EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000027348 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7179 bases
Position: chr5:57883873-57891051
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000041228	LSM	PF01423.22	9.4e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000036842	-	225	-	ENSNLEP00000041228	74 (aa)	-	A0A2I3HC47

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000027348	-	100	95.946	ENSNLEG00000018987	-	80	95.946
ENSNLEG00000027348	-	80	36.066	ENSNLEG00000015268	LSM5	65	36.066
ENSNLEG00000027348	-	100	83.784	ENSNLEG00000035496	-	78	83.784
ENSNLEG00000027348	-	70	78.846	ENSNLEG00000032973	-	100	78.846

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSG00000182004	SNRPE	100	100.000	Homo_sapiens
ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSAPOG00000024096	snrpe	80	94.595	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000027348	-	100	97.333	ENSAMEG00000000882	SNRPE	81	97.333	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000027348	-	100	66.216	ENSACIG00000019570	snrpe	75	66.216	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSAOCG00000023377	snrpe	80	94.595	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSAPEG00000015525	snrpe	80	94.595	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSATEG00000005597	-	80	94.595	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSATEG00000005274	snrpe	80	94.595	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSACAG00000010067	SNRPE	80	100.000	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSANAG00000036379	SNRPE	80	100.000	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000027348	-	89	83.333	ENSANAG00000023411	-	84	83.333	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000027348	-	100	66.216	ENSACLG00000024766	snrpe	75	66.216	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000027348	-	100	93.243	ENSAMXG00000042813	-	80	93.243	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000027348	-	100	93.243	ENSAMXG00000043656	SNRPE	80	93.243	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000027348	-	64	95.745	ENSBTAG00000054792	-	100	95.745	Bos_taurus
ENSNLEG00000027348	-	95	94.286	ENSBTAG00000049347	-	73	94.286	Bos_taurus
ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSBTAG00000030305	-	80	94.595	Bos_taurus
ENSNLEG00000027348	-	70	96.154	ENSBTAG00000039066	-	100	96.154	Bos_taurus
ENSNLEG00000027348	-	100	93.243	ENSBTAG00000032198	-	80	93.243	Bos_taurus
ENSNLEG00000027348	-	78	98.276	ENSBTAG00000050130	-	69	98.276	Bos_taurus
ENSNLEG00000027348	-	70	90.385	ENSBTAG00000008426	-	100	90.385	Bos_taurus
ENSNLEG00000027348	-	97	66.667	WBGene00004919	snr-6	80	66.667	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000027348	-	100	98.649	ENSCJAG00000022878	-	80	98.649	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSCJAG00000046841	SNRPE	80	100.000	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000027348	-	100	86.486	ENSCAFG00000017806	-	80	86.486	Canis_familiaris
ENSNLEG00000027348	-	100	95.946	ENSCAFG00000002085	-	80	95.946	Canis_familiaris
ENSNLEG00000027348	-	100	93.243	ENSCAFG00000013727	-	80	93.243	Canis_familiaris
ENSNLEG00000027348	-	92	97.059	ENSCAFG00020007342	-	88	97.059	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000027348	-	70	92.308	ENSCAFG00020007518	-	100	92.308	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000027348	-	70	98.077	ENSCAFG00020022987	-	100	98.077	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000027348	-	100	86.486	ENSCAFG00020011362	-	80	86.486	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000027348	-	78	98.276	ENSCAFG00020006733	-	63	98.276	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSCHIG00000024013	-	80	100.000	Capra_hircus
ENSNLEG00000027348	-	70	82.692	ENSCHIG00000009858	-	100	82.692	Capra_hircus
ENSNLEG00000027348	-	100	95.946	ENSCHIG00000013740	-	94	95.946	Capra_hircus
ENSNLEG00000027348	-	99	69.863	ENSCHIG00000023516	-	91	69.863	Capra_hircus
ENSNLEG00000027348	-	100	91.892	ENSCHIG00000004218	-	80	91.892	Capra_hircus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSCHIG00000004531	-	80	100.000	Capra_hircus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSTSYG00000029919	-	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000027348	-	100	93.243	ENSTSYG00000031884	-	80	93.243	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000027348	-	100	95.946	ENSCAPG00000007090	-	80	95.946	Cavia_aperea
ENSNLEG00000027348	-	100	97.297	ENSCAPG00000001019	-	80	97.297	Cavia_aperea
ENSNLEG00000027348	-	100	95.946	ENSCAPG00000007891	-	80	95.946	Cavia_aperea
ENSNLEG00000027348	-	100	97.297	ENSCAPG00000006739	-	80	97.297	Cavia_aperea
ENSNLEG00000027348	-	100	79.730	ENSCAPG00000016066	-	78	79.730	Cavia_aperea
ENSNLEG00000027348	-	100	89.189	ENSCAPG00000015503	-	76	89.189	Cavia_aperea
ENSNLEG00000027348	-	88	100.000	ENSCAPG00000006904	-	100	100.000	Cavia_aperea
ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSCPOG00000031058	-	80	94.595	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSCPOG00000023757	SNRPE	80	100.000	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000027348	-	100	95.946	ENSCPOG00000032851	-	80	95.946	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000027348	-	100	78.378	ENSCPOG00000040399	-	78	78.378	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSCPOG00000039330	-	80	94.595	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000027348	-	100	95.946	ENSCPOG00000033680	-	82	95.946	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000027348	-	91	85.075	ENSCPOG00000038470	-	91	85.075	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000027348	-	100	95.946	ENSCPOG00000032152	-	80	95.946	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSCCAG00000020762	-	80	100.000	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000027348	-	86	85.938	ENSCCAG00000032936	-	82	85.938	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSCATG00000041403	SNRPE	80	100.000	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSCLAG00000013355	-	80	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000027348	-	68	94.000	ENSCLAG00000004113	-	66	94.000	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSCSAG00000018742	-	80	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSCHOG00000009158	SNRPE	80	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000027348	-	100	98.649	ENSCPBG00000017410	SNRPE	80	98.649	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000027348	-	99	75.342	ENSCING00000023749	-	81	75.342	Ciona_intestinalis
ENSNLEG00000027348	-	100	71.622	ENSCSAVG00000003861	-	82	71.622	Ciona_savignyi
ENSNLEG00000027348	-	93	90.000	ENSCANG00000038507	-	79	90.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSCANG00000036317	-	80	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000027348	-	100	85.135	ENSCANG00000028439	-	93	85.135	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSCGRG00001019074	-	80	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000027348	-	100	86.486	ENSCGRG00001009217	-	84	86.486	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSCGRG00001013414	-	80	94.595	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000027348	-	100	91.892	ENSCGRG00001001996	-	83	91.892	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000027348	-	99	86.301	ENSCGRG00001021716	-	85	86.301	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000027348	-	100	86.486	ENSCGRG00000013527	-	83	86.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSCGRG00000000675	-	80	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000027348	-	88	90.769	ENSCSEG00000008431	snrpe	78	90.769	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000027348	-	100	95.946	ENSCVAG00000020150	snrpe	80	95.946	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000027348	-	100	93.243	ENSDARG00000033175	snrpe	100	92.308	Danio_rerio
ENSNLEG00000027348	-	100	95.946	ENSDNOG00000031493	-	80	95.946	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000027348	-	100	78.378	ENSDNOG00000033638	-	80	78.378	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000027348	-	100	97.297	ENSDNOG00000040661	-	80	97.297	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSDNOG00000004490	-	80	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000027348	-	100	98.649	ENSDNOG00000042795	-	80	98.649	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000027348	-	91	74.627	ENSDORG00000023576	-	91	74.627	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000027348	-	100	93.243	ENSDORG00000026946	-	80	93.243	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000027348	-	70	96.154	ENSDORG00000029115	-	100	96.154	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000027348	-	70	100.000	ENSDORG00000024454	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000027348	-	100	98.649	ENSDORG00000023819	-	80	98.649	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000027348	-	99	86.301	ENSDORG00000028315	-	95	86.301	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000027348	-	99	80.822	ENSDORG00000023808	-	79	80.822	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000027348	-	99	78.082	FBgn0261790	SmE	78	78.082	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000027348	-	85	77.778	ENSETEG00000001249	-	79	77.778	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSETEG00000014015	-	80	100.000	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000027348	-	97	76.389	ENSETEG00000013892	-	76	76.389	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000027348	-	100	89.189	ENSETEG00000015545	-	97	89.189	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSEASG00005011462	SNRPE	80	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000027348	-	88	100.000	ENSECAG00000030680	-	76	100.000	Equus_caballus
ENSNLEG00000027348	-	100	91.892	ENSELUG00000012430	snrpe	80	91.892	Esox_lucius
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSFCAG00000042558	SNRPE	80	100.000	Felis_catus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSFALG00000000488	SNRPE	80	100.000	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSFDAG00000009037	SNRPE	80	100.000	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000027348	-	100	95.946	ENSFHEG00000019712	snrpe	80	95.946	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000027348	-	97	93.056	ENSGMOG00000016322	snrpe	80	93.056	Gadus_morhua
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSGALG00000000137	SNRPE	80	100.000	Gallus_gallus
ENSNLEG00000027348	-	88	95.385	ENSGAFG00000006716	snrpe	78	95.385	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000027348	-	100	93.243	ENSGACG00000010920	snrpe	80	93.243	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000027348	-	100	98.649	ENSGAGG00000006438	SNRPE	80	98.649	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000027348	-	51	94.737	ENSGGOG00000042820	-	61	94.737	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000027348	-	100	75.676	ENSGGOG00000040431	-	93	75.676	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000027348	-	100	85.135	ENSGGOG00000042851	-	79	85.135	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSGGOG00000043102	SNRPE	80	100.000	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000027348	-	68	86.000	ENSGGOG00000000755	-	82	86.000	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000027348	-	78	91.379	ENSHBUG00000006106	snrpe	56	91.379	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSHGLG00000004221	SNRPE	80	100.000	Heterocephalus_glaber_female
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ENSNLEG00000027348	-	99	89.041	ENSHCOG00000019590	snrpe	79	89.041	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000027348	-	99	91.781	ENSIPUG00000004562	snrpe	79	91.781	Ictalurus_punctatus
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ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSSTOG00000021817	-	80	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000027348	-	100	91.892	ENSJJAG00000022841	-	80	91.892	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000027348	-	100	93.243	ENSJJAG00000007840	-	80	93.243	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000027348	-	100	95.946	ENSKMAG00000005461	snrpe	80	95.946	Kryptolebias_marmoratus
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ENSNLEG00000027348	-	100	82.432	ENSMPUG00000018623	-	80	82.432	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000027348	-	100	97.297	ENSMLUG00000013374	-	94	97.297	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000027348	-	100	98.649	ENSMLUG00000013244	-	80	98.649	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000027348	-	100	87.838	ENSNGAG00000024125	-	80	87.838	Nannospalax_galili
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ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSNBRG00000015473	snrpe	80	94.595	Neolamprologus_brichardi
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ENSNLEG00000027348	-	100	98.649	ENSOANG00000003101	-	80	98.649	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNLEG00000027348	-	100	91.892	ENSORLG00000012059	snrpe	80	91.892	Oryzias_latipes
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ENSNLEG00000027348	-	78	98.276	ENSOGAG00000004309	-	76	98.276	Otolemur_garnettii
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ENSNLEG00000027348	-	70	100.000	ENSPPRG00000024940	-	100	100.000	Panthera_pardus
ENSNLEG00000027348	-	96	71.831	ENSPTIG00000005218	-	77	71.831	Panthera_tigris_altaica
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ENSNLEG00000027348	-	82	88.525	ENSPANG00000013978	-	75	88.525	Papio_anubis
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSPANG00000034978	-	80	100.000	Papio_anubis
ENSNLEG00000027348	-	88	92.308	ENSPKIG00000013388	snrpe	78	92.308	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSPSIG00000008935	-	81	100.000	Pelodiscus_sinensis
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ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSPEMG00000008031	Snrpe	80	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSNLEG00000027348	-	100	63.514	ENSPCAG00000011199	SNRPE	80	63.514	Procavia_capensis
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ENSNLEG00000027348	-	100	85.135	ENSRBIG00000043777	-	92	85.135	Rhinopithecus_bieti
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ENSNLEG00000027348	-	96	47.436	YOR159C	SME1	83	47.436	Saccharomyces_cerevisiae
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSSBOG00000034982	-	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSSLDG00000015364	snrpe	80	94.595	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNLEG00000027348	-	100	77.027	ENSSARG00000004546	-	80	77.027	Sorex_araneus
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ENSNLEG00000027348	-	100	85.135	ENSSPUG00000011701	-	94	85.135	Sphenodon_punctatus
ENSNLEG00000027348	-	100	100.000	ENSSPUG00000000685	SNRPE	80	100.000	Sphenodon_punctatus
ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSSPAG00000016345	snrpe	80	94.595	Stegastes_partitus
ENSNLEG00000027348	-	100	79.730	ENSSSCG00000031582	-	85	79.730	Sus_scrofa
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ENSNLEG00000027348	-	88	92.308	ENSTRUG00000025909	SNRPE	78	92.308	Takifugu_rubripes
ENSNLEG00000027348	-	100	93.243	ENSTRUG00000025934	snrpe	80	93.243	Takifugu_rubripes
ENSNLEG00000027348	-	100	94.595	ENSTNIG00000007373	snrpe	80	94.595	Tetraodon_nigroviridis
ENSNLEG00000027348	-	78	82.759	ENSUAMG00000005257	-	74	82.759	Ursus_americanus
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