EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNLEG00000035610 (Gene tree)
Gene ID: 100581364
Gene Symbol: APOBEC4
Alias: C1orf169|FLJ25691|MGC26594|RP1-127C7.4
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4
Gene Type: protein_coding
Species: Nomascus_leucogenys
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1107 bases
Position: chr9:32237328-32238434
Accession: 100581364
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNLEP00000039833	APOBEC_N	PF08210.11	1.9e-28	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNLET00000048628	APOBEC4-201	1107	XM_012501995	ENSNLEP00000039833	368 (aa)	XP_012357449	A0A2I3H885

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	96.739	ENSG00000173627	APOBEC4	100	96.739	Homo_sapiens
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	83.844	ENSAMEG00000002503	APOBEC4	94	83.844	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	95	52.676	ENSACAG00000015192	APOBEC4	98	53.429	Anolis_carolinensis
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	96	80.508	ENSBTAG00000047395	APOBEC4	98	80.780	Bos_taurus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	89.972	ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	89.972	Callithrix_jacchus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	82.173	ENSCAFG00000013349	APOBEC4	98	82.173	Canis_familiaris
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	82.173	ENSCAFG00020015526	APOBEC4	98	82.173	Canis_lupus_dingo
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	96	78.814	ENSCHIG00000011987	APOBEC4	93	78.552	Capra_hircus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	92.479	ENSCSAG00000000243	APOBEC4	98	92.479	Chlorocebus_sabaeus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	80.223	ENSCHOG00000012387	APOBEC4	98	80.223	Choloepus_hoffmanni
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	99	54.521	ENSCPBG00000015714	APOBEC4	95	54.596	Chrysemys_picta_bellii
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	92	64.809	ENSCGRG00001004553	Apobec4	95	64.809	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	82.880	ENSDNOG00000044664	APOBEC4	98	82.730	Dasypus_novemcinctus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	66.574	ENSDORG00000007335	Apobec4	99	66.574	Dipodomys_ordii
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	83.565	ENSEASG00005006513	APOBEC4	97	83.565	Equus_asinus_asinus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	83.565	ENSECAG00000019734	APOBEC4	97	83.565	Equus_caballus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	82.173	ENSFCAG00000010909	APOBEC4	98	82.173	Felis_catus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	85	78.526	ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	78.526	Fukomys_damarensis
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	89	48.795	ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.503	Gallus_gallus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	97.554	ENSGGOG00000042217	APOBEC4	100	97.554	Gorilla_gorilla
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	51.070	ENSLACG00000014504	APOBEC4	97	51.923	Latimeria_chalumnae
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	60	36.771	ENSLOCG00000010326	-	88	36.400	Lepisosteus_oculatus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	93.872	ENSMMUG00000031303	APOBEC4	98	93.872	Macaca_mulatta
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	88	48.624	ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	48.457	Meleagris_gallopavo
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	62.602	MGP_CAROLIEiJ_G0014701	Apobec4	94	63.611	Mus_caroli
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	61.518	ENSMUSG00000055547	Apobec4	94	62.500	Mus_musculus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	61.518	MGP_PahariEiJ_G0027937	Apobec4	94	62.500	Mus_pahari
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	60.705	MGP_SPRETEiJ_G0015508	Apobec4	94	61.667	Mus_spretus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	96	80.226	ENSMPUG00000011756	APOBEC4	95	80.501	Mustela_putorius_furo
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	96	77.966	ENSMLUG00000002458	APOBEC4	98	77.437	Myotis_lucifugus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	97	60.167	ENSNGAG00000017599	Apobec4	97	60.000	Nannospalax_galili
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	89	74.312	ENSODEG00000009778	APOBEC4	95	73.193	Octodon_degus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	95	58.571	ENSOANG00000001000	APOBEC4	98	57.939	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	79.944	ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	79.944	Otolemur_garnettii
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	96	80.226	ENSOARG00000005287	APOBEC4	98	79.944	Ovis_aries
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	93.478	ENSPPAG00000038272	APOBEC4	100	93.478	Pan_paniscus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	83.008	ENSPPRG00000014706	APOBEC4	98	83.008	Panthera_pardus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	82.730	ENSPTIG00000005518	APOBEC4	98	82.730	Panthera_tigris_altaica
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	96.739	ENSPTRG00000047181	APOBEC4	100	96.739	Pan_troglodytes
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	96	68.732	ENSPEMG00000019164	Apobec4	98	68.889	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	93	31.806	ENSPMAG00000006156	APOBEC4	87	33.025	Petromyzon_marinus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	97	67.598	ENSPCIG00000003817	APOBEC4	95	67.409	Phascolarctos_cinereus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	95.265	ENSPPYG00000000424	APOBEC4	98	95.265	Pongo_abelii
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	97	62.953	ENSPCAG00000015174	APOBEC4	98	62.778	Procavia_capensis
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	83.287	ENSPVAG00000001100	APOBEC4	98	83.287	Pteropus_vampyrus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	61.351	ENSRNOG00000028089	Apobec4	91	62.050	Rattus_norvegicus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	96	66.667	ENSSHAG00000013804	APOBEC4	98	66.111	Sarcophilus_harrisii
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	99	53.552	ENSSPUG00000010884	APOBEC4	95	53.782	Sphenodon_punctatus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	99	80.548	ENSSSCG00000015561	APOBEC4	98	80.780	Sus_scrofa
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	81.616	ENSTBEG00000006476	APOBEC4	98	81.616	Tupaia_belangeri
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	97	81.844	ENSTTRG00000014784	APOBEC4	98	81.616	Tursiops_truncatus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	96	83.523	ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	83.565	Ursus_americanus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	96	83.239	ENSUMAG00000016285	APOBEC4	98	83.287	Ursus_maritimus
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	81.894	ENSVVUG00000009054	APOBEC4	98	81.894	Vulpes_vulpes
ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	46.505	ENSXETG00000017441	apobec4	94	46.556	Xenopus_tropicalis