EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000011181 (Gene tree)
Gene ID: 100586649
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 40856 bases
Position: chr12:5206828-5247683
Accession: 100586649
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000013638	PAZ	PF02170.22	1.3e-28	1	1
ENSNLEP00000036625	PAZ	PF02170.22	2.9e-28	1	1
ENSNLEP00000013638	Piwi	PF02171.17	1.7e-110	1	1
ENSNLEP00000036625	Piwi	PF02171.17	2.3e-95	1	2
ENSNLEP00000036625	Piwi	PF02171.17	2.3e-95	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000046336	AGO1-202	2508	-	ENSNLEP00000036625	835 (aa)	-	A0A2I3GZE6
ENSNLET00000014315	AGO1-201	7494	XM_003273413	ENSNLEP00000013638	857 (aa)	XP_003273461	G1RK81

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000011181	AGO1	98	83.489	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	83.489
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	81.047	ENSNLEG00000027092	AGO3	99	81.047
ENSNLEG00000011181	AGO1	98	79.714	ENSNLEG00000001461	AGO2	98	78.463

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSG00000092847	AGO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	ENSAPOG00000024299	ago1	100	96.154	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	99.883	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000011181	AGO1	82	92.023	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	ENSAOCG00000017727	ago1	100	96.154	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	ENSAPEG00000004458	ago1	100	96.154	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	ENSATEG00000008523	ago1	100	96.154	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	93.677	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.677	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000011181	AGO1	91	99.872	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSANAG00000037711	AGO1	100	99.883	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	95.921	ENSACLG00000000890	ago1	100	95.921	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000011181	AGO1	80	98.542	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.767	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.767	Bos_taurus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	99.883	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	99.883	Canis_familiaris
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	98.250	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	98.956	ENSCHIG00000011848	-	100	98.956	Capra_hircus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	78.646	ENSTSYG00000032426	-	100	78.646	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000011181	AGO1	89	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	Cavia_aperea
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.883	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	99.883	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.301	ENSCATG00000031521	AGO1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.883	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	99.883	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000011181	AGO1	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.650	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.650	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSCANG00000039798	AGO1	100	99.883	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	99.883	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	100.000	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	94.780	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.780	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	95.921	ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.921	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.503	ENSDARG00000092644	ago1	100	96.503	Danio_rerio
ENSNLEG00000011181	AGO1	91	100.000	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000011181	AGO1	93	98.673	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000011181	AGO1	84	93.065	ENSETEG00000007626	AGO1	100	93.065	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSEASG00005012086	AGO1	100	99.883	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSECAG00000024353	AGO1	100	99.883	Equus_caballus
ENSNLEG00000011181	AGO1	92	91.614	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000011181	AGO1	91	97.059	ENSELUG00000016803	ago1	100	97.059	Esox_lucius
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	99.883	Felis_catus
ENSNLEG00000011181	AGO1	91	92.219	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.767	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	92.680	ENSFHEG00000017927	ago1	99	92.680	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000011181	AGO1	87	84.646	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.646	Gadus_morhua
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.767	ENSGALG00000002249	AGO1	100	99.767	Gallus_gallus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.270	ENSGAFG00000009775	ago1	100	96.270	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000011181	AGO1	87	97.204	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000011181	AGO1	91	99.872	ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	99.883	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	95.921	ENSHBUG00000010459	ago1	100	95.921	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	99.883	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	99.883	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	96.576	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.576	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	ENSIPUG00000023216	ago1	100	96.154	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	99.883	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.767	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	99.767	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	ENSKMAG00000019464	ago1	100	96.154	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.270	ENSLBEG00000007694	ago1	100	96.270	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	93.522	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.522	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	94.056	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.056	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	99.882	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.882	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	99.883	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	97.599	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	97.818	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	98.571	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	99.883	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	ENSMAMG00000008381	ago1	100	96.154	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	95.921	ENSMZEG00005007996	ago1	100	95.921	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	94.179	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.179	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	99.883	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSMICG00000016147	AGO1	100	99.883	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.767	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	99.767	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000011181	AGO1	78	98.657	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.533	ENSMODG00000023335	AGO1	100	99.533	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	96.458	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.539	Monopterus_albus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.883	Mus_caroli
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	99.883	Mus_musculus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.883	Mus_pahari
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.883	Mus_spretus
ENSNLEG00000011181	AGO1	84	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000011181	AGO1	63	99.425	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.425	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.650	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	99.650	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000011181	AGO1	91	97.059	ENSNBRG00000010867	ago1	100	97.059	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000011181	AGO1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000011181	AGO1	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSODEG00000005321	AGO1	100	99.883	Octodon_degus
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	96.340	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.340	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	90.888	ENSOANG00000002080	AGO1	100	91.860	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.767	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	99.767	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	ENSORLG00000014965	ago1	100	96.154	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	ENSORLG00020018253	ago1	100	96.154	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	ENSORLG00015003287	ago1	100	96.154	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	ENSOMEG00000020528	ago1	100	96.154	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000011181	AGO1	99	99.882	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	99.882	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.767	ENSOARG00000019591	AGO1	100	99.767	Ovis_aries
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	99.883	Pan_paniscus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	99.883	Panthera_pardus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.650	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	99.650	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	99.883	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSPANG00000009060	AGO1	100	99.883	Papio_anubis
ENSNLEG00000011181	AGO1	98	99.050	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000011181	AGO1	80	97.384	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.533	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.533	Phascolarctos_cinereus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.270	ENSPFOG00000005867	ago1	100	96.270	Poecilia_formosa
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.270	ENSPLAG00000002824	ago1	99	98.119	Poecilia_latipinna
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.270	ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	Poecilia_mexicana
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.270	ENSPREG00000006534	ago1	100	96.270	Poecilia_reticulata
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSPPYG00000001551	AGO1	100	99.883	Pongo_abelii
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ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSPVAG00000005082	AGO1	100	99.883	Pteropus_vampyrus
ENSNLEG00000011181	AGO1	91	92.219	ENSPNYG00000012586	ago1	100	92.219	Pundamilia_nyererei
ENSNLEG00000011181	AGO1	93	92.356	ENSPNAG00000000597	ago1	99	92.356	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.767	ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.767	Rattus_norvegicus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSRBIG00000032611	AGO1	100	99.883	Rhinopithecus_bieti
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	ENSRROG00000044469	AGO1	100	99.883	Rhinopithecus_roxellana
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ENSNLEG00000011181	AGO1	84	99.445	ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	Tupaia_belangeri
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ENSNLEG00000011181	AGO1	91	96.419	ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	Xiphophorus_couchianus
ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.270	ENSXMAG00000021899	ago1	100	96.270	Xiphophorus_maculatus