EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSOCUG00000002727 (Gene tree)
Gene ID: 100350325
Gene Symbol: XPO6
Alias: -
Full Name: exportin-6
Gene Type: protein_coding
Species: Oryctolagus_cuniculus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 83757 bases
Position: chr6:18946175-19029931
Accession: 100350325
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOCUP00000002369	Xpo1	PF08389.12	1.3e-24	1	1
ENSOCUP00000002369	IBN_N	PF03810.19	2.6e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOCUT00000002734	XPO6-201	3564	XM_008257959	ENSOCUP00000002369	1124 (aa)	XP_008256181	G1SI70

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.399	ENSG00000169180	XPO6	100	100.000	Homo_sapiens
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	76.256	ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.629	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.954	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	97.954	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	76.596	ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.684	Amphilophus_citrinellus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	77.778	ENSAOCG00000001326	xpo6	99	77.778	Amphiprion_ocellaris
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	77.689	ENSAPEG00000016304	xpo6	99	77.689	Amphiprion_percula
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	77.462	ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.414	Anabas_testudineus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	94.217	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	94.217	Anas_platyrhynchos
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	79.615	ENSACAG00000016883	XPO6	99	79.615	Anolis_carolinensis
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.221	ENSANAG00000031761	XPO6	99	98.221	Aotus_nancymaae
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	77.184	ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.184	Astatotilapia_calliptera
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	72.561	ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.561	Astyanax_mexicanus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.598	ENSBTAG00000010309	XPO6	99	97.598	Bos_taurus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.310	ENSCJAG00000006014	XPO6	99	98.310	Callithrix_jacchus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.132	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	98.132	Canis_familiaris
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.221	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	98.287	Canis_lupus_dingo
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.509	ENSCHIG00000022341	XPO6	99	97.509	Capra_hircus
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	93.845	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	93.845	Carlito_syrichta
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.954	ENSCPOG00000012824	XPO6	99	97.954	Cavia_porcellus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.132	ENSCCAG00000036360	XPO6	99	98.132	Cebus_capucinus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.577	ENSCATG00000034030	XPO6	99	98.577	Cercocebus_atys
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.598	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.598	Chinchilla_lanigera
ENSOCUG00000002727	XPO6	91	97.834	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	97.834	Choloepus_hoffmanni
ENSOCUG00000002727	XPO6	89	92.986	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	94.118	Chrysemys_picta_bellii
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	47.502	ENSCING00000006884	-	99	47.502	Ciona_intestinalis
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	45.969	ENSCSAVG00000000850	-	99	45.969	Ciona_savignyi
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.399	ENSCANG00000041578	XPO6	99	98.399	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.509	ENSCGRG00001013173	Xpo6	99	97.509	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	76.356	ENSCSEG00000013622	xpo6	99	76.356	Cynoglossus_semilaevis
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	76.439	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	76.439	Cyprinodon_variegatus
ENSOCUG00000002727	XPO6	97	71.724	ENSDARG00000041217	xpo6	99	71.724	Danio_rerio
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.954	ENSDNOG00000012449	XPO6	99	97.954	Dasypus_novemcinctus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.420	ENSDORG00000000919	Xpo6	99	97.434	Dipodomys_ordii
ENSOCUG00000002727	XPO6	82	94.981	ENSETEG00000018768	XPO6	85	94.981	Echinops_telfairi
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	61.470	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	61.525	Eptatretus_burgeri
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.954	ENSEASG00005017296	XPO6	99	97.954	Equus_asinus_asinus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.865	ENSECAG00000008601	XPO6	99	97.865	Equus_caballus
ENSOCUG00000002727	XPO6	97	91.201	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	91.201	Erinaceus_europaeus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	78.565	ENSELUG00000009159	xpo6	99	79.554	Esox_lucius
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.221	ENSFCAG00000010309	XPO6	99	98.221	Felis_catus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	91.873	ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.873	Ficedula_albicollis
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.331	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	97.331	Fukomys_damarensis
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	76.241	ENSFHEG00000021190	xpo6	99	76.241	Fundulus_heteroclitus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	93.861	ENSGALG00000035360	XPO6	99	93.861	Gallus_gallus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.177	ENSGAFG00000004044	xpo6	99	75.065	Gambusia_affinis
ENSOCUG00000002727	XPO6	95	93.809	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	93.809	Gopherus_agassizii
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.310	ENSGGOG00000005609	XPO6	99	98.310	Gorilla_gorilla
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.586	ENSHBUG00000019504	xpo6	99	75.934	Haplochromis_burtoni
ENSOCUG00000002727	XPO6	94	79.022	ENSHGLG00000003865	-	99	79.022	Heterocephalus_glaber_female
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.598	ENSHGLG00000009679	-	99	97.598	Heterocephalus_glaber_female
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.598	ENSHGLG00100003673	-	99	97.598	Heterocephalus_glaber_male
ENSOCUG00000002727	XPO6	94	82.334	ENSHGLG00100001081	-	99	82.334	Heterocephalus_glaber_male
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.153	ENSHCOG00000004987	xpo6	99	75.327	Hippocampus_comes
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	72.203	ENSIPUG00000006516	xpo6	99	72.203	Ictalurus_punctatus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.954	ENSSTOG00000012161	XPO6	99	97.954	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.242	ENSJJAG00000019392	Xpo6	99	97.242	Jaculus_jaculus
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	76.313	ENSKMAG00000010403	xpo6	99	76.313	Kryptolebias_marmoratus
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	76.999	ENSLBEG00000023039	xpo6	99	76.999	Labrus_bergylta
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	85.587	ENSLACG00000017930	XPO6	99	85.587	Latimeria_chalumnae
ENSOCUG00000002727	XPO6	94	81.232	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.232	Lepisosteus_oculatus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.242	ENSLAFG00000011960	XPO6	98	99.725	Loxodonta_africana
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.577	ENSMFAG00000045067	XPO6	99	98.577	Macaca_fascicularis
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.577	ENSMMUG00000018623	XPO6	99	98.577	Macaca_mulatta
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.577	ENSMNEG00000028587	XPO6	99	98.577	Macaca_nemestrina
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.577	ENSMLEG00000029685	XPO6	99	98.577	Mandrillus_leucophaeus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.997	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	76.643	Mastacembelus_armatus
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	77.273	ENSMZEG00005010620	xpo6	99	77.273	Maylandia_zebra
ENSOCUG00000002727	XPO6	97	93.072	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	93.072	Meleagris_gallopavo
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	86.542	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	86.275	Mesocricetus_auratus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.488	ENSMICG00000001923	XPO6	99	98.488	Microcebus_murinus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.331	ENSMOCG00000008015	Xpo6	99	97.331	Microtus_ochrogaster
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	76.889	ENSMMOG00000011992	xpo6	99	76.889	Mola_mola
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	94.751	ENSMODG00000015516	XPO6	99	94.751	Monodelphis_domestica
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	70.771	ENSMALG00000020612	xpo6	99	71.036	Monopterus_albus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.865	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	98.626	Mus_caroli
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.776	ENSMUSG00000000131	Xpo6	99	97.776	Mus_musculus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.687	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	97.687	Mus_pahari
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.509	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	99	97.509	Mus_spretus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.153	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	97.153	Mustela_putorius_furo
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	96.886	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	96.886	Myotis_lucifugus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.132	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	98.132	Nannospalax_galili
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.586	ENSNBRG00000007275	xpo6	99	75.934	Neolamprologus_brichardi
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.399	ENSNLEG00000011518	XPO6	99	98.399	Nomascus_leucogenys
ENSOCUG00000002727	XPO6	87	97.674	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	97.674	Ochotona_princeps
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.153	ENSODEG00000012917	XPO6	99	97.153	Octodon_degus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.413	ENSONIG00000019366	xpo6	99	75.673	Oreochromis_niloticus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.400	ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.824	Oryzias_latipes
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	77.273	ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.273	Oryzias_latipes_hni
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.488	ENSORLG00015003636	xpo6	99	75.488	Oryzias_latipes_hsok
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.457	ENSOMEG00000016505	xpo6	99	75.457	Oryzias_melastigma
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.754	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	98.754	Otolemur_garnettii
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.687	ENSOARG00000000960	XPO6	100	97.687	Ovis_aries
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.310	ENSPPAG00000033668	XPO6	99	98.310	Pan_paniscus
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	97.840	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	97.840	Panthera_pardus
ENSOCUG00000002727	XPO6	97	97.330	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	97.330	Panthera_tigris_altaica
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.310	ENSPTRG00000007919	XPO6	99	98.310	Pan_troglodytes
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.577	ENSPANG00000017103	XPO6	99	98.577	Papio_anubis
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	79.982	ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.982	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	91.906	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	91.906	Pelodiscus_sinensis
ENSOCUG00000002727	XPO6	99	76.508	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	76.508	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.064	ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	97.064	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	71.491	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	71.491	Petromyzon_marinus
ENSOCUG00000002727	XPO6	97	94.592	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	94.366	Phascolarctos_cinereus
ENSOCUG00000002727	XPO6	100	74.826	ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.826	Poecilia_formosa
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