EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOCUG00000006879 (Gene tree)
Gene ID: 100341208
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: -
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Oryctolagus_cuniculus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 51875 bases
Position: chr19:45417704-45469578
Accession: 100341208
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOCUP00000005954	GTP_EFTU	PF00009.27	2.2e-45	1	1
ENSOCUP00000005954	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	8.1e-13	1	1
ENSOCUP00000005954	EFG_IV	PF03764.18	1.7e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOCUT00000006885	EFTUD2-201	3687	XM_002719444	ENSOCUP00000005954	972 (aa)	XP_002719490	G1SRX2

Gene Model

Click here to download ENSOCUG00000006879's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ocu03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOCUG00000006879's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	51	31.206	ENSOCUG00000013561	GFM1	58	31.206
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	57	34.074	ENSOCUG00000005349	GFM2	67	34.074

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.897	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.181	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.975	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.794	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	88.683	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.477	Amphilophus_citrinellus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.284	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.078	Amphiprion_percula
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.593	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.387	Anabas_testudineus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	99	94.233	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.233	Anas_platyrhynchos
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	97.634	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	Anolis_carolinensis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.794	Aotus_nancymaae
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.181	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	Astatotilapia_calliptera
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.709	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.691	Bos_taurus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	99	70.248	WBGene00001166	eftu-2	99	70.041	Caenorhabditis_elegans
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.794	Callithrix_jacchus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.794	Canis_familiaris
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	Canis_lupus_dingo
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.691	Capra_hircus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.383	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	Carlito_syrichta
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.971	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.971	Cavia_aperea
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.971	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	Cavia_porcellus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.794	Cebus_capucinus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.794	Cercocebus_atys
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.868	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	Chinchilla_lanigera
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.794	Chlorocebus_sabaeus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.457	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.457	Chrysemys_picta_bellii
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	77.641	ENSCING00000009372	-	100	77.641	Ciona_intestinalis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	99	78.039	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.794	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.691	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.691	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.770	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	Cynoglossus_semilaevis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.387	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.181	Cyprinodon_variegatus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	90.956	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	Danio_rerio
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.177	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	99.177	Dasypus_novemcinctus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.588	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	Dipodomys_ordii
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	75.179	FBgn0039566	CG4849	100	74.974	Drosophila_melanogaster
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.794	Equus_asinus_asinus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.691	Equus_caballus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.049	ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.049	Esox_lucius
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	Felis_catus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	97.840	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	Ficedula_albicollis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.383	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	Fukomys_damarensis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.490	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.284	Fundulus_heteroclitus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.152	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.770	Gadus_morhua
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	97.942	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	Gallus_gallus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.181	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.078	Gambusia_affinis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.667	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	Gasterosteus_aculeatus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.794	Gorilla_gorilla
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.078	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	Haplochromis_burtoni
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.971	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.971	Heterocephalus_glaber_female
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.971	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	Heterocephalus_glaber_male
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.564	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	Ictalurus_punctatus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	96	99.679	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.679	Jaculus_jaculus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.667	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.461	Kryptolebias_marmoratus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	95	91.694	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	94.239	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	Latimeria_chalumnae
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.078	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.078	Lepisosteus_oculatus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.280	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	Loxodonta_africana
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.794	Macaca_fascicularis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.794	Macaca_nemestrina
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.794	Mandrillus_leucophaeus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.593	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.387	Mastacembelus_armatus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.181	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.975	Maylandia_zebra
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	97.947	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.947	Meleagris_gallopavo
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.691	Mesocricetus_auratus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.794	Microcebus_murinus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	92	81.910	ENSMOCG00000017653	-	90	81.910	Microtus_ochrogaster
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSMOCG00000009039	-	100	99.794	Microtus_ochrogaster
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.486	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	Monodelphis_domestica
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.486	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.486	Mus_caroli
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.486	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.486	Mus_musculus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.486	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.486	Mus_pahari
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.486	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.486	Mus_spretus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	97	99.576	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.576	Mustela_putorius_furo
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.794	Myotis_lucifugus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	Nannospalax_galili
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.078	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	Neolamprologus_brichardi
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	97	97.981	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.981	Nomascus_leucogenys
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	95.782	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.782	Notamacropus_eugenii
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.461	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	Ochotona_princeps
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.663	ENSODEG00000018041	-	100	98.663	Octodon_degus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.181	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.975	Oreochromis_niloticus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.667	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	Oryzias_latipes_hni
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.667	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	97.531	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.531	Otolemur_garnettii
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.691	Ovis_aries
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.897	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.897	Pan_paniscus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.794	Panthera_pardus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.794	Panthera_tigris_altaica
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.897	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	Pan_troglodytes
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.794	Papio_anubis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	93	97.133	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	Pelodiscus_sinensis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	84.362	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.362	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.691	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.486	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.486	Phascolarctos_cinereus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.181	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	92.078	Poecilia_formosa
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.181	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	92.078	Poecilia_latipinna
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.181	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	92.078	Poecilia_mexicana
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.354	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.354	Pongo_abelii
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	95.473	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	Procavia_capensis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.691	Propithecus_coquereli
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	94.856	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	Pteropus_vampyrus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.078	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.872	Pundamilia_nyererei
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.975	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	Pygocentrus_nattereri
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.486	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.486	Rattus_norvegicus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.691	Rhinopithecus_bieti
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.691	Rhinopithecus_roxellana
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.794	Saccharomyces_cerevisiae
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.794	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	97	99.467	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.467	Sarcophilus_harrisii
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.564	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.564	Scleropages_formosus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.975	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.770	Scophthalmus_maximus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.284	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	Seriola_dumerili
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.387	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.181	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.358	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.358	Sorex_araneus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	97.531	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	Sphenodon_punctatus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.387	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.181	Stegastes_partitus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.588	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	Sus_scrofa
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	84	97.202	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	Taeniopygia_guttata
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.358	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	Takifugu_rubripes
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	86.885	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	Tetraodon_nigroviridis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	94.136	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.136	Tupaia_belangeri
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.665	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	Ursus_americanus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.794	Ursus_maritimus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.794	Vulpes_vulpes
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	97	94.776	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.181	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.078	Xiphophorus_maculatus