EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOARG00000005038 (Gene tree)
Gene ID: 101115311
Gene Symbol: TNPO1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ovis_aries
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 83905 bases
Position: chr16:8729224-8813128
Accession: 101115311
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOARP00000005404	IBN_N	PF03810.19	7.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOART00000005491	TNPO1-201	3811	XM_004016896	ENSOARP00000005404	1064 (aa)	XP_004016945	W5P4Q1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	83.817	ENSOARG00000011717	TNPO2	92	85.369

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.933	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.933	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	98.780	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.780	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOARG00000005038	TNPO1	73	93.023	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	Amphilophus_citrinellus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	94.045	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	94.045	Amphiprion_ocellaris
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	94.045	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.045	Amphiprion_percula
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.596	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.596	Anabas_testudineus
ENSOARG00000005038	TNPO1	83	92.559	ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	Anas_platyrhynchos
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	96.854	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.854	Anolis_carolinensis
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	88.307	ENSANAG00000025351	-	100	88.307	Aotus_nancymaae
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.332	ENSANAG00000022453	-	100	99.332	Aotus_nancymaae
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	64.309	ENSANAG00000027118	-	99	63.978	Aotus_nancymaae
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	91.685	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	Astatotilapia_calliptera
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.825	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.489	Astyanax_mexicanus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	100.000	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	100.000	Bos_taurus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.443	Callithrix_jacchus
ENSOARG00000005038	TNPO1	80	99.533	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.533	Canis_familiaris
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	96.742	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.742	Canis_lupus_dingo
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.889	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.889	Capra_hircus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	94.961	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.961	Carlito_syrichta
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.332	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.332	Cebus_capucinus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.777	Cercocebus_atys
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.332	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.332	Chinchilla_lanigera
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.889	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.889	Chlorocebus_sabaeus
ENSOARG00000005038	TNPO1	80	87.131	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	Choloepus_hoffmanni
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	97.643	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	Chrysemys_picta_bellii
ENSOARG00000005038	TNPO1	83	75.533	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.533	Ciona_savignyi
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.777	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.443	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOARG00000005038	TNPO1	80	99.415	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.415	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.360	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.360	Cynoglossus_semilaevis
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.146	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	Cyprinodon_variegatus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.480	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.480	Danio_rerio
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.638	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.638	Dasypus_novemcinctus
ENSOARG00000005038	TNPO1	78	99.759	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	Dipodomys_ordii
ENSOARG00000005038	TNPO1	83	57.788	FBgn0035693	CG8219	99	57.223	Drosophila_melanogaster
ENSOARG00000005038	TNPO1	73	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	Echinops_telfairi
ENSOARG00000005038	TNPO1	79	85.119	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	Eptatretus_burgeri
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.777	Equus_asinus_asinus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.555	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.555	Equus_caballus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	86.334	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.792	Esox_lucius
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.777	Felis_catus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	97.303	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	Ficedula_albicollis
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.443	Fukomys_damarensis
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.490	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	92.929	Fundulus_heteroclitus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	89.744	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.744	Gadus_morhua
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	96.629	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	Gallus_gallus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.265	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.040	Gambusia_affinis
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.065	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.065	Gasterosteus_aculeatus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	97.416	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	Gopherus_agassizii
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	83.017	ENSGGOG00000022535	-	99	82.793	Gorilla_gorilla
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.777	Gorilla_gorilla
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.258	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	Haplochromis_burtoni
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.332	ENSHGLG00000000970	-	100	99.332	Heterocephalus_glaber_female
ENSOARG00000005038	TNPO1	80	99.182	ENSHGLG00100017090	-	99	99.182	Heterocephalus_glaber_male
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	75.390	ENSHGLG00100000963	-	100	74.833	Heterocephalus_glaber_male
ENSOARG00000005038	TNPO1	85	98.782	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	98	98.782	Jaculus_jaculus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.483	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	Kryptolebias_marmoratus
ENSOARG00000005038	TNPO1	77	88.889	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.642	Labrus_bergylta
ENSOARG00000005038	TNPO1	80	89.070	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	Latimeria_chalumnae
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	95.190	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	95.190	Lepisosteus_oculatus
ENSOARG00000005038	TNPO1	81	98.961	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.961	Loxodonta_africana
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.777	Macaca_fascicularis
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.666	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.666	Macaca_mulatta
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.777	Macaca_nemestrina
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.777	Mandrillus_leucophaeus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.596	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.596	Mastacembelus_armatus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.034	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	Maylandia_zebra
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.330	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	95.633	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.633	Microcebus_murinus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	98.997	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	98.997	Microtus_ochrogaster
ENSOARG00000005038	TNPO1	73	92.655	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	91.881	Mola_mola
ENSOARG00000005038	TNPO1	83	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	Monodelphis_domestica
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.472	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.472	Monopterus_albus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.555	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.220	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.666	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.666	Mustela_putorius_furo
ENSOARG00000005038	TNPO1	80	99.069	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.069	Myotis_lucifugus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.443	Nannospalax_galili
ENSOARG00000005038	TNPO1	73	92.894	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	Neolamprologus_brichardi
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.777	Nomascus_leucogenys
ENSOARG00000005038	TNPO1	77	92.966	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	Ochotona_princeps
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.109	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.109	Octodon_degus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.333	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.333	Oreochromis_niloticus
ENSOARG00000005038	TNPO1	77	97.805	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOARG00000005038	TNPO1	80	93.107	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	Oryctolagus_cuniculus
ENSOARG00000005038	TNPO1	72	92.607	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	Oryzias_latipes
ENSOARG00000005038	TNPO1	83	92.897	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	Oryzias_latipes_hni
ENSOARG00000005038	TNPO1	83	93.010	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	Oryzias_latipes_hsok
ENSOARG00000005038	TNPO1	83	92.897	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	Oryzias_melastigma
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.889	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.889	Otolemur_garnettii
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.777	Pan_paniscus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.777	Panthera_pardus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.777	Panthera_tigris_altaica
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.777	Pan_troglodytes
ENSOARG00000005038	TNPO1	79	86.740	ENSPTRG00000047731	-	100	86.464	Pan_troglodytes
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.777	Papio_anubis
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	90.449	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.449	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	96.882	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	Pelodiscus_sinensis
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	90.685	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOARG00000005038	TNPO1	80	99.415	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.415	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	98.427	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.427	Phascolarctos_cinereus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.057	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	92.161	Poecilia_formosa
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.057	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.161	Poecilia_latipinna
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.258	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	Poecilia_mexicana
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.161	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.265	Poecilia_reticulata
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.666	ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.666	Pongo_abelii
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.666	ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.666	Propithecus_coquereli
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.443	Pteropus_vampyrus
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.042	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.480	Pundamilia_nyererei
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.713	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.713	Pygocentrus_nattereri
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.213	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	100	99.213	Rattus_norvegicus
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ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	ENSRROG00000035271	TNPO1	100	99.777	Rhinopithecus_roxellana
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	ENSSBOG00000029256	TNPO1	100	99.443	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOARG00000005038	TNPO1	81	97.917	ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.917	Sarcophilus_harrisii
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	94.388	ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.052	Scleropages_formosus
ENSOARG00000005038	TNPO1	80	93.575	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.575	Scophthalmus_maximus
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ENSOARG00000005038	TNPO1	58	88.799	ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	Tetraodon_nigroviridis
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ENSOARG00000005038	TNPO1	84	94.382	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	Xenopus_tropicalis
ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.929	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.817	Xiphophorus_maculatus