EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSODEG00000018390 (Gene tree)
Gene ID: 101571501
Gene Symbol: CTIF
Alias: -
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Octodon_degus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 213026 bases
Position: chrJH651518.1:25481382-25694407
Accession: 101571501
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSODEP00000025126	MIF4G	PF02854.19	2.4e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSODET00000025404	CTIF-201	1866	XM_004623634	ENSODEP00000025126	621 (aa)	XP_004623693	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.855	ENSG00000134030	CTIF	100	95.897	Homo_sapiens
ENSODEG00000018390	CTIF	100	56.495	ENSAPOG00000020192	ctif	99	56.113	Acanthochromis_polyacanthus
ENSODEG00000018390	CTIF	87	89.871	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	89.871	Ailuropoda_melanoleuca
ENSODEG00000018390	CTIF	100	51.872	ENSACIG00000017099	ctif	99	52.859	Amphilophus_citrinellus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	52.684	ENSAOCG00000014275	ctif	99	52.966	Amphiprion_ocellaris
ENSODEG00000018390	CTIF	100	52.778	ENSAPEG00000016975	ctif	99	54.857	Amphiprion_percula
ENSODEG00000018390	CTIF	100	54.610	ENSATEG00000016752	ctif	99	54.816	Anabas_testudineus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	72.072	ENSACAG00000018006	CTIF	100	72.222	Anolis_carolinensis
ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.389	ENSANAG00000024925	CTIF	100	89.389	Aotus_nancymaae
ENSODEG00000018390	CTIF	99	54.519	ENSACLG00000005956	ctif	99	54.936	Astatotilapia_calliptera
ENSODEG00000018390	CTIF	61	56.736	ENSAMXG00000015964	ctif	100	49.862	Astyanax_mexicanus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	87.923	ENSBTAG00000018901	CTIF	100	87.923	Bos_taurus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.550	ENSCJAG00000004729	CTIF	100	89.550	Callithrix_jacchus
ENSODEG00000018390	CTIF	97	90.413	ENSCAFG00000019076	CTIF	100	90.499	Canis_familiaris
ENSODEG00000018390	CTIF	97	90.248	ENSCAFG00020026482	CTIF	100	90.338	Canis_lupus_dingo
ENSODEG00000018390	CTIF	100	87.460	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	87.460	Capra_hircus
ENSODEG00000018390	CTIF	90	80.179	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	80.179	Carlito_syrichta
ENSODEG00000018390	CTIF	100	85.507	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	85.531	Cavia_aperea
ENSODEG00000018390	CTIF	100	91.948	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	91.787	Cavia_porcellus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.711	ENSCCAG00000022758	CTIF	100	89.711	Cebus_capucinus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.177	ENSCATG00000038134	CTIF	100	90.177	Cercocebus_atys
ENSODEG00000018390	CTIF	100	94.391	ENSCLAG00000008174	CTIF	100	94.391	Chinchilla_lanigera
ENSODEG00000018390	CTIF	100	88.069	ENSCSAG00000018021	CTIF	100	88.069	Chlorocebus_sabaeus
ENSODEG00000018390	CTIF	50	83.333	ENSCHOG00000009041	-	71	83.333	Choloepus_hoffmanni
ENSODEG00000018390	CTIF	100	78.914	ENSCPBG00000025654	CTIF	100	78.914	Chrysemys_picta_bellii
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.016	ENSCANG00000030916	CTIF	100	90.016	Colobus_angolensis_palliatus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	88.406	ENSCGRG00001020158	Ctif	100	88.406	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSODEG00000018390	CTIF	100	85.185	ENSCGRG00000000052	Ctif	100	85.185	Cricetulus_griseus_crigri
ENSODEG00000018390	CTIF	91	59.033	ENSCSEG00000019857	ctif	99	52.022	Cynoglossus_semilaevis
ENSODEG00000018390	CTIF	100	51.336	ENSCVAG00000017158	ctif	99	53.738	Cyprinodon_variegatus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	52.747	ENSDARG00000090617	ctif	100	54.834	Danio_rerio
ENSODEG00000018390	CTIF	73	87.168	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	87.168	Dasypus_novemcinctus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	87.923	ENSDORG00000003221	Ctif	100	87.923	Dipodomys_ordii
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.177	ENSEASG00005016094	CTIF	100	90.177	Equus_asinus_asinus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.338	ENSECAG00000020473	CTIF	100	90.338	Equus_caballus
ENSODEG00000018390	CTIF	90	80.179	ENSEEUG00000012451	CTIF	100	80.179	Erinaceus_europaeus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	59.403	ENSELUG00000008733	ctif	99	59.202	Esox_lucius
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.660	ENSFCAG00000000664	CTIF	100	90.660	Felis_catus
ENSODEG00000018390	CTIF	97	78.275	ENSFALG00000008943	CTIF	97	78.275	Ficedula_albicollis
ENSODEG00000018390	CTIF	100	93.398	ENSFDAG00000017379	CTIF	100	93.398	Fukomys_damarensis
ENSODEG00000018390	CTIF	99	53.943	ENSFHEG00000004334	ctif	99	54.259	Fundulus_heteroclitus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	77.939	ENSGALG00000035912	-	100	77.939	Gallus_gallus
ENSODEG00000018390	CTIF	99	55.418	ENSGAFG00000011896	ctif	99	55.046	Gambusia_affinis
ENSODEG00000018390	CTIF	69	73.068	ENSGAGG00000020663	CTIF	97	72.749	Gopherus_agassizii
ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.855	ENSGGOG00000015204	CTIF	100	89.855	Gorilla_gorilla
ENSODEG00000018390	CTIF	99	54.376	ENSHBUG00000018092	ctif	99	54.793	Haplochromis_burtoni
ENSODEG00000018390	CTIF	100	91.948	ENSHGLG00000005663	CTIF	100	91.948	Heterocephalus_glaber_female
ENSODEG00000018390	CTIF	100	91.787	ENSHGLG00100006976	CTIF	100	91.787	Heterocephalus_glaber_male
ENSODEG00000018390	CTIF	99	53.651	ENSHCOG00000011784	ctif	99	54.675	Hippocampus_comes
ENSODEG00000018390	CTIF	100	54.481	ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.370	Ictalurus_punctatus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	88.567	ENSSTOG00000001967	CTIF	100	88.567	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	88.818	ENSJJAG00000013706	Ctif	100	89.372	Jaculus_jaculus
ENSODEG00000018390	CTIF	99	51.847	ENSKMAG00000014651	ctif	99	53.050	Kryptolebias_marmoratus
ENSODEG00000018390	CTIF	99	59.618	ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.000	Labrus_bergylta
ENSODEG00000018390	CTIF	100	60.795	ENSLOCG00000011697	ctif	100	61.166	Lepisosteus_oculatus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	83.040	ENSLAFG00000016335	CTIF	100	90.592	Loxodonta_africana
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.177	ENSMFAG00000037903	CTIF	100	90.177	Macaca_fascicularis
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.177	ENSMMUG00000020898	CTIF	100	90.177	Macaca_mulatta
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.177	ENSMNEG00000039395	CTIF	100	90.177	Macaca_nemestrina
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.338	ENSMLEG00000041132	CTIF	100	90.338	Mandrillus_leucophaeus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	54.286	ENSMAMG00000014741	ctif	99	54.857	Mastacembelus_armatus
ENSODEG00000018390	CTIF	89	50.558	ENSMZEG00005019767	ctif	90	51.351	Maylandia_zebra
ENSODEG00000018390	CTIF	89	51.786	ENSMGAG00000001378	CTIF	100	51.786	Meleagris_gallopavo
ENSODEG00000018390	CTIF	100	87.440	ENSMAUG00000000656	Ctif	100	87.440	Mesocricetus_auratus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.694	ENSMICG00000010167	CTIF	100	89.694	Microcebus_murinus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	87.923	ENSMOCG00000020507	Ctif	100	87.923	Microtus_ochrogaster
ENSODEG00000018390	CTIF	100	52.162	ENSMMOG00000000831	ctif	99	52.374	Mola_mola
ENSODEG00000018390	CTIF	100	77.953	ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.628	Monodelphis_domestica
ENSODEG00000018390	CTIF	85	53.016	ENSMALG00000020553	ctif	99	53.480	Monopterus_albus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	88.907	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	100	88.907	Mus_caroli
ENSODEG00000018390	CTIF	100	88.782	ENSMUSG00000052928	Ctif	100	88.782	Mus_musculus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	88.160	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	100	88.160	Mus_pahari
ENSODEG00000018390	CTIF	100	88.622	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	100	88.622	Mus_spretus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.016	ENSMPUG00000000844	CTIF	100	90.016	Mustela_putorius_furo
ENSODEG00000018390	CTIF	100	88.245	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	88.245	Myotis_lucifugus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.533	ENSNGAG00000011452	Ctif	100	89.533	Nannospalax_galili
ENSODEG00000018390	CTIF	99	54.519	ENSNBRG00000008679	ctif	99	54.936	Neolamprologus_brichardi
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.016	ENSNLEG00000011503	CTIF	100	90.016	Nomascus_leucogenys
ENSODEG00000018390	CTIF	100	74.437	ENSMEUG00000000218	CTIF	100	74.437	Notamacropus_eugenii
ENSODEG00000018390	CTIF	100	84.541	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	84.541	Ochotona_princeps
ENSODEG00000018390	CTIF	100	60.000	ENSONIG00000007750	ctif	99	60.413	Oreochromis_niloticus
ENSODEG00000018390	CTIF	85	66.212	ENSOANG00000001337	CTIF	100	66.212	Ornithorhynchus_anatinus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	87.118	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	87.118	Oryctolagus_cuniculus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	55.728	ENSORLG00000005786	ctif	99	56.347	Oryzias_latipes
ENSODEG00000018390	CTIF	100	56.192	ENSORLG00020005385	ctif	99	56.854	Oryzias_latipes_hni
ENSODEG00000018390	CTIF	100	55.008	ENSORLG00015011872	ctif	99	55.659	Oryzias_latipes_hsok
ENSODEG00000018390	CTIF	99	52.833	ENSOMEG00000007917	ctif	99	53.324	Oryzias_melastigma
ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.533	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	89.533	Otolemur_garnettii
ENSODEG00000018390	CTIF	100	88.406	ENSOARG00000003754	CTIF	100	88.406	Ovis_aries
ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.855	ENSPPAG00000023554	CTIF	100	89.855	Pan_paniscus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.660	ENSPPRG00000002265	CTIF	100	90.660	Panthera_pardus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.338	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	90.338	Panthera_tigris_altaica
ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.855	ENSPTRG00000010009	CTIF	100	89.855	Pan_troglodytes
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.338	ENSPANG00000017087	CTIF	100	90.338	Papio_anubis
ENSODEG00000018390	CTIF	85	60.338	ENSPKIG00000011234	ctif	100	60.788	Paramormyrops_kingsleyae
ENSODEG00000018390	CTIF	100	75.884	ENSPSIG00000006508	CTIF	100	75.884	Pelodiscus_sinensis
ENSODEG00000018390	CTIF	100	49.096	ENSPMGG00000022958	ctif	99	48.247	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	87.781	ENSPEMG00000022746	Ctif	100	87.781	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSODEG00000018390	CTIF	77	81.551	ENSPCIG00000026247	CTIF	95	81.551	Phascolarctos_cinereus
ENSODEG00000018390	CTIF	99	58.658	ENSPFOG00000009243	ctif	99	58.814	Poecilia_formosa
ENSODEG00000018390	CTIF	99	55.283	ENSPLAG00000019171	ctif	99	55.640	Poecilia_latipinna
ENSODEG00000018390	CTIF	99	51.460	ENSPMEG00000020089	ctif	99	52.573	Poecilia_mexicana
ENSODEG00000018390	CTIF	100	48.794	ENSPREG00000017326	ctif	99	48.993	Poecilia_reticulata
ENSODEG00000018390	CTIF	85	88.994	ENSPPYG00000009147	CTIF	100	88.994	Pongo_abelii
ENSODEG00000018390	CTIF	100	87.480	ENSPCOG00000013391	CTIF	100	87.480	Propithecus_coquereli
ENSODEG00000018390	CTIF	100	88.585	ENSPVAG00000001965	CTIF	100	88.585	Pteropus_vampyrus
ENSODEG00000018390	CTIF	99	58.029	ENSPNYG00000007879	ctif	99	58.188	Pundamilia_nyererei
ENSODEG00000018390	CTIF	100	55.352	ENSPNAG00000029174	ctif	100	56.479	Pygocentrus_nattereri
ENSODEG00000018390	CTIF	100	87.762	ENSRNOG00000018342	Ctif	100	87.762	Rattus_norvegicus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.016	ENSRBIG00000043937	CTIF	100	90.016	Rhinopithecus_bieti
ENSODEG00000018390	CTIF	100	90.016	ENSRROG00000006039	CTIF	100	90.016	Rhinopithecus_roxellana
ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.068	ENSSBOG00000028468	CTIF	100	89.068	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSODEG00000018390	CTIF	100	77.974	ENSSHAG00000016321	CTIF	100	77.974	Sarcophilus_harrisii
ENSODEG00000018390	CTIF	100	60.315	ENSSFOG00015022594	ctif	100	60.776	Scleropages_formosus
ENSODEG00000018390	CTIF	99	54.849	ENSSMAG00000005707	ctif	99	57.014	Scophthalmus_maximus
ENSODEG00000018390	CTIF	92	66.667	ENSSDUG00000016033	ctif	92	66.667	Seriola_dumerili
ENSODEG00000018390	CTIF	92	61.680	ENSSLDG00000007282	ctif	99	54.964	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSODEG00000018390	CTIF	100	79.871	ENSSPUG00000014734	CTIF	100	79.871	Sphenodon_punctatus
ENSODEG00000018390	CTIF	99	57.121	ENSSPAG00000003721	ctif	99	57.746	Stegastes_partitus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.372	ENSSSCG00000004506	CTIF	100	89.372	Sus_scrofa
ENSODEG00000018390	CTIF	97	78.383	ENSTGUG00000000030	CTIF	100	78.686	Taeniopygia_guttata
ENSODEG00000018390	CTIF	99	58.870	ENSTNIG00000018763	ctif	99	59.248	Tetraodon_nigroviridis
ENSODEG00000018390	CTIF	100	69.565	ENSTBEG00000002613	CTIF	100	69.565	Tupaia_belangeri
ENSODEG00000018390	CTIF	100	87.118	ENSTTRG00000004347	CTIF	100	87.118	Tursiops_truncatus
ENSODEG00000018390	CTIF	86	90.994	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	90.994	Ursus_americanus
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ENSODEG00000018390	CTIF	68	74.104	ENSVPAG00000001497	-	75	74.104	Vicugna_pacos
ENSODEG00000018390	CTIF	97	90.248	ENSVVUG00000014347	CTIF	100	90.338	Vulpes_vulpes
ENSODEG00000018390	CTIF	97	59.339	ENSXETG00000026836	ctif	97	59.339	Xenopus_tropicalis
ENSODEG00000018390	CTIF	64	55.366	ENSXCOG00000002477	ctif	83	55.122	Xiphophorus_couchianus
ENSODEG00000018390	CTIF	100	54.367	ENSXMAG00000004236	ctif	99	55.740	Xiphophorus_maculatus