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Description

Ensembl ID: ENSOCUG00000013318 (Gene tree)
Gene ID: 100343169
Gene Symbol: TNPO1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryctolagus_cuniculus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 53155 bases
Position: chrGL018720:1447236-1500390
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOCUP00000011467	IBN_N	PF03810.19	5.5e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOCUT00000013324	TNPO1-201	5340	-	ENSOCUP00000011467	844 (aa)	-	G1T568

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOCUG00000013318	TNPO1	90	84.892	ENSOCUG00000008251	TNPO2	86	67.337

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSG00000083312	TNPO1	100	99.482	Homo_sapiens
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.734	ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	87.734	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.245	ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	92.361	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOCUG00000013318	TNPO1	86	85.541	ENSACIG00000003711	tnpo1	95	85.811	Amphilophus_citrinellus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.850	ENSAOCG00000008154	tnpo1	96	87.850	Amphiprion_ocellaris
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.850	ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	87.850	Amphiprion_percula
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.617	ENSATEG00000010408	tnpo1	96	87.617	Anabas_testudineus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	88.631	ENSAPLG00000009619	-	96	88.631	Anas_platyrhynchos
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	90.771	ENSACAG00000009599	TNPO1	96	90.771	Anolis_carolinensis
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	60.814	ENSANAG00000027118	-	97	61.279	Aotus_nancymaae
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.085	ENSANAG00000025351	-	95	87.085	Aotus_nancymaae
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.757	ENSANAG00000022453	-	95	92.757	Aotus_nancymaae
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.215	ENSACLG00000027223	tnpo1	96	86.449	Astatotilapia_calliptera
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.179	ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	87.179	Astyanax_mexicanus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	ENSBTAG00000007979	TNPO1	95	93.107	Bos_taurus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	92.874	Callithrix_jacchus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.007	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.007	Canis_familiaris
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	89.953	ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	89.953	Canis_lupus_dingo
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	93.107	Capra_hircus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.589	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.589	Carlito_syrichta
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.757	ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	92.757	Cebus_capucinus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSCATG00000043792	TNPO1	96	93.224	Cercocebus_atys
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.757	ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	92.757	Chinchilla_lanigera
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	ENSCSAG00000015616	TNPO1	95	93.107	Chlorocebus_sabaeus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	94	78.634	ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	79.255	Choloepus_hoffmanni
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.355	ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	91.355	Chrysemys_picta_bellii
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	70.314	ENSCSAVG00000010981	-	96	70.547	Ciona_savignyi
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSCANG00000004353	TNPO1	95	93.224	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	92.874	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	92.874	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.449	ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	86.449	Cynoglossus_semilaevis
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.033	ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	87.033	Cyprinodon_variegatus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.814	ENSDARG00000035390	tnpo1	96	86.814	Danio_rerio
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.030	ENSDNOG00000006647	TNPO1	96	86.612	Dasypus_novemcinctus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	97	92.900	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.892	Dipodomys_ordii
ENSOCUG00000013318	TNPO1	97	55.758	FBgn0035693	CG8219	96	55.758	Drosophila_melanogaster
ENSOCUG00000013318	TNPO1	85	99.251	ENSETEG00000017805	TNPO1	85	99.251	Echinops_telfairi
ENSOCUG00000013318	TNPO1	98	79.738	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	79.738	Eptatretus_burgeri
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSEASG00005018055	TNPO1	96	93.224	Equus_asinus_asinus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	ENSECAG00000024424	TNPO1	95	93.107	Equus_caballus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	82.727	ENSELUG00000002821	tnpo1	96	82.727	Esox_lucius
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSFCAG00000013181	TNPO1	96	93.224	Felis_catus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.005	ENSFALG00000010292	TNPO1	96	91.005	Ficedula_albicollis
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	92.874	Fukomys_damarensis
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.515	ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	87.515	Fundulus_heteroclitus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	84.517	ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	84.517	Gadus_morhua
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	89.953	ENSGALG00000015014	TNPO1	96	90.187	Gallus_gallus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.480	ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	86.480	Gambusia_affinis
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.150	ENSGACG00000015841	tnpo1	96	87.150	Gasterosteus_aculeatus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.121	ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	91.121	Gopherus_agassizii
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSGGOG00000026800	TNPO1	96	93.224	Gorilla_gorilla
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	77.273	ENSGGOG00000022535	-	95	77.273	Gorilla_gorilla
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.033	ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	87.033	Haplochromis_burtoni
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.757	ENSHGLG00000000970	-	95	92.757	Heterocephalus_glaber_female
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.757	ENSHGLG00100017090	-	99	92.757	Heterocephalus_glaber_male
ENSOCUG00000013318	TNPO1	99	75.445	ENSHGLG00100000963	-	98	75.445	Heterocephalus_glaber_male
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	93.107	Jaculus_jaculus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.266	ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	87.266	Kryptolebias_marmoratus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	90	83.269	ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	83.269	Labrus_bergylta
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	82.558	ENSLACG00000012199	TNPO1	99	82.791	Latimeria_chalumnae
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	89.136	ENSLOCG00000011092	tnpo1	93	89.136	Lepisosteus_oculatus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	94.090	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	94.090	Loxodonta_africana
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSMFAG00000003636	TNPO1	95	93.224	Macaca_fascicularis
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	93.107	Macaca_mulatta
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSMNEG00000044581	TNPO1	95	93.224	Macaca_nemestrina
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSMLEG00000030740	TNPO1	95	93.224	Mandrillus_leucophaeus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.617	ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	87.617	Mastacembelus_armatus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.565	ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	86.799	Maylandia_zebra
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	92.874	Mesocricetus_auratus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	89.019	ENSMICG00000008468	TNPO1	95	89.019	Microcebus_murinus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	92.874	Microtus_ochrogaster
ENSOCUG00000013318	TNPO1	86	85.175	ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	85.714	Mola_mola
ENSOCUG00000013318	TNPO1	99	88.110	ENSMODG00000001721	TNPO1	77	88.110	Monodelphis_domestica
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.332	ENSMALG00000009782	tnpo1	96	86.332	Monopterus_albus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	96	92.874	Mus_caroli
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	96	92.874	Mus_musculus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	92.109	Mus_pahari
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.640	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	96	91.850	Mus_spretus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	ENSMPUG00000014387	TNPO1	95	93.107	Mustela_putorius_furo
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.558	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.558	Myotis_lucifugus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.991	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	92.991	Nannospalax_galili
ENSOCUG00000013318	TNPO1	86	85.405	ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	85.676	Neolamprologus_brichardi
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSNLEG00000004572	TNPO1	96	93.224	Nomascus_leucogenys
ENSOCUG00000013318	TNPO1	92	94.014	ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	94.014	Ochotona_princeps
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.640	ENSODEG00000001771	TNPO1	95	92.640	Octodon_degus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.079	ENSONIG00000011151	tnpo1	95	86.311	Oreochromis_niloticus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	96	90.621	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	91.108	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	86	85.135	ENSORLG00000003182	tnpo1	95	85.541	Oryzias_latipes
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.449	ENSORLG00020011559	tnpo1	96	86.799	Oryzias_latipes_hni
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.916	ENSORLG00015019113	tnpo1	96	86.916	Oryzias_latipes_hsok
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.799	ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	86.799	Oryzias_melastigma
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	ENSOGAG00000000808	TNPO1	95	93.107	Otolemur_garnettii
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	ENSOARG00000005038	TNPO1	80	93.107	Ovis_aries
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSPPAG00000042518	TNPO1	95	93.224	Pan_paniscus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSPPRG00000022336	TNPO1	96	93.224	Panthera_pardus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSPTIG00000018839	TNPO1	96	93.224	Panthera_tigris_altaica
ENSOCUG00000013318	TNPO1	94	79.016	ENSPTRG00000047731	-	96	79.740	Pan_troglodytes
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSPTRG00000016972	TNPO1	95	93.224	Pan_troglodytes
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSPANG00000006074	TNPO1	95	93.224	Papio_anubis
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	84.463	ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	84.463	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.005	ENSPSIG00000014366	TNPO1	95	91.005	Pelodiscus_sinensis
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	85.380	ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	85.380	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.874	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.939	ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	91.939	Phascolarctos_cinereus
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.962	ENSPFOG00000011447	tnpo1	96	86.962	Poecilia_formosa
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.962	ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	86.962	Poecilia_latipinna
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.150	ENSPMEG00000024121	tnpo1	96	87.150	Poecilia_mexicana
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.063	ENSPREG00000020705	tnpo1	96	87.063	Poecilia_reticulata
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	ENSPPYG00000015545	TNPO1	95	93.107	Pongo_abelii
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSPCOG00000004254	TNPO1	95	93.224	Propithecus_coquereli
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.991	ENSPVAG00000013051	TNPO1	95	92.991	Pteropus_vampyrus
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ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.612	ENSPNAG00000021484	tnpo1	96	87.296	Pygocentrus_nattereri
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ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	ENSRROG00000035271	TNPO1	95	93.224	Rhinopithecus_roxellana
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ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	90.521	ENSXETG00000016812	tnpo1	95	90.521	Xenopus_tropicalis
ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.048	ENSXMAG00000005440	tnpo1	96	87.048	Xiphophorus_maculatus