EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000010679 (Gene tree)
Gene ID: 100580626
Gene Symbol: EFL1
Alias: EFTUD1|FAM42A|FLJ13119|HsT19294|RIA1
Full Name: elongation factor like GTPase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 343023 bases
Position: chr6:101707578-102050600
Accession: 100580626
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000012974	GTP_EFTU	PF00009.27	1.6e-32	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000034264	EFL1-202	1380	-	ENSNLEP00000037165	459 (aa)	-	A0A2I3H0X7
ENSNLET00000013611	EFL1-201	3114	XM_012507504	ENSNLEP00000012974	1037 (aa)	XP_012362958	G1RIB8

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000010679	EFL1	73	31.461	ENSNLEG00000002981	-	77	31.461

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	98.844	ENSG00000140598	EFL1	97	98.844	Homo_sapiens
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	66.478	ENSAPOG00000000188	efl1	97	66.225	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	92.352	ENSAMEG00000006031	EFL1	93	92.352	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	67.622	ENSACIG00000017802	efl1	93	67.908	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	66.603	ENSAOCG00000023933	efl1	93	66.509	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	67.233	ENSAPEG00000000262	efl1	93	67.139	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	67.205	ENSATEG00000012373	efl1	93	67.110	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	78.215	ENSAPLG00000011147	EFL1	93	78.215	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	73.905	ENSACAG00000011040	EFL1	93	73.905	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	97.495	ENSANAG00000027459	EFL1	97	97.495	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	66.826	ENSACLG00000025780	efl1	93	66.826	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	68.461	ENSAMXG00000019529	efl1	97	68.302	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	91.022	ENSBTAG00000003410	EFL1	93	91.022	Bos_taurus
ENSNLEG00000010679	EFL1	93	31.232	WBGene00010732	K10C3.5	83	57.658	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000010679	EFL1	84	100.000	ENSCJAG00000015607	-	90	100.000	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	91.587	ENSCAFG00000013671	EFL1	93	91.587	Canis_familiaris
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	91.117	ENSCHIG00000001883	EFL1	93	91.117	Capra_hircus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	94.701	ENSTSYG00000000348	EFL1	97	94.701	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	75.928	ENSCAPG00000017944	EFL1	92	75.737	Cavia_aperea
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.962	ENSCPOG00000001924	EFL1	93	89.962	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	97.784	ENSCCAG00000034450	EFL1	97	97.784	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	97.206	ENSCATG00000031678	-	97	97.206	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.771	ENSCLAG00000010155	EFL1	93	89.771	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	97.303	ENSCSAG00000015165	EFL1	93	97.303	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000010679	EFL1	78	91.978	ENSCHOG00000014029	EFL1	78	91.978	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	78.376	ENSCPBG00000017638	EFL1	92	78.376	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000010679	EFL1	94	60.169	ENSCSAVG00000001787	-	97	54.657	Ciona_savignyi
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	97.495	ENSCANG00000038093	EFL1	97	97.495	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	86.138	ENSCGRG00001010826	Efl1	92	86.138	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	90.249	ENSCGRG00000003273	Efl1	93	90.249	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	63.654	ENSCSEG00000005856	efl1	92	63.749	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	66.029	ENSCVAG00000011863	efl1	95	65.521	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	69.038	ENSDARG00000079672	efl1	91	68.942	Danio_rerio
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	92.734	ENSDNOG00000006097	EFL1	93	92.734	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	87.966	ENSDORG00000000719	Efl1	93	88.050	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	43.482	FBgn0053158	CG33158	92	43.318	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	82.981	ENSETEG00000004309	EFL1	100	82.981	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000010679	EFL1	83	65.706	ENSEBUG00000010738	efl1	91	65.706	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	89.499	ENSEASG00005007108	EFL1	93	89.499	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	89.306	ENSECAG00000016354	EFL1	97	89.220	Equus_caballus
ENSNLEG00000010679	EFL1	75	85.920	ENSEEUG00000006326	EFL1	79	85.920	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	62.862	ENSELUG00000002520	efl1	93	62.488	Esox_lucius
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.499	ENSFCAG00000007741	EFL1	97	89.499	Felis_catus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	77.032	ENSFALG00000011103	EFL1	93	77.032	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	88.995	ENSFDAG00000009023	EFL1	93	88.995	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	65.807	ENSFHEG00000017795	efl1	93	65.807	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	63.193	ENSGMOG00000005041	efl1	93	63.098	Gadus_morhua
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	77.243	ENSGALG00000006225	EFL1	93	77.243	Gallus_gallus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	65.810	ENSGACG00000012495	efl1	100	65.257	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	78.699	ENSGAGG00000022841	EFL1	97	78.335	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000010679	EFL1	96	95.495	ENSGGOG00000005017	EFL1	93	95.495	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	66.667	ENSHBUG00000022667	efl1	93	66.952	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	86.329	ENSHGLG00000011798	EFL1	92	86.329	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	90.057	ENSHGLG00100010319	EFTUD1	93	90.057	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	66.855	ENSHCOG00000007325	efl1	93	66.573	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	66.827	ENSIPUG00000023360	EFTUD1	97	66.827	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000010679	EFL1	96	92.223	ENSSTOG00000022945	EFL1	91	92.223	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.866	ENSJJAG00000018598	Efl1	93	89.866	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	65.817	ENSLBEG00000015269	efl1	93	65.534	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	70.943	ENSLACG00000016121	EFL1	93	70.943	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	70.532	ENSLOCG00000012862	efl1	91	70.057	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.971	ENSLAFG00000012504	EFL1	93	89.971	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	97.206	ENSMFAG00000032657	-	97	97.206	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	97.206	ENSMMUG00000023353	EFL1	97	97.206	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	97.399	ENSMNEG00000041671	-	97	97.399	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	97.303	ENSMLEG00000033735	EFL1	97	97.303	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	67.110	ENSMAMG00000011336	efl1	93	66.825	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	66.730	ENSMZEG00005003012	efl1	93	67.016	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	77.958	ENSMGAG00000007991	EFL1	100	74.656	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.771	ENSMAUG00000010709	Efl1	93	89.771	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	94.231	ENSMICG00000027853	EFL1	97	94.231	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.293	ENSMOCG00000007470	Efl1	93	89.293	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	64.510	ENSMMOG00000015370	efl1	97	64.415	Mola_mola
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	83.699	ENSMODG00000019386	EFL1	93	83.699	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	66.009	ENSMALG00000018810	efl1	93	65.915	Monopterus_albus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.484	MGP_CAROLIEiJ_G0029936	Efl1	93	89.484	Mus_caroli
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.579	ENSMUSG00000038563	Efl1	93	89.579	Mus_musculus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.197	MGP_PahariEiJ_G0013157	Efl1	93	89.197	Mus_pahari
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.189	MGP_SPRETEiJ_G0031038	Efl1	92	89.189	Mus_spretus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	88.241	ENSMPUG00000015494	EFL1	93	88.241	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	90.144	ENSNGAG00000017740	Efl1	93	90.144	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000010679	EFL1	62	75.966	ENSMEUG00000012049	-	64	75.966	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000010679	EFL1	60	97.727	ENSOPRG00000012488	-	56	97.727	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.197	ENSODEG00000016193	EFL1	93	89.197	Octodon_degus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	66.635	ENSONIG00000003394	efl1	93	66.635	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	90.202	ENSOCUG00000012163	EFL1	93	90.202	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000010679	EFL1	68	63.675	ENSORLG00000020390	efl1	100	64.095	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	70.588	ENSORLG00015012031	efl1	92	65.742	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	66.220	ENSOMEG00000022784	efl1	92	66.029	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	91.317	ENSOARG00000014452	EFL1	93	91.317	Ovis_aries
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	92.768	ENSPPAG00000039672	EFL1	97	92.768	Pan_paniscus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	90.173	ENSPPRG00000002193	EFL1	97	90.173	Panthera_pardus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.981	ENSPTIG00000007053	EFL1	97	89.981	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	98.266	ENSPTRG00000007374	EFL1	97	98.266	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	97.399	ENSPANG00000015635	-	97	97.399	Papio_anubis
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	74.903	ENSPKIG00000018456	efl1	99	63.836	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	78.491	ENSPSIG00000007790	EFL1	93	78.491	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	60.598	ENSPMAG00000002026	efl1	100	60.224	Petromyzon_marinus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	83.683	ENSPCIG00000004372	EFL1	93	83.683	Phascolarctos_cinereus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	65.842	ENSPFOG00000018687	efl1	93	65.717	Poecilia_formosa
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	65.937	ENSPLAG00000001988	efl1	93	65.812	Poecilia_latipinna
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	66.157	ENSPMEG00000000402	efl1	93	66.126	Poecilia_mexicana
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	66.412	ENSPREG00000022085	efl1	93	66.381	Poecilia_reticulata
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	98.651	ENSPPYG00000006724	EFL1	93	98.651	Pongo_abelii
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	90.743	ENSPVAG00000003189	EFL1	93	90.743	Pteropus_vampyrus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	61.487	ENSPNYG00000019406	efl1	92	61.678	Pundamilia_nyererei
ENSNLEG00000010679	EFL1	99	69.245	ENSPNAG00000012104	efl1	93	69.565	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	89.101	ENSRNOG00000032723	Efl1	93	89.101	Rattus_norvegicus
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	97.495	ENSRBIG00000040576	EFL1	97	97.495	Rhinopithecus_bieti
ENSNLEG00000010679	EFL1	100	93.256	ENSRROG00000031475	EFL1	92	93.256	Rhinopithecus_roxellana
ENSNLEG00000010679	EFL1	96	44.386	YNL163C	RIA1	79	44.413	Saccharomyces_cerevisiae
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