EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOARG00000004404 (Gene tree)
Gene ID: 101117964
Gene Symbol: SBNO1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ovis_aries
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 41738 bases
Position: chr17:51840483-51882220
Accession: 101117964
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOARP00000004726	ResIII	PF04851.15	7.9e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOART00000004807	SBNO1-201	4185	XM_004017323	ENSOARP00000004726	1394 (aa)	XP_004017372	W5P2S6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOARG00000004404	SBNO1	66	64.560	ENSOARG00000011130	SBNO2	68	64.560

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.775	ENSG00000139697	SBNO1	99	97.775	Homo_sapiens
ENSOARG00000004404	SBNO1	83	81.046	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.132	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.136	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	98.136	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	74.701	ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.040	Amphilophus_citrinellus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.263	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.105	Amphiprion_ocellaris
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.263	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	75.105	Amphiprion_percula
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.891	ENSATEG00000006667	sbno1	100	76.031	Anabas_testudineus
ENSOARG00000004404	SBNO1	98	92.319	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	91.894	Anas_platyrhynchos
ENSOARG00000004404	SBNO1	98	87.482	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.074	Anolis_carolinensis
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.418	ENSANAG00000029958	-	99	98.188	Aotus_nancymaae
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	74.251	ENSACLG00000024913	sbno1	100	74.200	Astatotilapia_calliptera
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	79.205	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	79.489	Astyanax_mexicanus
ENSOARG00000004404	SBNO1	100	99.570	ENSBTAG00000020505	SBNO1	100	99.570	Bos_taurus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.561	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	97.561	Callithrix_jacchus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.066	ENSCAFG00000007503	SBNO1	99	98.242	Canis_familiaris
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.346	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	97.346	Canis_lupus_dingo
ENSOARG00000004404	SBNO1	100	99.785	ENSCHIG00000008382	SBNO1	100	99.785	Capra_hircus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.135	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	98.135	Carlito_syrichta
ENSOARG00000004404	SBNO1	95	97.673	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	97.861	Cavia_aperea
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.272	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	98.732	Cavia_porcellus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	93.190	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	93.190	Cebus_capucinus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	95.827	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	98.732	Cercocebus_atys
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.059	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	98.732	Chinchilla_lanigera
ENSOARG00000004404	SBNO1	83	98.274	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	98.274	Chlorocebus_sabaeus
ENSOARG00000004404	SBNO1	96	94.524	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	94.524	Choloepus_hoffmanni
ENSOARG00000004404	SBNO1	98	92.398	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	91.822	Chrysemys_picta_bellii
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	92.258	ENSCANG00000042688	-	99	92.186	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOARG00000004404	SBNO1	100	96.918	ENSCGRG00001017470	Sbno1	100	96.918	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOARG00000004404	SBNO1	100	96.918	ENSCGRG00000004756	Sbno1	100	96.918	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	74.429	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	75.490	Cynoglossus_semilaevis
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.457	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	75.613	Cyprinodon_variegatus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	79.429	ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.714	Danio_rerio
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.200	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	97.949	Dasypus_novemcinctus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	84.263	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	84.263	Dipodomys_ordii
ENSOARG00000004404	SBNO1	93	90.286	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.286	Echinops_telfairi
ENSOARG00000004404	SBNO1	75	62.791	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.140	Eptatretus_burgeri
ENSOARG00000004404	SBNO1	51	94.225	ENSEASG00005012595	-	92	94.225	Equus_asinus_asinus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.637	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	98.668	Equus_caballus
ENSOARG00000004404	SBNO1	83	97.814	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	97.814	Erinaceus_europaeus
ENSOARG00000004404	SBNO1	100	77.879	ENSELUG00000002886	sbno1	100	77.949	Esox_lucius
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.565	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	98.565	Felis_catus
ENSOARG00000004404	SBNO1	98	92.099	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	91.822	Ficedula_albicollis
ENSOARG00000004404	SBNO1	100	95.624	ENSFDAG00000014232	SBNO1	100	95.624	Fukomys_damarensis
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.565	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	75.615	Fundulus_heteroclitus
ENSOARG00000004404	SBNO1	94	78.185	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.659	Gadus_morhua
ENSOARG00000004404	SBNO1	88	92.539	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.376	Gallus_gallus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.758	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	75.386	Gambusia_affinis
ENSOARG00000004404	SBNO1	94	78.979	ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.751	Gasterosteus_aculeatus
ENSOARG00000004404	SBNO1	96	94.953	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.384	Gopherus_agassizii
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.703	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	97.703	Gorilla_gorilla
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	68.608	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	68.577	Haplochromis_burtoni
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.274	ENSHGLG00000014165	-	99	98.913	Heterocephalus_glaber_female
ENSOARG00000004404	SBNO1	93	84.980	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	84.980	Hippocampus_comes
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	78.790	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	78.861	Ictalurus_punctatus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.349	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.275	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.418	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	97.418	Jaculus_jaculus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.352	ENSKMAG00000009696	sbno1	100	75.017	Kryptolebias_marmoratus
ENSOARG00000004404	SBNO1	100	75.175	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	76.031	Labrus_bergylta
ENSOARG00000004404	SBNO1	100	81.254	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.900	Latimeria_chalumnae
ENSOARG00000004404	SBNO1	100	81.999	ENSLOCG00000005725	sbno1	98	81.844	Lepisosteus_oculatus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.059	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	97.059	Loxodonta_africana
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.561	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	97.561	Macaca_fascicularis
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.631	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	97.631	Macaca_mulatta
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	95.839	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	98.732	Mandrillus_leucophaeus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.721	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	75.862	Mastacembelus_armatus
ENSOARG00000004404	SBNO1	98	92.246	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	92.295	Meleagris_gallopavo
ENSOARG00000004404	SBNO1	50	92.857	ENSMAUG00000004834	-	100	92.857	Mesocricetus_auratus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	96.987	ENSMICG00000006573	-	99	96.987	Microcebus_murinus
ENSOARG00000004404	SBNO1	100	93.481	ENSMOCG00000009390	Sbno1	100	96.975	Microtus_ochrogaster
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	71.640	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	71.609	Mola_mola
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	94.763	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	94.763	Monodelphis_domestica
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.402	ENSMALG00000001056	sbno1	100	75.402	Monopterus_albus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	96.841	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	99	96.841	Mus_caroli
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.344	ENSMUSG00000038095	Sbno1	100	96.831	Mus_musculus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.416	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	100	96.831	Mus_pahari
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.128	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	99	97.128	Mus_spretus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.350	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	98.350	Mustela_putorius_furo
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.920	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	97.920	Myotis_lucifugus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.704	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	99.408	Nannospalax_galili
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	74.341	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	74.290	Neolamprologus_brichardi
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	93.970	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	93.970	Nomascus_leucogenys
ENSOARG00000004404	SBNO1	62	84.203	ENSMEUG00000008768	-	93	87.975	Notamacropus_eugenii
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	94.194	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	94.122	Ochotona_princeps
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.200	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	97.200	Octodon_degus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.509	ENSONIG00000015348	sbno1	100	75.594	Oreochromis_niloticus
ENSOARG00000004404	SBNO1	98	96.356	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	96.356	Oryctolagus_cuniculus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.088	ENSORLG00000001593	sbno1	100	74.825	Oryzias_latipes
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.211	ENSORLG00020015216	sbno1	100	74.807	Oryzias_latipes_hni
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.211	ENSORLG00015002726	sbno1	100	74.877	Oryzias_latipes_hsok
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.228	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	74.842	Oryzias_melastigma
ENSOARG00000004404	SBNO1	50	89.714	ENSOGAG00000010781	-	100	90.286	Otolemur_garnettii
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.704	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	97.704	Pan_paniscus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.565	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.565	Panthera_pardus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.350	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	98.350	Panthera_tigris_altaica
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.776	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	97.776	Pan_troglodytes
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.703	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	98.732	Papio_anubis
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	80.399	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.627	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOARG00000004404	SBNO1	98	91.345	ENSPSIG00000009572	-	99	90.922	Pelodiscus_sinensis
ENSOARG00000004404	SBNO1	92	87.888	ENSPSIG00000009256	-	100	87.888	Pelodiscus_sinensis
ENSOARG00000004404	SBNO1	100	96.774	ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	96.774	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	93.907	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	94.122	Phascolarctos_cinereus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	76.056	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	75.753	Poecilia_formosa
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.915	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	76.104	Poecilia_latipinna
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	76.144	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	75.840	Poecilia_mexicana
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.792	ENSPREG00000017746	sbno1	100	75.490	Poecilia_reticulata
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.416	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	97.416	Pongo_abelii
ENSOARG00000004404	SBNO1	89	92.886	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	92.886	Procavia_capensis
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.063	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	98.361	Propithecus_coquereli
ENSOARG00000004404	SBNO1	87	98.807	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	98.807	Pteropus_vampyrus
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.826	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	75.700	Pundamilia_nyererei
ENSOARG00000004404	SBNO1	99	79.093	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	78.951	Pygocentrus_nattereri
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ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.704	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	98.732	Rhinopithecus_roxellana
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