EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOCUG00000013050 (Gene tree)
Gene ID: 100354879
Gene Symbol: SYF2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryctolagus_cuniculus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7717 bases
Position: chr13:128352476-128360192
Accession: 100354879
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOCUP00000011232	SYF2	PF08231.12	1.3e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOCUT00000013047	SYF2-201	3187	XM_002716013	ENSOCUP00000011232	244 (aa)	XP_002716059	G1T4L6

Gene Model

Click here to download ENSOCUG00000013050's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ocu03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOCUG00000013050's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.672	ENSG00000117614	SYF2	100	94.672	Homo_sapiens
ENSOCUG00000013050	SYF2	91	84.234	ENSAPOG00000001174	syf2	91	85.185	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOCUG00000013050	SYF2	97	94.118	ENSAMEG00000010115	-	98	93.697	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOCUG00000013050	SYF2	80	96.923	ENSAMEG00000010134	-	100	96.923	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOCUG00000013050	SYF2	91	81.532	ENSACIG00000023688	syf2	86	82.791	Amphilophus_citrinellus
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	81.780	ENSAOCG00000022046	syf2	92	85.648	Amphiprion_ocellaris
ENSOCUG00000013050	SYF2	88	80.365	ENSAOCG00000010912	syf2	62	84.422	Amphiprion_ocellaris
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	81.780	ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.648	Amphiprion_percula
ENSOCUG00000013050	SYF2	89	83.410	ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	Anabas_testudineus
ENSOCUG00000013050	SYF2	82	89.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	Anas_platyrhynchos
ENSOCUG00000013050	SYF2	68	76.048	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSOCUG00000013050	SYF2	84	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	ENSANAG00000032473	SYF2	100	94.262	Aotus_nancymaae
ENSOCUG00000013050	SYF2	91	81.081	ENSACLG00000019916	syf2	91	82.870	Astatotilapia_calliptera
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	77.869	ENSAMXG00000004051	syf2	100	77.869	Astyanax_mexicanus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.878	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.915	Bos_taurus
ENSOCUG00000013050	SYF2	85	50.476	WBGene00019402	syf-2	90	50.237	Caenorhabditis_elegans
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.672	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	94.672	Callithrix_jacchus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.089	ENSCAFG00000012895	-	100	93.089	Canis_familiaris
ENSOCUG00000013050	SYF2	98	84.454	ENSCAFG00000030331	-	98	84.454	Canis_familiaris
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.089	ENSCAFG00020021091	-	100	93.089	Canis_lupus_dingo
ENSOCUG00000013050	SYF2	74	87.912	ENSCAFG00020021094	-	100	69.919	Canis_lupus_dingo
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	92.623	ENSCHIG00000020874	SYF2	98	94.915	Capra_hircus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.443	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.443	Carlito_syrichta
ENSOCUG00000013050	SYF2	81	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.852	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.852	Cavia_porcellus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.672	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	94.672	Cebus_capucinus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	ENSCATG00000026917	SYF2	100	94.262	Cercocebus_atys
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.492	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	95.492	Chinchilla_lanigera
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	94.262	Chlorocebus_sabaeus
ENSOCUG00000013050	SYF2	74	77.348	ENSCHOG00000005273	-	100	74.444	Choloepus_hoffmanni
ENSOCUG00000013050	SYF2	92	90.625	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	88.841	Chrysemys_picta_bellii
ENSOCUG00000013050	SYF2	86	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSOCUG00000013050	SYF2	86	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	81.967	ENSCANG00000037322	SYF2	100	81.967	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	91.803	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.803	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOCUG00000013050	SYF2	82	95.980	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOCUG00000013050	SYF2	89	78.440	ENSCSEG00000000117	syf2	90	79.070	Cynoglossus_semilaevis
ENSOCUG00000013050	SYF2	91	81.900	ENSCVAG00000019543	syf2	90	82.407	Cyprinodon_variegatus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	78.279	ENSDARG00000004706	syf2	91	83.796	Danio_rerio
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.878	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	93.878	Dasypus_novemcinctus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	ENSDORG00000001274	Syf2	100	94.262	Dipodomys_ordii
ENSOCUG00000013050	SYF2	92	57.522	FBgn0033556	CG12343	96	57.339	Drosophila_melanogaster
ENSOCUG00000013050	SYF2	91	79.186	ENSETEG00000015729	SYF2	100	79.130	Echinops_telfairi
ENSOCUG00000013050	SYF2	81	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.286	ENSEASG00005004224	-	100	94.286	Equus_asinus_asinus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	82.787	ENSEASG00005004232	-	100	82.787	Equus_asinus_asinus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.694	ENSECAG00000012023	-	100	94.694	Equus_caballus
ENSOCUG00000013050	SYF2	99	93.361	ENSECAG00000010440	-	98	95.745	Equus_caballus
ENSOCUG00000013050	SYF2	74	81.319	ENSEEUG00000015084	SYF2	99	81.319	Erinaceus_europaeus
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	81.702	ENSELUG00000003465	syf2	91	86.574	Esox_lucius
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.309	ENSFCAG00000043095	-	100	94.309	Felis_catus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.715	ENSFCAG00000010324	-	85	94.715	Felis_catus
ENSOCUG00000013050	SYF2	84	85.784	ENSFALG00000000460	SYF2	88	85.185	Ficedula_albicollis
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	94.262	Fukomys_damarensis
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	61.290	ENSFHEG00000007238	syf2	96	67.742	Fundulus_heteroclitus
ENSOCUG00000013050	SYF2	89	83.486	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	Gadus_morhua
ENSOCUG00000013050	SYF2	92	88.839	ENSGALG00000013639	SYF2	86	89.815	Gallus_gallus
ENSOCUG00000013050	SYF2	91	79.279	ENSGAFG00000019435	syf2	91	81.019	Gambusia_affinis
ENSOCUG00000013050	SYF2	88	83.721	ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	Gasterosteus_aculeatus
ENSOCUG00000013050	SYF2	92	91.071	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	88.841	Gopherus_agassizii
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.082	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	95.082	Gorilla_gorilla
ENSOCUG00000013050	SYF2	94	79.399	ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.639	Haplochromis_burtoni
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.492	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	95.492	Heterocephalus_glaber_female
ENSOCUG00000013050	SYF2	93	83.700	ENSHGLG00000004304	-	100	79.098	Heterocephalus_glaber_female
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.492	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	95.492	Heterocephalus_glaber_male
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	78.689	ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.049	Hippocampus_comes
ENSOCUG00000013050	SYF2	90	84.091	ENSIPUG00000019859	syf2	91	85.185	Ictalurus_punctatus
ENSOCUG00000013050	SYF2	60	97.260	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOCUG00000013050	SYF2	82	97.487	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	Jaculus_jaculus
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	79.149	ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.870	Kryptolebias_marmoratus
ENSOCUG00000013050	SYF2	90	83.562	ENSLBEG00000014425	syf2	91	84.259	Labrus_bergylta
ENSOCUG00000013050	SYF2	96	82.128	ENSLACG00000012064	SYF2	91	87.037	Latimeria_chalumnae
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	79.918	ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.098	Lepisosteus_oculatus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.469	ENSLAFG00000023150	-	100	93.469	Loxodonta_africana
ENSOCUG00000013050	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.672	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	94.672	Macaca_fascicularis
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	94.262	Macaca_mulatta
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.672	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	94.672	Macaca_nemestrina
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	94.262	Mandrillus_leucophaeus
ENSOCUG00000013050	SYF2	89	82.028	ENSMAMG00000010403	syf2	96	75.309	Mastacembelus_armatus
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	78.390	ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.870	Maylandia_zebra
ENSOCUG00000013050	SYF2	82	89.447	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	Meleagris_gallopavo
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	92.213	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	92.213	Mesocricetus_auratus
ENSOCUG00000013050	SYF2	82	97.487	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.443	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	93.443	Microtus_ochrogaster
ENSOCUG00000013050	SYF2	91	79.730	ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.556	Mola_mola
ENSOCUG00000013050	SYF2	92	88.987	ENSMODG00000013951	-	95	88.991	Monodelphis_domestica
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	78.903	ENSMALG00000010706	syf2	90	83.410	Monopterus_albus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.033	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	92.623	Mus_caroli
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.033	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	92.623	Mus_musculus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.033	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	92.623	Mus_pahari
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.033	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	92.623	Mus_spretus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	92.276	ENSMPUG00000015801	-	100	91.870	Mustela_putorius_furo
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.902	ENSMPUG00000015802	-	100	93.496	Mustela_putorius_furo
ENSOCUG00000013050	SYF2	94	97.380	ENSMLUG00000001885	SYF2	94	97.380	Myotis_lucifugus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.522	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.522	Nannospalax_galili
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	71.730	ENSNBRG00000010720	syf2	91	74.178	Neolamprologus_brichardi
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.082	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	95.082	Nomascus_leucogenys
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	94.262	Ochotona_princeps
ENSOCUG00000013050	SYF2	98	93.697	ENSODEG00000017664	-	100	93.697	Octodon_degus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	83.197	ENSODEG00000014338	-	99	85.106	Octodon_degus
ENSOCUG00000013050	SYF2	91	81.081	ENSONIG00000008213	syf2	91	82.407	Oreochromis_niloticus
ENSOCUG00000013050	SYF2	83	91.089	ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOCUG00000013050	SYF2	94	80.000	ENSORLG00000028820	syf2	93	83.796	Oryzias_latipes
ENSOCUG00000013050	SYF2	91	81.982	ENSORLG00020018333	syf2	91	83.796	Oryzias_latipes_hni
ENSOCUG00000013050	SYF2	89	83.028	ENSORLG00015014665	syf2	91	83.796	Oryzias_latipes_hsok
ENSOCUG00000013050	SYF2	94	80.769	ENSOMEG00000013911	syf2	91	84.259	Oryzias_melastigma
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.672	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	94.672	Otolemur_garnettii
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.927	ENSOARG00000006348	-	100	93.522	Ovis_aries
ENSOCUG00000013050	SYF2	80	66.667	ENSOARG00000006269	-	100	66.667	Ovis_aries
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.082	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	95.082	Pan_paniscus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.496	ENSPPRG00000001638	-	100	93.496	Panthera_pardus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.309	ENSPPRG00000001651	-	100	94.309	Panthera_pardus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.309	ENSPTIG00000007036	-	100	93.902	Panthera_tigris_altaica
ENSOCUG00000013050	SYF2	91	97.309	ENSPTIG00000005711	-	81	97.309	Panthera_tigris_altaica
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.082	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	95.082	Pan_troglodytes
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.672	ENSPANG00000008139	SYF2	100	94.672	Papio_anubis
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	81.545	ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.279	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOCUG00000013050	SYF2	96	88.034	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	88.034	Pelodiscus_sinensis
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	79.741	ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.870	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.033	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	93.033	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOCUG00000013050	SYF2	92	94.222	ENSPCIG00000014235	SYF2	86	94.907	Phascolarctos_cinereus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	74.590	ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.590	Poecilia_formosa
ENSOCUG00000013050	SYF2	96	77.350	ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.350	Poecilia_latipinna
ENSOCUG00000013050	SYF2	98	73.750	ENSPMEG00000011684	syf2	99	73.750	Poecilia_mexicana
ENSOCUG00000013050	SYF2	89	81.481	ENSPREG00000003009	syf2	99	76.250	Poecilia_reticulata
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.082	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	95.082	Pongo_abelii
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	65.574	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	65.164	Propithecus_coquereli
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	82.041	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.816	Pteropus_vampyrus
ENSOCUG00000013050	SYF2	91	81.081	ENSPNYG00000004979	syf2	91	82.870	Pundamilia_nyererei
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	81.148	ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.738	Pygocentrus_nattereri
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.033	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	92.623	Rattus_norvegicus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	92.213	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	92.213	Rhinopithecus_bieti
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.672	ENSRROG00000001347	SYF2	100	94.672	Rhinopithecus_roxellana
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.443	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	93.443	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOCUG00000013050	SYF2	84	93.204	ENSSHAG00000007152	-	100	93.204	Sarcophilus_harrisii
ENSOCUG00000013050	SYF2	92	92.889	ENSSHAG00000015630	-	87	93.056	Sarcophilus_harrisii
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	78.689	ENSSFOG00015023647	syf2	100	78.689	Scleropages_formosus
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	77.966	ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.944	Scophthalmus_maximus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	77.049	ENSSDUG00000013072	syf2	91	83.796	Seriola_dumerili
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	77.049	ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.796	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOCUG00000013050	SYF2	99	74.074	ENSSARG00000012889	SYF2	99	73.663	Sorex_araneus
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	87.446	ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.889	Sphenodon_punctatus
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	80.000	ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.796	Stegastes_partitus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.469	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.469	Sus_scrofa
ENSOCUG00000013050	SYF2	61	60.265	ENSTGUG00000001126	SYF2	80	61.491	Taeniopygia_guttata
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	76.230	ENSTRUG00000001499	syf2	93	74.897	Takifugu_rubripes
ENSOCUG00000013050	SYF2	91	79.372	ENSTNIG00000016912	syf2	97	81.019	Tetraodon_nigroviridis
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	72.131	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	71.721	Tupaia_belangeri
ENSOCUG00000013050	SYF2	99	94.239	ENSTTRG00000003550	SYF2	99	94.239	Tursiops_truncatus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	92.683	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	92.276	Ursus_americanus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.089	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	92.683	Ursus_maritimus
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.061	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.061	Vicugna_pacos
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	89.919	ENSVVUG00000027181	-	100	89.919	Vulpes_vulpes
ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.089	ENSVVUG00000027175	-	100	93.089	Vulpes_vulpes
ENSOCUG00000013050	SYF2	95	83.691	ENSXETG00000022797	syf2	94	83.691	Xenopus_tropicalis
ENSOCUG00000013050	SYF2	88	81.395	ENSXMAG00000022698	syf2	91	81.019	Xiphophorus_maculatus