EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSODEG00000006355 (Gene tree)
Gene ID: 101570473
Gene Symbol: AGO4
Alias: -
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Octodon_degus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 32285 bases
Position: chrJH651645.1:3700445-3732729
Accession: 101570473
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSODEP00000008512	PAZ	PF02170.22	6.2e-28	1	1
ENSODEP00000008512	Piwi	PF02171.17	2.7e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSODET00000008639	AGO4-201	2463	XM_004641016	ENSODEP00000008512	820 (aa)	XP_004641073	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSODEG00000006355	AGO4	97	79.825	ENSODEG00000014145	AGO2	92	79.825
ENSODEG00000006355	AGO4	97	83.960	ENSODEG00000005321	AGO1	92	83.960
ENSODEG00000006355	AGO4	97	81.908	ENSODEG00000005161	AGO3	93	81.908

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSG00000134698	AGO4	93	99.875	Homo_sapiens
ENSODEG00000006355	AGO4	93	96.248	ENSAPOG00000023867	ago4	92	96.248	Acanthochromis_polyacanthus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSAMEG00000000573	AGO4	93	99.875	Ailuropoda_melanoleuca
ENSODEG00000006355	AGO4	97	97.607	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.607	Amphilophus_citrinellus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	92.947	ENSAPEG00000022426	ago4	100	92.947	Amphiprion_percula
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.273	Anabas_testudineus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.373	ENSAPLG00000010882	AGO4	94	99.373	Anas_platyrhynchos
ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.371	ENSACAG00000017275	AGO4	92	98.371	Anolis_carolinensis
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.749	ENSANAG00000031428	AGO4	93	99.749	Aotus_nancymaae
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	ENSACLG00000005181	ago4	100	94.584	Astatotilapia_calliptera
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.539	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.348	Astyanax_mexicanus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.747	ENSBTAG00000015220	AGO4	93	98.747	Bos_taurus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSCJAG00000001610	AGO4	93	99.875	Callithrix_jacchus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.874	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.874	Canis_familiaris
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.749	ENSCHIG00000026564	AGO4	93	99.749	Capra_hircus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSTSYG00000014007	AGO4	93	99.875	Carlito_syrichta
ENSODEG00000006355	AGO4	90	99.735	ENSCAPG00000009369	AGO4	92	99.735	Cavia_aperea
ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.120	ENSCPOG00000011557	AGO4	92	98.120	Cavia_porcellus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSCCAG00000001397	AGO4	93	99.875	Cebus_capucinus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSCATG00000043421	AGO4	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.749	ENSCLAG00000012097	AGO4	93	99.749	Chinchilla_lanigera
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSCSAG00000001090	AGO4	93	99.875	Chlorocebus_sabaeus
ENSODEG00000006355	AGO4	77	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	75	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.373	ENSCPBG00000018602	AGO4	92	99.373	Chrysemys_picta_bellii
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSCANG00000016914	AGO4	93	99.875	Colobus_angolensis_palliatus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.373	ENSCGRG00001002701	Ago4	93	99.373	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.373	ENSCGRG00000013335	Ago4	93	99.373	Cricetulus_griseus_crigri
ENSODEG00000006355	AGO4	97	91.583	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.583	Cynoglossus_semilaevis
ENSODEG00000006355	AGO4	97	97.744	ENSDARG00000100854	ago4	92	97.744	Danio_rerio
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSDNOG00000015674	AGO4	93	99.875	Dasypus_novemcinctus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSDORG00000008933	Ago4	93	99.875	Dipodomys_ordii
ENSODEG00000006355	AGO4	63	100.000	ENSETEG00000018390	AGO4	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSEASG00005012079	AGO4	93	99.875	Equus_asinus_asinus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSECAG00000024686	AGO4	93	99.875	Equus_caballus
ENSODEG00000006355	AGO4	76	96.364	ENSEEUG00000000745	AGO4	72	96.364	Erinaceus_europaeus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.168	ENSELUG00000023873	ago4	92	96.168	Esox_lucius
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSFCAG00000006218	AGO4	93	99.875	Felis_catus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSFDAG00000021483	AGO4	93	99.875	Fukomys_damarensis
ENSODEG00000006355	AGO4	97	88.346	ENSFHEG00000019658	ago4	95	88.346	Fundulus_heteroclitus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	97.619	ENSGMOG00000009544	ago4	92	97.619	Gadus_morhua
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.373	ENSGALG00000039713	AGO4	100	99.370	Gallus_gallus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	ENSGAFG00000017239	ago4	93	96.292	Gambusia_affinis
ENSODEG00000006355	AGO4	97	97.744	ENSGACG00000002683	ago4	93	97.744	Gasterosteus_aculeatus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.370	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.370	Gopherus_agassizii
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.245	ENSGGOG00000036532	AGO4	94	96.245	Gorilla_gorilla
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	ENSHBUG00000001525	ago4	93	96.292	Haplochromis_burtoni
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSHGLG00000010241	AGO4	93	99.875	Heterocephalus_glaber_female
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSHGLG00100005233	AGO4	94	99.875	Heterocephalus_glaber_male
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.168	ENSHCOG00000003725	ago4	93	96.168	Hippocampus_comes
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.415	ENSIPUG00000015600	ago4	93	96.415	Ictalurus_punctatus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSSTOG00000004725	AGO4	93	99.875	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.415	ENSKMAG00000018602	ago4	93	96.415	Kryptolebias_marmoratus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	95.583	ENSLBEG00000010670	ago4	93	95.583	Labrus_bergylta
ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.496	ENSLACG00000016888	AGO4	93	98.496	Latimeria_chalumnae
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.415	ENSLOCG00000000584	ago4	93	96.415	Lepisosteus_oculatus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.124	ENSLAFG00000010394	AGO4	99	99.124	Loxodonta_africana
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSMFAG00000035543	AGO4	93	99.875	Macaca_fascicularis
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.750	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSMLEG00000039490	AGO4	93	99.875	Mandrillus_leucophaeus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.168	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.086	Mastacembelus_armatus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	ENSMZEG00005026346	ago4	93	96.292	Maylandia_zebra
ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.997	ENSMGAG00000003851	AGO4	93	98.997	Meleagris_gallopavo
ENSODEG00000006355	AGO4	79	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	87	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.625	ENSMICG00000033507	AGO4	93	99.625	Microcebus_murinus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.373	ENSMOCG00000005772	Ago4	93	99.373	Microtus_ochrogaster
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.599	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.599	Mola_mola
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.499	ENSMODG00000017888	AGO4	93	99.499	Monodelphis_domestica
ENSODEG00000006355	AGO4	97	95.614	ENSMALG00000011797	ago4	93	95.614	Monopterus_albus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.872	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	93	98.872	Mus_caroli
ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.622	ENSMUSG00000042500	Ago4	93	98.622	Mus_musculus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.246	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	93	98.246	Mus_pahari
ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.371	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	93	98.371	Mus_spretus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.874	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	99.874	Mustela_putorius_furo
ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.496	ENSMLUG00000017102	AGO4	92	98.496	Myotis_lucifugus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSNGAG00000020544	Ago4	93	99.875	Nannospalax_galili
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	ENSNBRG00000013492	ago4	93	96.292	Neolamprologus_brichardi
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSNLEG00000011125	AGO4	93	99.875	Nomascus_leucogenys
ENSODEG00000006355	AGO4	87	97.770	ENSMEUG00000001023	AGO4	84	97.770	Notamacropus_eugenii
ENSODEG00000006355	AGO4	97	92.105	ENSOPRG00000012309	AGO4	93	92.105	Ochotona_princeps
ENSODEG00000006355	AGO4	97	97.118	ENSONIG00000013603	ago4	93	96.292	Oreochromis_niloticus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.496	ENSOANG00000002082	AGO4	100	99.496	Ornithorhynchus_anatinus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	100.000	ENSOCUG00000004076	AGO4	93	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	ENSORLG00000009865	ago4	85	96.292	Oryzias_latipes
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	ENSORLG00020016978	ago4	85	96.292	Oryzias_latipes_hni
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	ENSORLG00015008800	ago4	85	96.292	Oryzias_latipes_hsok
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	ENSOMEG00000006399	ago4	93	96.292	Oryzias_melastigma
ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.371	ENSOGAG00000004233	-	99	98.371	Otolemur_garnettii
ENSODEG00000006355	AGO4	97	91.980	ENSOGAG00000027107	-	93	91.980	Otolemur_garnettii
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.248	ENSOARG00000019568	AGO4	91	99.248	Ovis_aries
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSPPAG00000031752	AGO4	93	99.875	Pan_paniscus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSPPRG00000006520	AGO4	93	99.875	Panthera_pardus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSPTIG00000020262	AGO4	93	99.875	Panthera_tigris_altaica
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSPTRG00000000527	AGO4	93	99.875	Pan_troglodytes
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.874	ENSPANG00000007232	AGO4	100	99.874	Papio_anubis
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	ENSPKIG00000022598	ago4	93	96.292	Paramormyrops_kingsleyae
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.373	ENSPSIG00000013832	AGO4	93	99.373	Pelodiscus_sinensis
ENSODEG00000006355	AGO4	97	97.481	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.481	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	88.375	ENSPEMG00000022651	-	88	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.499	ENSPCIG00000000092	AGO4	93	99.499	Phascolarctos_cinereus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.415	ENSPFOG00000001935	ago4	93	96.415	Poecilia_formosa
ENSODEG00000006355	AGO4	97	97.744	ENSPLAG00000011534	ago4	98	97.004	Poecilia_latipinna
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.415	ENSPMEG00000005049	ago4	93	96.415	Poecilia_mexicana
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.415	ENSPREG00000010315	ago4	93	96.415	Poecilia_reticulata
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	ENSPPYG00000001552	AGO4	93	99.875	Pongo_abelii
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.625	ENSPCOG00000015935	AGO4	93	99.625	Propithecus_coquereli
ENSODEG00000006355	AGO4	85	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	81	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	ENSPNYG00000002089	ago4	93	96.292	Pundamilia_nyererei
ENSODEG00000006355	AGO4	97	97.619	ENSPNAG00000005191	ago4	92	97.619	Pygocentrus_nattereri
ENSODEG00000006355	AGO4	73	98.325	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	98.325	Rattus_norvegicus
ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.623	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.874	ENSRROG00000035783	AGO4	100	99.874	Rhinopithecus_roxellana
ENSODEG00000006355	AGO4	93	99.736	ENSSBOG00000026529	AGO4	100	99.736	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSODEG00000006355	AGO4	98	98.637	ENSSHAG00000017320	AGO4	94	98.637	Sarcophilus_harrisii
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ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.415	ENSXMAG00000016657	ago4	93	96.415	Xiphophorus_maculatus