EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000035185 (Gene tree)
Gene ID: 100592121
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13138 bases
Position: chr24:24208424-24221561
Accession: 100592121
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000041167	SYF2	PF08231.12	2e-54	1	1
ENSNLEP00000048830	SYF2	PF08231.12	5e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000053539	SYF2-202	1235	XM_003271623	ENSNLEP00000041167	201 (aa)	XP_003271671	A0A2I3HCD8
ENSNLET00000057875	SYF2-201	1365	XM_003271622	ENSNLEP00000048830	243 (aa)	XP_003271670	A0A2I3HZ55

Gene Model

Click here to download ENSNLEG00000035185's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
nle03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNLEG00000035185's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	99.502	ENSG00000117614	SYF2	100	99.502	Homo_sapiens
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	84.475	ENSAPOG00000001174	syf2	91	84.722	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000035185	SYF2	98	93.361	ENSAMEG00000010115	-	99	92.946	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000035185	SYF2	80	96.923	ENSAMEG00000010134	-	100	96.923	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	74.699	ENSACIG00000023688	syf2	86	82.326	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000035185	SYF2	98	80.252	ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.832	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000035185	SYF2	88	79.452	ENSAOCG00000010912	syf2	62	83.920	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000035185	SYF2	95	80.932	ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.185	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000035185	SYF2	89	83.410	ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000035185	SYF2	82	89.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	Anas_platyrhynchos
ENSNLEG00000035185	SYF2	79	75.472	ENSACAG00000026777	-	95	75.472	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000035185	SYF2	84	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	98.354	ENSANAG00000032473	SYF2	100	98.354	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	81.279	ENSACLG00000019916	syf2	91	82.407	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	83.028	ENSAMXG00000004051	syf2	91	83.333	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	92.653	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	92.245	Bos_taurus
ENSNLEG00000035185	SYF2	86	50.952	WBGene00019402	syf-2	90	50.711	Caenorhabditis_elegans
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	98.765	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	98.765	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000035185	SYF2	92	88.839	ENSCAFG00000030331	-	100	83.128	Canis_familiaris
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	93.852	ENSCAFG00000012895	-	99	93.852	Canis_familiaris
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	93.852	ENSCAFG00020021091	-	99	93.852	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035185	SYF2	95	87.895	ENSCAFG00020021094	-	100	83.824	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	92.181	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.181	Capra_hircus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	94.239	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	94.239	Carlito_syrichta
ENSNLEG00000035185	SYF2	81	98.990	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	Cavia_aperea
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	93.443	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.443	Cavia_porcellus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	98.765	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	98.765	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	97.942	ENSCATG00000026917	SYF2	100	97.942	Cercocebus_atys
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	94.672	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.672	Chinchilla_lanigera
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	97.942	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	97.942	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000035185	SYF2	74	77.348	ENSCHOG00000005273	-	100	75.000	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000035185	SYF2	92	88.839	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	86.695	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000035185	SYF2	87	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSNLEG00000035185	SYF2	96	46.392	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	84.774	ENSCANG00000037322	SYF2	100	84.774	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	90.535	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000035185	SYF2	82	95.980	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	Cynoglossus_semilaevis
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	81.735	ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.944	Cyprinodon_variegatus
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	77.917	ENSDARG00000004706	syf2	99	77.917	Danio_rerio
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	93.827	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	93.827	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	92.149	ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.149	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	56.818	FBgn0033556	CG12343	92	58.454	Drosophila_melanogaster
ENSNLEG00000035185	SYF2	94	77.293	ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.166	Echinops_telfairi
ENSNLEG00000035185	SYF2	89	55.495	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	82.305	ENSEASG00005004232	-	100	82.305	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	92.245	ENSEASG00005004224	-	100	92.245	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	92.653	ENSECAG00000012023	-	100	92.653	Equus_caballus
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	92.975	ENSECAG00000010440	-	99	93.277	Equus_caballus
ENSNLEG00000035185	SYF2	75	81.421	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	Erinaceus_europaeus
ENSNLEG00000035185	SYF2	96	80.252	ENSELUG00000003465	syf2	100	80.252	Esox_lucius
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	94.694	ENSFCAG00000010324	-	85	94.286	Felis_catus
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	94.262	ENSFCAG00000043095	-	99	93.852	Felis_catus
ENSNLEG00000035185	SYF2	84	85.294	ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	Ficedula_albicollis
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	93.827	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.827	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	67.273	ENSFHEG00000007238	syf2	100	63.677	Fundulus_heteroclitus
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	83.028	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	Gadus_morhua
ENSNLEG00000035185	SYF2	92	87.946	ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.000	Gallus_gallus
ENSNLEG00000035185	SYF2	95	75.424	ENSGAFG00000019435	syf2	91	80.556	Gambusia_affinis
ENSNLEG00000035185	SYF2	88	83.256	ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	Gasterosteus_aculeatus
ENSNLEG00000035185	SYF2	92	89.286	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	87.124	Gopherus_agassizii
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	99.588	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	99.588	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	81.279	ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.407	Haplochromis_burtoni
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	93.852	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000035185	SYF2	93	83.700	ENSHGLG00000004304	-	99	80.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	93.852	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	Heterocephalus_glaber_male
ENSNLEG00000035185	SYF2	98	78.008	ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	Hippocampus_comes
ENSNLEG00000035185	SYF2	91	83.258	ENSIPUG00000019859	syf2	91	84.722	Ictalurus_punctatus
ENSNLEG00000035185	SYF2	60	97.945	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNLEG00000035185	SYF2	82	97.990	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	Jaculus_jaculus
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	76.667	ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.407	Kryptolebias_marmoratus
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	83.105	ENSLBEG00000014425	syf2	91	83.796	Labrus_bergylta
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	80.417	ENSLACG00000012064	SYF2	91	86.111	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000035185	SYF2	97	80.851	ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.851	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	92.653	ENSLAFG00000023150	-	100	92.653	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000035185	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	98.354	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	98.354	Macaca_fascicularis
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	98.354	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	98.354	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	98.354	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	98.354	Macaca_nemestrina
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	97.942	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	97.942	Mandrillus_leucophaeus
ENSNLEG00000035185	SYF2	89	81.567	ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.944	Mastacembelus_armatus
ENSNLEG00000035185	SYF2	95	78.390	ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.407	Maylandia_zebra
ENSNLEG00000035185	SYF2	82	89.447	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	90.947	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	Mesocricetus_auratus
ENSNLEG00000035185	SYF2	89	97.753	ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	Microcebus_murinus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	91.770	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.535	Microtus_ochrogaster
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	79.909	ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.093	Mola_mola
ENSNLEG00000035185	SYF2	93	88.546	ENSMODG00000013951	-	95	89.450	Monodelphis_domestica
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	75.820	ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	Monopterus_albus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	91.770	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	91.358	Mus_caroli
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	91.770	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	91.358	Mus_musculus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	91.770	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	91.358	Mus_pahari
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	91.770	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	91.358	Mus_spretus
ENSNLEG00000035185	SYF2	98	94.583	ENSMPUG00000015801	-	98	94.167	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	94.262	ENSMPUG00000015802	-	99	94.262	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000035185	SYF2	98	94.118	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	93.333	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	92.683	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000035185	SYF2	97	72.083	ENSNBRG00000010720	syf2	100	69.583	Neolamprologus_brichardi
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	91.358	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSNLEG00000035185	SYF2	96	95.279	ENSODEG00000017664	-	98	95.279	Octodon_degus
ENSNLEG00000035185	SYF2	96	84.979	ENSODEG00000014338	-	98	84.979	Octodon_degus
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	81.279	ENSONIG00000008213	syf2	91	81.944	Oreochromis_niloticus
ENSNLEG00000035185	SYF2	83	90.594	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	95.082	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.082	Oryctolagus_cuniculus
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	82.648	ENSORLG00000028820	syf2	99	79.565	Oryzias_latipes
ENSNLEG00000035185	SYF2	96	78.481	ENSORLG00020018333	syf2	91	83.333	Oryzias_latipes_hni
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	82.569	ENSORLG00015014665	syf2	91	83.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	83.562	ENSOMEG00000013911	syf2	91	83.796	Oryzias_melastigma
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	94.215	ENSOGAG00000009962	SYF2	99	94.215	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000035185	SYF2	80	67.692	ENSOARG00000006269	-	100	67.692	Ovis_aries
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	92.713	ENSOARG00000006348	-	100	92.308	Ovis_aries
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	99.588	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	99.588	Pan_paniscus
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	94.262	ENSPPRG00000001651	-	99	93.852	Panthera_pardus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	94.309	ENSPPRG00000001638	-	100	93.902	Panthera_pardus
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	93.852	ENSPTIG00000007036	-	99	93.443	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000035185	SYF2	93	96.903	ENSPTIG00000005711	-	82	96.903	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	99.588	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	99.588	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	98.354	ENSPANG00000008139	SYF2	100	98.354	Papio_anubis
ENSNLEG00000035185	SYF2	95	80.687	ENSPKIG00000008130	syf2	92	84.722	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNLEG00000035185	SYF2	96	85.837	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	85.837	Pelodiscus_sinensis
ENSNLEG00000035185	SYF2	97	77.966	ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.407	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	91.358	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNLEG00000035185	SYF2	93	93.778	ENSPCIG00000014235	SYF2	86	95.370	Phascolarctos_cinereus
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	80.275	ENSPFOG00000004116	syf2	89	80.556	Poecilia_formosa
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	80.275	ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.930	Poecilia_latipinna
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	71.605	ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.077	Poecilia_mexicana
ENSNLEG00000035185	SYF2	89	81.019	ENSPREG00000003009	syf2	91	81.019	Poecilia_reticulata
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	99.588	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	99.588	Pongo_abelii
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	77.114	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	77.114	Propithecus_coquereli
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	82.305	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	82.305	Pteropus_vampyrus
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	81.279	ENSPNYG00000004979	syf2	91	82.407	Pundamilia_nyererei
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	79.424	ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	Pygocentrus_nattereri
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	91.770	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	91.358	Rattus_norvegicus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	95.885	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	95.885	Rhinopithecus_bieti
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	98.354	ENSRROG00000001347	SYF2	100	98.354	Rhinopithecus_roxellana
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	97.531	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	97.531	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNLEG00000035185	SYF2	93	92.000	ENSSHAG00000015630	-	87	93.056	Sarcophilus_harrisii
ENSNLEG00000035185	SYF2	84	93.689	ENSSHAG00000007152	-	100	93.689	Sarcophilus_harrisii
ENSNLEG00000035185	SYF2	93	82.222	ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.722	Scleropages_formosus
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	81.651	ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.944	Scophthalmus_maximus
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	83.028	ENSSDUG00000013072	syf2	91	83.333	Seriola_dumerili
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	83.028	ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.333	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	74.590	ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	Sorex_araneus
ENSNLEG00000035185	SYF2	95	86.147	ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.426	Sphenodon_punctatus
ENSNLEG00000035185	SYF2	96	78.151	ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.333	Stegastes_partitus
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	91.770	ENSSSCG00000037481	SYF2	88	98.611	Sus_scrofa
ENSNLEG00000035185	SYF2	58	73.504	ENSTGUG00000001126	SYF2	80	60.870	Taeniopygia_guttata
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	74.486	ENSTRUG00000001499	syf2	86	81.860	Takifugu_rubripes
ENSNLEG00000035185	SYF2	90	80.275	ENSTNIG00000016912	syf2	97	80.556	Tetraodon_nigroviridis
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	71.193	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.782	Tupaia_belangeri
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	92.623	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.033	Tursiops_truncatus
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	93.033	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	92.623	Ursus_americanus
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	93.443	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	93.033	Ursus_maritimus
ENSNLEG00000035185	SYF2	100	93.033	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.623	Vicugna_pacos
ENSNLEG00000035185	SYF2	84	97.073	ENSVVUG00000027181	-	100	90.323	Vulpes_vulpes
ENSNLEG00000035185	SYF2	99	93.852	ENSVVUG00000027175	-	99	93.852	Vulpes_vulpes
ENSNLEG00000035185	SYF2	96	82.833	ENSXETG00000022797	syf2	94	82.833	Xenopus_tropicalis
ENSNLEG00000035185	SYF2	88	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	Xiphophorus_maculatus