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Description

Ensembl ID: ENSOCUG00000023902 (Gene tree)
Gene ID: 100344574
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Oryctolagus_cuniculus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1455 bases
Position: chr11:68839361-68840815
Accession: 100344574
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOCUP00000021230	eRF1_2	PF03464.15	1.6e-37	1	1
ENSOCUP00000021230	eRF1_3	PF03465.15	5e-27	1	1
ENSOCUP00000021230	eRF1_1	PF03463.15	1.2e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOCUT00000029541	PELO-201	1158	XM_002714027	ENSOCUP00000021230	385 (aa)	XP_002714073	G1TVY8

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ocu03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.182	ENSG00000152684	PELO	100	98.182	Homo_sapiens
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.260	ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOCUG00000023902	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOCUG00000023902	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000023700	-	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	ENSAMEG00000007734	PELO	100	98.442	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOCUG00000023902	PELO	97	77.480	ENSACIG00000014386	pelo	97	82.249	Amphilophus_citrinellus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.519	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.519	Amphiprion_ocellaris
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.519	ENSAPEG00000011235	pelo	100	80.519	Amphiprion_percula
ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.818	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	Anabas_testudineus
ENSOCUG00000023902	PELO	77	85.235	ENSAPLG00000013265	PELO	100	85.235	Anas_platyrhynchos
ENSOCUG00000023902	PELO	98	90.160	ENSACAG00000004352	PELO	100	89.870	Anolis_carolinensis
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.182	ENSANAG00000014096	PELO	100	98.182	Aotus_nancymaae
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.779	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.779	Astatotilapia_calliptera
ENSOCUG00000023902	PELO	97	81.501	ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	Astyanax_mexicanus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.442	Bos_taurus
ENSOCUG00000023902	PELO	98	57.979	WBGene00011280	pelo-1	99	57.979	Caenorhabditis_elegans
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.442	Callithrix_jacchus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	Canis_lupus_dingo
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.182	ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.182	Capra_hircus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.961	ENSTSYG00000005203	PELO	100	98.961	Carlito_syrichta
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.442	Cavia_porcellus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	ENSCCAG00000035600	PELO	100	98.442	Cebus_capucinus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSCATG00000011829	PELO	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.922	ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.922	Chinchilla_lanigera
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.701	Chlorocebus_sabaeus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.182	ENSCHOG00000000523	PELO	100	98.182	Choloepus_hoffmanni
ENSOCUG00000023902	PELO	98	93.617	ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	Chrysemys_picta_bellii
ENSOCUG00000023902	PELO	97	68.365	ENSCING00000001979	-	100	68.831	Ciona_intestinalis
ENSOCUG00000023902	PELO	100	69.870	ENSCSAVG00000006158	-	100	69.870	Ciona_savignyi
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSCANG00000023382	PELO	100	98.701	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	95.065	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.065	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOCUG00000023902	PELO	100	96.364	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.364	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.260	ENSCSEG00000008807	pelo	100	80.260	Cynoglossus_semilaevis
ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.818	ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.818	Cyprinodon_variegatus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	82.078	ENSDARG00000055477	pelo	100	82.078	Danio_rerio
ENSOCUG00000023902	PELO	100	95.337	ENSDNOG00000036721	PELO	100	95.337	Dasypus_novemcinctus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.662	ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.662	Dipodomys_ordii
ENSOCUG00000023902	PELO	96	67.027	FBgn0011207	pelo	96	66.491	Drosophila_melanogaster
ENSOCUG00000023902	PELO	71	81.287	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	Eptatretus_burgeri
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.961	ENSEASG00005013348	PELO	100	98.961	Equus_asinus_asinus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.519	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	Esox_lucius
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSFCAG00000032341	PELO	100	98.701	Felis_catus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	95.065	ENSFALG00000004559	PELO	100	95.065	Ficedula_albicollis
ENSOCUG00000023902	PELO	74	98.239	ENSFDAG00000002076	PELO	88	98.239	Fukomys_damarensis
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.000	ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	Fundulus_heteroclitus
ENSOCUG00000023902	PELO	98	80.106	ENSGMOG00000005849	pelo	100	79.740	Gadus_morhua
ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.039	ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	Gambusia_affinis
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.260	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	Gasterosteus_aculeatus
ENSOCUG00000023902	PELO	98	93.883	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	Gopherus_agassizii
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSGGOG00000012635	PELO	100	98.701	Gorilla_gorilla
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.779	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.779	Haplochromis_burtoni
ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.922	ENSHGLG00000005932	PELO	100	97.922	Heterocephalus_glaber_female
ENSOCUG00000023902	PELO	100	95.584	ENSHGLG00100017627	PELO	100	95.584	Heterocephalus_glaber_male
ENSOCUG00000023902	PELO	100	77.922	ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.922	Hippocampus_comes
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.260	ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.260	Ictalurus_punctatus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.442	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	93.766	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	93.766	Jaculus_jaculus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.039	ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	Kryptolebias_marmoratus
ENSOCUG00000023902	PELO	99	80.729	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.729	Labrus_bergylta
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSLAFG00000020551	PELO	100	98.701	Loxodonta_africana
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSMFAG00000000651	PELO	100	98.701	Macaca_fascicularis
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSMMUG00000039101	PELO	100	98.701	Macaca_mulatta
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSMNEG00000035538	PELO	100	98.701	Macaca_nemestrina
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSMLEG00000039113	PELO	100	98.701	Mandrillus_leucophaeus
ENSOCUG00000023902	PELO	97	83.378	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	Mastacembelus_armatus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.779	ENSMZEG00005014258	pelo	100	80.779	Maylandia_zebra
ENSOCUG00000023902	PELO	100	96.364	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	96.364	Mesocricetus_auratus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.961	ENSMICG00000044040	PELO	100	98.961	Microcebus_murinus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	96.883	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	96.883	Microtus_ochrogaster
ENSOCUG00000023902	PELO	100	79.221	ENSMMOG00000001324	pelo	100	79.221	Mola_mola
ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.818	ENSMALG00000008194	pelo	100	81.818	Monopterus_albus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.143	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.143	Mus_caroli
ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.143	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	97.143	Mus_musculus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.403	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	97.403	Mus_pahari
ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.143	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	97.143	Mus_spretus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	95.325	ENSMLUG00000024132	PELO	100	95.325	Myotis_lucifugus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.662	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	97.662	Nannospalax_galili
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.779	ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.779	Neolamprologus_brichardi
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSNLEG00000035970	PELO	100	98.701	Nomascus_leucogenys
ENSOCUG00000023902	PELO	100	94.805	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.805	Notamacropus_eugenii
ENSOCUG00000023902	PELO	98	97.625	ENSOPRG00000018793	PELO	100	97.625	Ochotona_princeps
ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.143	ENSODEG00000017579	PELO	100	97.143	Octodon_degus
ENSOCUG00000023902	PELO	96	80.593	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.260	Oreochromis_niloticus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.299	ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	Oryzias_latipes
ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.558	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	Oryzias_latipes_hni
ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.818	ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	Oryzias_latipes_hsok
ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.818	ENSOMEG00000021567	pelo	100	81.818	Oryzias_melastigma
ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.662	ENSOGAG00000027940	PELO	100	97.662	Otolemur_garnettii
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	ENSOARG00000008324	PELO	99	98.442	Ovis_aries
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSPPAG00000038951	PELO	100	98.701	Pan_paniscus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSPPRG00000018800	PELO	100	98.701	Panthera_pardus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.701	Panthera_tigris_altaica
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.442	Pan_troglodytes
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSPANG00000010902	PELO	100	98.701	Papio_anubis
ENSOCUG00000023902	PELO	100	82.857	ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.857	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOCUG00000023902	PELO	98	93.351	ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	Pelodiscus_sinensis
ENSOCUG00000023902	PELO	67	78.682	ENSPMGG00000014561	pelo	95	78.682	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	96.883	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	96.883	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.143	ENSPCIG00000004880	PELO	100	97.143	Phascolarctos_cinereus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.818	ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.818	Poecilia_formosa
ENSOCUG00000023902	PELO	100	82.078	ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	Poecilia_latipinna
ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.818	ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	Poecilia_mexicana
ENSOCUG00000023902	PELO	100	82.078	ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	Poecilia_reticulata
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	ENSPPYG00000015451	PELO	96	98.442	Pongo_abelii
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.961	ENSPCOG00000021178	PELO	100	98.961	Propithecus_coquereli
ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.779	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.779	Pundamilia_nyererei
ENSOCUG00000023902	PELO	97	82.038	ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.779	Pygocentrus_nattereri
ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.403	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	97.403	Rattus_norvegicus
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSRBIG00000007299	PELO	100	98.701	Rhinopithecus_bieti
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	ENSRROG00000035507	PELO	100	98.701	Rhinopithecus_roxellana
ENSOCUG00000023902	PELO	98	34.635	YNL001W	-	98	34.635	Saccharomyces_cerevisiae
ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.182	ENSSBOG00000036140	PELO	100	98.182	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOCUG00000023902	PELO	63	95.902	ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.902	Sarcophilus_harrisii
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ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.260	ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.260	Scophthalmus_maximus
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