EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSODEG00000017579 (Gene tree)
Gene ID: 101573637
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Octodon_degus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1451 bases
Position: chrJH651516.1:40932767-40934217
Accession: 101573637
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSODEP00000024029	eRF1_2	PF03464.15	5.3e-37	1	1
ENSODEP00000024029	eRF1_3	PF03465.15	6.1e-27	1	1
ENSODEP00000024029	eRF1_1	PF03463.15	1.5e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSODET00000024302	PELO-201	1169	XM_004623107	ENSODEP00000024029	385 (aa)	XP_004623164	UPI0003337764

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSODEG00000017579	PELO	100	96.883	ENSG00000152684	PELO	100	96.883	Homo_sapiens
ENSODEG00000017579	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000023700	-	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSODEG00000017579	PELO	100	80.260	ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	Acanthochromis_polyacanthus
ENSODEG00000017579	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSAMEG00000007734	PELO	100	97.403	Ailuropoda_melanoleuca
ENSODEG00000017579	PELO	97	77.212	ENSACIG00000014386	pelo	97	81.657	Amphilophus_citrinellus
ENSODEG00000017579	PELO	100	80.519	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.519	Amphiprion_ocellaris
ENSODEG00000017579	PELO	100	80.519	ENSAPEG00000011235	pelo	100	80.519	Amphiprion_percula
ENSODEG00000017579	PELO	100	82.338	ENSATEG00000019550	pelo	100	82.338	Anabas_testudineus
ENSODEG00000017579	PELO	77	84.899	ENSAPLG00000013265	PELO	100	84.899	Anas_platyrhynchos
ENSODEG00000017579	PELO	98	91.223	ENSACAG00000004352	PELO	100	90.909	Anolis_carolinensis
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.922	ENSANAG00000014096	PELO	100	97.922	Aotus_nancymaae
ENSODEG00000017579	PELO	100	80.000	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	Astatotilapia_calliptera
ENSODEG00000017579	PELO	97	82.038	ENSAMXG00000020299	pelo	100	81.347	Astyanax_mexicanus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.662	Bos_taurus
ENSODEG00000017579	PELO	99	58.793	WBGene00011280	pelo-1	100	58.793	Caenorhabditis_elegans
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.662	Callithrix_jacchus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSCAFG00020023234	PELO	100	97.662	Canis_lupus_dingo
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.403	Capra_hircus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSTSYG00000005203	PELO	100	97.662	Carlito_syrichta
ENSODEG00000017579	PELO	100	98.442	ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.442	Cavia_porcellus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSCCAG00000035600	PELO	100	97.662	Cebus_capucinus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSCATG00000011829	PELO	100	97.403	Cercocebus_atys
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.922	ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.922	Chinchilla_lanigera
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.403	Chlorocebus_sabaeus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSCHOG00000000523	PELO	100	97.403	Choloepus_hoffmanni
ENSODEG00000017579	PELO	98	93.617	ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	Chrysemys_picta_bellii
ENSODEG00000017579	PELO	97	69.705	ENSCING00000001979	-	100	70.130	Ciona_intestinalis
ENSODEG00000017579	PELO	100	70.390	ENSCSAVG00000006158	-	100	70.390	Ciona_savignyi
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSCANG00000023382	PELO	100	97.403	Colobus_angolensis_palliatus
ENSODEG00000017579	PELO	100	95.584	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSODEG00000017579	PELO	100	96.623	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.623	Cricetulus_griseus_crigri
ENSODEG00000017579	PELO	100	80.519	ENSCSEG00000008807	pelo	100	80.519	Cynoglossus_semilaevis
ENSODEG00000017579	PELO	100	82.857	ENSCVAG00000016082	pelo	100	82.857	Cyprinodon_variegatus
ENSODEG00000017579	PELO	100	81.818	ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	Danio_rerio
ENSODEG00000017579	PELO	100	94.041	ENSDNOG00000036721	PELO	100	94.041	Dasypus_novemcinctus
ENSODEG00000017579	PELO	100	98.701	ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.701	Dipodomys_ordii
ENSODEG00000017579	PELO	96	67.655	FBgn0011207	pelo	96	67.282	Drosophila_melanogaster
ENSODEG00000017579	PELO	71	81.871	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.871	Eptatretus_burgeri
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSEASG00005013348	PELO	100	97.662	Equus_asinus_asinus
ENSODEG00000017579	PELO	100	80.779	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	Esox_lucius
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSFCAG00000032341	PELO	100	97.662	Felis_catus
ENSODEG00000017579	PELO	100	95.065	ENSFALG00000004559	PELO	100	95.065	Ficedula_albicollis
ENSODEG00000017579	PELO	74	97.887	ENSFDAG00000002076	PELO	88	97.887	Fukomys_damarensis
ENSODEG00000017579	PELO	100	81.039	ENSFHEG00000009769	pelo	100	81.039	Fundulus_heteroclitus
ENSODEG00000017579	PELO	98	80.371	ENSGMOG00000005849	pelo	100	80.260	Gadus_morhua
ENSODEG00000017579	PELO	100	82.078	ENSGAFG00000019350	pelo	100	82.078	Gambusia_affinis
ENSODEG00000017579	PELO	100	80.779	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.779	Gasterosteus_aculeatus
ENSODEG00000017579	PELO	98	93.883	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	Gopherus_agassizii
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSGGOG00000012635	PELO	100	97.403	Gorilla_gorilla
ENSODEG00000017579	PELO	100	80.000	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	Haplochromis_burtoni
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSHGLG00000005932	PELO	100	97.662	Heterocephalus_glaber_female
ENSODEG00000017579	PELO	100	95.325	ENSHGLG00100017627	PELO	100	95.325	Heterocephalus_glaber_male
ENSODEG00000017579	PELO	100	78.182	ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.182	Hippocampus_comes
ENSODEG00000017579	PELO	100	81.039	ENSIPUG00000020627	pelo	100	81.039	Ictalurus_punctatus
ENSODEG00000017579	PELO	100	98.182	ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.182	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSODEG00000017579	PELO	100	95.325	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	95.325	Jaculus_jaculus
ENSODEG00000017579	PELO	100	82.078	ENSKMAG00000021305	pelo	100	82.078	Kryptolebias_marmoratus
ENSODEG00000017579	PELO	99	80.990	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.990	Labrus_bergylta
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSLAFG00000020551	PELO	100	97.403	Loxodonta_africana
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSMFAG00000000651	PELO	100	97.403	Macaca_fascicularis
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSMMUG00000039101	PELO	100	97.403	Macaca_mulatta
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSMNEG00000035538	PELO	100	97.403	Macaca_nemestrina
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSMLEG00000039113	PELO	100	97.403	Mandrillus_leucophaeus
ENSODEG00000017579	PELO	97	83.110	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	Mastacembelus_armatus
ENSODEG00000017579	PELO	100	80.000	ENSMZEG00005014258	pelo	100	80.000	Maylandia_zebra
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.143	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	97.143	Mesocricetus_auratus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSMICG00000044040	PELO	100	97.662	Microcebus_murinus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.143	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.143	Microtus_ochrogaster
ENSODEG00000017579	PELO	100	79.481	ENSMMOG00000001324	pelo	100	79.481	Mola_mola
ENSODEG00000017579	PELO	100	81.818	ENSMALG00000008194	pelo	100	81.818	Monopterus_albus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.922	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.922	Mus_caroli
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.922	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	97.922	Mus_musculus
ENSODEG00000017579	PELO	100	98.182	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	98.182	Mus_pahari
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.922	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	97.922	Mus_spretus
ENSODEG00000017579	PELO	100	95.325	ENSMLUG00000024132	PELO	100	95.325	Myotis_lucifugus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	97.403	Nannospalax_galili
ENSODEG00000017579	PELO	100	80.000	ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	Neolamprologus_brichardi
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSNLEG00000035970	PELO	100	97.403	Nomascus_leucogenys
ENSODEG00000017579	PELO	100	94.805	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.805	Notamacropus_eugenii
ENSODEG00000017579	PELO	98	96.570	ENSOPRG00000018793	PELO	100	96.570	Ochotona_princeps
ENSODEG00000017579	PELO	96	80.000	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.000	Oreochromis_niloticus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.143	ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.143	Oryctolagus_cuniculus
ENSODEG00000017579	PELO	100	80.779	ENSORLG00000005827	pelo	100	80.779	Oryzias_latipes
ENSODEG00000017579	PELO	100	81.039	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	Oryzias_latipes_hni
ENSODEG00000017579	PELO	100	81.299	ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	Oryzias_latipes_hsok
ENSODEG00000017579	PELO	100	82.597	ENSOMEG00000021567	pelo	100	82.597	Oryzias_melastigma
ENSODEG00000017579	PELO	100	96.883	ENSOGAG00000027940	PELO	100	96.883	Otolemur_garnettii
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSOARG00000008324	PELO	99	97.662	Ovis_aries
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSPPAG00000038951	PELO	100	97.403	Pan_paniscus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSPPRG00000018800	PELO	100	97.662	Panthera_pardus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.662	Panthera_tigris_altaica
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.143	ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.143	Pan_troglodytes
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSPANG00000010902	PELO	100	97.403	Papio_anubis
ENSODEG00000017579	PELO	100	83.117	ENSPKIG00000015190	pelo	100	83.117	Paramormyrops_kingsleyae
ENSODEG00000017579	PELO	98	94.415	ENSPSIG00000004971	PELO	100	94.026	Pelodiscus_sinensis
ENSODEG00000017579	PELO	67	78.682	ENSPMGG00000014561	pelo	95	78.682	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.143	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.143	ENSPCIG00000004880	PELO	100	97.143	Phascolarctos_cinereus
ENSODEG00000017579	PELO	100	82.857	ENSPFOG00000007277	pelo	100	82.857	Poecilia_formosa
ENSODEG00000017579	PELO	100	83.117	ENSPLAG00000020787	pelo	100	83.117	Poecilia_latipinna
ENSODEG00000017579	PELO	100	82.857	ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.857	Poecilia_mexicana
ENSODEG00000017579	PELO	100	83.117	ENSPREG00000023071	pelo	100	83.117	Poecilia_reticulata
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.143	ENSPPYG00000015451	PELO	96	97.143	Pongo_abelii
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSPCOG00000021178	PELO	100	97.662	Propithecus_coquereli
ENSODEG00000017579	PELO	100	80.000	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.000	Pundamilia_nyererei
ENSODEG00000017579	PELO	97	82.574	ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.299	Pygocentrus_nattereri
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	97.662	Rattus_norvegicus
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSRBIG00000007299	PELO	100	97.403	Rhinopithecus_bieti
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	ENSRROG00000035507	PELO	100	97.403	Rhinopithecus_roxellana
ENSODEG00000017579	PELO	98	35.065	YNL001W	-	98	35.065	Saccharomyces_cerevisiae
ENSODEG00000017579	PELO	100	97.922	ENSSBOG00000036140	PELO	100	97.922	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSODEG00000017579	PELO	63	95.082	ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.082	Sarcophilus_harrisii
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