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Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000009841 (Gene tree)
Gene ID: 100595577
Gene Symbol: PRPF3
Alias: Prp3|RP18|SNRNP90|hPrp3
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 34272 bases
Position: chr12:51822255-51856526
Accession: 100595577
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000011995	PRP3	PF08572.10	2.3e-79	1	1
ENSNLEP00000043589	PRP3	PF08572.10	5.1e-51	1	1
ENSNLEP00000043875	PWI	PF01480.17	2.9e-14	1	1
ENSNLEP00000011995	PWI	PF01480.17	3.6e-13	1	1
ENSNLEP00000043589	PWI	PF01480.17	4.4e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000012580	PRPF3-202	1929	XM_012510925	ENSNLEP00000011995	614 (aa)	XP_012366379	G1RFJ5
ENSNLET00000043823	PRPF3-203	339	-	ENSNLEP00000043875	112 (aa)	-	A0A2I3HK32
ENSNLET00000033260	PRPF3-201	1911	-	ENSNLEP00000043589	636 (aa)	-	A0A2I3HIZ6

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle03040	Spliceosome	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSG00000117360	PRPF3	90	100.000	Homo_sapiens
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	72.555	ENSAPOG00000015584	prpf3	90	73.028	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.837	ENSAMEG00000001630	PRPF3	90	99.837	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	71.924	ENSACIG00000007876	prpf3	91	71.451	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	71.767	ENSAOCG00000011449	prpf3	90	72.973	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	71.860	ENSATEG00000023583	prpf3	90	72.178	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	95.114	ENSAPLG00000002440	PRPF3	90	94.959	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	92.058	ENSACAG00000003176	PRPF3	90	92.395	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.183	ENSACLG00000020127	prpf3	90	72.698	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.585	ENSAMXG00000007306	prpf3	90	73.113	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSBTAG00000013946	PRPF3	90	100.000	Bos_taurus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	79	39.034	WBGene00010844	prp-3	72	39.394	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSCAFG00000011820	PRPF3	92	100.000	Canis_familiaris
ENSNLEG00000009841	PRPF3	89	100.000	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSCHIG00000015434	PRPF3	90	100.000	Capra_hircus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.349	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	99.107	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000009841	PRPF3	92	80.212	ENSCAPG00000017812	PRPF3	84	80.776	Cavia_aperea
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.511	ENSCPOG00000008068	PRPF3	90	99.511	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSCCAG00000026380	PRPF3	98	95.738	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.107	ENSCATG00000041778	PRPF3	100	99.107	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.837	ENSCLAG00000015009	PRPF3	90	99.837	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000009841	PRPF3	84	97.872	ENSCHOG00000011645	PRPF3	67	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	96.423	ENSCPBG00000008216	PRPF3	90	96.423	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000009841	PRPF3	57	60.112	ENSCING00000003312	-	86	60.112	Ciona_intestinalis
ENSNLEG00000009841	PRPF3	80	54.839	ENSCSAVG00000008720	-	81	55.741	Ciona_savignyi
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSCGRG00001019100	Prpf3	90	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSCGRG00000007322	Prpf3	90	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	72.527	ENSCSEG00000002532	prpf3	90	71.272	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.217	ENSCVAG00000009318	prpf3	90	72.742	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.768	ENSDARG00000086425	prpf3	100	66.667	Danio_rerio
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	88.254	ENSDNOG00000005904	PRPF3	89	89.577	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	92	99.823	ENSDORG00000008664	Prpf3	89	99.823	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000009841	PRPF3	78	52.515	FBgn0036915	Prp3	88	52.708	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	98.860	ENSETEG00000019124	PRPF3	90	98.860	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	63.278	ENSEBUG00000011680	prpf3	90	63.142	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.837	ENSEASG00005001566	PRPF3	90	99.837	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSECAG00000019840	PRPF3	99	100.000	Equus_caballus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	83	100.000	ENSEEUG00000007338	PRPF3	75	99.291	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	64.434	ENSELUG00000013624	prpf3	89	65.550	Esox_lucius
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSFCAG00000013940	PRPF3	90	100.000	Felis_catus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.674	ENSFDAG00000010365	PRPF3	90	99.674	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.955	ENSFHEG00000021746	prpf3	90	73.473	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	71.115	ENSGMOG00000008535	prpf3	90	71.429	Gadus_morhua
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	94.951	ENSGALG00000028205	PRPF3	90	94.797	Gallus_gallus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.237	ENSGAFG00000012671	prpf3	100	66.998	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	71.835	ENSGACG00000011792	prpf3	90	71.994	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	96.098	ENSGAGG00000013765	PRPF3	87	96.098	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.667	ENSHBUG00000003493	prpf3	90	73.183	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	68.352	ENSHGLG00000016033	-	87	69.055	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.674	ENSHGLG00000016569	PRPF3	90	99.674	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	69.005	ENSHGLG00100008951	-	89	90.909	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.674	ENSHGLG00100007590	PRPF3	90	99.674	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	69.316	ENSHCOG00000014058	prpf3	90	68.839	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.046	ENSIPUG00000000902	PRPF3	90	73.408	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSSTOG00000001889	PRPF3	90	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	71.429	ENSKMAG00000001390	prpf3	90	70.952	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	70.892	ENSLBEG00000026310	prpf3	90	71.767	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	82.573	ENSLACG00000010541	PRPF3	99	81.132	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.674	ENSLAFG00000004713	PRPF3	90	99.674	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSMMUG00000016301	PRPF3	98	100.000	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.107	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	99.107	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	65.041	ENSMLEG00000041065	-	86	64.390	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	72.152	ENSMAMG00000014968	prpf3	90	72.468	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	71.362	ENSMZEG00005015970	prpf3	90	70.846	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	94.951	ENSMGAG00000000707	PRPF3	90	94.797	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.837	ENSMAUG00000017112	Prpf3	90	99.837	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.674	ENSMICG00000015386	PRPF3	96	99.667	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.837	ENSMOCG00000000242	Prpf3	90	99.837	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	66.562	ENSMMOG00000016131	prpf3	90	68.285	Mola_mola
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	98.534	ENSMODG00000018774	PRPF3	95	98.534	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	70.952	ENSMALG00000007257	prpf3	90	71.270	Monopterus_albus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.511	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	100.000	Mus_caroli
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.511	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	100.000	Mus_musculus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.349	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	100.000	Mus_pahari
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.511	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	100.000	Mus_spretus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	96.248	ENSMPUG00000005080	PRPF3	90	96.254	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.350	ENSMLUG00000004646	-	90	99.350	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSNGAG00000000910	Prpf3	90	100.000	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	71.340	ENSNBRG00000003462	prpf3	90	70.872	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000009841	PRPF3	81	100.000	ENSMEUG00000008733	PRPF3	78	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.674	ENSOPRG00000010139	PRPF3	90	99.674	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.065	ENSODEG00000014412	-	90	73.108	Octodon_degus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.349	ENSODEG00000011363	-	90	99.349	Octodon_degus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	71.317	ENSONIG00000006394	prpf3	90	71.003	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	65.756	ENSOANG00000015441	PRPF3	90	65.434	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSOCUG00000011760	PRPF3	90	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.089	ENSORLG00000010330	prpf3	95	72.611	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.089	ENSORLG00020009054	prpf3	95	72.611	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.016	ENSORLG00015015016	prpf3	90	72.496	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	72.756	ENSOMEG00000000940	prpf3	90	72.276	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	93.160	ENSOGAG00000005352	PRPF3	90	93.171	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSOARG00000020798	PRPF3	90	100.000	Ovis_aries
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSPPAG00000030983	PRPF3	100	100.000	Pan_paniscus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	74.959	ENSPPAG00000043769	-	97	74.468	Pan_paniscus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSPPRG00000000731	PRPF3	90	100.000	Panthera_pardus
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSPTIG00000005516	PRPF3	90	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.977	ENSPTRG00000047819	-	89	73.486	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	99.837	ENSPANG00000000499	PRPF3	100	99.107	Papio_anubis
ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	72.943	ENSPKIG00000010501	prpf3	90	73.101	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	67.747	ENSPMGG00000007776	prpf3	89	66.613	Periophthalmus_magnuspinnatus
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