EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSOCUG00000004986 (Gene tree)
Gene ID: 100343451
Gene Symbol: XPO1
Alias: -
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryctolagus_cuniculus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 45756 bases
Position: chr2:124747173-124792928
Accession: 100343451
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOCUP00000004318	CRM1_C	PF08767.11	5.4e-135	1	1
ENSOCUP00000004318	Xpo1	PF08389.12	4e-41	1	1
ENSOCUP00000004318	IBN_N	PF03810.19	1.8e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOCUT00000004989	XPO1-201	4813	XM_002709852	ENSOCUP00000004318	1071 (aa)	XP_002709898	G1SMY6

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ocu03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
ocu03013	RNA transport	KEGG
ocu05164	Influenza A	KEGG
ocu05166	Human T-cell leukemia virus 1 infection	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.786	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.359	ENSAPOG00000004984	-	100	96.359	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	90.532	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.532	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.813	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	99.813	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	96.702	ENSACIG00000010818	-	100	96.702	Amphilophus_citrinellus
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	92.872	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	Amphilophus_citrinellus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.359	ENSAOCG00000010121	-	100	96.359	Amphiprion_ocellaris
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	92.157	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	92.157	Amphiprion_ocellaris
ENSOCUG00000004986	XPO1	91	92.688	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.688	Amphiprion_percula
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.359	ENSAPEG00000007038	-	100	96.359	Amphiprion_percula
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	91.783	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.783	Anabas_testudineus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.359	ENSATEG00000008816	-	100	96.359	Anabas_testudineus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.627	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	99.627	Anas_platyrhynchos
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.627	ENSACAG00000002501	XPO1	100	99.627	Anolis_carolinensis
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.786	ENSANAG00000020802	XPO1	100	98.786	Aotus_nancymaae
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	93.191	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	93.191	Astatotilapia_calliptera
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.172	ENSACLG00000015192	-	100	96.172	Astatotilapia_calliptera
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.639	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	96.639	Astyanax_mexicanus
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	93.962	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.962	Astyanax_mexicanus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.907	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	99.907	Bos_taurus
ENSOCUG00000004986	XPO1	99	51.941	WBGene00002078	xpo-1	99	51.941	Caenorhabditis_elegans
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.786	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.786	Callithrix_jacchus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.907	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	99.907	Canis_familiaris
ENSOCUG00000004986	XPO1	93	99.799	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	99.799	Canis_lupus_dingo
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.907	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	99.907	Capra_hircus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.907	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	99.907	Carlito_syrichta
ENSOCUG00000004986	XPO1	53	95.390	ENSCAPG00000006454	-	100	95.390	Cavia_aperea
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.413	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	98.413	Cavia_porcellus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	79.685	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.870	Cebus_capucinus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.927	ENSCATG00000032674	XPO1	100	98.617	Cercocebus_atys
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.627	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.627	Chinchilla_lanigera
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.786	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.786	Chlorocebus_sabaeus
ENSOCUG00000004986	XPO1	83	99.870	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.870	Choloepus_hoffmanni
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.533	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.533	Chrysemys_picta_bellii
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	81.192	ENSCING00000024562	-	100	81.192	Ciona_intestinalis
ENSOCUG00000004986	XPO1	99	80.205	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.205	Ciona_savignyi
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	94.585	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.599	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.599	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.599	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	98.599	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	95.532	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	Cynoglossus_semilaevis
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.265	ENSCVAG00000016788	-	100	96.265	Cyprinodon_variegatus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	91.410	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	91.410	Cyprinodon_variegatus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	93.277	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.356	Danio_rerio
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	97.012	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	97.012	Danio_rerio
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.813	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	99.813	Dasypus_novemcinctus
ENSOCUG00000004986	XPO1	92	96.305	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.305	Dipodomys_ordii
ENSOCUG00000004986	XPO1	99	71.509	FBgn0020497	emb	99	71.509	Drosophila_melanogaster
ENSOCUG00000004986	XPO1	94	98.708	ENSETEG00000018045	XPO1	94	98.708	Echinops_telfairi
ENSOCUG00000004986	XPO1	90	79.772	ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	Eptatretus_burgeri
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.907	ENSEASG00005007223	XPO1	100	99.907	Equus_asinus_asinus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.907	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.907	Equus_caballus
ENSOCUG00000004986	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	95.213	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.213	Esox_lucius
ENSOCUG00000004986	XPO1	87	93.041	ENSELUG00000014306	-	99	93.041	Esox_lucius
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.907	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	99.907	Felis_catus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.346	ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.346	Ficedula_albicollis
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.039	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	98.039	Fukomys_damarensis
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	91.690	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	91.690	Fundulus_heteroclitus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	92.997	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.997	Gadus_morhua
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	90.289	ENSGMOG00000019063	-	100	90.289	Gadus_morhua
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.627	ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.627	Gallus_gallus
ENSOCUG00000004986	XPO1	91	96.395	ENSGAFG00000003355	-	98	96.395	Gambusia_affinis
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	92.766	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	Gambusia_affinis
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.078	ENSGACG00000002743	-	100	96.078	Gasterosteus_aculeatus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	91.690	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	Gasterosteus_aculeatus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.440	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.440	Gopherus_agassizii
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.786	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	98.786	Gorilla_gorilla
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.265	ENSHBUG00000020037	-	100	96.265	Haplochromis_burtoni
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	92.344	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.344	Haplochromis_burtoni
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.533	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	99.533	Heterocephalus_glaber_female
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.533	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	99.533	Heterocephalus_glaber_male
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	95.532	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.532	Hippocampus_comes
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.639	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	96.639	Ictalurus_punctatus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	94.118	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.118	Ictalurus_punctatus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.720	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.720	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.627	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	99.627	Jaculus_jaculus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	91.597	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	91.597	Kryptolebias_marmoratus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	95.798	ENSKMAG00000016218	-	100	95.798	Kryptolebias_marmoratus
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	90.254	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	90.254	Labrus_bergylta
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.359	ENSLBEG00000005740	-	100	96.359	Labrus_bergylta
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	77.747	ENSLACG00000018213	XPO1	100	77.747	Latimeria_chalumnae
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	97.106	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	97.106	Lepisosteus_oculatus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.533	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	99.533	Loxodonta_africana
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.786	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	98.786	Macaca_fascicularis
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.786	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	98.786	Macaca_mulatta
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.786	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	98.786	Macaca_nemestrina
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.930	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	96.930	Mandrillus_leucophaeus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	92.063	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	92.063	Mastacembelus_armatus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.265	ENSMAMG00000010568	-	100	96.265	Mastacembelus_armatus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	92.344	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	92.344	Maylandia_zebra
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.172	ENSMZEG00005018158	-	98	96.395	Maylandia_zebra
ENSOCUG00000004986	XPO1	68	99.311	ENSMGAG00000001496	-	100	99.311	Meleagris_gallopavo
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.599	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	98.599	Mesocricetus_auratus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.907	ENSMICG00000027770	XPO1	100	99.907	Microcebus_murinus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.880	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	98.880	Microtus_ochrogaster
ENSOCUG00000004986	XPO1	87	96.371	ENSMMOG00000008001	-	99	96.371	Mola_mola
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	92.872	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	92.872	Mola_mola
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.599	ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.599	Monodelphis_domestica
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	95.892	ENSMALG00000007085	-	100	95.892	Monopterus_albus
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	92.030	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	92.030	Monopterus_albus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.973	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.973	Mus_caroli
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.066	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	99.066	Mus_musculus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.973	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.973	Mus_pahari
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.066	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	99.066	Mus_spretus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.907	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	99.907	Mustela_putorius_furo
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.813	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	99.813	Myotis_lucifugus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.720	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	99.720	Nannospalax_galili
ENSOCUG00000004986	XPO1	96	95.644	ENSNBRG00000012229	-	100	96.809	Neolamprologus_brichardi
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	92.344	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	92.344	Neolamprologus_brichardi
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	94.904	ENSNLEG00000009680	XPO1	100	94.904	Nomascus_leucogenys
ENSOCUG00000004986	XPO1	63	100.000	ENSMEUG00000013277	-	63	100.000	Notamacropus_eugenii
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ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.319	ENSODEG00000012632	XPO1	100	98.319	Octodon_degus
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ENSOCUG00000004986	XPO1	93	96.386	ENSONIG00000002969	-	99	96.386	Oreochromis_niloticus
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ENSOCUG00000004986	XPO1	100	97.292	ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.274	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	94.771	ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.771	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.514	ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.668	Pelodiscus_sinensis
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	94.403	ENSPMGG00000010632	XPO1	100	94.403	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.907	ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.907	Propithecus_coquereli
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ENSOCUG00000004986	XPO1	100	98.786	ENSRROG00000038442	XPO1	100	98.786	Rhinopithecus_roxellana
ENSOCUG00000004986	XPO1	98	47.271	YGR218W	CRM1	99	47.271	Saccharomyces_cerevisiae
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ENSOCUG00000004986	XPO1	51	91.636	ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	91.636	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.907	ENSUAMG00000026512	XPO1	100	99.907	Ursus_americanus
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ENSOCUG00000004986	XPO1	100	99.907	ENSVVUG00000012009	XPO1	100	99.907	Vulpes_vulpes
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	97.946	ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.946	Xenopus_tropicalis
ENSOCUG00000004986	XPO1	88	92.766	ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	Xiphophorus_couchianus
ENSOCUG00000004986	XPO1	78	97.187	ENSXCOG00000006625	-	97	97.187	Xiphophorus_couchianus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	91.877	ENSXMAG00000005790	xpo1a	100	91.877	Xiphophorus_maculatus
ENSOCUG00000004986	XPO1	100	96.078	ENSXMAG00000007353	-	100	96.078	Xiphophorus_maculatus