EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSOCUG00000002054 (Gene tree)
Gene ID: 100339655
Gene Symbol: TRIT1
Alias: -
Full Name: tRNA isopentenyltransferase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryctolagus_cuniculus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 47041 bases
Position: chr13:126629736-126676776
Accession: 100339655
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOCUP00000001771	IPPT	PF01715.17	1.5e-65	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOCUT00000002053	TRIT1-201	1405	XM_002715728	ENSOCUP00000001771	467 (aa)	XP_002715774	G1SGQ1

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ocu01100	Metabolic pathways	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	91.006	ENSG00000043514	TRIT1	99	91.716	Homo_sapiens
ENSOCUG00000002054	TRIT1	88	64.354	ENSAPOG00000020918	trit1	90	64.678	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.201	ENSAMEG00000004342	TRIT1	97	89.357	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOCUG00000002054	TRIT1	85	63.819	ENSACIG00000017409	trit1	94	60.544	Amphilophus_citrinellus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	92	61.712	ENSAOCG00000009850	trit1	92	61.712	Amphiprion_ocellaris
ENSOCUG00000002054	TRIT1	92	61.712	ENSAPEG00000001481	trit1	92	61.712	Amphiprion_percula
ENSOCUG00000002054	TRIT1	94	58.427	ENSATEG00000005426	trit1	91	58.427	Anabas_testudineus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	71	69.231	ENSAPLG00000011421	TRIT1	96	69.231	Anas_platyrhynchos
ENSOCUG00000002054	TRIT1	87	73.105	ENSACAG00000002280	TRIT1	84	72.749	Anolis_carolinensis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	90.558	ENSANAG00000030732	TRIT1	99	90.130	Aotus_nancymaae
ENSOCUG00000002054	TRIT1	95	57.363	ENSACLG00000004920	trit1	96	56.957	Astatotilapia_calliptera
ENSOCUG00000002054	TRIT1	94	59.226	ENSAMXG00000010959	trit1	94	60.142	Astyanax_mexicanus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	88.412	ENSBTAG00000013832	TRIT1	97	88.546	Bos_taurus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	84	33.907	WBGene00001740	gro-1	96	34.426	Caenorhabditis_elegans
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.914	ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	89.868	Callithrix_jacchus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	88.034	ENSCAFG00000003048	TRIT1	97	88.158	Canis_familiaris
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	86.373	ENSCAFG00020003875	TRIT1	93	92.784	Canis_lupus_dingo
ENSOCUG00000002054	TRIT1	98	86.739	ENSCHIG00000013259	TRIT1	97	86.871	Capra_hircus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	89.868	ENSTSYG00000004363	TRIT1	97	89.868	Carlito_syrichta
ENSOCUG00000002054	TRIT1	77	85.475	ENSCAPG00000017001	TRIT1	92	85.475	Cavia_aperea
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	86.695	ENSCPOG00000012820	TRIT1	97	87.140	Cavia_porcellus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.462	ENSCCAG00000031271	TRIT1	97	89.404	Cebus_capucinus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	85.075	ENSCATG00000034344	TRIT1	93	90.244	Cercocebus_atys
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	87.152	ENSCLAG00000009828	TRIT1	97	87.611	Chinchilla_lanigera
ENSOCUG00000002054	TRIT1	88	89.512	ENSCSAG00000001137	TRIT1	99	89.512	Chlorocebus_sabaeus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	87.004	ENSCHOG00000000435	TRIT1	97	87.004	Choloepus_hoffmanni
ENSOCUG00000002054	TRIT1	87	43.478	ENSCSAVG00000002050	-	91	43.478	Ciona_savignyi
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.056	ENSCANG00000043008	TRIT1	97	89.207	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.201	ENSCGRG00001001894	Trit1	96	89.333	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOCUG00000002054	TRIT1	88	88.264	ENSCGRG00000007059	Trit1	91	87.715	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOCUG00000002054	TRIT1	88	60.382	ENSCSEG00000009574	trit1	88	61.893	Cynoglossus_semilaevis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	91	60.880	ENSDARG00000032876	trit1	95	64.873	Danio_rerio
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	77.148	ENSDNOG00000001994	TRIT1	97	77.148	Dasypus_novemcinctus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	96	79.556	ENSDORG00000012449	Trit1	97	79.642	Dipodomys_ordii
ENSOCUG00000002054	TRIT1	90	39.956	FBgn0043799	CG31381	95	40.000	Drosophila_melanogaster
ENSOCUG00000002054	TRIT1	87	88.434	ENSETEG00000008733	TRIT1	97	88.350	Echinops_telfairi
ENSOCUG00000002054	TRIT1	88	57.005	ENSEBUG00000012845	trit1	92	57.005	Eptatretus_burgeri
ENSOCUG00000002054	TRIT1	98	87.124	ENSECAG00000010597	TRIT1	90	87.257	Equus_caballus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	66.176	ENSEEUG00000009269	TRIT1	97	65.948	Erinaceus_europaeus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	90	54.717	ENSELUG00000017278	trit1	88	54.717	Esox_lucius
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	90.687	ENSFCAG00000006029	TRIT1	97	90.687	Felis_catus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	80	76.862	ENSFALG00000000532	TRIT1	99	74.430	Ficedula_albicollis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	94	85.177	ENSFDAG00000003098	TRIT1	97	85.845	Fukomys_damarensis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	68	55.937	ENSFHEG00000022274	trit1	96	55.625	Fundulus_heteroclitus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	91	61.327	ENSGMOG00000006522	trit1	98	62.264	Gadus_morhua
ENSOCUG00000002054	TRIT1	90	76.303	ENSGALG00000003851	TRIT1	92	76.303	Gallus_gallus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	74	61.494	ENSGAFG00000018636	trit1	100	59.669	Gambusia_affinis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	90	61.395	ENSGACG00000008493	trit1	97	61.737	Gasterosteus_aculeatus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	83	75.127	ENSGAGG00000000522	TRIT1	97	75.339	Gopherus_agassizii
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	90.792	ENSGGOG00000010070	TRIT1	97	90.769	Gorilla_gorilla
ENSOCUG00000002054	TRIT1	95	57.582	ENSHBUG00000018999	trit1	96	57.174	Haplochromis_burtoni
ENSOCUG00000002054	TRIT1	96	79.688	ENSHGLG00000009564	-	96	79.688	Heterocephalus_glaber_female
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	87.805	ENSHGLG00000010308	-	96	88.117	Heterocephalus_glaber_female
ENSOCUG00000002054	TRIT1	82	67.358	ENSHGLG00100018159	-	99	67.358	Heterocephalus_glaber_male
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	87.826	ENSHGLG00100015382	-	97	88.117	Heterocephalus_glaber_male
ENSOCUG00000002054	TRIT1	88	62.824	ENSHCOG00000006755	trit1	94	53.202	Hippocampus_comes
ENSOCUG00000002054	TRIT1	96	60.217	ENSIPUG00000021822	trit1	95	60.217	Ictalurus_punctatus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.270	ENSSTOG00000006446	TRIT1	95	89.207	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	98	81.917	ENSJJAG00000000300	-	97	81.798	Jaculus_jaculus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	96	84.375	ENSJJAG00000000316	-	99	84.375	Jaculus_jaculus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	89	63.270	ENSKMAG00000021788	trit1	88	63.270	Kryptolebias_marmoratus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	98	58.405	ENSLBEG00000024262	trit1	93	59.333	Labrus_bergylta
ENSOCUG00000002054	TRIT1	92	66.438	ENSLACG00000013861	TRIT1	88	67.517	Latimeria_chalumnae
ENSOCUG00000002054	TRIT1	93	59.333	ENSLOCG00000002057	trit1	90	61.072	Lepisosteus_oculatus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	87.983	ENSLAFG00000016876	TRIT1	97	88.106	Loxodonta_africana
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.700	ENSMFAG00000001316	TRIT1	97	89.868	Macaca_fascicularis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.700	ENSMMUG00000016220	TRIT1	97	89.868	Macaca_mulatta
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.700	ENSMNEG00000023137	TRIT1	97	89.868	Macaca_nemestrina
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.485	ENSMLEG00000035296	TRIT1	97	89.648	Mandrillus_leucophaeus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	88	60.482	ENSMAMG00000005868	trit1	91	60.230	Mastacembelus_armatus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	95	57.143	ENSMZEG00005011506	trit1	96	56.739	Maylandia_zebra
ENSOCUG00000002054	TRIT1	79	76.613	ENSMGAG00000005516	TRIT1	99	76.613	Meleagris_gallopavo
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.633	ENSMAUG00000000399	Trit1	96	89.778	Mesocricetus_auratus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	90.909	ENSMICG00000016294	TRIT1	97	90.909	Microcebus_murinus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	88.769	ENSMOCG00000008173	Trit1	96	89.111	Microtus_ochrogaster
ENSOCUG00000002054	TRIT1	81	62.467	ENSMMOG00000021140	trit1	88	62.467	Mola_mola
ENSOCUG00000002054	TRIT1	93	77.376	ENSMODG00000017650	TRIT1	96	77.376	Monodelphis_domestica
ENSOCUG00000002054	TRIT1	91	59.629	ENSMALG00000017843	trit1	93	58.014	Monopterus_albus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	88.437	MGP_CAROLIEiJ_G0026428	Trit1	97	88.546	Mus_caroli
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	88.651	ENSMUSG00000028653	Trit1	97	88.767	Mus_musculus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	88.009	MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	97	88.106	Mus_pahari
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	88.651	MGP_SPRETEiJ_G0027408	Trit1	97	88.767	Mus_spretus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.655	ENSMPUG00000014291	TRIT1	97	89.823	Mustela_putorius_furo
ENSOCUG00000002054	TRIT1	98	86.026	ENSMLUG00000000334	TRIT1	97	86.154	Myotis_lucifugus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	91.006	ENSNLEG00000012038	TRIT1	97	90.989	Nomascus_leucogenys
ENSOCUG00000002054	TRIT1	96	69.420	ENSMEUG00000005217	TRIT1	96	69.420	Notamacropus_eugenii
ENSOCUG00000002054	TRIT1	73	73.248	ENSOPRG00000003205	-	71	73.563	Ochotona_princeps
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	83.864	ENSODEG00000006117	TRIT1	97	84.211	Octodon_degus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	98	55.814	ENSONIG00000015407	trit1	96	56.987	Oreochromis_niloticus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	79	77.688	ENSOANG00000002779	TRIT1	100	74.809	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	93	61.818	ENSORLG00000005802	trit1	92	63.294	Oryzias_latipes
ENSOCUG00000002054	TRIT1	90	63.059	ENSORLG00020005519	trit1	89	64.634	Oryzias_latipes_hni
ENSOCUG00000002054	TRIT1	90	62.353	ENSORLG00015018715	trit1	89	63.902	Oryzias_latipes_hsok
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	60.573	ENSOMEG00000006569	trit1	92	61.678	Oryzias_melastigma
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	88.717	ENSOGAG00000009571	TRIT1	97	88.717	Otolemur_garnettii
ENSOCUG00000002054	TRIT1	98	87.773	ENSOARG00000020140	TRIT1	97	87.912	Ovis_aries
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	90.792	ENSPPAG00000023930	TRIT1	97	90.769	Pan_paniscus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	90.330	ENSPPRG00000009680	TRIT1	97	90.330	Panthera_pardus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	90.330	ENSPTIG00000021134	TRIT1	97	90.330	Panthera_tigris_altaica
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	90.792	ENSPTRG00000000579	TRIT1	97	90.769	Pan_troglodytes
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.485	ENSPANG00000018125	TRIT1	97	89.648	Papio_anubis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	81	59.840	ENSPKIG00000024527	trit1	96	59.840	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOCUG00000002054	TRIT1	77	58.496	ENSPSIG00000017073	TRIT1	99	58.496	Pelodiscus_sinensis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	85	60.050	ENSPMGG00000018445	trit1	98	60.050	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	90.497	ENSPEMG00000022418	Trit1	96	90.889	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOCUG00000002054	TRIT1	83	57.895	ENSPMAG00000008892	trit1	100	57.895	Petromyzon_marinus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	92	79.587	ENSPCIG00000020666	TRIT1	94	83.030	Phascolarctos_cinereus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	90	62.069	ENSPFOG00000014626	trit1	92	62.069	Poecilia_formosa
ENSOCUG00000002054	TRIT1	70	62.614	ENSPLAG00000011669	trit1	94	63.438	Poecilia_latipinna
ENSOCUG00000002054	TRIT1	56	62.879	ENSPMEG00000023788	trit1	94	63.320	Poecilia_mexicana
ENSOCUG00000002054	TRIT1	71	63.554	ENSPREG00000018182	trit1	90	65.094	Poecilia_reticulata
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	90.773	ENSPPYG00000001499	TRIT1	97	90.969	Pongo_abelii
ENSOCUG00000002054	TRIT1	77	72.299	ENSPCAG00000014680	TRIT1	99	72.299	Procavia_capensis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	91.150	ENSPCOG00000014150	TRIT1	96	91.131	Propithecus_coquereli
ENSOCUG00000002054	TRIT1	98	78.947	ENSPVAG00000003344	TRIT1	97	79.121	Pteropus_vampyrus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	65	61.290	ENSPNYG00000001003	trit1	96	62.752	Pundamilia_nyererei
ENSOCUG00000002054	TRIT1	94	58.864	ENSPNAG00000009466	trit1	87	65.116	Pygocentrus_nattereri
ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	84.615	ENSRNOG00000014274	Trit1	97	84.615	Rattus_norvegicus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.056	ENSRBIG00000043179	TRIT1	97	89.207	Rhinopithecus_bieti
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.056	ENSRROG00000042670	TRIT1	97	89.207	Rhinopithecus_roxellana
ENSOCUG00000002054	TRIT1	89	34.174	YOR274W	-	96	34.174	Saccharomyces_cerevisiae
ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.247	ENSSBOG00000024417	TRIT1	97	89.183	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	89	75.952	ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	75.952	Sarcophilus_harrisii
ENSOCUG00000002054	TRIT1	88	62.683	ENSSFOG00015007284	trit1	81	62.683	Scleropages_formosus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	87	63.814	ENSSMAG00000020730	trit1	86	63.814	Scophthalmus_maximus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	94	58.889	ENSSDUG00000001683	trit1	93	58.889	Seriola_dumerili
ENSOCUG00000002054	TRIT1	85	61.787	ENSSLDG00000008379	trit1	87	61.631	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	84.017	ENSSARG00000004540	TRIT1	97	84.017	Sorex_araneus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	82	73.629	ENSSPUG00000003472	TRIT1	79	73.629	Sphenodon_punctatus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	87	62.500	ENSSPAG00000020745	trit1	93	62.740	Stegastes_partitus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	80	72.606	ENSTGUG00000001242	TRIT1	100	72.606	Taeniopygia_guttata
ENSOCUG00000002054	TRIT1	98	59.130	ENSTRUG00000013936	trit1	98	59.778	Takifugu_rubripes
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	59.219	ENSTNIG00000009240	trit1	91	63.107	Tetraodon_nigroviridis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	79	92.632	ENSTBEG00000001317	TRIT1	78	93.617	Tupaia_belangeri
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	89.231	ENSTTRG00000005064	TRIT1	97	89.231	Tursiops_truncatus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	55	88.417	ENSUAMG00000000522	-	95	88.417	Ursus_americanus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	89.357	ENSUMAG00000017299	TRIT1	89	88.985	Ursus_maritimus
ENSOCUG00000002054	TRIT1	98	83.370	ENSVPAG00000003008	TRIT1	97	83.480	Vicugna_pacos
ENSOCUG00000002054	TRIT1	89	67.849	ENSXETG00000010952	trit1	92	67.849	Xenopus_tropicalis
ENSOCUG00000002054	TRIT1	68	65.094	ENSXMAG00000016302	trit1	88	65.094	Xiphophorus_maculatus