EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000012334 (Gene tree)
Gene ID: 100598545
Gene Symbol: REXO5
Alias: NEF-sp
Full Name: RNA exonuclease 5
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 44522 bases
Position: chr2:89119366-89163887
Accession: 100598545
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000046831	RRM_1	PF00076.22	8.2e-12	1	1
ENSNLEP00000014991	RNase_T	PF00929.24	4.9e-07	1	1
ENSNLEP00000046831	RNase_T	PF00929.24	5.4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000036062	REXO5-201	2902	XM_003261462	ENSNLEP00000046831	774 (aa)	XP_003261510	A0A2I3HTM1
ENSNLET00000015741	REXO5-202	2697	XM_003261464	ENSNLEP00000014991	743 (aa)	XP_003261512	G1RP27

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	97.933	ENSG00000005189	REXO5	100	98.601	Homo_sapiens
ENSNLEG00000012334	REXO5	96	33.621	ENSAPOG00000008514	REXO5	97	33.867	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	85.548	ENSAMEG00000006178	REXO5	100	85.548	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000012334	REXO5	50	41.114	ENSAOCG00000003481	-	77	40.244	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000012334	REXO5	96	34.860	ENSAPEG00000010627	REXO5	98	34.860	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000012334	REXO5	77	37.236	ENSATEG00000004682	REXO5	97	38.856	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000012334	REXO5	94	49.001	ENSAPLG00000015740	REXO5	99	49.001	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000012334	REXO5	98	45.013	ENSACAG00000009744	REXO5	97	45.013	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	90.323	ENSANAG00000034379	REXO5	100	90.323	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000012334	REXO5	77	35.177	ENSACLG00000004778	REXO5	99	35.177	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	82.581	ENSBTAG00000006449	REXO5	98	82.581	Bos_taurus
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	90.065	ENSCJAG00000009363	REXO5	100	90.065	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	85.013	ENSCAFG00000017924	REXO5	100	85.013	Canis_familiaris
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	82.946	ENSCAFG00020021846	REXO5	99	82.946	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	83.871	ENSCHIG00000022443	REXO5	99	83.871	Capra_hircus
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	73.677	ENSCPOG00000008940	REXO5	95	73.677	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	92.742	ENSCCAG00000034936	REXO5	100	92.742	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	95.725	ENSCATG00000044063	REXO5	100	95.725	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	76.516	ENSCLAG00000008033	REXO5	95	76.516	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	95.596	ENSCSAG00000007562	REXO5	100	95.596	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000012334	REXO5	77	89.899	ENSCHOG00000009146	-	79	89.899	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000012334	REXO5	97	48.148	ENSCPBG00000019062	REXO5	98	48.148	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	95.337	ENSCANG00000035776	REXO5	100	95.337	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000012334	REXO5	98	72.164	ENSCGRG00001016179	-	99	72.164	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000012334	REXO5	98	71.879	ENSCGRG00000010868	-	98	71.771	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000012334	REXO5	94	83.539	ENSEASG00005007266	REXO5	100	85.842	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	84.000	ENSECAG00000018769	REXO5	89	84.000	Equus_caballus
ENSNLEG00000012334	REXO5	84	73.099	ENSEEUG00000003572	REXO5	89	73.099	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	83.871	ENSFCAG00000015160	REXO5	100	83.871	Felis_catus
ENSNLEG00000012334	REXO5	93	47.664	ENSFALG00000014026	REXO5	99	47.664	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000012334	REXO5	98	32.410	ENSFHEG00000013388	REXO5	99	32.410	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000012334	REXO5	96	46.323	ENSGALG00000002239	REXO5	98	46.452	Gallus_gallus
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	33.176	ENSGAFG00000011045	REXO5	98	33.176	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000012334	REXO5	56	39.151	ENSGACG00000019507	-	92	39.151	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000012334	REXO5	94	48.797	ENSGAGG00000008242	REXO5	94	48.797	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	97.804	ENSGGOG00000004539	REXO5	100	97.804	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000012334	REXO5	91	34.954	ENSHBUG00000017976	REXO5	92	34.954	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000012334	REXO5	86	77.130	ENSHGLG00000012652	REXO5	99	77.130	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	74.677	ENSHGLG00100013255	REXO5	100	76.149	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000012334	REXO5	72	38.246	ENSHCOG00000008648	REXO5	93	38.645	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000012334	REXO5	86	73.463	ENSSTOG00000007071	REXO5	97	73.463	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000012334	REXO5	95	71.138	ENSJJAG00000023821	-	96	71.138	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	33.052	ENSKMAG00000009488	REXO5	99	33.052	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	32.616	ENSLBEG00000009276	REXO5	99	33.333	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000012334	REXO5	77	47.107	ENSLACG00000001758	REXO5	100	47.107	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000012334	REXO5	98	83.071	ENSLAFG00000006157	REXO5	99	83.071	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	95.855	ENSMFAG00000036613	REXO5	100	95.855	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	95.725	ENSMMUG00000016748	REXO5	100	95.725	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	95.855	ENSMNEG00000045028	REXO5	100	95.855	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	95.725	ENSMLEG00000029851	REXO5	100	95.725	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000012334	REXO5	94	33.796	ENSMAMG00000006915	REXO5	92	33.796	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000012334	REXO5	91	34.342	ENSMZEG00005013657	REXO5	92	34.342	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000012334	REXO5	94	47.757	ENSMGAG00000010369	REXO5	99	47.757	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	86.694	ENSMICG00000014886	REXO5	100	86.694	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000012334	REXO5	59	71.991	ENSMOCG00000010062	-	100	71.991	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000012334	REXO5	98	55.177	ENSMODG00000007059	REXO5	94	55.177	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	67.788	MGP_CAROLIEiJ_G0030385	-	99	67.788	Mus_caroli
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	67.788	ENSMUSG00000030924	Rexo5	98	69.710	Mus_musculus
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	67.917	MGP_SPRETEiJ_G0031499	-	99	67.917	Mus_spretus
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	85.548	ENSMPUG00000013643	REXO5	100	85.548	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000012334	REXO5	94	71.370	ENSNGAG00000002025	-	98	74.833	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000012334	REXO5	66	37.925	ENSNBRG00000006877	REXO5	81	37.925	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000012334	REXO5	93	54.372	ENSMEUG00000015298	REXO5	99	54.372	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000012334	REXO5	90	68.773	ENSOPRG00000011398	REXO5	90	68.773	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000012334	REXO5	91	35.007	ENSONIG00000000148	REXO5	97	39.437	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000012334	REXO5	93	55.495	ENSOANG00000014291	REXO5	100	55.495	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	80.645	ENSOCUG00000009913	REXO5	99	80.645	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000012334	REXO5	91	34.570	ENSORLG00000009738	REXO5	93	34.570	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000012334	REXO5	91	35.247	ENSORLG00020010270	REXO5	93	35.247	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000012334	REXO5	91	34.788	ENSORLG00015009678	REXO5	93	34.788	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000012334	REXO5	90	36.119	ENSOMEG00000019491	REXO5	91	36.119	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	82.968	ENSOGAG00000011564	REXO5	100	82.968	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	84.000	ENSOARG00000013401	REXO5	100	83.875	Ovis_aries
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	97.416	ENSPPAG00000035005	REXO5	100	97.416	Pan_paniscus
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	80.774	ENSPPRG00000022345	REXO5	100	81.032	Panthera_pardus
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	84.129	ENSPTIG00000012096	REXO5	100	84.387	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	97.416	ENSPTRG00000007851	REXO5	100	97.416	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	95.596	ENSPANG00000006898	REXO5	99	95.596	Papio_anubis
ENSNLEG00000012334	REXO5	91	39.004	ENSPKIG00000014406	REXO5	94	39.004	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNLEG00000012334	REXO5	93	48.113	ENSPSIG00000012172	REXO5	94	48.113	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	54.759	ENSPCIG00000029238	-	99	55.528	Phascolarctos_cinereus
ENSNLEG00000012334	REXO5	97	32.084	ENSPFOG00000012767	REXO5	98	32.381	Poecilia_formosa
ENSNLEG00000012334	REXO5	97	32.084	ENSPLAG00000006408	REXO5	98	32.381	Poecilia_latipinna
ENSNLEG00000012334	REXO5	97	32.353	ENSPMEG00000007726	REXO5	98	32.656	Poecilia_mexicana
ENSNLEG00000012334	REXO5	88	33.639	ENSPREG00000000146	REXO5	90	33.639	Poecilia_reticulata
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	97.804	ENSPPYG00000007163	REXO5	100	97.804	Pongo_abelii
ENSNLEG00000012334	REXO5	91	77.889	ENSPCAG00000006265	REXO5	100	77.889	Procavia_capensis
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	85.753	ENSPCOG00000018775	REXO5	100	85.753	Propithecus_coquereli
ENSNLEG00000012334	REXO5	94	83.128	ENSPVAG00000003293	REXO5	100	83.128	Pteropus_vampyrus
ENSNLEG00000012334	REXO5	71	38.036	ENSPNYG00000006922	REXO5	75	38.036	Pundamilia_nyererei
ENSNLEG00000012334	REXO5	90	35.440	ENSPNAG00000018866	-	92	35.440	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000012334	REXO5	97	69.507	ENSRNOG00000014513	Rexo5	98	69.507	Rattus_norvegicus
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	95.207	ENSRBIG00000035163	REXO5	89	95.207	Rhinopithecus_bieti
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	94.948	ENSRROG00000034741	REXO5	100	94.948	Rhinopithecus_roxellana
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	91.532	ENSSBOG00000029650	REXO5	100	91.532	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNLEG00000012334	REXO5	97	57.833	ENSSHAG00000005042	REXO5	97	57.833	Sarcophilus_harrisii
ENSNLEG00000012334	REXO5	91	41.086	ENSSFOG00015007581	REXO5	92	41.086	Scleropages_formosus
ENSNLEG00000012334	REXO5	91	34.902	ENSSMAG00000000709	REXO5	99	34.412	Scophthalmus_maximus
ENSNLEG00000012334	REXO5	91	33.901	ENSSDUG00000014528	REXO5	91	34.420	Seriola_dumerili
ENSNLEG00000012334	REXO5	90	33.903	ENSSLDG00000007641	REXO5	90	33.945	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	85.935	ENSSSCG00000007855	REXO5	99	86.115	Sus_scrofa
ENSNLEG00000012334	REXO5	93	48.064	ENSTGUG00000009219	REXO5	99	48.064	Taeniopygia_guttata
ENSNLEG00000012334	REXO5	94	35.414	ENSTRUG00000015295	-	93	35.414	Takifugu_rubripes
ENSNLEG00000012334	REXO5	87	82.677	ENSTBEG00000008797	REXO5	90	82.677	Tupaia_belangeri
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	82.965	ENSTTRG00000016439	REXO5	99	82.965	Tursiops_truncatus
ENSNLEG00000012334	REXO5	87	80.832	ENSUAMG00000017756	REXO5	100	80.832	Ursus_americanus
ENSNLEG00000012334	REXO5	50	84.319	ENSUMAG00000010466	-	93	84.319	Ursus_maritimus
ENSNLEG00000012334	REXO5	100	80.774	ENSVPAG00000003459	REXO5	100	80.774	Vicugna_pacos
ENSNLEG00000012334	REXO5	99	85.013	ENSVVUG00000023257	REXO5	99	85.013	Vulpes_vulpes
ENSNLEG00000012334	REXO5	95	47.967	ENSXETG00000016735	rexo5	100	47.967	Xenopus_tropicalis
ENSNLEG00000012334	REXO5	77	34.189	ENSXCOG00000015997	REXO5	72	34.189	Xiphophorus_couchianus
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