EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOANG00000015785 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ornithorhynchus_anatinus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 40565 bases
Position: chr1:13239073-13279637
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOANP00000024890	IBN_N	PF03810.19	4.1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOANT00000024894	TNPO1-201	2470	-	ENSOANP00000024890	820 (aa)	-	F7FXJ5

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	86.341	ENSOANG00000010051	TNPO2	92	86.341

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSG00000083312	TNPO1	92	97.927	Homo_sapiens
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.512	ENSAPOG00000003453	tnpo1	92	94.512	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	96.981	ENSAMEG00000007147	TNPO1	91	96.981	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOANG00000015785	TNPO1	90	93.775	ENSACIG00000003711	tnpo1	95	93.775	Amphilophus_citrinellus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.634	ENSAOCG00000008154	tnpo1	92	94.634	Amphiprion_ocellaris
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.634	ENSAPEG00000001112	tnpo1	92	94.634	Amphiprion_percula
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.634	ENSATEG00000010408	tnpo1	92	94.634	Anabas_testudineus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	95.157	ENSAPLG00000009619	-	92	95.157	Anas_platyrhynchos
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	98.171	ENSACAG00000009599	TNPO1	92	98.171	Anolis_carolinensis
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.439	ENSANAG00000022453	-	91	97.439	Aotus_nancymaae
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	89.146	ENSANAG00000025351	-	91	89.146	Aotus_nancymaae
ENSOANG00000015785	TNPO1	96	65.707	ENSANAG00000027118	-	91	65.461	Aotus_nancymaae
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	92.073	ENSACLG00000027223	tnpo1	92	92.073	Astatotilapia_calliptera
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.309	ENSAMXG00000009842	tnpo1	92	93.187	Astyanax_mexicanus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSBTAG00000007979	TNPO1	91	97.805	Bos_taurus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.561	ENSCJAG00000016409	TNPO1	91	97.561	Callithrix_jacchus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.689	ENSCAFG00000008081	TNPO1	96	97.689	Canis_familiaris
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.878	ENSCAFG00020017397	TNPO1	92	94.878	Canis_lupus_dingo
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.683	ENSCHIG00000023462	TNPO1	91	97.683	Capra_hircus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	96.341	ENSTSYG00000001871	TNPO1	93	96.341	Carlito_syrichta
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.439	ENSCCAG00000026472	TNPO1	92	97.439	Cebus_capucinus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSCATG00000043792	TNPO1	92	97.927	Cercocebus_atys
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.683	ENSCLAG00000016191	TNPO1	92	97.683	Chinchilla_lanigera
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSCSAG00000015616	TNPO1	91	97.927	Chlorocebus_sabaeus
ENSOANG00000015785	TNPO1	98	84.950	ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	84.950	Choloepus_hoffmanni
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	98.902	ENSCPBG00000000260	TNPO1	87	98.902	Chrysemys_picta_bellii
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	75.636	ENSCSAVG00000010981	-	92	75.515	Ciona_savignyi
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSCANG00000004353	TNPO1	91	97.927	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	91	97.805	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	96	97.805	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.659	ENSCSEG00000012674	tnpo1	92	93.659	Cynoglossus_semilaevis
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.634	ENSCVAG00000001010	tnpo1	92	94.634	Cyprinodon_variegatus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.301	ENSDARG00000035390	tnpo1	92	92.570	Danio_rerio
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	91.252	ENSDNOG00000006647	TNPO1	91	91.252	Dasypus_novemcinctus
ENSOANG00000015785	TNPO1	97	97.736	ENSDORG00000006476	Tnpo1	96	97.733	Dipodomys_ordii
ENSOANG00000015785	TNPO1	97	60.050	FBgn0035693	CG8219	92	59.925	Drosophila_melanogaster
ENSOANG00000015785	TNPO1	89	98.876	ENSETEG00000017805	TNPO1	85	98.876	Echinops_telfairi
ENSOANG00000015785	TNPO1	98	85.590	ENSEBUG00000001895	tnpo1	96	85.714	Eptatretus_burgeri
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSEASG00005018055	TNPO1	92	97.927	Equus_asinus_asinus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSECAG00000024424	TNPO1	91	97.805	Equus_caballus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	86.910	ENSELUG00000002821	tnpo1	92	86.203	Esox_lucius
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSFCAG00000013181	TNPO1	92	97.927	Felis_catus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	98.537	ENSFALG00000010292	TNPO1	92	98.537	Ficedula_albicollis
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSFDAG00000013345	TNPO1	91	97.805	Fukomys_damarensis
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.641	ENSFHEG00000019234	tnpo1	92	94.641	Fundulus_heteroclitus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	91.252	ENSGMOG00000000347	tnpo1	92	91.252	Gadus_morhua
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.683	ENSGALG00000015014	TNPO1	94	97.683	Gallus_gallus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.431	ENSGAFG00000000943	tnpo1	92	93.431	Gambusia_affinis
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.659	ENSGACG00000015841	tnpo1	92	93.659	Gasterosteus_aculeatus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	98.659	ENSGAGG00000013419	TNPO1	92	98.659	Gopherus_agassizii
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSGGOG00000026800	TNPO1	92	97.927	Gorilla_gorilla
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	81.509	ENSGGOG00000022535	-	90	81.509	Gorilla_gorilla
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.902	ENSHBUG00000008068	tnpo1	92	93.902	Haplochromis_burtoni
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.439	ENSHGLG00000000970	-	91	97.439	Heterocephalus_glaber_female
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.439	ENSHGLG00100017090	-	95	97.439	Heterocephalus_glaber_male
ENSOANG00000015785	TNPO1	99	75.702	ENSHGLG00100000963	-	93	75.092	Heterocephalus_glaber_male
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	98.049	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	89	98.049	Jaculus_jaculus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.512	ENSKMAG00000018195	tnpo1	92	94.512	Kryptolebias_marmoratus
ENSOANG00000015785	TNPO1	94	91.108	ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	91.108	Labrus_bergylta
ENSOANG00000015785	TNPO1	99	90.122	ENSLACG00000012199	TNPO1	95	90.122	Latimeria_chalumnae
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	96.463	ENSLOCG00000011092	tnpo1	90	96.463	Lepisosteus_oculatus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSLAFG00000011796	TNPO1	95	97.927	Loxodonta_africana
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSMFAG00000003636	TNPO1	91	97.927	Macaca_fascicularis
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSMMUG00000020923	TNPO1	92	97.805	Macaca_mulatta
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSMNEG00000044581	TNPO1	91	97.927	Macaca_nemestrina
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSMLEG00000030740	TNPO1	91	97.927	Mandrillus_leucophaeus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.634	ENSMAMG00000001357	tnpo1	92	94.634	Mastacembelus_armatus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.537	ENSMZEG00005004913	tnpo1	92	93.537	Maylandia_zebra
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	91	97.805	Mesocricetus_auratus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.659	ENSMICG00000008468	TNPO1	91	93.659	Microcebus_murinus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	91	97.805	Microtus_ochrogaster
ENSOANG00000015785	TNPO1	90	93.927	ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	93.927	Mola_mola
ENSOANG00000015785	TNPO1	99	97.931	ENSMODG00000001721	TNPO1	74	97.931	Monodelphis_domestica
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.293	ENSMALG00000009782	tnpo1	92	93.293	Monopterus_albus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.561	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	96	97.798	Mus_caroli
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	96	98.057	Mus_musculus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.683	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	97.927	Mus_pahari
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.561	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	96	97.798	Mus_spretus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSMPUG00000014387	TNPO1	91	97.805	Mustela_putorius_furo
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.330	ENSMLUG00000016317	TNPO1	96	97.330	Myotis_lucifugus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	92	97.927	Nannospalax_galili
ENSOANG00000015785	TNPO1	90	93.640	ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	93.640	Neolamprologus_brichardi
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSNLEG00000004572	TNPO1	92	97.927	Nomascus_leucogenys
ENSOANG00000015785	TNPO1	90	91.901	ENSOPRG00000012390	TNPO1	82	91.901	Ochotona_princeps
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.439	ENSODEG00000001771	TNPO1	91	97.439	Octodon_degus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.099	ENSONIG00000011151	tnpo1	91	93.099	Oreochromis_niloticus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	91.108	ENSOCUG00000013318	TNPO1	96	90.621	Oryctolagus_cuniculus
ENSOANG00000015785	TNPO1	90	93.775	ENSORLG00000003182	tnpo1	95	93.775	Oryzias_latipes
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.902	ENSORLG00020011559	tnpo1	92	93.902	Oryzias_latipes_hni
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.146	ENSORLG00015019113	tnpo1	92	94.146	Oryzias_latipes_hsok
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.268	ENSOMEG00000014567	tnpo1	92	94.268	Oryzias_melastigma
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSOGAG00000000808	TNPO1	91	97.927	Otolemur_garnettii
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSOARG00000005038	TNPO1	77	97.805	Ovis_aries
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSPPAG00000042518	TNPO1	91	97.927	Pan_paniscus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSPPRG00000022336	TNPO1	92	97.927	Panthera_pardus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSPTIG00000018839	TNPO1	92	97.927	Panthera_tigris_altaica
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSPTRG00000016972	TNPO1	91	97.927	Pan_troglodytes
ENSOANG00000015785	TNPO1	94	85.652	ENSPTRG00000047731	-	91	85.652	Pan_troglodytes
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSPANG00000006074	TNPO1	91	97.927	Papio_anubis
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	90.610	ENSPKIG00000019795	tnpo1	92	90.610	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSOANG00000015785	TNPO1	100	91.108	ENSPMGG00000017014	tnpo1	92	90.987	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	96	97.805	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.168	ENSPFOG00000011447	tnpo1	92	94.168	Poecilia_formosa
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ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	ENSPPYG00000015545	TNPO1	91	97.805	Pongo_abelii
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSPCOG00000004254	TNPO1	91	97.927	Propithecus_coquereli
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	ENSPVAG00000013051	TNPO1	91	97.927	Pteropus_vampyrus
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.666	ENSPNYG00000001522	tnpo1	92	93.666	Pundamilia_nyererei
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	92.822	ENSPNAG00000021484	tnpo1	92	93.309	Pygocentrus_nattereri
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	98.049	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	92	98.049	Rattus_norvegicus
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ENSOANG00000015785	TNPO1	100	95.000	ENSXETG00000016812	tnpo1	91	95.000	Xenopus_tropicalis
ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.910	ENSXMAG00000005440	tnpo1	92	93.910	Xiphophorus_maculatus