EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000035447 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2708 bases
Position: chr17:81447615-81450322
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000048228	Ribosomal_L39	PF00832.20	6.8e-24	1	1
ENSNLEP00000029658	Ribosomal_L39	PF00832.20	6.8e-24	1	1
ENSNLEP00000031308	Ribosomal_L39	PF00832.20	8.9e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000039600	-	147	-	ENSNLEP00000048228	48 (aa)	-	A0A2I3HXB0
ENSNLET00000054312	-	159	-	ENSNLEP00000031308	52 (aa)	-	A0A2I3GJ22
ENSNLET00000035217	-	147	-	ENSNLEP00000029658	48 (aa)	-	A0A2I3GEF7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSNLEG00000034348	-	90	100.000
ENSNLEG00000035447	-	96	97.826	ENSNLEG00000029853	-	90	97.826
ENSNLEG00000035447	-	96	97.826	ENSNLEG00000029575	-	90	97.826
ENSNLEG00000035447	-	96	93.478	ENSNLEG00000032768	RPL39L	90	93.478
ENSNLEG00000035447	-	96	95.652	ENSNLEG00000028606	-	61	95.652

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSG00000198918	RPL39	90	100.000	Homo_sapiens
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSAPOG00000012798	rpl39	87	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSACIG00000013617	rpl39	88	100.000	Amphilophus_citrinellus
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSAOCG00000011218	rpl39	90	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSNLEG00000035447	-	96	97.826	ENSAPEG00000005525	rpl39	87	97.826	Amphiprion_percula
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSATEG00000018783	rpl39	90	100.000	Anabas_testudineus
ENSNLEG00000035447	-	96	97.826	ENSACAG00000003624	RPL39	90	97.826	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000035447	-	96	95.652	ENSANAG00000015996	-	90	95.652	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSANAG00000033543	-	90	100.000	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000035447	-	96	97.826	ENSANAG00000012093	-	90	97.826	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSANAG00000012309	-	90	100.000	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSANAG00000031269	-	90	100.000	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000035447	-	96	97.826	ENSANAG00000011451	-	62	97.826	Aotus_nancymaae
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSACLG00000001657	rpl39	84	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSNLEG00000035447	-	90	100.000	ENSAMXG00000000196	rpl39	100	88.000	Astyanax_mexicanus
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSBTAG00000054736	RPL39	90	100.000	Bos_taurus
ENSNLEG00000035447	-	96	95.652	ENSBTAG00000048605	-	90	95.652	Bos_taurus
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSBTAG00000054083	RPL39	90	100.000	Bos_taurus
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSBTAG00000047136	RPL39	90	100.000	Bos_taurus
ENSNLEG00000035447	-	96	97.826	ENSBTAG00000049161	-	90	97.826	Bos_taurus
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSBTAG00000049441	RPL39	90	100.000	Bos_taurus
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSBTAG00000049833	RPL39	90	100.000	Bos_taurus
ENSNLEG00000035447	-	96	93.478	ENSBTAG00000048422	-	90	93.478	Bos_taurus
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSBTAG00000034844	RPL39	90	100.000	Bos_taurus
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCJAG00000038615	-	90	100.000	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000035447	-	96	91.304	ENSCJAG00000045028	-	61	91.304	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCJAG00000040046	-	90	100.000	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000035447	-	96	93.478	ENSCJAG00000048360	-	90	93.478	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAFG00000029014	-	90	100.000	Canis_familiaris
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAFG00000029524	-	90	100.000	Canis_familiaris
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAFG00000031092	-	90	100.000	Canis_familiaris
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAFG00000032101	-	90	100.000	Canis_familiaris
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAFG00000032122	-	90	100.000	Canis_familiaris
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAFG00020023650	-	90	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	89.583	ENSCAFG00020019046	-	91	89.583	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	97.826	ENSCAFG00020010357	-	90	97.826	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAFG00020027407	-	90	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAFG00020026703	-	90	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAFG00020003011	-	90	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAFG00020025145	-	92	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	97.826	ENSCAFG00020012355	-	90	97.826	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	97.826	ENSCAFG00020006843	-	90	97.826	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	93.478	ENSCAFG00020018445	-	61	93.478	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	95.652	ENSCAFG00020005870	-	90	95.652	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAFG00020014857	-	90	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	93.478	ENSCAFG00020017348	-	68	93.478	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	90.196	ENSCAFG00020004092	-	82	90.196	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAFG00020000437	-	90	100.000	Canis_lupus_dingo
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ENSNLEG00000035447	-	96	97.826	ENSCAFG00020013245	-	90	97.826	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035447	-	96	80.435	ENSCHIG00000005668	-	90	80.435	Capra_hircus
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ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCAPG00000011023	-	90	100.000	Cavia_aperea
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ENSNLEG00000035447	-	96	82.609	ENSCPOG00000036952	-	71	82.609	Cavia_porcellus
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ENSNLEG00000035447	-	96	95.652	ENSCCAG00000019645	-	92	95.652	Cebus_capucinus
ENSNLEG00000035447	-	96	97.826	ENSCCAG00000002926	-	90	97.826	Cebus_capucinus
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ENSNLEG00000035447	-	96	95.652	ENSCATG00000006529	-	90	95.652	Cercocebus_atys
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ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCSAG00000019753	-	90	100.000	Chlorocebus_sabaeus
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ENSNLEG00000035447	-	96	89.130	ENSCSAVG00000003995	-	90	89.130	Ciona_savignyi
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ENSNLEG00000035447	-	96	100.000	ENSCANG00000016024	-	90	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
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