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Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000015179 (Gene tree)
Gene ID: 100603408
Gene Symbol: SMARCA1
Alias: ISWI|NURF140|SNF2L|SNF2L1|SNF2LB|SWI|hSNF2L
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 83763 bases
Position: chrX:116015337-116099099
Accession: 100603408
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000018442	ResIII	PF04851.15	7.3e-12	1	1
ENSNLEP00000029689	ResIII	PF04851.15	7.4e-12	1	1
ENSNLEP00000018442	DEAD	PF00270.29	1.2e-06	1	1
ENSNLEP00000029689	DEAD	PF00270.29	1.4e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000057446	SMARCA1-201	3195	XM_012499148	ENSNLEP00000029689	1064 (aa)	XP_012354602	A0A2I3GEI6
ENSNLET00000019359	SMARCA1-202	2988	-	ENSNLEP00000018442	995 (aa)	-	G1RYW5

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	52	47.410	ENSNLEG00000012987	HELLS	78	47.410
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	56	43.523	ENSNLEG00000000179	CHD1L	61	43.523
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	95	85.489	ENSNLEG00000005383	SMARCA5	94	83.417

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	99.159	ENSG00000102038	SMARCA1	100	99.159	Homo_sapiens
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	84.043	ENSAPOG00000016035	smarca5	96	84.494	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	96.355	ENSAMEG00000015218	SMARCA1	100	96.355	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	86	84.722	ENSACIG00000016982	smarca5	97	84.633	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	84.043	ENSAOCG00000015578	smarca5	95	81.076	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	84.043	ENSAPEG00000011117	smarca5	97	84.587	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	80.622	ENSATEG00000012894	smarca5	98	80.622	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	93.122	ENSAPLG00000013149	SMARCA1	100	91.549	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	98	90.909	ENSACAG00000011376	SMARCA1	95	89.614	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	93.925	ENSANAG00000023098	SMARCA1	100	93.925	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	84.038	ENSACLG00000025356	smarca5	95	81.474	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	91	88.235	ENSAMXG00000011227	smarca1	99	89.062	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	84.452	ENSAMXG00000005709	smarca5	92	84.277	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	98	97.449	ENSBTAG00000002292	SMARCA1	99	96.857	Bos_taurus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	97	63.136	WBGene00002169	isw-1	97	62.313	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	98.785	ENSCJAG00000002868	SMARCA1	100	98.785	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	88.290	ENSCAFG00000018673	SMARCA1	98	88.352	Canis_familiaris
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	96.916	ENSCAFG00020001751	SMARCA1	100	96.916	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	95.806	ENSCHIG00000009837	SMARCA1	100	95.806	Capra_hircus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	97.376	ENSTSYG00000004240	SMARCA1	99	97.376	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	95.596	ENSCPOG00000013601	SMARCA1	94	97.065	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	96.429	ENSCCAG00000030817	SMARCA1	100	96.429	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	99.159	ENSCATG00000015921	SMARCA1	100	99.159	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	95.140	ENSCLAG00000002171	SMARCA1	100	95.140	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	97.944	ENSCSAG00000008460	SMARCA1	100	97.944	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	98	92.033	ENSCPBG00000001146	SMARCA1	94	91.098	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	74.211	ENSCING00000004110	swi/snf	97	72.497	Ciona_intestinalis
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	95	73.229	ENSCSAVG00000004620	-	100	73.497	Ciona_savignyi
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	99.065	ENSCANG00000007183	SMARCA1	100	99.065	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	94.118	ENSCGRG00001010776	Smarca1	98	94.481	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	94.306	ENSCGRG00000015301	Smarca1	99	94.306	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	96	83.612	ENSCSEG00000000328	smarca5	95	81.419	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	83.404	ENSCVAG00000008668	smarca5	97	84.000	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	97	85.040	ENSDARG00000012776	smarca1	96	85.040	Danio_rerio
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	96	82.128	ENSDARG00000052348	smarca5	95	81.994	Danio_rerio
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	98	95.821	ENSDNOG00000004315	SMARCA1	98	94.255	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	96.353	ENSDORG00000009270	Smarca1	97	94.547	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	97	71.996	FBgn0011604	Iswi	98	70.968	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	82	93.750	ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	93.750	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	93	81.711	ENSEBUG00000001239	smarca5	95	81.017	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	97	92.982	ENSEASG00005008218	SMARCA1	100	92.115	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	96.365	ENSECAG00000012106	SMARCA1	100	96.365	Equus_caballus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	80	97.306	ENSEEUG00000014927	SMARCA1	83	97.306	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	96	86.646	ENSELUG00000010515	smarca1	98	84.842	Esox_lucius
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	97.944	ENSFCAG00000018496	SMARCA1	100	97.944	Felis_catus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	91	92.771	ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.873	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	95.238	ENSFDAG00000009818	SMARCA1	99	95.238	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	83.827	ENSFHEG00000007687	smarca5	91	84.678	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	96	92.420	ENSGALG00000008431	SMARCA1	97	91.947	Gallus_gallus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	83.827	ENSGAFG00000017731	smarca5	95	81.138	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	95	92.932	ENSGAGG00000023575	SMARCA1	100	91.768	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	74	96.000	ENSGGOG00000012841	-	98	96.000	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	95.140	ENSHGLG00000003080	SMARCA1	99	96.180	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	97	96.115	ENSHGLG00100001102	SMARCA1	100	94.867	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	83.864	ENSHCOG00000005458	smarca5	95	81.038	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	95	83.158	ENSIPUG00000005229	SMARCA5	97	80.962	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	97	86.154	ENSIPUG00000016905	Smarca1	98	86.708	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	96.542	ENSSTOG00000014524	SMARCA1	100	96.542	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	96.353	ENSJJAG00000002593	Smarca1	98	94.218	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	84.076	ENSKMAG00000003777	smarca5	95	81.238	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	93	82.976	ENSLBEG00000013295	SMARCA1	100	83.944	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	95	82.914	ENSLBEG00000018112	smarca5	95	80.938	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	88.710	ENSLACG00000016697	SMARCA1	98	88.328	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	97	88.557	ENSLOCG00000014591	smarca1	96	88.426	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	95.560	ENSLAFG00000000896	SMARCA1	100	95.560	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	99.159	ENSMFAG00000002117	SMARCA1	100	99.159	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	99.159	ENSMMUG00000008818	SMARCA1	100	99.159	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	99.159	ENSMNEG00000041768	SMARCA1	100	99.159	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	99.065	ENSMLEG00000043198	SMARCA1	100	99.065	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	84.038	ENSMAMG00000014294	smarca5	96	80.910	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	84.038	ENSMZEG00005009369	smarca5	95	81.474	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	96	91.282	ENSMGAG00000007042	SMARCA1	99	90.900	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	95.753	ENSMAUG00000008133	Smarca1	97	95.910	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	97.383	ENSMICG00000015768	SMARCA1	100	97.383	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	93.860	ENSMOCG00000009464	Smarca1	97	95.716	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	95	81.466	ENSMMOG00000005547	smarca5	99	79.561	Mola_mola
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	97	91.331	ENSMODG00000013187	-	99	87.943	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	96	82.541	ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.735	Monopterus_albus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	96.158	MGP_CAROLIEiJ_G0033034	Smarca1	98	94.313	Mus_caroli
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	96.259	ENSMUSG00000031099	Smarca1	98	94.313	Mus_musculus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	96.158	MGP_PahariEiJ_G0031579	Smarca1	98	94.313	Mus_pahari
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	96.259	MGP_SPRETEiJ_G0034192	Smarca1	98	94.408	Mus_spretus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	97.570	ENSMPUG00000017423	SMARCA1	95	97.570	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	93.937	ENSMLUG00000029614	SMARCA1	100	93.377	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	97.169	ENSNGAG00000006492	Smarca1	99	96.275	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	84.144	ENSNBRG00000004463	smarca5	99	81.437	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	81.152	ENSMEUG00000008819	SMARCA1	100	81.152	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	94.895	ENSODEG00000012163	SMARCA1	99	95.798	Octodon_degus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	84.144	ENSONIG00000009993	smarca5	95	81.574	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	95	93.361	ENSOANG00000002862	SMARCA1	100	92.073	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	98	96.429	ENSOCUG00000001047	SMARCA1	98	93.619	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	83.864	ENSORLG00000021998	smarca5	95	81.138	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	83.970	ENSORLG00020017679	smarca5	95	81.433	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	83.864	ENSORLG00015017210	smarca5	95	81.038	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	94	83.864	ENSOMEG00000000086	smarca5	95	81.038	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	98	97.517	ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	97.517	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	98	96.173	ENSOARG00000014638	SMARCA1	100	96.875	Ovis_aries
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	99.159	ENSPPAG00000034647	SMARCA1	100	99.159	Pan_paniscus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	97.944	ENSPPRG00000008929	SMARCA1	100	97.944	Panthera_pardus
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	98	95.687	ENSPTIG00000000915	SMARCA1	98	96.365	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	99.159	ENSPTRG00000049876	SMARCA1	100	99.159	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	100	99.159	ENSPANG00000003871	SMARCA1	100	99.159	Papio_anubis
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	97	85.291	ENSPKIG00000013411	smarca1	99	85.291	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	98	90.817	ENSPSIG00000010101	SMARCA1	100	91.463	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000015179	SMARCA1	99	96.562	ENSPEMG00000017503	Smarca1	99	96.180	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSNLEG00000015179	SMARCA1	96	89.271	ENSXETG00000001526	smarca1	99	87.575	Xenopus_tropicalis
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