EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000027546 (Gene tree)
Gene ID: 100603740
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: 60S ribosomal protein L38
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 213 bases
Position: chr1a:20506949-20507161
Accession: 100603740
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000041010	Ribosomal_L38e	PF01781.18	2.5e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000054408	-	213	XM_012500709	ENSNLEP00000041010	70 (aa)	XP_003281156	A0A2I3HBY9

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle03010	Ribosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000027546	-	89	96.774	ENSNLEG00000029022	-	89	96.774
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSNLEG00000029031	-	100	100.000
ENSNLEG00000027546	-	99	98.551	ENSNLEG00000034085	-	100	98.551
ENSNLEG00000027546	-	100	98.571	ENSNLEG00000031161	-	100	98.571
ENSNLEG00000027546	-	100	98.571	ENSNLEG00000029720	-	100	98.571

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSG00000172809	RPL38	100	100.000	Homo_sapiens
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSAPOG00000015058	rpl38	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000027546	-	100	98.571	ENSAMEG00000001269	-	100	98.571	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000027546	-	99	78.261	ENSAMEG00000018646	-	97	78.261	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000027546	-	99	97.101	ENSACIG00000009353	rpl38	100	97.101	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSAOCG00000001669	-	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSAPEG00000007742	rpl38	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSATEG00000004864	-	100	100.000	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000027546	-	100	98.571	ENSACAG00000014849	RPL38	100	98.571	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000027546	-	100	97.143	ENSANAG00000007502	-	100	97.143	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSANAG00000030554	RPL38	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000027546	-	100	77.143	ENSANAG00000021628	-	100	77.143	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSACLG00000026657	rpl38	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000027546	-	90	98.413	ENSAMXG00000017793	RPL38	90	98.413	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSBTAG00000030164	RPL38	100	100.000	Bos_taurus
ENSNLEG00000027546	-	99	76.812	ENSBTAG00000030185	-	99	76.812	Bos_taurus
ENSNLEG00000027546	-	100	78.571	WBGene00004452	rpl-38	100	78.571	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSCJAG00000043541	RPL38	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000027546	-	89	79.032	ENSCAFG00000024743	-	89	79.032	Canis_familiaris
ENSNLEG00000027546	-	100	77.143	ENSCAFG00020023724	-	100	77.143	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000027546	-	100	84.722	ENSCAFG00020026527	-	100	84.722	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000027546	-	99	95.652	ENSCAFG00020021803	-	86	95.652	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000027546	-	100	82.667	ENSCAFG00020027279	-	100	82.667	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000027546	-	100	80.282	ENSCHIG00000010665	-	100	80.282	Capra_hircus
ENSNLEG00000027546	-	100	74.286	ENSCHIG00000016157	-	89	74.286	Capra_hircus
ENSNLEG00000027546	-	100	75.714	ENSCHIG00000012246	-	100	75.714	Capra_hircus
ENSNLEG00000027546	-	99	100.000	ENSCHIG00000026897	-	100	100.000	Capra_hircus
ENSNLEG00000027546	-	100	77.143	ENSCHIG00000012360	-	100	77.143	Capra_hircus
ENSNLEG00000027546	-	69	100.000	ENSTSYG00000004596	-	98	100.000	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000027546	-	100	78.571	ENSTSYG00000025454	-	100	78.571	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000027546	-	100	75.714	ENSTSYG00000034714	-	100	75.714	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSCPOG00000008988	RPL38	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSCCAG00000021269	-	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000027546	-	99	79.710	ENSCCAG00000024034	-	67	79.710	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000027546	-	100	82.857	ENSCCAG00000019236	-	100	82.857	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSCATG00000044644	RPL38	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000027546	-	100	75.714	ENSCATG00000024547	-	100	75.714	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSCATG00000022828	-	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSCLAG00000003126	RPL38	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSCPBG00000010293	RPL38	100	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000027546	-	97	83.824	ENSCING00000023534	-	100	83.824	Ciona_intestinalis
ENSNLEG00000027546	-	100	87.143	ENSCSAVG00000004353	-	100	87.143	Ciona_savignyi
ENSNLEG00000027546	-	100	82.857	ENSCANG00000030355	-	100	82.857	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000027546	-	100	74.286	ENSCANG00000042032	-	100	74.286	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSCANG00000041844	-	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000027546	-	99	69.565	ENSCANG00000034857	-	94	69.565	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000027546	-	90	93.651	ENSCGRG00001008388	-	97	93.651	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSCGRG00001019446	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000027546	-	100	91.429	ENSCGRG00001023968	-	100	91.429	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000027546	-	90	88.889	ENSCGRG00001006351	-	100	88.889	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000027546	-	97	89.706	ENSCGRG00000019703	-	100	89.706	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000027546	-	97	98.529	ENSCGRG00000013010	-	97	98.529	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000027546	-	100	91.429	ENSCGRG00000010296	-	100	91.429	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000027546	-	90	93.651	ENSCGRG00000002673	-	97	93.651	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSCSEG00000013755	rpl38	100	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSCVAG00000020481	rpl38	100	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSDARG00000006413	rpl38	100	100.000	Danio_rerio
ENSNLEG00000027546	-	96	86.567	ENSDARG00000111040	LO018128.1	77	86.567	Danio_rerio
ENSNLEG00000027546	-	96	98.507	ENSDNOG00000004821	-	100	98.507	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSDNOG00000047328	RPL38	97	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000027546	-	100	84.286	ENSDNOG00000040801	-	99	84.286	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000027546	-	100	94.286	ENSDNOG00000034870	-	91	94.286	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000027546	-	100	91.429	ENSDORG00000028829	-	100	91.429	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSDORG00000013146	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000027546	-	100	72.857	FBgn0040007	RpL38	100	72.857	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000027546	-	86	96.667	ENSETEG00000001873	-	100	96.667	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000027546	-	99	79.710	ENSEBUG00000005571	rpl38	100	79.710	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSEASG00005018952	-	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000027546	-	100	78.571	ENSEASG00005014055	-	100	78.571	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSECAG00000018554	RPL38	100	100.000	Equus_caballus
ENSNLEG00000027546	-	100	80.000	ENSECAG00000037667	-	100	80.000	Equus_caballus
ENSNLEG00000027546	-	90	84.127	ENSECAG00000007768	-	94	84.127	Equus_caballus
ENSNLEG00000027546	-	100	98.571	ENSELUG00000016533	rpl38	100	98.571	Esox_lucius
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSFCAG00000010851	RPL38	100	100.000	Felis_catus
ENSNLEG00000027546	-	96	85.075	ENSFCAG00000013076	-	99	85.075	Felis_catus
ENSNLEG00000027546	-	100	70.000	ENSFCAG00000022964	-	100	70.000	Felis_catus
ENSNLEG00000027546	-	99	100.000	ENSFALG00000012803	RPL38	96	100.000	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSFDAG00000015439	RPL38	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSFHEG00000008898	rpl38	100	100.000	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000027546	-	99	100.000	ENSGMOG00000005166	rpl38	100	100.000	Gadus_morhua
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSGALG00000001465	RPL38	100	100.000	Gallus_gallus
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSGAFG00000011413	rpl38	100	100.000	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000027546	-	100	94.286	ENSGACG00000003288	rpl38	91	94.286	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000027546	-	100	81.429	ENSGAGG00000015667	-	100	81.429	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000027546	-	90	100.000	ENSGAGG00000013893	-	95	100.000	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSGGOG00000000794	RPL38	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSHBUG00000008667	-	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000027546	-	100	94.286	ENSHGLG00000019788	-	84	94.286	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSHGLG00000008753	RPL38	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000027546	-	89	77.419	ENSHGLG00000021017	-	100	77.419	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000027546	-	100	85.714	ENSHGLG00000012920	-	100	85.714	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000027546	-	99	100.000	ENSHGLG00100012735	-	91	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000027546	-	89	77.419	ENSHGLG00100020046	-	100	77.419	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000027546	-	100	85.714	ENSHGLG00100014888	-	100	85.714	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000027546	-	99	94.203	ENSHGLG00100020574	-	99	94.203	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSHCOG00000018583	rpl38	100	100.000	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSIPUG00000000953	rpl38	100	100.000	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSSTOG00000019394	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000027546	-	100	91.429	ENSJJAG00000010719	-	100	91.429	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000027546	-	99	84.058	ENSJJAG00000017426	-	98	84.058	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000027546	-	100	85.714	ENSJJAG00000012837	-	100	85.714	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000027546	-	100	87.143	ENSJJAG00000010774	-	97	87.143	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSJJAG00000005013	-	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000027546	-	100	98.571	ENSKMAG00000008360	RPL38	100	98.571	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000027546	-	100	97.143	ENSLBEG00000027693	rpl38	100	97.143	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000027546	-	90	93.651	ENSLACG00000017820	-	84	88.406	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000027546	-	94	93.939	ENSLACG00000016913	-	89	94.286	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000027546	-	100	100.000	ENSLOCG00000012842	rpl38	100	100.000	Lepisosteus_oculatus
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