EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSODEG00000001771 (Gene tree)
Gene ID: 101568634
Gene Symbol: TNPO1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Octodon_degus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 95149 bases
Position: chrJH651692.1:295344-390492
Accession: 101568634
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSODEP00000002270	IBN_N	PF03810.19	6.3e-16	1	1
ENSODEP00000002269	IBN_N	PF03810.19	6.3e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSODET00000002323	TNPO1-202	2700	-	ENSODEP00000002270	899 (aa)	-	-
ENSODET00000002322	TNPO1-201	5143	XM_004643474	ENSODEP00000002269	898 (aa)	XP_004643531	UPI0003338936

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	85.118	ENSODEG00000009670	TNPO2	99	84.893

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSG00000083312	TNPO1	100	99.332	Homo_sapiens
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	93.146	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.146	Acanthochromis_polyacanthus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	98.337	ENSAMEG00000007147	TNPO1	100	98.124	Ailuropoda_melanoleuca
ENSODEG00000001771	TNPO1	86	92.119	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.119	Amphilophus_citrinellus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	93.258	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.258	Amphiprion_ocellaris
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	93.258	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.258	Amphiprion_percula
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.809	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	92.809	Anabas_testudineus
ENSODEG00000001771	TNPO1	98	92.334	ENSAPLG00000009619	-	97	93.333	Anas_platyrhynchos
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	96.292	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.292	Anolis_carolinensis
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	87.862	ENSANAG00000025351	-	100	87.862	Aotus_nancymaae
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.886	ENSANAG00000022453	-	100	98.886	Aotus_nancymaae
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	63.929	ENSANAG00000027118	-	99	63.818	Aotus_nancymaae
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	90.899	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	90.899	Astatotilapia_calliptera
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.040	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.928	Astyanax_mexicanus
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.109	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.109	Bos_taurus
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.998	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	98.998	Callithrix_jacchus
ENSODEG00000001771	TNPO1	95	99.067	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.067	Canis_familiaris
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	96.180	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.180	Canis_lupus_dingo
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.220	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.220	Capra_hircus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	95.028	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.289	Carlito_syrichta
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.886	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	98.886	Cebus_capucinus
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.332	Cercocebus_atys
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.777	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.777	Chinchilla_lanigera
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.220	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.220	Chlorocebus_sabaeus
ENSODEG00000001771	TNPO1	94	86.423	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.423	Choloepus_hoffmanni
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	97.082	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.082	Chrysemys_picta_bellii
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	74.860	ENSCSAVG00000010981	-	99	74.860	Ciona_savignyi
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.332	Colobus_angolensis_palliatus
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.998	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	98.998	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSODEG00000001771	TNPO1	95	98.947	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	98.947	Cricetulus_griseus_crigri
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	91.798	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	91.798	Cynoglossus_semilaevis
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.921	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.921	Cyprinodon_variegatus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	91.919	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.582	Danio_rerio
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.969	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	92.969	Dasypus_novemcinctus
ENSODEG00000001771	TNPO1	92	99.036	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.035	Dipodomys_ordii
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	57.449	FBgn0035693	CG8219	99	56.998	Drosophila_melanogaster
ENSODEG00000001771	TNPO1	86	98.876	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.876	Echinops_telfairi
ENSODEG00000001771	TNPO1	94	84.762	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.000	Eptatretus_burgeri
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.332	Equus_asinus_asinus
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.109	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.109	Equus_caballus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	85.948	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.512	Esox_lucius
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.332	Felis_catus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	96.742	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	96.742	Ficedula_albicollis
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.666	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	Fukomys_damarensis
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	93.154	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.154	Fundulus_heteroclitus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	89.509	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.509	Gadus_morhua
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	95.880	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.292	Gallus_gallus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	91.928	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	91.928	Gambusia_affinis
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.282	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.282	Gasterosteus_aculeatus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	97.079	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.079	Gopherus_agassizii
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.332	Gorilla_gorilla
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	82.682	ENSGGOG00000022535	-	99	82.682	Gorilla_gorilla
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.472	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.472	Haplochromis_burtoni
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.777	ENSHGLG00000000970	-	100	99.777	Heterocephalus_glaber_female
ENSODEG00000001771	TNPO1	95	99.650	ENSHGLG00100017090	-	99	99.650	Heterocephalus_glaber_male
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	75.835	ENSHGLG00100000963	-	99	77.558	Heterocephalus_glaber_male
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	99.104	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.104	Jaculus_jaculus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.921	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	92.921	Kryptolebias_marmoratus
ENSODEG00000001771	TNPO1	90	89.396	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.396	Labrus_bergylta
ENSODEG00000001771	TNPO1	95	88.721	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.721	Latimeria_chalumnae
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	94.737	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	94.631	Lepisosteus_oculatus
ENSODEG00000001771	TNPO1	96	98.730	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.730	Loxodonta_africana
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.332	Macaca_fascicularis
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.220	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.220	Macaca_mulatta
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.332	Macaca_nemestrina
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.332	Mandrillus_leucophaeus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.809	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	92.809	Mastacembelus_armatus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.247	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.247	Maylandia_zebra
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	98.884	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	99.438	Mesocricetus_auratus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	95.297	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.297	Microcebus_murinus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	98.554	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	98.554	Microtus_ochrogaster
ENSODEG00000001771	TNPO1	86	91.753	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	91.753	Mola_mola
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	97.447	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.447	Monodelphis_domestica
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	91.685	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.685	Monopterus_albus
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.775	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	99.438	Mus_caroli
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.998	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	99.438	Mus_musculus
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.886	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	99.438	Mus_pahari
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.775	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	99.438	Mus_spretus
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.220	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.220	Mustela_putorius_furo
ENSODEG00000001771	TNPO1	95	98.603	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.603	Myotis_lucifugus
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.998	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	98.998	Nannospalax_galili
ENSODEG00000001771	TNPO1	86	91.990	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	91.990	Neolamprologus_brichardi
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.332	Nomascus_leucogenys
ENSODEG00000001771	TNPO1	91	92.355	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.355	Ochotona_princeps
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	91.648	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.648	Oreochromis_niloticus
ENSODEG00000001771	TNPO1	91	97.439	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.439	Ornithorhynchus_anatinus
ENSODEG00000001771	TNPO1	95	92.640	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.640	Oryctolagus_cuniculus
ENSODEG00000001771	TNPO1	86	92.348	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.348	Oryzias_latipes
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.672	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.672	Oryzias_latipes_hni
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.785	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.785	Oryzias_latipes_hsok
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.446	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.446	Oryzias_melastigma
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.220	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.220	Otolemur_garnettii
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.109	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.109	Ovis_aries
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.332	Pan_paniscus
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.332	Panthera_pardus
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.332	Panthera_tigris_altaica
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.332	Pan_troglodytes
ENSODEG00000001771	TNPO1	93	86.326	ENSPTRG00000047731	-	100	86.326	Pan_troglodytes
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.332	Papio_anubis
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	89.888	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	89.888	Paramormyrops_kingsleyae
ENSODEG00000001771	TNPO1	100	96.325	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.325	Pelodiscus_sinensis
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	90.236	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSODEG00000001771	TNPO1	95	98.947	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	98.947	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	97.640	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.640	Phascolarctos_cinereus
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.721	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	92.721	Poecilia_formosa
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.721	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.721	Poecilia_latipinna
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.921	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	92.921	Poecilia_mexicana
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.825	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.825	Poecilia_reticulata
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ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.220	ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.220	Propithecus_coquereli
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ENSODEG00000001771	TNPO1	99	91.713	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.152	Pygocentrus_nattereri
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ENSODEG00000001771	TNPO1	96	97.106	ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.106	Sarcophilus_harrisii
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ENSODEG00000001771	TNPO1	99	94.531	ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.531	Taeniopygia_guttata
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ENSODEG00000001771	TNPO1	99	99.326	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	99.326	Vulpes_vulpes
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	94.045	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.045	Xenopus_tropicalis
ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.593	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.593	Xiphophorus_maculatus