EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSOARG00000020798 (Gene tree)
Gene ID: 101104702
Gene Symbol: PRPF3
Alias: -
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Ovis_aries
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17403 bases
Position: chr1:99305883-99323285
Accession: 101104702
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOARP00000022356	PRP3	PF08572.10	1.6e-79	1	1
ENSOARP00000022356	PWI	PF01480.17	2.4e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOART00000022661	PRPF3-201	2190	XM_004002449	ENSOARP00000022356	683 (aa)	XP_004002498	W5QI06

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
oas03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSG00000117360	PRPF3	100	100.000	Homo_sapiens
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	71.751	ENSAPOG00000015584	prpf3	99	72.316	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.854	ENSAMEG00000001630	PRPF3	100	99.854	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	71.994	ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	Amphilophus_citrinellus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	71.045	ENSAOCG00000011449	prpf3	99	72.262	Amphiprion_ocellaris
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	71.266	ENSATEG00000023583	prpf3	99	71.693	Anabas_testudineus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	95.029	ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	Anas_platyrhynchos
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	92.576	ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	Anolis_carolinensis
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.294	ENSACLG00000020127	prpf3	99	72.006	Astatotilapia_calliptera
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	73.803	ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	Astyanax_mexicanus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSBTAG00000013946	PRPF3	100	100.000	Bos_taurus
ENSOARG00000020798	PRPF3	81	38.790	WBGene00010844	prp-3	82	38.929	Caenorhabditis_elegans
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSCAFG00000011820	PRPF3	100	100.000	Canis_familiaris
ENSOARG00000020798	PRPF3	80	100.000	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSCHIG00000015434	PRPF3	100	100.000	Capra_hircus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.414	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	99.414	Carlito_syrichta
ENSOARG00000020798	PRPF3	93	82.390	ENSCAPG00000017812	PRPF3	95	82.862	Cavia_aperea
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.561	ENSCPOG00000008068	PRPF3	100	99.561	Cavia_porcellus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSCCAG00000026380	PRPF3	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	84.593	ENSCATG00000041778	PRPF3	100	84.593	Cercocebus_atys
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.854	ENSCLAG00000015009	PRPF3	100	99.854	Chinchilla_lanigera
ENSOARG00000020798	PRPF3	77	100.000	ENSCHOG00000011645	PRPF3	77	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	96.345	ENSCPBG00000008216	PRPF3	100	96.345	Chrysemys_picta_bellii
ENSOARG00000020798	PRPF3	61	59.189	ENSCING00000003312	-	99	58.711	Ciona_intestinalis
ENSOARG00000020798	PRPF3	83	54.035	ENSCSAVG00000008720	-	94	54.792	Ciona_savignyi
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.268	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	99.268	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSCGRG00001019100	Prpf3	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSCGRG00000007322	Prpf3	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.011	ENSCSEG00000002532	prpf3	99	70.605	Cynoglossus_semilaevis
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.624	ENSCVAG00000009318	prpf3	99	72.340	Cyprinodon_variegatus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.973	ENSDARG00000086425	prpf3	99	72.688	Danio_rerio
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	89.458	ENSDNOG00000005904	PRPF3	100	90.630	Dasypus_novemcinctus
ENSOARG00000020798	PRPF3	93	99.685	ENSDORG00000008664	Prpf3	100	99.685	Dipodomys_ordii
ENSOARG00000020798	PRPF3	81	53.086	FBgn0036915	Prp3	99	53.273	Drosophila_melanogaster
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	98.536	ENSETEG00000019124	PRPF3	100	98.536	Echinops_telfairi
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	63.934	ENSEBUG00000011680	prpf3	99	63.934	Eptatretus_burgeri
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.854	ENSEASG00005001566	PRPF3	100	99.854	Equus_asinus_asinus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSECAG00000019840	PRPF3	100	100.000	Equus_caballus
ENSOARG00000020798	PRPF3	85	99.291	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	99.291	Erinaceus_europaeus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	65.906	ENSELUG00000013624	prpf3	99	66.334	Esox_lucius
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSFCAG00000013940	PRPF3	100	100.000	Felis_catus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.414	ENSFDAG00000010365	PRPF3	100	99.414	Fukomys_damarensis
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	73.132	ENSFHEG00000021746	prpf3	99	72.845	Fundulus_heteroclitus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	71.287	ENSGMOG00000008535	prpf3	99	71.146	Gadus_morhua
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	94.883	ENSGALG00000028205	PRPF3	100	94.883	Gallus_gallus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.350	ENSGAFG00000012671	prpf3	99	72.063	Gambusia_affinis
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	70.963	ENSGACG00000011792	prpf3	99	71.246	Gasterosteus_aculeatus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	96.053	ENSGAGG00000013765	PRPF3	100	95.811	Gopherus_agassizii
ENSOARG00000020798	PRPF3	86	100.000	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.727	ENSHBUG00000003493	prpf3	99	72.439	Haplochromis_burtoni
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	70.278	ENSHGLG00000016033	-	100	70.864	Heterocephalus_glaber_female
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.561	ENSHGLG00000016569	PRPF3	100	99.561	Heterocephalus_glaber_female
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	70.864	ENSHGLG00100008951	-	95	90.909	Heterocephalus_glaber_male
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.561	ENSHGLG00100007590	PRPF3	100	99.561	Heterocephalus_glaber_male
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	68.563	ENSHCOG00000014058	prpf3	99	68.279	Hippocampus_comes
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	73.466	ENSIPUG00000000902	PRPF3	99	73.789	Ictalurus_punctatus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSSTOG00000001889	PRPF3	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	70.881	ENSKMAG00000001390	prpf3	99	70.597	Kryptolebias_marmoratus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	70.266	ENSLBEG00000026310	prpf3	99	71.186	Labrus_bergylta
ENSOARG00000020798	PRPF3	93	82.418	ENSLACG00000010541	PRPF3	100	82.575	Latimeria_chalumnae
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.707	ENSLAFG00000004713	PRPF3	100	99.707	Loxodonta_africana
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSOARG00000020798	PRPF3	90	100.000	ENSMMUG00000016301	PRPF3	98	100.000	Macaca_mulatta
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSOARG00000020798	PRPF3	99	67.257	ENSMLEG00000041065	-	98	66.667	Mandrillus_leucophaeus
ENSOARG00000020798	PRPF3	86	100.000	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	71.955	ENSMAMG00000014968	prpf3	99	71.813	Mastacembelus_armatus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	70.687	ENSMZEG00005015970	prpf3	99	70.365	Maylandia_zebra
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	94.883	ENSMGAG00000000707	PRPF3	100	94.883	Meleagris_gallopavo
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.707	ENSMAUG00000017112	Prpf3	100	99.707	Mesocricetus_auratus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.707	ENSMICG00000015386	PRPF3	100	99.707	Microcebus_murinus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.854	ENSMOCG00000000242	Prpf3	100	99.854	Microtus_ochrogaster
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	66.432	ENSMMOG00000016131	prpf3	99	67.234	Mola_mola
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	98.389	ENSMODG00000018774	PRPF3	100	98.389	Monodelphis_domestica
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	70.429	ENSMALG00000007257	prpf3	99	70.429	Monopterus_albus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.561	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	99.561	Mus_caroli
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.561	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	99.561	Mus_musculus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.414	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	99.414	Mus_pahari
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.561	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	99.561	Mus_spretus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	96.633	ENSMPUG00000005080	PRPF3	100	96.633	Mustela_putorius_furo
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.269	ENSMLUG00000004646	-	100	99.269	Myotis_lucifugus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSNGAG00000000910	Prpf3	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	70.531	ENSNBRG00000003462	prpf3	99	70.251	Neolamprologus_brichardi
ENSOARG00000020798	PRPF3	90	100.000	ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSOARG00000020798	PRPF3	83	100.000	ENSMEUG00000008733	PRPF3	89	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.414	ENSOPRG00000010139	PRPF3	100	99.414	Ochotona_princeps
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	73.768	ENSODEG00000014412	-	100	73.768	Octodon_degus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.268	ENSODEG00000011363	-	100	99.268	Octodon_degus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	70.646	ENSONIG00000006394	prpf3	99	70.506	Oreochromis_niloticus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	65.462	ENSOANG00000015441	PRPF3	100	65.262	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSOCUG00000011760	PRPF3	100	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.650	ENSORLG00000010330	prpf3	99	71.755	Oryzias_latipes
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.650	ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	Oryzias_latipes_hni
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.443	ENSORLG00015015016	prpf3	99	71.550	Oryzias_latipes_hsok
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.063	ENSOMEG00000000940	prpf3	99	71.777	Oryzias_melastigma
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	93.860	ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	Otolemur_garnettii
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.854	ENSPPAG00000030983	PRPF3	100	99.854	Pan_paniscus
ENSOARG00000020798	PRPF3	99	76.261	ENSPPAG00000043769	-	99	75.816	Pan_paniscus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSPPRG00000000731	PRPF3	100	100.000	Panthera_pardus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSPTIG00000005516	PRPF3	100	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSOARG00000020798	PRPF3	99	75.371	ENSPTRG00000047819	-	99	74.926	Pan_troglodytes
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	99.854	ENSPANG00000000499	PRPF3	100	99.854	Papio_anubis
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	74.322	ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	96.053	ENSPSIG00000014877	PRPF3	100	95.906	Pelodiscus_sinensis
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	67.438	ENSPMGG00000007776	prpf3	99	66.570	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOARG00000020798	PRPF3	100	100.000	ENSPEMG00000011672	Prpf3	100	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSOARG00000020798	PRPF3	100	98.389	ENSPCIG00000008795	PRPF3	100	98.389	Phascolarctos_cinereus
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