EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOCUG00000010700 (Gene tree)
Gene ID: 100338510
Gene Symbol: URB2
Alias: -
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Oryctolagus_cuniculus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26853 bases
Position: chr16:38120231-38147083
Accession: 100338510
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOCUP00000009216	Urb2	PF10441.9	1.4e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOCUT00000010701	URB2-201	6607	XM_002717340	ENSOCUP00000009216	1523 (aa)	XP_002717386	G1SZU0

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOCUG00000010700	URB2	99	81.353	ENSG00000135763	URB2	100	89.286	Homo_sapiens
ENSOCUG00000010700	URB2	90	36.538	ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.357	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	79.790	ENSAMEG00000009206	URB2	100	79.790	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOCUG00000010700	URB2	100	54.321	ENSAOCG00000019961	urb2	97	54.321	Amphiprion_ocellaris
ENSOCUG00000010700	URB2	100	54.321	ENSAPEG00000005263	urb2	97	54.321	Amphiprion_percula
ENSOCUG00000010700	URB2	100	34.636	ENSATEG00000020930	urb2	100	34.306	Anabas_testudineus
ENSOCUG00000010700	URB2	97	51.101	ENSAPLG00000002998	URB2	99	50.901	Anas_platyrhynchos
ENSOCUG00000010700	URB2	99	48.191	ENSACAG00000001285	URB2	99	48.191	Anolis_carolinensis
ENSOCUG00000010700	URB2	99	82.009	ENSANAG00000033963	URB2	99	81.878	Aotus_nancymaae
ENSOCUG00000010700	URB2	90	35.021	ENSACLG00000009254	urb2	95	34.925	Astatotilapia_calliptera
ENSOCUG00000010700	URB2	99	36.028	ENSAMXG00000003474	urb2	99	36.028	Astyanax_mexicanus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	72.441	ENSBTAG00000010180	URB2	100	72.441	Bos_taurus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	81.944	ENSCJAG00000010968	URB2	99	85.714	Callithrix_jacchus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	78.923	ENSCAFG00000012118	URB2	99	78.923	Canis_familiaris
ENSOCUG00000010700	URB2	93	77.864	ENSCAFG00020027217	URB2	99	77.864	Canis_lupus_dingo
ENSOCUG00000010700	URB2	100	72.507	ENSCHIG00000014513	URB2	100	72.507	Capra_hircus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	79.856	ENSTSYG00000006924	URB2	100	79.856	Carlito_syrichta
ENSOCUG00000010700	URB2	64	83.642	ENSCPOG00000020777	-	99	80.460	Cavia_porcellus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	81.681	ENSCCAG00000023932	URB2	99	81.550	Cebus_capucinus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	80.762	ENSCATG00000043366	URB2	99	80.762	Cercocebus_atys
ENSOCUG00000010700	URB2	99	76.216	ENSCLAG00000006268	URB2	99	76.216	Chinchilla_lanigera
ENSOCUG00000010700	URB2	99	80.893	ENSCSAG00000010599	URB2	99	80.893	Chlorocebus_sabaeus
ENSOCUG00000010700	URB2	69	82.177	ENSCHOG00000010163	URB2	71	82.177	Choloepus_hoffmanni
ENSOCUG00000010700	URB2	99	54.971	ENSCPBG00000006191	URB2	99	55.035	Chrysemys_picta_bellii
ENSOCUG00000010700	URB2	99	81.024	ENSCANG00000023711	URB2	99	81.024	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	71.982	ENSCGRG00001009591	Urb2	99	71.982	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOCUG00000010700	URB2	99	71.982	ENSCGRG00000011259	Urb2	99	71.982	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOCUG00000010700	URB2	100	33.174	ENSCSEG00000000299	urb2	100	33.094	Cynoglossus_semilaevis
ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.509	ENSCVAG00000011011	urb2	100	35.409	Cyprinodon_variegatus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	37.229	ENSDARG00000003217	urb2	100	53.623	Danio_rerio
ENSOCUG00000010700	URB2	97	60.283	ENSDNOG00000043064	URB2	99	60.486	Dasypus_novemcinctus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	74.524	ENSDORG00000014975	Urb2	99	74.524	Dipodomys_ordii
ENSOCUG00000010700	URB2	95	73.298	ENSETEG00000002869	URB2	95	73.298	Echinops_telfairi
ENSOCUG00000010700	URB2	100	79.921	ENSEASG00005012060	URB2	100	79.921	Equus_asinus_asinus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	79.921	ENSECAG00000012338	URB2	100	84.507	Equus_caballus
ENSOCUG00000010700	URB2	92	77.857	ENSEEUG00000002669	URB2	92	77.857	Erinaceus_europaeus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	40.103	ENSELUG00000014647	urb2	100	40.322	Esox_lucius
ENSOCUG00000010700	URB2	99	77.807	ENSFCAG00000007662	URB2	99	77.807	Felis_catus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	49.968	ENSFALG00000003385	URB2	99	49.968	Ficedula_albicollis
ENSOCUG00000010700	URB2	99	76.150	ENSFDAG00000021079	URB2	99	76.150	Fukomys_damarensis
ENSOCUG00000010700	URB2	100	36.121	ENSFHEG00000010357	urb2	100	36.109	Fundulus_heteroclitus
ENSOCUG00000010700	URB2	54	40.023	ENSGMOG00000012459	urb2	100	36.031	Gadus_morhua
ENSOCUG00000010700	URB2	99	52.154	ENSGALG00000011101	URB2	99	52.154	Gallus_gallus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	37.412	ENSGACG00000016179	urb2	100	37.181	Gasterosteus_aculeatus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	54.627	ENSGAGG00000021879	URB2	99	54.692	Gopherus_agassizii
ENSOCUG00000010700	URB2	99	81.550	ENSGGOG00000025643	URB2	99	81.550	Gorilla_gorilla
ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.413	ENSHBUG00000018469	urb2	97	52.469	Haplochromis_burtoni
ENSOCUG00000010700	URB2	97	75.962	ENSHGLG00000016561	URB2	99	75.962	Heterocephalus_glaber_female
ENSOCUG00000010700	URB2	99	74.442	ENSHGLG00100001838	URB2	99	74.442	Heterocephalus_glaber_male
ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.820	ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.820	Ictalurus_punctatus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	75.558	ENSSTOG00000025323	URB2	99	75.558	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	74.426	ENSJJAG00000011998	Urb2	99	74.295	Jaculus_jaculus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	34.109	ENSKMAG00000020129	urb2	100	33.989	Kryptolebias_marmoratus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	46.564	ENSLACG00000002038	URB2	99	46.825	Latimeria_chalumnae
ENSOCUG00000010700	URB2	99	41.370	ENSLOCG00000015462	urb2	99	41.059	Lepisosteus_oculatus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	75.953	ENSLAFG00000012484	URB2	100	75.953	Loxodonta_africana
ENSOCUG00000010700	URB2	99	80.368	ENSMFAG00000039905	URB2	99	80.368	Macaca_fascicularis
ENSOCUG00000010700	URB2	99	80.499	ENSMMUG00000009509	URB2	99	80.499	Macaca_mulatta
ENSOCUG00000010700	URB2	99	80.893	ENSMNEG00000038762	URB2	99	80.893	Macaca_nemestrina
ENSOCUG00000010700	URB2	99	80.696	ENSMLEG00000043252	URB2	99	80.696	Mandrillus_leucophaeus
ENSOCUG00000010700	URB2	54	36.467	ENSMAMG00000020365	urb2	100	34.760	Mastacembelus_armatus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.497	ENSMZEG00005011027	urb2	97	52.469	Maylandia_zebra
ENSOCUG00000010700	URB2	94	49.177	ENSMGAG00000012073	URB2	99	48.907	Meleagris_gallopavo
ENSOCUG00000010700	URB2	95	82.857	ENSMAUG00000017980	Urb2	99	82.857	Mesocricetus_auratus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	79.987	ENSMICG00000033302	URB2	100	79.987	Microcebus_murinus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	71.279	ENSMOCG00000020369	Urb2	99	71.279	Microtus_ochrogaster
ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.197	ENSMALG00000006529	urb2	100	35.129	Monopterus_albus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	68.807	ENSMUSG00000031976	Urb2	99	68.807	Mus_musculus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	77.705	ENSMPUG00000012438	URB2	99	77.574	Mustela_putorius_furo
ENSOCUG00000010700	URB2	99	72.984	ENSNGAG00000016524	Urb2	99	72.984	Nannospalax_galili
ENSOCUG00000010700	URB2	99	81.090	ENSNLEG00000014450	URB2	99	81.090	Nomascus_leucogenys
ENSOCUG00000010700	URB2	91	62.084	ENSMEUG00000016434	URB2	94	61.913	Notamacropus_eugenii
ENSOCUG00000010700	URB2	92	83.051	ENSOPRG00000009906	URB2	92	83.051	Ochotona_princeps
ENSOCUG00000010700	URB2	99	75.756	ENSODEG00000005593	URB2	99	75.756	Octodon_degus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	38.062	ENSONIG00000017078	urb2	100	38.117	Oreochromis_niloticus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	49.510	ENSOANG00000013732	URB2	100	50.098	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.922	ENSORLG00000010915	urb2	100	35.883	Oryzias_latipes
ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.983	ENSORLG00020003361	urb2	100	35.823	Oryzias_latipes_hni
ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.801	ENSORLG00015001534	urb2	100	35.801	Oryzias_latipes_hsok
ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.009	ENSOMEG00000010076	urb2	100	35.009	Oryzias_melastigma
ENSOCUG00000010700	URB2	100	77.115	ENSOGAG00000003021	URB2	100	77.115	Otolemur_garnettii
ENSOCUG00000010700	URB2	100	72.113	ENSOARG00000003102	URB2	100	72.178	Ovis_aries
ENSOCUG00000010700	URB2	99	81.812	ENSPPAG00000040629	URB2	99	81.812	Pan_paniscus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	77.676	ENSPPRG00000012767	URB2	99	77.676	Panthera_pardus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	77.938	ENSPTIG00000012577	URB2	99	78.462	Panthera_tigris_altaica
ENSOCUG00000010700	URB2	99	81.615	ENSPTRG00000002092	URB2	99	81.615	Pan_troglodytes
ENSOCUG00000010700	URB2	99	78.267	ENSPANG00000002245	URB2	99	78.267	Papio_anubis
ENSOCUG00000010700	URB2	99	39.757	ENSPKIG00000005787	urb2	99	39.667	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOCUG00000010700	URB2	99	54.231	ENSPSIG00000002690	URB2	99	54.295	Pelodiscus_sinensis
ENSOCUG00000010700	URB2	96	72.416	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	72.416	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOCUG00000010700	URB2	99	62.803	ENSPCIG00000030071	URB2	99	62.606	Phascolarctos_cinereus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.893	ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.911	Poecilia_formosa
ENSOCUG00000010700	URB2	100	34.718	ENSPLAG00000014654	urb2	100	34.923	Poecilia_latipinna
ENSOCUG00000010700	URB2	100	34.969	ENSPMEG00000012356	urb2	100	35.112	Poecilia_mexicana
ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.050	ENSPREG00000010268	urb2	100	34.885	Poecilia_reticulata
ENSOCUG00000010700	URB2	100	81.234	ENSPPYG00000000123	URB2	100	81.234	Pongo_abelii
ENSOCUG00000010700	URB2	100	80.709	ENSPCOG00000023537	URB2	100	80.709	Propithecus_coquereli
ENSOCUG00000010700	URB2	100	65.095	ENSPVAG00000002108	URB2	100	65.138	Pteropus_vampyrus
ENSOCUG00000010700	URB2	90	35.226	ENSPNYG00000016840	urb2	95	35.130	Pundamilia_nyererei
ENSOCUG00000010700	URB2	99	36.825	ENSPNAG00000013684	urb2	99	36.750	Pygocentrus_nattereri
ENSOCUG00000010700	URB2	99	70.858	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	70.858	Rattus_norvegicus
ENSOCUG00000010700	URB2	99	80.893	ENSRBIG00000037937	URB2	99	80.893	Rhinopithecus_bieti
ENSOCUG00000010700	URB2	99	81.090	ENSRROG00000039854	URB2	99	81.090	Rhinopithecus_roxellana
ENSOCUG00000010700	URB2	99	81.615	ENSSBOG00000023055	URB2	99	81.484	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOCUG00000010700	URB2	99	63.065	ENSSHAG00000014735	URB2	99	62.934	Sarcophilus_harrisii
ENSOCUG00000010700	URB2	98	39.446	ENSSFOG00015015432	urb2	99	39.593	Scleropages_formosus
ENSOCUG00000010700	URB2	90	34.450	ENSSMAG00000004984	urb2	96	34.339	Scophthalmus_maximus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	34.881	ENSSDUG00000000902	urb2	100	34.901	Seriola_dumerili
ENSOCUG00000010700	URB2	99	53.077	ENSSPUG00000018549	URB2	99	53.077	Sphenodon_punctatus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	36.798	ENSSPAG00000013632	urb2	100	36.858	Stegastes_partitus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	74.344	ENSSSCG00000010186	URB2	100	74.344	Sus_scrofa
ENSOCUG00000010700	URB2	99	49.805	ENSTGUG00000009990	URB2	99	49.805	Taeniopygia_guttata
ENSOCUG00000010700	URB2	100	33.670	ENSTRUG00000008173	urb2	100	33.750	Takifugu_rubripes
ENSOCUG00000010700	URB2	100	36.334	ENSTNIG00000017689	urb2	100	36.311	Tetraodon_nigroviridis
ENSOCUG00000010700	URB2	100	67.060	ENSTTRG00000014864	URB2	100	66.995	Tursiops_truncatus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	79.724	ENSUAMG00000015022	URB2	100	79.724	Ursus_americanus
ENSOCUG00000010700	URB2	100	79.659	ENSUMAG00000004728	URB2	100	79.659	Ursus_maritimus
ENSOCUG00000010700	URB2	63	85.106	ENSVPAG00000001750	-	63	85.106	Vicugna_pacos
ENSOCUG00000010700	URB2	99	78.661	ENSVVUG00000006747	URB2	99	78.661	Vulpes_vulpes
ENSOCUG00000010700	URB2	99	42.156	ENSXETG00000023331	urb2	99	41.963	Xenopus_tropicalis
ENSOCUG00000010700	URB2	100	34.901	ENSXMAG00000015059	urb2	100	34.737	Xiphophorus_maculatus