EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000029364 (Gene tree)
Gene ID: 100604593
Gene Symbol: RAB30
Alias: -
Full Name: RAB30%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 52384 bases
Position: chr15:54258601-54310984
Accession: 100604593
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000040884	MMR_HSR1	PF01926.23	1.8e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000034064	RAB30-201	695	XM_003254640	ENSNLEP00000040884	203 (aa)	XP_003254688	A0A2I3HB73
ENSNLET00000036978	RAB30-202	528	-	ENSNLEP00000031909	175 (aa)	-	A0A2I3GKS3

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000029364	RAB30	87	38.068	ENSNLEG00000027830	RAB23	74	38.068
ENSNLEG00000029364	RAB30	81	33.133	ENSNLEG00000004197	MRAS	79	33.133
ENSNLEG00000029364	RAB30	97	39.524	ENSNLEG00000001733	RAB11B	96	39.524
ENSNLEG00000029364	RAB30	82	50.000	ENSNLEG00000006058	RAB1B	83	50.000
ENSNLEG00000029364	RAB30	90	42.391	ENSNLEG00000036148	RAB2A	87	42.391
ENSNLEG00000029364	RAB30	92	36.842	ENSNLEG00000028438	RAB36	60	36.842
ENSNLEG00000029364	RAB30	79	40.361	ENSNLEG00000018324	RAB9B	82	40.361
ENSNLEG00000029364	RAB30	82	31.737	ENSNLEG00000004500	RHEB	88	31.737
ENSNLEG00000029364	RAB30	80	49.383	ENSNLEG00000028944	-	83	49.383
ENSNLEG00000029364	RAB30	77	35.625	ENSNLEG00000002777	RAB34	62	35.625
ENSNLEG00000029364	RAB30	78	48.447	ENSNLEG00000014505	RAB39B	76	48.447
ENSNLEG00000029364	RAB30	65	35.821	ENSNLEG00000029492	RERG	67	35.821
ENSNLEG00000029364	RAB30	97	41.148	ENSNLEG00000012323	RAB25	96	41.148
ENSNLEG00000029364	RAB30	89	40.556	ENSNLEG00000017108	RAB14	84	40.556
ENSNLEG00000029364	RAB30	89	46.703	ENSNLEG00000006939	RAB12	74	47.222
ENSNLEG00000029364	RAB30	75	31.013	ENSNLEG00000001103	DNAJC27	89	31.013
ENSNLEG00000029364	RAB30	95	38.889	ENSNLEG00000036073	RAB9A	97	38.889
ENSNLEG00000029364	RAB30	87	32.584	ENSNLEG00000027684	KRAS	93	32.584
ENSNLEG00000029364	RAB30	83	34.524	ENSNLEG00000030435	-	71	34.524
ENSNLEG00000029364	RAB30	79	42.857	ENSNLEG00000017098	RAB6A	77	42.857
ENSNLEG00000029364	RAB30	86	43.678	ENSNLEG00000003434	RAB5A	81	43.678
ENSNLEG00000029364	RAB30	81	47.647	ENSNLEG00000032616	RAB33B	74	47.647
ENSNLEG00000029364	RAB30	81	51.176	ENSNLEG00000034919	RAB33A	72	51.176
ENSNLEG00000029364	RAB30	84	34.503	ENSNLEG00000034325	NRAS	89	34.503
ENSNLEG00000029364	RAB30	83	42.857	ENSNLEG00000017570	-	78	42.857
ENSNLEG00000029364	RAB30	83	47.929	ENSNLEG00000016970	RAB18	82	47.929
ENSNLEG00000029364	RAB30	89	34.426	ENSNLEG00000008300	HRAS	94	34.426
ENSNLEG00000029364	RAB30	88	38.043	ENSNLEG00000029309	RAB7A	88	38.043
ENSNLEG00000029364	RAB30	94	44.271	ENSNLEG00000014534	RAB2B	92	44.271
ENSNLEG00000029364	RAB30	75	41.447	ENSNLEG00000003675	RAB6B	73	41.447
ENSNLEG00000029364	RAB30	96	37.864	ENSNLEG00000012853	-	90	44.604

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSG00000137502	RAB30	100	100.000	Homo_sapiens
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	86.207	ENSAPOG00000022625	rab30	100	86.207	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSAMEG00000005231	RAB30	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000029364	RAB30	95	86.010	ENSAOCG00000012556	rab30	69	86.010	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	86.207	ENSAPEG00000012044	rab30	100	86.207	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	86.207	ENSATEG00000010475	rab30	100	86.207	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	98.030	ENSACAG00000001098	RAB30	100	98.030	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSANAG00000029292	RAB30	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	86.700	ENSACLG00000023526	rab30	100	86.700	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	85.222	ENSAMXG00000009935	rab30	82	85.222	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSBTAG00000002417	RAB30	100	100.000	Bos_taurus
ENSNLEG00000029364	RAB30	85	63.218	WBGene00004282	rab-30	81	63.218	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSCJAG00000041773	RAB30	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSCAFG00000004616	RAB30	100	100.000	Canis_familiaris
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSCAFG00020017865	RAB30	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSCHIG00000020601	RAB30	100	100.000	Capra_hircus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSTSYG00000009392	RAB30	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSCAPG00000009331	RAB30	100	100.000	Cavia_aperea
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSCPOG00000005047	RAB30	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSCCAG00000026824	RAB30	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSCATG00000040441	RAB30	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSCLAG00000014030	RAB30	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSCSAG00000003704	RAB30	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	97.537	ENSCPBG00000006855	RAB30	100	97.537	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	99.507	ENSCANG00000022240	RAB30	100	99.507	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSCGRG00001021787	Rab30	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSCGRG00000014842	Rab30	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	85.714	ENSCSEG00000007292	rab30	100	85.714	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	85.222	ENSCVAG00000018085	rab30	100	85.222	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000029364	RAB30	99	85.572	ENSDARG00000037884	rab30	100	85.572	Danio_rerio
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSDNOG00000039115	RAB30	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	97.044	ENSDORG00000015066	-	100	97.044	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	99.015	ENSDORG00000010504	-	100	99.015	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000029364	RAB30	85	73.988	FBgn0031882	Rab30	87	67.692	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSEASG00005012754	RAB30	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSECAG00000022769	RAB30	100	100.000	Equus_caballus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	84.314	ENSELUG00000022997	rab30	100	85.149	Esox_lucius
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSFCAG00000014416	RAB30	100	100.000	Felis_catus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	98.522	ENSFALG00000007765	RAB30	100	98.522	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSFDAG00000014521	RAB30	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	85.714	ENSFHEG00000013918	rab30	100	85.714	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	81.773	ENSGMOG00000002552	rab30	100	81.773	Gadus_morhua
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	98.522	ENSGALG00000017248	RAB30	100	98.522	Gallus_gallus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	85.222	ENSGAFG00000020309	rab30	100	85.222	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	87.192	ENSGACG00000012006	rab30	100	87.192	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	97.537	ENSGAGG00000004474	RAB30	100	97.537	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSGGOG00000017157	RAB30	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	86.700	ENSHBUG00000000993	rab30	93	86.700	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSHGLG00000002759	RAB30	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSHGLG00100001213	RAB30	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000029364	RAB30	66	89.474	ENSHCOG00000010707	rab30	71	89.474	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000029364	RAB30	99	87.562	ENSIPUG00000021010	Rab30	100	87.562	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSSTOG00000020966	RAB30	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSJJAG00000020064	Rab30	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	85.714	ENSKMAG00000004439	rab30	100	85.714	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	86.207	ENSLBEG00000001146	rab30	100	86.207	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	91.626	ENSLACG00000006407	RAB30	100	91.626	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	89.163	ENSLOCG00000005884	rab30	100	89.163	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	99.507	ENSLAFG00000010711	RAB30	100	99.507	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSMFAG00000033119	RAB30	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSMMUG00000007842	RAB30	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSMNEG00000037406	RAB30	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSMLEG00000039496	RAB30	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	86.207	ENSMAMG00000011973	rab30	100	86.207	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	86.700	ENSMZEG00005024032	rab30	93	86.700	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	97.549	ENSMGAG00000015230	RAB30	100	97.549	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSMAUG00000008179	Rab30	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSMICG00000012002	RAB30	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSMOCG00000009821	-	100	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	85.714	ENSMMOG00000000304	rab30	100	85.714	Mola_mola
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	99.507	ENSMODG00000004506	RAB30	100	99.507	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	86.700	ENSMALG00000010438	rab30	100	86.700	Monopterus_albus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	99.507	MGP_CAROLIEiJ_G0029992	Rab30	100	99.507	Mus_caroli
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSMUSG00000030643	Rab30	100	100.000	Mus_musculus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0013212	Rab30	100	100.000	Mus_pahari
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0031102	Rab30	100	100.000	Mus_spretus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSMPUG00000008088	RAB30	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	98.522	ENSMLUG00000006552	RAB30	100	98.522	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSNGAG00000018930	Rab30	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	86.700	ENSNBRG00000002082	rab30	93	86.700	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000029364	RAB30	100	97.537	ENSMEUG00000012886	RAB30	100	97.537	Notamacropus_eugenii
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ENSNLEG00000029364	RAB30	100	100.000	ENSODEG00000003833	RAB30	100	100.000	Octodon_degus
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