EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000010193 (Gene tree)
Gene ID: 100590413
Gene Symbol: PPARGC1B
Alias: PERC|PGC1B
Full Name: PPARG coactivator 1 beta
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 116610 bases
Position: chr2:31204470-31321079
Accession: 100590413
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000028967	RRM_1	PF00076.22	4.8e-08	1	1
ENSNLEP00000012424	RRM_1	PF00076.22	5.1e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000013031	PPARGC1B-201	3042	XM_012504565	ENSNLEP00000012424	1013 (aa)	XP_012360019	G1RGS4
ENSNLET00000052922	PPARGC1B-202	2925	-	ENSNLEP00000028967	974 (aa)	-	A0A2I3GCE5

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle04931	Insulin resistance	KEGG

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSNLEG00000016760	PPARGC1A	59	48.201

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSG00000109819	PPARGC1A	56	51.042	Homo_sapiens
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	94.824	ENSG00000155846	PPARGC1B	100	94.824	Homo_sapiens
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSAMEG00000010421	PPARGC1A	56	51.042	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	82.091	ENSAMEG00000005287	PPARGC1B	100	81.801	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	52	50.676	ENSAOCG00000006754	ppargc1a	70	50.676	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	52	50.676	ENSAPEG00000022574	ppargc1a	69	50.676	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	98	49.125	ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	48.599	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	52	49.640	ENSAPLG00000005303	PPARGC1A	55	51.042	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	53	51.145	ENSACAG00000000741	PPARGC1A	57	51.042	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	47.470	ENSACAG00000015737	PPARGC1B	99	46.685	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	90.341	ENSANAG00000021830	PPARGC1B	100	90.537	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSANAG00000035930	PPARGC1A	59	48.201	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	56	44.199	ENSAMXG00000002461	ppargc1a	57	51.020	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	79.477	ENSBTAG00000012943	PPARGC1B	100	79.477	Bos_taurus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	47.482	ENSBTAG00000017024	PPARGC1A	57	51.042	Bos_taurus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	54	51.042	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	89.571	ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	88.317	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	81.818	ENSCAFG00000018275	PPARGC1B	100	81.528	Canis_familiaris
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSCAFG00000016519	PPARGC1A	56	51.042	Canis_familiaris
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	50	48.201	ENSCAFG00020027242	PPARGC1A	57	51.136	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	81.508	ENSCAFG00020023524	PPARGC1B	100	81.206	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	79.090	ENSCHIG00000004409	PPARGC1B	100	79.090	Capra_hircus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSCHIG00000015991	PPARGC1A	57	51.042	Capra_hircus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSTSYG00000010439	PPARGC1A	56	51.042	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	97	75.805	ENSTSYG00000034354	PPARGC1B	100	77.140	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	98	78.373	ENSCAPG00000008859	PPARGC1B	99	78.373	Cavia_aperea
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSCPOG00000001518	PPARGC1A	56	51.042	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	77.273	ENSCPOG00000001958	PPARGC1B	100	77.317	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSCCAG00000024681	PPARGC1A	53	51.042	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	90.723	ENSCCAG00000026909	PPARGC1B	100	90.430	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSCATG00000032575	PPARGC1A	59	48.201	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	92.792	ENSCATG00000030402	PPARGC1B	100	92.893	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	77.027	ENSCLAG00000015452	PPARGC1B	100	77.220	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	56	51.042	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSCSAG00000016575	PPARGC1A	56	51.042	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	98	93.788	ENSCSAG00000011792	PPARGC1B	100	93.687	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	63	76.190	ENSCHOG00000005517	-	68	76.190	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	99	48.997	ENSCPBG00000007891	PPARGC1B	99	47.966	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSCANG00000033426	PPARGC1A	59	48.201	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	91.910	ENSCANG00000037487	PPARGC1B	100	92.105	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	50	48.855	ENSCGRG00001015534	Ppargc1a	57	50.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	98	76.048	ENSCGRG00001017949	Ppargc1b	96	76.048	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	50	48.855	ENSCGRG00000000200	Ppargc1a	57	50.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	98	75.549	ENSCGRG00000008387	Ppargc1b	99	75.549	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	52	48.649	ENSCSEG00000006884	ppargc1a	68	48.649	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	53	52.101	ENSDARG00000101569	ppargc1b	73	52.893	Danio_rerio
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	51.880	ENSDARG00000067829	ppargc1a	66	50.360	Danio_rerio
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	54	48.201	ENSDNOG00000041106	PPARGC1A	56	51.042	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	95	81.040	ENSDNOG00000005985	PPARGC1B	97	80.734	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSDORG00000016276	Ppargc1a	56	51.042	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	77.250	ENSDORG00000012605	Ppargc1b	100	77.452	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSEASG00005007984	PPARGC1A	56	51.042	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	81.300	ENSEASG00005002826	PPARGC1B	100	80.500	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	80.732	ENSECAG00000019769	PPARGC1B	83	80.829	Equus_caballus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSECAG00000009164	PPARGC1A	56	51.042	Equus_caballus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	56	42.132	ENSEEUG00000009219	PPARGC1A	58	51.042	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	79	72.355	ENSEEUG00000014903	PPARGC1B	86	72.355	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	66	50.000	ENSELUG00000014929	ppargc1b	74	44.094	Esox_lucius
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	55	41.026	ENSFCAG00000000043	PPARGC1A	64	51.042	Felis_catus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	97	48.930	ENSFALG00000008858	PPARGC1B	99	49.756	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	97	77.327	ENSFDAG00000008719	PPARGC1B	99	77.525	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSFDAG00000005659	PPARGC1A	54	51.042	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	52	49.640	ENSGALG00000042851	PPARGC1A	55	50.000	Gallus_gallus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	91	67.532	ENSGAGG00000012870	PPARGC1B	98	66.667	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSGGOG00000009810	PPARGC1A	56	51.042	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	99	93.367	ENSGGOG00000009505	PPARGC1B	100	94.790	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	53	50.676	ENSHBUG00000005269	ppargc1a	71	50.676	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	78.447	ENSHGLG00000005967	PPARGC1B	100	78.738	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.921	ENSHGLG00000007022	PPARGC1A	57	51.042	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.921	ENSHGLG00100000133	PPARGC1A	56	51.042	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	77.868	ENSHGLG00100010588	PPARGC1B	100	78.274	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	53	50.413	ENSIPUG00000001584	Ppargc1b	82	39.873	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.921	ENSSTOG00000012522	PPARGC1A	56	51.042	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	80.865	ENSSTOG00000024758	PPARGC1B	100	81.317	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	76.488	ENSJJAG00000018633	Ppargc1b	100	76.683	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	97	36.699	ENSLACG00000011232	PPARGC1B	100	35.782	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	54	52.027	ENSLACG00000014054	PPARGC1A	59	53.571	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	69	45.860	ENSLOCG00000012195	ppargc1b	92	45.860	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	53	50.676	ENSLOCG00000012350	ppargc1a	70	50.676	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.921	ENSLAFG00000012981	PPARGC1A	54	50.000	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	98	79.447	ENSLAFG00000012339	PPARGC1B	99	79.765	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	92.871	ENSMFAG00000042269	PPARGC1B	100	92.969	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSMFAG00000000534	PPARGC1A	59	48.201	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSMMUG00000001844	PPARGC1A	58	51.042	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	92.871	ENSMMUG00000004749	PPARGC1B	100	92.969	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	92.578	ENSMNEG00000034121	PPARGC1B	100	92.676	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSMNEG00000028682	PPARGC1A	59	48.201	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	97	93.687	ENSMLEG00000040973	PPARGC1B	100	93.788	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSMLEG00000034233	PPARGC1A	59	48.201	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	52	50.360	ENSMGAG00000012485	PPARGC1A	55	51.042	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	82	69.355	ENSMGAG00000003134	PPARGC1B	86	69.531	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	75.170	ENSMAUG00000014191	Ppargc1b	100	75.073	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	50	49.618	ENSMAUG00000011811	Ppargc1a	57	50.000	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSMICG00000015390	PPARGC1A	60	48.201	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	82.715	ENSMICG00000002702	PPARGC1B	100	82.715	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	52	46.939	ENSMOCG00000008765	Ppargc1a	55	50.000	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	75.194	ENSMOCG00000014885	Ppargc1b	100	75.194	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	47.482	ENSMODG00000000549	PPARGC1A	56	52.083	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	98	57.102	ENSMODG00000009891	PPARGC1B	99	56.597	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	75.752	MGP_CAROLIEiJ_G0022323	Ppargc1b	100	75.752	Mus_caroli
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	50	48.855	MGP_CAROLIEiJ_G0027213	Ppargc1a	56	51.087	Mus_caroli
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	50	48.855	ENSMUSG00000029167	Ppargc1a	56	51.087	Mus_musculus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	75.581	ENSMUSG00000033871	Ppargc1b	100	75.581	Mus_musculus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	50	49.618	MGP_PahariEiJ_G0016995	Ppargc1a	55	51.087	Mus_pahari
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	74.349	MGP_PahariEiJ_G0019053	Ppargc1b	100	74.349	Mus_pahari
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	50	48.855	MGP_SPRETEiJ_G0028208	Ppargc1a	56	51.087	Mus_spretus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	75.584	MGP_SPRETEiJ_G0023235	Ppargc1b	100	75.584	Mus_spretus
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ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	89	78.158	ENSMLUG00000013169	PPARGC1B	97	77.944	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	50	49.618	ENSNGAG00000015090	Ppargc1a	56	50.000	Nannospalax_galili
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ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	53	50.676	ENSNBRG00000023403	ppargc1a	71	50.676	Neolamprologus_brichardi
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ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	94.922	ENSPPYG00000015938	PPARGC1B	100	94.922	Pongo_abelii
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ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	71	78.641	ENSPCAG00000012171	PPARGC1B	71	79.417	Procavia_capensis
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ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSPCOG00000022858	PPARGC1A	64	48.201	Propithecus_coquereli
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ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	81.305	ENSPVAG00000001308	PPARGC1B	100	81.207	Pteropus_vampyrus
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ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	54	50.833	ENSPNAG00000023871	ppargc1b	67	55.172	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	56	44.199	ENSPNAG00000010393	ppargc1a	61	51.020	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	52	46.939	ENSRNOG00000004473	Ppargc1a	57	50.000	Rattus_norvegicus
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ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	89.844	ENSSBOG00000028738	PPARGC1B	100	89.941	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	52	50.676	ENSSPAG00000023514	ppargc1a	69	50.676	Stegastes_partitus
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ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	51	48.201	ENSVVUG00000013365	PPARGC1A	56	51.042	Vulpes_vulpes
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ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	97	40.059	ENSXETG00000012711	ppargc1b	96	45.217	Xenopus_tropicalis