EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOANG00000009552 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Ornithorhynchus_anatinus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8634 bases
Position: chrUltra690:55253-63886
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOANP00000015167	SYF2	PF08231.12	7.9e-57	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOANT00000015170	SYF2-201	3297	-	ENSOANP00000015167	202 (aa)	XP_001510962	F6SWF6

Gene Model

Click here to download ENSOANG00000009552's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOANG00000009552's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSG00000117614	SYF2	83	90.099	Homo_sapiens
ENSOANG00000009552	SYF2	100	84.653	ENSAPOG00000001174	syf2	85	84.653	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSAMEG00000010115	-	83	89.604	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOANG00000009552	SYF2	97	90.769	ENSAMEG00000010134	-	100	90.769	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	ENSACIG00000023688	syf2	81	81.683	Amphilophus_citrinellus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	85.149	ENSAOCG00000022046	syf2	86	85.149	Amphiprion_ocellaris
ENSOANG00000009552	SYF2	92	83.784	ENSAOCG00000010912	syf2	58	83.784	Amphiprion_ocellaris
ENSOANG00000009552	SYF2	100	85.149	ENSAPEG00000018858	syf2	78	85.149	Amphiprion_percula
ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.663	ENSATEG00000007745	syf2	85	83.663	Anabas_testudineus
ENSOANG00000009552	SYF2	99	90.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	90.000	Anas_platyrhynchos
ENSOANG00000009552	SYF2	82	77.246	ENSACAG00000026777	-	100	77.246	Anolis_carolinensis
ENSOANG00000009552	SYF2	99	88.500	ENSACAG00000013653	-	98	88.500	Anolis_carolinensis
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	ENSANAG00000032473	SYF2	83	91.089	Aotus_nancymaae
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	ENSACLG00000019916	syf2	85	81.683	Astatotilapia_calliptera
ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.673	ENSAMXG00000004051	syf2	85	82.673	Astyanax_mexicanus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSBTAG00000001651	SYF2	86	90.594	Bos_taurus
ENSOANG00000009552	SYF2	99	51.485	WBGene00019402	syf-2	86	51.485	Caenorhabditis_elegans
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	ENSCJAG00000046570	SYF2	83	91.089	Callithrix_jacchus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	86.139	ENSCAFG00000030331	-	89	86.139	Canis_familiaris
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSCAFG00000012895	-	82	89.604	Canis_familiaris
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSCAFG00020021091	-	82	89.604	Canis_lupus_dingo
ENSOANG00000009552	SYF2	90	81.868	ENSCAFG00020021094	-	95	81.868	Canis_lupus_dingo
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSCHIG00000020874	SYF2	84	90.594	Capra_hircus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSTSYG00000005114	SYF2	83	90.099	Carlito_syrichta
ENSOANG00000009552	SYF2	98	90.404	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	90.404	Cavia_aperea
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSCPOG00000005326	SYF2	83	90.099	Cavia_porcellus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	ENSCCAG00000022459	SYF2	83	91.089	Cebus_capucinus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSCATG00000026917	SYF2	83	89.604	Cercocebus_atys
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	ENSCLAG00000008474	SYF2	83	91.089	Chinchilla_lanigera
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSCSAG00000000948	SYF2	83	89.604	Chlorocebus_sabaeus
ENSOANG00000009552	SYF2	64	82.946	ENSCHOG00000005273	-	79	82.946	Choloepus_hoffmanni
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	ENSCPBG00000025073	SYF2	81	91.089	Chrysemys_picta_bellii
ENSOANG00000009552	SYF2	99	55.665	ENSCING00000003017	-	85	55.172	Ciona_intestinalis
ENSOANG00000009552	SYF2	99	54.187	ENSCSAVG00000006627	-	93	54.187	Ciona_savignyi
ENSOANG00000009552	SYF2	100	77.228	ENSCANG00000037322	SYF2	80	77.228	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSCGRG00001020733	Syf2	83	89.604	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOANG00000009552	SYF2	97	90.306	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	89.950	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOANG00000009552	SYF2	100	78.713	ENSCSEG00000000117	syf2	85	78.713	Cynoglossus_semilaevis
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	ENSCVAG00000019543	syf2	85	81.683	Cyprinodon_variegatus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.168	ENSDARG00000004706	syf2	85	83.168	Danio_rerio
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSDNOG00000047605	SYF2	82	90.099	Dasypus_novemcinctus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.584	ENSDORG00000001274	Syf2	83	91.584	Dipodomys_ordii
ENSOANG00000009552	SYF2	99	59.113	FBgn0033556	CG12343	90	59.113	Drosophila_melanogaster
ENSOANG00000009552	SYF2	93	73.404	ENSETEG00000015729	SYF2	82	73.404	Echinops_telfairi
ENSOANG00000009552	SYF2	98	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSOANG00000009552	SYF2	100	80.693	ENSEASG00005004232	-	83	80.693	Equus_asinus_asinus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.584	ENSEASG00005004224	-	82	91.584	Equus_asinus_asinus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	ENSECAG00000012023	-	82	91.089	Equus_caballus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.584	ENSECAG00000010440	-	84	91.584	Equus_caballus
ENSOANG00000009552	SYF2	70	78.723	ENSEEUG00000015084	SYF2	77	78.723	Erinaceus_europaeus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	85.644	ENSELUG00000003465	syf2	85	85.644	Esox_lucius
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSFCAG00000043095	-	82	90.099	Felis_catus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.584	ENSFCAG00000010324	-	70	91.584	Felis_catus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	87.129	ENSFALG00000000460	SYF2	82	87.129	Ficedula_albicollis
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSFDAG00000008310	SYF2	83	90.099	Fukomys_damarensis
ENSOANG00000009552	SYF2	100	66.502	ENSFHEG00000007238	syf2	90	66.502	Fundulus_heteroclitus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	84.158	ENSGMOG00000019138	syf2	90	84.158	Gadus_morhua
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSGALG00000013639	SYF2	80	90.099	Gallus_gallus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	80.198	ENSGAFG00000019435	syf2	85	80.198	Gambusia_affinis
ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.178	ENSGACG00000007305	syf2	85	82.178	Gasterosteus_aculeatus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.584	ENSGAGG00000010670	SYF2	81	91.584	Gopherus_agassizii
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSGGOG00000012796	SYF2	83	90.594	Gorilla_gorilla
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	ENSHBUG00000020477	syf2	87	81.683	Haplochromis_burtoni
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSHGLG00000014393	SYF2	83	90.594	Heterocephalus_glaber_female
ENSOANG00000009552	SYF2	100	76.733	ENSHGLG00000004304	-	83	77.228	Heterocephalus_glaber_female
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSHGLG00100014722	SYF2	83	90.594	Heterocephalus_glaber_male
ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.663	ENSHCOG00000012904	syf2	66	83.663	Hippocampus_comes
ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.168	ENSIPUG00000019859	syf2	85	83.168	Ictalurus_punctatus
ENSOANG00000009552	SYF2	72	88.356	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	88.356	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOANG00000009552	SYF2	99	91.960	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	91.960	Jaculus_jaculus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.178	ENSKMAG00000013856	syf2	85	82.178	Kryptolebias_marmoratus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.663	ENSLBEG00000014425	syf2	85	83.663	Labrus_bergylta
ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.663	ENSLACG00000012064	SYF2	85	83.663	Latimeria_chalumnae
ENSOANG00000009552	SYF2	100	84.653	ENSLOCG00000002728	syf2	80	84.653	Lepisosteus_oculatus
ENSOANG00000009552	SYF2	87	63.128	ENSLAFG00000030814	-	96	63.128	Loxodonta_africana
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSLAFG00000023150	-	82	90.099	Loxodonta_africana
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSMFAG00000041831	SYF2	83	89.604	Macaca_fascicularis
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSMMUG00000002968	SYF2	83	89.604	Macaca_mulatta
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSMNEG00000030180	SYF2	83	89.604	Macaca_nemestrina
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSMLEG00000030248	SYF2	83	89.604	Mandrillus_leucophaeus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.188	ENSMAMG00000010403	syf2	84	81.188	Mastacembelus_armatus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	ENSMZEG00005006429	syf2	85	81.683	Maylandia_zebra
ENSOANG00000009552	SYF2	99	90.452	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	90.452	Meleagris_gallopavo
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSMAUG00000018974	Syf2	83	89.604	Mesocricetus_auratus
ENSOANG00000009552	SYF2	99	91.960	ENSMICG00000016191	SYF2	100	91.960	Microcebus_murinus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSMOCG00000022938	Syf2	83	90.594	Microtus_ochrogaster
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	ENSMMOG00000002396	syf2	85	81.683	Mola_mola
ENSOANG00000009552	SYF2	100	86.765	ENSMODG00000013951	-	89	86.765	Monodelphis_domestica
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.281	ENSMALG00000010706	syf2	84	81.773	Monopterus_albus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	83	90.099	Mus_caroli
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSMUSG00000028821	Syf2	83	90.099	Mus_musculus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	83	90.099	Mus_pahari
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	83	90.099	Mus_spretus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSMPUG00000015802	-	82	89.604	Mustela_putorius_furo
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSMPUG00000015801	-	82	90.594	Mustela_putorius_furo
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSMLUG00000001885	SYF2	83	90.099	Myotis_lucifugus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSNGAG00000007912	Syf2	82	90.594	Nannospalax_galili
ENSOANG00000009552	SYF2	100	72.772	ENSNBRG00000010720	syf2	86	72.772	Neolamprologus_brichardi
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSNLEG00000035185	SYF2	83	90.594	Nomascus_leucogenys
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSOPRG00000012870	SYF2	83	90.099	Ochotona_princeps
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSODEG00000017664	-	85	90.099	Octodon_degus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	80.198	ENSODEG00000014338	-	83	80.198	Octodon_degus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.188	ENSONIG00000008213	syf2	85	81.188	Oreochromis_niloticus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	ENSOCUG00000013050	SYF2	83	91.089	Oryctolagus_cuniculus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.673	ENSORLG00000028820	syf2	87	82.673	Oryzias_latipes
ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.673	ENSORLG00020018333	syf2	85	82.673	Oryzias_latipes_hni
ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.673	ENSORLG00015014665	syf2	85	82.673	Oryzias_latipes_hsok
ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.663	ENSOMEG00000013911	syf2	85	83.663	Oryzias_melastigma
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	ENSOGAG00000009962	SYF2	83	91.089	Otolemur_garnettii
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.706	ENSOARG00000006348	-	83	89.706	Ovis_aries
ENSOANG00000009552	SYF2	97	63.590	ENSOARG00000006269	-	100	63.590	Ovis_aries
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSPPAG00000036579	SYF2	83	90.594	Pan_paniscus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.584	ENSPPRG00000001638	-	82	91.584	Panthera_pardus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSPPRG00000001651	-	82	90.099	Panthera_pardus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.584	ENSPTIG00000005711	-	74	91.584	Panthera_tigris_altaica
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSPTIG00000007036	-	82	90.099	Panthera_tigris_altaica
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSPTRG00000000352	SYF2	83	90.594	Pan_troglodytes
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSPANG00000008139	SYF2	83	89.604	Papio_anubis
ENSOANG00000009552	SYF2	100	84.158	ENSPKIG00000008130	syf2	86	84.158	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSPSIG00000011816	SYF2	79	90.099	Pelodiscus_sinensis
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	ENSPMGG00000008755	syf2	79	81.683	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSPEMG00000008283	Syf2	83	90.099	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOANG00000009552	SYF2	100	94.059	ENSPCIG00000014235	SYF2	81	94.059	Phascolarctos_cinereus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.188	ENSPFOG00000004116	syf2	83	81.188	Poecilia_formosa
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.188	ENSPLAG00000006691	syf2	87	81.188	Poecilia_latipinna
ENSOANG00000009552	SYF2	100	77.228	ENSPMEG00000011684	syf2	86	77.228	Poecilia_mexicana
ENSOANG00000009552	SYF2	100	80.693	ENSPREG00000003009	syf2	85	80.693	Poecilia_reticulata
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSPPYG00000001713	SYF2	83	90.594	Pongo_abelii
ENSOANG00000009552	SYF2	79	74.214	ENSPCOG00000027011	SYF2	75	74.214	Propithecus_coquereli
ENSOANG00000009552	SYF2	100	78.713	ENSPVAG00000005841	SYF2	82	78.713	Pteropus_vampyrus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	ENSPNYG00000004979	syf2	85	81.683	Pundamilia_nyererei
ENSOANG00000009552	SYF2	100	84.158	ENSPNAG00000015570	syf2	85	84.158	Pygocentrus_nattereri
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	ENSRNOG00000060597	Syf2	83	90.099	Rattus_norvegicus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	86.634	ENSRBIG00000042970	SYF2	83	86.634	Rhinopithecus_bieti
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSRROG00000001347	SYF2	83	89.604	Rhinopithecus_roxellana
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSSBOG00000020184	SYF2	83	90.594	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOANG00000009552	SYF2	99	93.970	ENSSHAG00000007152	-	97	93.970	Sarcophilus_harrisii
ENSOANG00000009552	SYF2	100	93.069	ENSSHAG00000015630	-	81	93.069	Sarcophilus_harrisii
ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.663	ENSSFOG00015023647	syf2	85	83.663	Scleropages_formosus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.178	ENSSMAG00000009867	syf2	85	82.178	Scophthalmus_maximus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.673	ENSSDUG00000013072	syf2	85	82.673	Seriola_dumerili
ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.673	ENSSLDG00000012677	syf2	85	82.673	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOANG00000009552	SYF2	78	87.898	ENSSARG00000012889	SYF2	64	87.898	Sorex_araneus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.109	ENSSPUG00000005251	SYF2	80	89.109	Sphenodon_punctatus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.178	ENSSPAG00000009626	syf2	85	82.178	Stegastes_partitus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSSSCG00000037481	SYF2	82	90.594	Sus_scrofa
ENSOANG00000009552	SYF2	66	65.185	ENSTGUG00000001126	SYF2	51	80.392	Taeniopygia_guttata
ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	ENSTRUG00000001499	syf2	81	81.683	Takifugu_rubripes
ENSOANG00000009552	SYF2	100	79.208	ENSTNIG00000016912	syf2	91	79.208	Tetraodon_nigroviridis
ENSOANG00000009552	SYF2	100	64.851	ENSTBEG00000017370	SYF2	80	64.851	Tupaia_belangeri
ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	ENSTTRG00000003550	SYF2	83	90.594	Tursiops_truncatus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.109	ENSUAMG00000002897	SYF2	82	89.109	Ursus_americanus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.109	ENSUMAG00000013108	SYF2	82	89.109	Ursus_maritimus
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.109	ENSVPAG00000005705	SYF2	83	89.109	Vicugna_pacos
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSVVUG00000027181	-	81	89.604	Vulpes_vulpes
ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	ENSVVUG00000027175	-	82	89.604	Vulpes_vulpes
ENSOANG00000009552	SYF2	100	85.149	ENSXETG00000022797	syf2	81	85.149	Xenopus_tropicalis
ENSOANG00000009552	SYF2	100	80.693	ENSXMAG00000022698	syf2	85	80.693	Xiphophorus_maculatus