EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOARG00000020601 (Gene tree)
Gene ID: 101105398
Gene Symbol: POLR1A
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Ovis_aries
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 84444 bases
Position: chr3:57780869-57865312
Accession: 101105398
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOARP00000022139	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	7.4e-104	1	1
ENSOARP00000022139	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	5.7e-26	1	1
ENSOARP00000022139	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	1.1e-70	1	1
ENSOARP00000022139	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	2.4e-33	1	1
ENSOARP00000022139	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	3.7e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOART00000022444	POLR1A-201	5166	XM_004005884	ENSOARP00000022139	1721 (aa)	XP_004005933	W5QHD9

Gene Model

Click here to download ENSOARG00000020601's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
oas03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOARG00000020601's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOARG00000020601	POLR1A	71	32.183	ENSOARG00000009656	POLR3A	74	32.183
ENSOARG00000020601	POLR1A	83	30.769	ENSOARG00000013874	-	68	30.769

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.669	ENSG00000068654	POLR1A	100	89.611	Homo_sapiens
ENSOARG00000020601	POLR1A	69	67.647	ENSAPOG00000017945	polr1a	99	67.647	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	91.347	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	91.922	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	63.426	ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.927	Amphilophus_citrinellus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	66.262	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	68.443	Amphiprion_ocellaris
ENSOARG00000020601	POLR1A	94	72.535	ENSAPEG00000016105	polr1a	98	72.535	Amphiprion_percula
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	66.532	ENSATEG00000016773	polr1a	100	66.224	Anabas_testudineus
ENSOARG00000020601	POLR1A	86	72.807	ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.151	Anas_platyrhynchos
ENSOARG00000020601	POLR1A	99	69.129	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	68.876	Anolis_carolinensis
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.502	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	88.502	Aotus_nancymaae
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	63.179	ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.891	Astatotilapia_calliptera
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	97.096	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	97.096	Bos_taurus
ENSOARG00000020601	POLR1A	99	38.668	WBGene00012999	rpoa-1	98	37.788	Caenorhabditis_elegans
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.044	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	87.986	Callithrix_jacchus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	90.825	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	90.825	Canis_familiaris
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	90.620	ENSCAFG00020014752	POLR1A	100	90.620	Canis_lupus_dingo
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	96.296	ENSCHIG00000018204	POLR1A	99	98.836	Capra_hircus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	86.941	ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.477	Carlito_syrichta
ENSOARG00000020601	POLR1A	97	83.701	ENSCAPG00000010132	POLR1A	100	83.632	Cavia_aperea
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.232	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	88.167	Cavia_porcellus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.392	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	88.508	Cebus_capucinus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.785	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	89.727	Cercocebus_atys
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.201	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.266	Chinchilla_lanigera
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.785	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	89.785	Chlorocebus_sabaeus
ENSOARG00000020601	POLR1A	99	74.173	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	74.102	Chrysemys_picta_bellii
ENSOARG00000020601	POLR1A	91	55.693	ENSCSAVG00000007184	-	91	55.693	Ciona_savignyi
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	86.992	ENSCANG00000031785	POLR1A	100	86.934	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	82.775	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	82.143	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOARG00000020601	POLR1A	60	86.377	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	85.303	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	61.587	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	61.294	Cynoglossus_semilaevis
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	64.273	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	64.129	Cyprinodon_variegatus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	66.686	ENSDARG00000098375	polr1a	100	67.206	Danio_rerio
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	82.513	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	82.513	Dasypus_novemcinctus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	87.796	ENSDORG00000008298	Polr1a	100	86.369	Dipodomys_ordii
ENSOARG00000020601	POLR1A	72	100.000	ENSETEG00000000412	-	72	100.000	Echinops_telfairi
ENSOARG00000020601	POLR1A	81	66.667	ENSEBUG00000005667	-	99	47.220	Eptatretus_burgeri
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	92.058	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	91.812	Equus_asinus_asinus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	92.058	ENSECAG00000030510	-	100	93.983	Equus_caballus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	92.058	ENSECAG00000010092	POLR1A	100	93.983	Equus_caballus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	92.058	ENSECAG00000036306	-	100	93.983	Equus_caballus
ENSOARG00000020601	POLR1A	85	95.745	ENSEEUG00000000676	POLR1A	85	95.556	Erinaceus_europaeus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	66.609	ENSELUG00000012769	polr1a	99	67.438	Esox_lucius
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	90.957	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	91.173	Felis_catus
ENSOARG00000020601	POLR1A	99	71.487	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	71.145	Ficedula_albicollis
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	87.949	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	86.974	Fukomys_damarensis
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	61.855	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	61.410	Fundulus_heteroclitus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	60.244	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	60.347	Gadus_morhua
ENSOARG00000020601	POLR1A	90	69.814	ENSGALG00000038160	-	99	70.330	Gallus_gallus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	64.178	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	63.830	Gambusia_affinis
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	64.429	ENSGACG00000018791	polr1a	100	64.396	Gasterosteus_aculeatus
ENSOARG00000020601	POLR1A	90	75.097	ENSGAGG00000004984	-	96	81.337	Gopherus_agassizii
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.611	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	89.553	Gorilla_gorilla
ENSOARG00000020601	POLR1A	90	64.762	ENSHBUG00000020021	polr1a	99	64.964	Haplochromis_burtoni
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.457	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	88.106	Heterocephalus_glaber_female
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.201	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	87.853	Heterocephalus_glaber_male
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	62.723	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	62.788	Hippocampus_comes
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	66.223	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	65.098	Ictalurus_punctatus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	86.616	ENSSTOG00000012580	POLR1A	100	86.061	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	87.261	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	86.901	Jaculus_jaculus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	65.603	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	65.429	Kryptolebias_marmoratus
ENSOARG00000020601	POLR1A	94	68.908	ENSLBEG00000015401	polr1a	99	69.021	Labrus_bergylta
ENSOARG00000020601	POLR1A	53	76.030	ENSLACG00000003218	polr1a	100	76.030	Latimeria_chalumnae
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	71.016	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	71.074	Lepisosteus_oculatus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.619	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	88.388	Loxodonta_africana
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.919	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	89.785	Macaca_fascicularis
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.919	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	89.785	Macaca_mulatta
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.919	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	89.785	Macaca_nemestrina
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.147	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	89.089	Mandrillus_leucophaeus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	65.918	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	66.532	Mastacembelus_armatus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	66.474	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	65.272	Maylandia_zebra
ENSOARG00000020601	POLR1A	99	69.119	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	69.119	Meleagris_gallopavo
ENSOARG00000020601	POLR1A	92	87.516	ENSMAUG00000008497	Polr1a	100	87.060	Mesocricetus_auratus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.727	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	89.437	Microcebus_murinus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	87.102	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	87.392	Microtus_ochrogaster
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	64.887	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	64.835	Mola_mola
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	75.416	ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.244	Monodelphis_domestica
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	63.951	ENSMALG00000013363	polr1a	100	65.533	Monopterus_albus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	85.665	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	85.946	Mus_caroli
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	85.723	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	84.713	Mus_musculus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	86.382	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	85.362	Mus_pahari
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	84.357	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	85.217	Mus_spretus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	90.941	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	90.883	Mustela_putorius_furo
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.249	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	89.184	Myotis_lucifugus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	87.464	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	87.514	Nannospalax_galili
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	66.243	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	65.387	Neolamprologus_brichardi
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	87.926	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	87.868	Nomascus_leucogenys
ENSOARG00000020601	POLR1A	75	92.126	ENSMEUG00000011665	-	75	92.126	Notamacropus_eugenii
ENSOARG00000020601	POLR1A	99	82.588	ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.422	Ochotona_princeps
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.535	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	88.580	Octodon_degus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	66.416	ENSONIG00000015895	polr1a	100	65.484	Oreochromis_niloticus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.986	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	88.895	Oryctolagus_cuniculus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	64.951	ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.913	Oryzias_latipes
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	63.736	ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.389	Oryzias_latipes_hni
ENSOARG00000020601	POLR1A	96	73.404	ENSORLG00015016071	polr1a	99	73.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.850	ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.850	Otolemur_garnettii
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.553	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	89.495	Pan_paniscus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	91.246	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	91.405	Panthera_pardus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	90.699	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	90.856	Panthera_tigris_altaica
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.669	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	89.669	Pan_troglodytes
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.669	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	89.611	Papio_anubis
ENSOARG00000020601	POLR1A	94	74.306	ENSPKIG00000005468	polr1a	99	74.306	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOARG00000020601	POLR1A	63	72.059	ENSPSIG00000009321	-	99	71.507	Pelodiscus_sinensis
ENSOARG00000020601	POLR1A	54	68.410	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.410	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.143	ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.041	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOARG00000020601	POLR1A	95	78.931	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	78.871	Phascolarctos_cinereus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	64.583	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	64.120	Poecilia_formosa
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	64.774	ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.311	Poecilia_latipinna
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	63.021	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	62.565	Poecilia_mexicana
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	64.873	ENSPREG00000002389	polr1a	100	64.319	Poecilia_reticulata
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.321	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	89.263	Pongo_abelii
ENSOARG00000020601	POLR1A	92	100.000	ENSPCAG00000011582	POLR1A	92	100.000	Procavia_capensis
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.843	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	89.611	Propithecus_coquereli
ENSOARG00000020601	POLR1A	95	89.706	ENSPVAG00000012674	POLR1A	95	88.421	Pteropus_vampyrus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	66.474	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	65.272	Pundamilia_nyererei
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	66.994	ENSPNAG00000019223	polr1a	100	66.609	Pygocentrus_nattereri
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	86.813	ENSRNOG00000009545	Polr1a	100	87.392	Rattus_norvegicus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.147	ENSRBIG00000028335	POLR1A	100	89.089	Rhinopithecus_bieti
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	89.089	ENSRROG00000031473	POLR1A	100	89.031	Rhinopithecus_roxellana
ENSOARG00000020601	POLR1A	99	36.972	YOR341W	RPA190	99	36.461	Saccharomyces_cerevisiae
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	87.986	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	87.928	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	73.690	ENSSHAG00000014739	POLR1A	100	73.690	Sarcophilus_harrisii
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	67.690	ENSSFOG00015019716	polr1a	100	67.805	Scleropages_formosus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	66.168	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	66.474	Scophthalmus_maximus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	67.359	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	67.512	Seriola_dumerili
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	65.340	ENSSLDG00000024095	polr1a	100	65.063	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOARG00000020601	POLR1A	75	95.745	ENSSARG00000003136	-	76	95.745	Sorex_araneus
ENSOARG00000020601	POLR1A	94	80.000	ENSSPUG00000004215	POLR1A	98	80.000	Sphenodon_punctatus
ENSOARG00000020601	POLR1A	65	72.676	ENSSPAG00000016341	polr1a	96	72.676	Stegastes_partitus
ENSOARG00000020601	POLR1A	83	92.862	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	92.842	Sus_scrofa
ENSOARG00000020601	POLR1A	99	70.153	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	69.464	Taeniopygia_guttata
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	63.746	ENSTRUG00000002210	polr1a	97	65.618	Takifugu_rubripes
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	59.954	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	59.828	Tetraodon_nigroviridis
ENSOARG00000020601	POLR1A	74	96.018	ENSTBEG00000008646	POLR1A	74	96.018	Tupaia_belangeri
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.406	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	88.792	Tursiops_truncatus
ENSOARG00000020601	POLR1A	69	91.293	ENSUAMG00000012158	-	94	91.293	Ursus_americanus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	90.534	ENSUMAG00000006700	POLR1A	100	90.534	Ursus_maritimus
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	90.534	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	90.534	Vulpes_vulpes
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	68.166	ENSXETG00000001952	polr1a	100	69.441	Xenopus_tropicalis
ENSOARG00000020601	POLR1A	100	64.719	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	64.380	Xiphophorus_maculatus