EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000008575 (Gene tree)
Gene ID: 100601544
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 170206 bases
Position: chr1a:2783308-2953513
Accession: 100601544
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000049118	ResIII	PF04851.15	2.2e-08	1	1
ENSNLEP00000037801	ResIII	PF04851.15	2.3e-08	1	1
ENSNLEP00000036849	ResIII	PF04851.15	2.6e-08	1	1
ENSNLEP00000028040	ResIII	PF04851.15	2.9e-08	1	1
ENSNLEP00000033292	ResIII	PF04851.15	2.9e-08	1	1
ENSNLEP00000046521	ResIII	PF04851.15	2.9e-08	1	1
ENSNLEP00000010477	ResIII	PF04851.15	2.9e-08	1	1
ENSNLEP00000049118	BRK	PF07533.16	3e-17	1	1
ENSNLEP00000036849	BRK	PF07533.16	3.2e-17	1	1
ENSNLEP00000037801	BRK	PF07533.16	3.2e-17	1	1
ENSNLEP00000046521	BRK	PF07533.16	3.3e-17	1	1
ENSNLEP00000028040	BRK	PF07533.16	3.3e-17	1	1
ENSNLEP00000010477	BRK	PF07533.16	3.3e-17	1	1
ENSNLEP00000033292	BRK	PF07533.16	3.3e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000041778	SMARCA2-209	837	-	ENSNLEP00000049290	278 (aa)	-	A0A2I3I0H2
ENSNLET00000050694	SMARCA2-202	4638	-	ENSNLEP00000046521	1545 (aa)	-	A0A2I3HSS3
ENSNLET00000031943	SMARCA2-208	849	-	ENSNLEP00000023571	282 (aa)	-	M3ZA34
ENSNLET00000037307	SMARCA2-204	4575	-	ENSNLEP00000028040	1524 (aa)	-	A0A2I3G9S8
ENSNLET00000033715	SMARCA2-207	4149	-	ENSNLEP00000049118	1382 (aa)	-	A0A2I3HZT9
ENSNLET00000056030	SMARCA2-210	783	-	ENSNLEP00000035069	260 (aa)	-	A0A2I3GUQ2
ENSNLET00000036470	SMARCA2-206	4395	-	ENSNLEP00000037801	1464 (aa)	-	A0A2I3H2N5
ENSNLET00000010989	SMARCA2-201	4647	XM_003273844	ENSNLEP00000010477	1548 (aa)	XP_003273892	G1RB80
ENSNLET00000034436	SMARCA2-205	4449	-	ENSNLEP00000036849	1482 (aa)	-	A0A2I3GZQ3
ENSNLET00000049967	SMARCA2-203	4593	-	ENSNLEP00000033292	1530 (aa)	-	A0A2I3GPU9

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle04714	Thermogenesis	KEGG
nle05225	Hepatocellular carcinoma	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	92	81.640	ENSNLEG00000012389	SMARCA4	84	79.650

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	95.802	ENSG00000080503	SMARCA2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	79.159	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	78.400	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	98	88.966	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.748	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	79.442	ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.167	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	79.310	ENSAOCG00000009647	-	97	79.068	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	79.222	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	97	78.042	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	78.904	ENSATEG00000006916	SMARCA2	90	85.862	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	98	88.675	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	79	92.119	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	89.430	ENSACAG00000002423	SMARCA2	81	93.829	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	95.605	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	95.605	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	81.130	ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.000	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	81.222	ENSAMXG00000012404	smarca2	96	80.280	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.703	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	94.703	Bos_taurus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	95.516	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	94.350	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	95.083	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	95.083	Canis_familiaris
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	80	94.330	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	98	94.330	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.703	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	94.703	Capra_hircus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.514	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	94.514	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	90.597	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	91.169	Cavia_aperea
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.707	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	94.707	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	95.672	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	95.672	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	96.823	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	96.823	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.469	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	94.469	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	98	94.059	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	95.368	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	87	90.660	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	87	90.660	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	90.070	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	87.027	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	96.110	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	96.110	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	90.381	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	90.323	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	75.604	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	96	76.144	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	93	78.378	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	76	84.511	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	81.001	ENSDARG00000008904	smarca2	80	87.322	Danio_rerio
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	93.750	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	80	98.654	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.526	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	94.526	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	80	60.870	FBgn0000212	brm	79	57.290	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	78	66.546	ENSEBUG00000002449	-	84	67.635	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	97	72.012	ENSEBUG00000011442	-	94	69.945	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.895	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	94.895	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	67	98.611	ENSEEUG00000015540	-	68	98.611	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	95	78.853	ENSELUG00000010318	smarca2	93	79.790	Esox_lucius
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.317	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	94.381	Felis_catus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	90.573	ENSFALG00000010416	SMARCA2	87	95.886	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	94.080	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	99	93.550	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	79.874	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.124	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	97	77.908	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.836	Gadus_morhua
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	96	96.656	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	89.809	Gallus_gallus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	95	75.367	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	89	96.667	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	90.127	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	81	95.807	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	96.018	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	96.018	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	79.310	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	91	85.748	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	94.353	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	99	94.480	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.835	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	95.142	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	98	75.564	ENSHCOG00000015348	-	88	85.644	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	98	80.620	ENSIPUG00000011060	smarca2	94	80.208	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.790	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	94.790	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.784	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	94.784	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	76.694	ENSKMAG00000015844	-	93	84.901	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	97	88.828	ENSLOCG00000011499	smarca2	94	88.006	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	82	98.089	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	93	97.943	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	97.990	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	97.990	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	96.110	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	96.110	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	96.358	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	96.358	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	98.370	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	98.370	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	78.696	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	80.984	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	80.425	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	91	85.669	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	82	90.411	ENSMGAG00000005160	-	100	76.644	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	95.211	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	95.211	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.466	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	94.466	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	98	79.672	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	97	78.018	Mola_mola
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	92.357	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	89.675	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	79.082	ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.421	Monopterus_albus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	93.883	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	93.883	Mus_caroli
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	93.936	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	99.441	Mus_musculus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	93.987	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	93.987	Mus_pahari
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	93.813	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	100	93.813	Mus_spretus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	83	98.595	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	98.595	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	83	93.770	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	95	93.681	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	93.350	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	93.312	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	93	69.917	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	98	87.445	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	85.421	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	83	93.508	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	80	93.349	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	93.674	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	93.674	Octodon_degus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	78.180	ENSONIG00000014163	SMARCA2	90	86.832	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	56	94.480	ENSOANG00000008299	-	95	98.248	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.483	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	94.483	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	78.553	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	78.484	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	78.818	ENSORLG00015006289	SMARCA2	98	90.736	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	80.272	ENSOMEG00000009736	-	100	80.077	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	82	98.887	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	95	98.728	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.331	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	94.331	Ovis_aries
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	97.262	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	100	97.262	Pan_paniscus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.381	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	94.444	Panthera_pardus
ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.968	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	94.968	Pan_troglodytes
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