.506	ENSNLEG00000015913	-	77	39.409
ENSNLEG00000008059	MSI2	73	37.821	ENSNLEG00000034385	-	68	33.945
ENSNLEG00000008059	MSI2	62	34.286	ENSNLEG00000027980	-	66	31.250
ENSNLEG00000008059	MSI2	72	48.701	ENSNLEG00000008636	HNRNPDL	74	48.701
ENSNLEG00000008059	MSI2	75	37.126	ENSNLEG00000032894	-	67	37.126
ENSNLEG00000008059	MSI2	73	35.714	ENSNLEG00000027497	-	62	36.098
ENSNLEG00000008059	MSI2	58	35.385	ENSNLEG00000012944	-	57	33.516

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSG00000153944	MSI2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSNLEG00000008059	MSI2	96	92.891	ENSAPOG00000001658	msi2a	93	92.444	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSAMEG00000002697	MSI2	99	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	92.788	ENSACIG00000009475	msi2a	94	77.528	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000008059	MSI2	70	85.965	ENSAOCG00000014822	msi2a	64	85.965	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	93.301	ENSAPEG00000007706	msi2a	93	92.444	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000008059	MSI2	96	92.891	ENSATEG00000010498	msi2a	93	92.444	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	93.299	ENSATEG00000003301	-	100	92.889	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	97.849	ENSACAG00000005452	MSI2	68	97.826	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSANAG00000037827	MSI2	96	100.000	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000008059	MSI2	96	92.417	ENSACLG00000007752	msi2a	93	92.000	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	96.172	ENSAMXG00000032796	msi2a	94	92.035	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000008059	MSI2	96	96.209	ENSAMXG00000010474	msi2b	98	94.667	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000008059	MSI2	96	98.578	ENSBTAG00000004406	MSI2	97	99.111	Bos_taurus
ENSNLEG00000008059	MSI2	90	62.150	WBGene00003423	msi-1	71	62.150	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSCJAG00000013998	MSI2	96	100.000	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSCAFG00020025620	MSI2	81	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	99.043	ENSCHIG00000016580	MSI2	94	99.111	Capra_hircus
ENSNLEG00000008059	MSI2	99	89.667	ENSCPOG00000034042	MSI2	99	89.667	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSCCAG00000033927	MSI2	96	100.000	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSCATG00000040879	MSI2	100	98.502	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSCLAG00000014325	MSI2	94	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	94.212	ENSCSAG00000005633	MSI2	94	99.556	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000008059	MSI2	75	100.000	ENSCHOG00000008660	MSI2	83	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000008059	MSI2	94	98.895	ENSCPBG00000009942	MSI2	96	93.688	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000008059	MSI2	87	72.222	ENSCING00000018579	-	99	52.632	Ciona_intestinalis
ENSNLEG00000008059	MSI2	89	65.217	ENSCSAVG00000010397	-	71	68.116	Ciona_savignyi
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSCANG00000036414	MSI2	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	99.043	ENSCGRG00001013330	Msi2	94	99.115	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	99.679	ENSCGRG00000003141	Msi2	100	99.679	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000008059	MSI2	88	69.340	ENSCSEG00000013557	msi2a	83	74.227	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000008059	MSI2	70	70.470	ENSCSEG00000013549	msi2a	88	70.470	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	84.689	ENSCSEG00000003266	-	91	81.778	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000008059	MSI2	96	92.891	ENSCVAG00000017075	msi2a	92	91.943	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	96.172	ENSDARG00000032614	msi2b	100	98.020	Danio_rerio
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	92.823	ENSDARG00000033901	msi2a	95	78.754	Danio_rerio
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	94.118	ENSDNOG00000014501	MSI2	100	99.556	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000008059	MSI2	88	81.395	ENSDORG00000005394	Msi2	84	87.817	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000008059	MSI2	70	100.000	ENSDORG00000028440	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000008059	MSI2	94	69.953	FBgn0260943	Rbp6	88	68.750	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000008059	MSI2	94	76.316	ENSETEG00000012450	-	64	76.316	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000008059	MSI2	96	81.604	ENSEBUG00000006732	msi2a	86	68.710	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSEASG00005002965	MSI2	97	88.690	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	97.179	ENSECAG00000011435	MSI2	94	97.179	Equus_caballus
ENSNLEG00000008059	MSI2	90	81.868	ENSEEUG00000007810	MSI2	100	78.967	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000008059	MSI2	96	95.261	ENSELUG00000011747	msi2a	93	93.333	Esox_lucius
ENSNLEG00000008059	MSI2	99	92.332	ENSELUG00000001361	msi2b	93	92.332	Esox_lucius
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSFCAG00000041686	MSI2	96	100.000	Felis_catus
ENSNLEG00000008059	MSI2	70	82.645	ENSFCAG00000033787	-	69	82.645	Felis_catus
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSFDAG00000016118	MSI2	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	93.301	ENSFHEG00000000084	msi2a	93	92.000	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000008059	MSI2	67	95.652	ENSGMOG00000007596	-	80	95.652	Gadus_morhua
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	98.392	ENSGALG00000005567	MSI2	94	98.392	Gallus_gallus
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	82.160	ENSGAFG00000006974	msi2a	78	95.833	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000008059	MSI2	99	96.053	ENSGAGG00000016542	MSI2	100	96.053	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSGGOG00000013182	MSI2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000008059	MSI2	96	92.417	ENSHBUG00000020800	msi2a	93	92.000	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	90.032	ENSHGLG00000012444	MSI2	89	90.032	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000008059	MSI2	70	99.020	ENSHGLG00100004028	-	88	99.020	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000008059	MSI2	85	100.000	ENSHGLG00100003744	MSI2	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	86.603	ENSHCOG00000017241	-	70	87.560	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	92.823	ENSHCOG00000000266	msi2a	91	84.691	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	96.651	ENSIPUG00000003732	msi2b	92	94.273	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000008059	MSI2	96	94.787	ENSIPUG00000021097	msi2a	93	91.556	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000008059	MSI2	99	89.667	ENSSTOG00000007884	MSI2	99	89.667	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000008059	MSI2	70	100.000	ENSJJAG00000009467	-	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000008059	MSI2	85	88.889	ENSJJAG00000006292	-	100	88.406	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	92.823	ENSKMAG00000009494	msi2a	88	91.469	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	93.301	ENSLBEG00000007061	msi2a	93	92.444	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	85.052	ENSLBEG00000026223	-	100	68.915	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000008059	MSI2	70	97.101	ENSLACG00000016798	MSI2	89	97.101	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	96.172	ENSLOCG00000004675	msi2b	95	81.818	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSMFAG00000003775	MSI2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSMMUG00000002069	MSI2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSMNEG00000045275	MSI2	100	98.502	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSMLEG00000033888	MSI2	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000008059	MSI2	96	92.891	ENSMAMG00000010503	msi2a	93	90.265	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	93.780	ENSMAMG00000002488	-	85	95.833	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000008059	MSI2	96	92.417	ENSMZEG00005007676	msi2a	94	92.000	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	99.679	ENSMAUG00000003862	Msi2	94	99.679	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSMICG00000013598	-	96	100.000	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	75.000	ENSMICG00000032913	-	93	75.217	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	ENSMOCG00000005820	Msi2	94	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000008059	MSI2	99	89.545	ENSMMOG00000008348	msi2a	91	82.428	Mola_mola
ENSNLEG00000008059	MSI2	85	98.551	ENSMODG00000014790	MSI2	100	98.551	Monodelphis_domestica
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ENSNLEG00000008059	MSI2	96	92.891	ENSOMEG00000000146	msi2a	96	92.444	Oryzias_melastigma
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ENSNLEG00000008059	MSI2	95	98.086	ENSPSIG00000008618	MSI2	82	97.425	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000008059	MSI2	95	92.788	ENSPMGG00000005888	msi2a	93	91.556	Periophthalmus_magnuspinnatus
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