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Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000015636 (Gene tree)
Gene ID: 100592525
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29874 bases
Position: chr10:94282374-94312247
Accession: 100592525
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000018957	RRM_1	PF00076.22	1.4e-19	1	2
ENSNLEP00000018957	RRM_1	PF00076.22	1.4e-19	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000019912	MSI1-201	891	XM_012509873	ENSNLEP00000018957	296 (aa)	XP_012365327	G1S0C9

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000015636	MSI1	99	59.021	ENSNLEG00000008059	MSI2	95	66.351

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSG00000135097	MSI1	91	89.634	Homo_sapiens
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.915	ENSAPOG00000023458	-	90	75.915	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	ENSAPOG00000003191	MSI1	90	75.610	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	72.368	ENSAMEG00000013302	MSI1	99	72.368	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000015636	MSI1	96	72.063	ENSACIG00000017754	-	74	72.063	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	ENSAOCG00000003804	MSI1	90	75.610	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	67.073	ENSAOCG00000009031	-	91	67.378	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	ENSAPEG00000003245	MSI1	90	75.610	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.915	ENSAPEG00000006857	-	78	89.286	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	ENSATEG00000017059	MSI1	94	75.610	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	72.644	ENSATEG00000023779	-	90	72.644	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	86.585	ENSACAG00000002762	MSI1	90	86.585	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSANAG00000027151	MSI1	92	89.634	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000015636	MSI1	78	84.091	ENSANAG00000027901	-	81	84.091	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	ENSACLG00000000117	-	96	75.305	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	ENSACLG00000011230	MSI1	90	75.305	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	74.390	ENSAMXG00000038960	msi1	75	74.390	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSBTAG00000009800	MSI1	96	89.634	Bos_taurus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSCJAG00000008578	MSI1	91	89.634	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.329	ENSCAFG00000010283	MSI1	91	89.329	Canis_familiaris
ENSNLEG00000015636	MSI1	94	89.068	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	89.068	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	83.881	ENSCHIG00000024304	MSI1	91	83.881	Capra_hircus
ENSNLEG00000015636	MSI1	99	89.602	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	89.602	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000015636	MSI1	90	78.914	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	78.914	Cavia_aperea
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSCPOG00000012361	MSI1	96	89.634	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSCCAG00000035567	MSI1	91	89.634	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSCATG00000030019	MSI1	91	89.634	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSCLAG00000011329	MSI1	96	89.634	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000015636	MSI1	69	82.305	ENSCSAG00000002265	MSI1	84	82.305	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	85.671	ENSCPBG00000011349	MSI1	90	85.671	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSCANG00000040651	MSI1	100	89.634	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSCGRG00001018883	Msi1	91	89.634	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	89.634	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	ENSCSEG00000005834	-	90	75.610	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	74.695	ENSCSEG00000008352	-	90	74.695	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	68.293	ENSCSEG00000011032	MSI1	96	68.293	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000015636	MSI1	67	61.765	ENSCVAG00000017463	-	89	61.765	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.915	ENSCVAG00000009100	MSI1	90	75.915	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	71.951	ENSDARG00000010710	msi1	100	71.366	Danio_rerio
ENSNLEG00000015636	MSI1	67	68.122	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	57.343	Danio_rerio
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	79.573	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	79.573	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSDORG00000005610	Msi1	93	89.634	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	85.671	ENSETEG00000004756	MSI1	100	85.671	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSEASG00005004736	MSI1	91	89.634	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSECAG00000017526	MSI1	91	89.634	Equus_caballus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	71.037	ENSELUG00000023280	-	96	70.732	Esox_lucius
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	70.690	ENSELUG00000023219	MSI1	88	70.690	Esox_lucius
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSFCAG00000011007	MSI1	91	89.634	Felis_catus
ENSNLEG00000015636	MSI1	94	84.887	ENSFALG00000007574	MSI1	100	84.887	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.329	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	89.329	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.915	ENSFHEG00000003560	-	90	75.915	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	76.220	ENSFHEG00000022446	MSI1	90	76.220	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	67.378	ENSGMOG00000017838	-	90	67.378	Gadus_morhua
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	73.476	ENSGMOG00000001006	MSI1	90	73.171	Gadus_morhua
ENSNLEG00000015636	MSI1	99	76.751	ENSGALG00000007227	MSI1	90	76.751	Gallus_gallus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	68.966	ENSGAFG00000005860	-	89	68.966	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.000	ENSGAFG00000021522	MSI1	90	75.000	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	71.341	ENSGACG00000008674	-	91	71.341	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	74.695	ENSGACG00000012679	MSI1	90	74.695	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	85.671	ENSGAGG00000016037	MSI1	90	85.671	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000015636	MSI1	95	89.172	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	89.172	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	ENSHBUG00000021921	MSI1	90	75.305	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	ENSHBUG00000011841	-	90	75.305	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.329	ENSHGLG00000012782	MSI1	91	89.329	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.329	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	89.329	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	74.390	ENSHCOG00000012067	-	89	74.390	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	70.427	ENSHCOG00000012019	MSI1	96	70.427	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	73.780	ENSIPUG00000001976	msi1	97	70.122	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000015636	MSI1	94	89.068	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	89.068	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSJJAG00000010463	Msi1	91	89.634	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	72.866	ENSJJAG00000010643	-	90	72.561	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.000	ENSKMAG00000011251	MSI1	90	75.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	73.171	ENSKMAG00000019877	-	96	73.171	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	ENSLBEG00000008789	MSI1	90	75.305	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.000	ENSLBEG00000001375	-	90	75.000	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	76.829	ENSLACG00000018287	MSI1	96	76.829	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	78.788	ENSLAFG00000009412	MSI1	99	78.788	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSMFAG00000001798	MSI1	96	89.634	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSMMUG00000031527	MSI1	91	89.634	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSMNEG00000040034	MSI1	91	89.634	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	89.634	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	ENSMAMG00000018426	-	90	75.610	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	74.695	ENSMAMG00000002279	MSI1	90	74.695	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	ENSMZEG00005000340	-	90	75.305	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	ENSMZEG00005026892	MSI1	90	75.305	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000015636	MSI1	67	85.590	ENSMAUG00000016820	Msi1	94	85.590	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSMICG00000033181	MSI1	91	89.634	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.329	ENSMOCG00000002286	Msi1	91	89.329	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	65.549	ENSMMOG00000010492	MSI1	89	65.549	Mola_mola
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	72.256	ENSMMOG00000012265	-	96	72.256	Mola_mola
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	66.061	ENSMODG00000003189	-	99	66.061	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	ENSMALG00000017889	MSI1	90	75.305	Monopterus_albus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	74.695	ENSMALG00000001426	-	96	74.695	Monopterus_albus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.024	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	91	89.024	Mus_caroli
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.024	ENSMUSG00000054256	Msi1	98	85.671	Mus_musculus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	88.720	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	91	88.720	Mus_pahari
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.024	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	91	89.024	Mus_spretus
ENSNLEG00000015636	MSI1	94	89.068	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	89.068	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	82.985	ENSMLUG00000010313	MSI1	99	82.985	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	89.634	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000015636	MSI1	76	65.370	ENSNBRG00000018012	MSI1	89	58.681	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	ENSNBRG00000000841	-	90	75.305	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000015636	MSI1	86	96.528	ENSMEUG00000015759	MSI1	88	96.528	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000015636	MSI1	96	95.890	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	95.890	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSODEG00000006328	MSI1	100	89.634	Octodon_degus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	ENSONIG00000019452	-	90	75.610	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	ENSONIG00000011182	MSI1	90	75.305	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000015636	MSI1	94	88.746	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	88.746	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	ENSORLG00000029593	MSI1	90	75.610	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.915	ENSORLG00000019978	-	90	75.915	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	ENSORLG00020008266	MSI1	93	72.561	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.915	ENSORLG00020001208	-	64	75.915	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.915	ENSORLG00015013672	-	68	72.256	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	ENSORLG00015003916	MSI1	90	75.610	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	76.220	ENSOMEG00000002272	-	92	76.220	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.915	ENSOMEG00000017536	MSI1	96	72.866	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	88.822	ENSOGAG00000003847	MSI1	91	88.822	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	85.714	ENSOARG00000012097	MSI1	99	85.714	Ovis_aries
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSPPAG00000043073	MSI1	100	89.634	Pan_paniscus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSPPRG00000000370	MSI1	91	89.634	Panthera_pardus
ENSNLEG00000015636	MSI1	94	89.068	ENSPTIG00000008913	MSI1	100	89.068	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSPTRG00000005531	MSI1	91	89.634	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.329	ENSPANG00000006335	MSI1	91	89.329	Papio_anubis
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	ENSPKIG00000023575	-	90	75.610	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSNLEG00000015636	MSI1	67	78.166	ENSPSIG00000009621	-	100	78.166	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	81.402	ENSPSIG00000011608	-	88	81.402	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000015636	MSI1	96	71.111	ENSPMGG00000000514	MSI1	93	71.111	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.915	ENSPMEG00000012796	MSI1	90	75.915	Poecilia_mexicana
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.000	ENSPMEG00000007025	-	89	67.378	Poecilia_mexicana
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ENSNLEG00000015636	MSI1	95	55.516	ENSPREG00000014574	-	100	55.516	Poecilia_reticulata
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	ENSPPYG00000005027	MSI1	91	89.634	Pongo_abelii
ENSNLEG00000015636	MSI1	81	64.835	ENSPCAG00000002300	MSI1	100	64.835	Procavia_capensis
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ENSNLEG00000015636	MSI1	86	99.107	ENSPVAG00000002225	MSI1	88	99.107	Pteropus_vampyrus
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ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	ENSPNYG00000004379	MSI1	90	75.305	Pundamilia_nyererei
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	74.085	ENSPNAG00000019337	msi1	90	74.085	Pygocentrus_nattereri
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ENSNLEG00000015636	MSI1	100	77.744	ENSSFOG00015005350	MSI1	92	77.744	Scleropages_formosus
ENSNLEG00000015636	MSI1	82	73.818	ENSSMAG00000009156	-	71	73.818	Scophthalmus_maximus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	72.561	ENSSMAG00000018824	MSI1	97	72.561	Scophthalmus_maximus
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ENSNLEG00000015636	MSI1	100	85.061	ENSSPUG00000015741	MSI1	90	85.061	Sphenodon_punctatus
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.915	ENSSPAG00000013098	-	96	75.915	Stegastes_partitus
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ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.329	ENSSSCG00000029365	MSI1	100	88.746	Sus_scrofa
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	86.280	ENSTGUG00000009534	MSI1	96	86.280	Taeniopygia_guttata
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	66.159	ENSTRUG00000015636	-	78	66.159	Takifugu_rubripes
ENSNLEG00000015636	MSI1	67	67.532	ENSTRUG00000016249	MSI1	100	62.172	Takifugu_rubripes
ENSNLEG00000015636	MSI1	100	70.091	ENSTNIG00000011469	MSI1	90	70.091	Tetraodon_nigroviridis
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ENSNLEG00000015636	MSI1	62	77.626	ENSUAMG00000015514	MSI1	94	77.626	Ursus_americanus
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ENSNLEG00000015636	MSI1	100	60.976	ENSXCOG00000017605	MSI1	85	60.976	Xiphophorus_couchianus
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ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.915	ENSXMAG00000027103	MSI1	89	69.301	Xiphophorus_maculatus