EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000017999 (Gene tree)
Gene ID: 100606118
Gene Symbol: PRPF38A
Alias: FLJ14936|Prp38
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11990 bases
Position: chr9:35228726-35240715
Accession: 100606118
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000021867	PRP38	PF03371.15	4.3e-57	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000022970	PRPF38A-201	939	XM_003264591	ENSNLEP00000021867	312 (aa)	XP_003264639	G1S8M8

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	87	74.539	ENSNLEG00000012592	-	89	74.539
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	65.744	ENSNLEG00000033398	-	86	65.744

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSG00000134748	PRPF38A	93	100.000	Homo_sapiens
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	87.879	ENSAPOG00000011652	prpf38a	93	80.690	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	93	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	85.354	ENSACIG00000012292	prpf38a	68	84.615	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	87.879	ENSAOCG00000018004	prpf38a	93	80.690	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	87.879	ENSAPEG00000021414	prpf38a	93	80.690	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	87.879	ENSATEG00000004608	prpf38a	93	80.345	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	79	97.571	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	97.571	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	95.502	ENSACAG00000008249	PRPF38A	93	95.502	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	77	77.366	ENSANAG00000029204	-	83	70.370	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSANAG00000027839	PRPF38A	93	100.000	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	85.354	ENSACLG00000021595	prpf38a	93	78.966	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	81.379	ENSAMXG00000029274	prpf38a	93	81.379	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	93	100.000	Bos_taurus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	55	61.628	WBGene00008380	prp-38	60	60.622	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	93	100.000	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	93	100.000	Canis_familiaris
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	93	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	93	100.000	Capra_hircus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSTSYG00000009868	-	93	100.000	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	86	98.885	ENSTSYG00000031994	-	95	98.885	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	93	100.000	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	99.654	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	93	99.654	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSCATG00000032296	PRPF38A	93	100.000	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	91	66.784	ENSCATG00000044190	-	92	65.714	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	93	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	70	97.260	ENSCHOG00000008388	PRPF38A	70	97.260	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	97.924	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	93	97.924	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	60	70.053	ENSCSAVG00000009580	-	71	63.850	Ciona_savignyi
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	88	100.000	ENSCANG00000032608	PRPF38A	92	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	99.654	ENSCGRG00001018502	-	93	99.654	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	67	87.019	ENSCGRG00001002557	-	71	87.019	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	99.654	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	93	99.654	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	86.869	ENSCSEG00000001269	prpf38a	71	86.058	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	89.899	ENSCVAG00000012305	prpf38a	93	81.379	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	81.034	ENSDARG00000039213	prpf38a	93	81.034	Danio_rerio
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	93	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	77	82.500	ENSDORG00000025371	-	70	87.255	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	85.467	ENSDORG00000023857	-	91	85.467	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	77	82.500	ENSDORG00000023691	-	70	87.255	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	56	75.287	FBgn0050342	Prp38	50	76.364	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	68	79.535	ENSEBUG00000012588	prpf38a	67	79.524	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSEASG00005014427	PRPF38A	93	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSECAG00000022628	PRPF38A	93	100.000	Equus_caballus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	85.859	ENSELUG00000021094	prpf38a	93	79.310	Esox_lucius
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	93	100.000	Felis_catus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	87	96.679	ENSFALG00000005598	-	100	96.679	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	92	84.375	ENSFALG00000003612	-	69	89.904	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	99.654	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	93	99.654	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	76	77.178	ENSFHEG00000014317	prpf38a	71	87.981	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	97.578	ENSGALG00000010627	PRPF38A	93	97.578	Gallus_gallus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	89.899	ENSGAFG00000012422	prpf38a	93	81.379	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	85.000	ENSGACG00000005423	prpf38a	93	78.425	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	98.270	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	93	98.270	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSGGOG00000003940	PRPF38A	93	100.000	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	53	90.361	ENSHBUG00000020572	prpf38a	70	90.303	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	83.391	ENSHGLG00000007918	-	92	83.045	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	93	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	93	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	83.391	ENSHGLG00100003928	-	92	83.045	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	79	66.935	ENSHCOG00000020781	prpf38a	52	90.303	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	67	86.603	ENSIPUG00000005757	prpf38a	67	86.603	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	93	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	98.616	ENSJJAG00000015811	Prpf38a	93	98.616	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	89.394	ENSKMAG00000006588	prpf38a	93	81.034	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	88	77.818	ENSLBEG00000020585	prpf38a	93	78.276	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	91.696	ENSLACG00000011495	PRPF38A	93	91.696	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	78.966	ENSLOCG00000006262	prpf38a	93	80.345	Lepisosteus_oculatus
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ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSMFAG00000039449	PRPF38A	93	100.000	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	87	99.265	ENSMMUG00000014333	PRPF38A	98	99.265	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSMNEG00000031221	PRPF38A	93	100.000	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	91	67.138	ENSMNEG00000040242	-	92	66.429	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	93	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	87.374	ENSMAMG00000015431	prpf38a	93	80.345	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	85.354	ENSMZEG00005017838	prpf38a	93	78.966	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	88	97.464	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	92	97.464	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	77	94.606	ENSMAUG00000018029	-	79	94.712	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	100.000	ENSMICG00000014193	PRPF38A	93	100.000	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	99.654	ENSMOCG00000013080	Prpf38a	93	99.654	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	75	80.000	ENSMMOG00000016972	prpf38a	73	86.538	Mola_mola
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	98.276	ENSMODG00000000644	PRPF38A	93	98.276	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	63	87.374	ENSMALG00000019363	prpf38a	90	80.345	Monopterus_albus
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	98.616	MGP_CAROLIEiJ_G0026269	Prpf38a	93	98.616	Mus_caroli
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ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	94.464	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	93	94.464	Notamacropus_eugenii
ENSNLEG00000017999	PRPF38A	70	99.539	ENSOPRG00000008985	PRPF38A	90	99.539	Ochotona_princeps
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