EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSODEG00000012424 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Octodon_degus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20003 bases
Position: chrJH651593.1:8587998-8608000
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSODEP00000016855	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.7e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSODET00000017068	PAPOLG-201	1269	-	ENSODEP00000016855	422 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSODEG00000012424's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSODEG00000012424's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSODEG00000012424	PAPOLG	96	73.479	ENSODEG00000009844	PAPOLB	62	73.479

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSG00000115421	PAPOLG	100	92.735	Homo_sapiens
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.491	ENSAPOG00000004798	papolg	62	83.452	Acanthochromis_polyacanthus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	95.305	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	58	95.305	Ailuropoda_melanoleuca
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.452	ENSACIG00000010546	papolg	62	83.452	Amphilophus_citrinellus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.215	ENSAOCG00000010254	papolg	51	83.215	Amphiprion_ocellaris
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.452	ENSAPEG00000006944	papolg	51	83.452	Amphiprion_percula
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.886	ENSATEG00000009007	papolg	67	83.886	Anabas_testudineus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	84.507	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	57	84.507	Anas_platyrhynchos
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSANAG00000024627	PAPOLG	60	94.131	Aotus_nancymaae
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.215	ENSACLG00000015592	papolg	50	83.215	Astatotilapia_calliptera
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.688	ENSAMXG00000004611	papolg	57	83.688	Astyanax_mexicanus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	58	94.131	Bos_taurus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	58	94.131	Callithrix_jacchus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.366	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	52	94.366	Canis_familiaris
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	60	94.313	Canis_lupus_dingo
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	93.897	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	58	93.897	Capra_hircus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	57	94.601	Carlito_syrichta
ENSODEG00000012424	PAPOLG	89	87.664	ENSCAPG00000014901	-	100	87.664	Cavia_aperea
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	58	94.601	Cavia_porcellus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	60	94.131	Cebus_capucinus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	83	98.438	ENSCATG00000044395	PAPOLG	53	98.438	Cercocebus_atys
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	57	94.601	Chinchilla_lanigera
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.366	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	58	94.366	Chlorocebus_sabaeus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	81	94.236	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	53	94.236	Choloepus_hoffmanni
ENSODEG00000012424	PAPOLG	95	65.764	ENSCING00000024664	-	76	65.764	Ciona_intestinalis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	95	65.764	ENSCSAVG00000009085	-	82	65.764	Ciona_savignyi
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.366	ENSCANG00000038120	PAPOLG	60	94.366	Colobus_angolensis_palliatus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.238	ENSCGRG00001014951	Papolg	57	95.238	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.238	ENSCGRG00000005552	-	57	95.238	Cricetulus_griseus_crigri
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.215	ENSCSEG00000000771	papolg	60	83.215	Cynoglossus_semilaevis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.701	ENSCVAG00000016602	papolg	75	82.701	Cyprinodon_variegatus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.924	ENSDARG00000012141	papolg	57	83.924	Danio_rerio
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	89.906	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	57	89.906	Dasypus_novemcinctus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSDORG00000016228	Papolg	99	94.601	Dipodomys_ordii
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	66.588	ENSETEG00000011815	PAPOLG	57	66.509	Echinops_telfairi
ENSODEG00000012424	PAPOLG	78	84.291	ENSEBUG00000004020	papolg	74	79.577	Eptatretus_burgeri
ENSODEG00000012424	PAPOLG	91	59.530	ENSEBUG00000005042	-	65	59.530	Eptatretus_burgeri
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSEASG00005002038	PAPOLG	57	94.601	Equus_asinus_asinus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	95.305	ENSECAG00000009859	PAPOLG	57	95.305	Equus_caballus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	78.404	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	58	78.404	Erinaceus_europaeus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.175	ENSELUG00000014497	papolg	51	83.175	Esox_lucius
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	57	94.601	Felis_catus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	76.471	ENSFALG00000011079	PAPOLG	56	76.471	Ficedula_albicollis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	56	94.601	Fukomys_damarensis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	83.693	ENSGMOG00000018772	papolg	63	83.693	Gadus_morhua
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.938	ENSGALG00000007853	PAPOLG	58	82.938	Gallus_gallus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.742	ENSGAFG00000003263	papolg	50	82.742	Gambusia_affinis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.215	ENSGACG00000002718	papolg	57	83.215	Gasterosteus_aculeatus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	60	94.131	Gorilla_gorilla
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.373	ENSHBUG00000004882	papolg	50	83.373	Haplochromis_burtoni
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	95.305	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	58	95.305	Heterocephalus_glaber_female
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	58	94.601	Heterocephalus_glaber_male
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.742	ENSHCOG00000006782	papolg	52	82.742	Hippocampus_comes
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	83.333	ENSIPUG00000021642	papolg	60	83.333	Ictalurus_punctatus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	57	94.601	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.366	ENSJJAG00000015601	Papolg	99	94.366	Jaculus_jaculus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	82.436	ENSKMAG00000016439	papolg	59	82.436	Kryptolebias_marmoratus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	74.588	ENSLACG00000009543	PAPOLG	57	74.588	Latimeria_chalumnae
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	84.161	ENSLOCG00000016130	papolg	56	84.161	Lepisosteus_oculatus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.366	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	94.366	Loxodonta_africana
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	58	94.601	Macaca_fascicularis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	58	94.601	Macaca_mulatta
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	80.328	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	56	80.328	Macaca_nemestrina
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	60	94.131	Mandrillus_leucophaeus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.610	ENSMAMG00000010667	papolg	61	83.452	Mastacembelus_armatus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.373	ENSMZEG00005018140	papolg	60	83.373	Maylandia_zebra
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	81.604	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	57	81.604	Meleagris_gallopavo
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.714	ENSMAUG00000009088	Papolg	57	95.714	Mesocricetus_auratus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSMICG00000010042	PAPOLG	59	94.131	Microcebus_murinus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	94.824	ENSMOCG00000006857	Papolg	58	94.824	Microtus_ochrogaster
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.783	ENSMMOG00000008020	papolg	67	79.227	Mola_mola
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	91.784	ENSMODG00000002160	PAPOLG	57	91.784	Monodelphis_domestica
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.452	ENSMALG00000007012	papolg	51	83.452	Monopterus_albus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.059	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	95.059	Mus_caroli
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.059	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	95.059	Mus_musculus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.238	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	58	94.588	Mus_pahari
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.059	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	95.059	Mus_spretus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	52	94.601	Mustela_putorius_furo
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.836	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	58	94.836	Myotis_lucifugus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSNGAG00000001120	Papolg	58	94.601	Nannospalax_galili
ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	70.504	ENSNBRG00000011943	papolg	53	70.504	Neolamprologus_brichardi
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSNLEG00000009507	-	99	94.131	Nomascus_leucogenys
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	58	94.601	Ochotona_princeps
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	71.663	ENSONIG00000002985	papolg	58	71.663	Oreochromis_niloticus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	91.509	ENSOANG00000012403	PAPOLG	56	91.509	Ornithorhynchus_anatinus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	58	94.601	Oryctolagus_cuniculus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	82.974	ENSORLG00000001577	papolg	50	82.974	Oryzias_latipes
ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	83.213	ENSORLG00020002482	papolg	50	83.213	Oryzias_latipes_hni
ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	83.213	ENSORLG00015008836	papolg	50	83.213	Oryzias_latipes_hsok
ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	83.213	ENSOMEG00000001406	papolg	50	83.213	Oryzias_melastigma
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	93.897	ENSOARG00000001563	PAPOLG	52	93.897	Ovis_aries
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	60	94.131	Pan_paniscus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	57	94.601	Panthera_pardus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.366	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	57	94.366	Panthera_tigris_altaica
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	60	94.131	Pan_troglodytes
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	87.264	ENSPANG00000014543	PAPOLG	57	87.264	Papio_anubis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	81.176	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	66	78.199	Paramormyrops_kingsleyae
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.742	ENSPKIG00000003313	papolg	59	82.742	Paramormyrops_kingsleyae
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	87.559	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	57	87.559	Pelodiscus_sinensis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.714	ENSPEMG00000008960	-	57	95.714	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSODEG00000012424	PAPOLG	97	65.311	ENSPMAG00000002961	papolg	57	65.311	Petromyzon_marinus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	95	64.039	ENSPMAG00000004864	-	80	64.039	Petromyzon_marinus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	93.510	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	57	93.510	Phascolarctos_cinereus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	82.394	ENSPFOG00000012909	papolg	56	82.394	Poecilia_formosa
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.506	ENSPLAG00000018445	papolg	50	82.506	Poecilia_latipinna
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.506	ENSPMEG00000003961	papolg	50	82.506	Poecilia_mexicana
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.270	ENSPREG00000010358	papolg	50	82.270	Poecilia_reticulata
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	58	94.131	Pongo_abelii
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	90.047	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	57	90.047	Procavia_capensis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	90	94.026	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	59	94.026	Propithecus_coquereli
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.024	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	57	95.024	Pteropus_vampyrus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.215	ENSPNYG00000006729	papolg	61	83.215	Pundamilia_nyererei
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	82.864	ENSPNAG00000015521	papolg	58	82.864	Pygocentrus_nattereri
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	94.824	ENSRNOG00000006261	Papolg	58	94.824	Rattus_norvegicus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	85.308	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	56	85.308	Rhinopithecus_bieti
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.366	ENSRROG00000035954	PAPOLG	60	94.366	Rhinopithecus_roxellana
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	60	94.131	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	90	93.766	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	54	93.766	Sarcophilus_harrisii
ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	76.259	ENSSFOG00015011874	papolg	59	76.259	Scleropages_formosus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	81.775	ENSSFOG00015002383	papolg	61	81.579	Scleropages_formosus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	97	84.019	ENSSMAG00000015598	papolg	51	83.933	Scophthalmus_maximus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.771	ENSSDUG00000000912	papolg	63	83.452	Seriola_dumerili
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.452	ENSSLDG00000001217	papolg	58	78.066	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	97	88.647	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	57	88.647	Sphenodon_punctatus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.452	ENSSPAG00000009004	papolg	62	83.452	Stegastes_partitus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	59	94.131	Sus_scrofa
ENSODEG00000012424	PAPOLG	97	77.536	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	77	77.536	Taeniopygia_guttata
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.506	ENSTRUG00000006410	papolg	59	82.506	Takifugu_rubripes
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	73.843	ENSTNIG00000017106	papolg	58	73.843	Tetraodon_nigroviridis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	88.416	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	58	88.416	Tupaia_belangeri
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	93.882	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	57	93.882	Tursiops_truncatus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	59	95.249	Ursus_americanus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.249	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	52	95.249	Ursus_maritimus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	89.125	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	58	89.125	Vicugna_pacos
ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	57	94.601	Vulpes_vulpes
ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	83.654	ENSXETG00000002208	papolg	55	83.654	Xenopus_tropicalis
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.464	ENSXCOG00000006611	papolg	62	82.464	Xiphophorus_couchianus
ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	79.433	ENSXMAG00000007383	papolg	70	79.433	Xiphophorus_maculatus