EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000000543 (Gene tree)
Gene ID: 100951884
Gene Symbol: CNOT1
Alias: -
Full Name: CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 119493 bases
Position: chrGL873577.1:10642239-10761731
Accession: 100951884
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000000491	Not1	PF04054.15	6.8e-153	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000000548	CNOT1-201	7438	XM_012806837	ENSOGAP00000000491	2376 (aa)	XP_012662291	H0WGN3

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.621	ENSG00000125107	CNOT1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSOGAG00000000543	CNOT1	97	96.914	ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.453	ENSAMEG00000017298	CNOT1	100	99.453	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000000543	CNOT1	90	90.028	ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.214	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	90.596	ENSAPEG00000022342	cnot1	100	90.512	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000000543	CNOT1	97	97.055	ENSATEG00000012892	cnot1	100	97.055	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	97.605	ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.605	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000000543	CNOT1	91	96.197	ENSACAG00000001602	CNOT1	98	96.197	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	96.732	ENSANAG00000038198	CNOT1	100	96.732	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000000543	CNOT1	97	97.055	ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	91.081	ENSAMXG00000013170	cnot1	100	91.548	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.705	ENSBTAG00000020782	CNOT1	100	99.705	Bos_taurus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	77	41.528	WBGene00002845	let-711	92	54.430	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.579	ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.579	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.370	ENSCAFG00000008426	CNOT1	100	99.370	Canis_familiaris
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	98.616	ENSCAFG00020010156	CNOT1	100	99.259	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.705	ENSCHIG00000010452	CNOT1	100	99.705	Capra_hircus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.747	ENSTSYG00000006888	CNOT1	100	99.747	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	94.949	ENSCPOG00000013026	CNOT1	100	94.949	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	98.022	ENSCCAG00000026333	CNOT1	100	98.022	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.663	ENSCATG00000032625	CNOT1	100	99.663	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.621	ENSCLAG00000006289	CNOT1	100	99.621	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.663	ENSCSAG00000004731	CNOT1	100	99.663	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	81	100.000	ENSCHOG00000009712	CNOT1	83	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000000543	CNOT1	98	94.674	ENSCPBG00000026222	CNOT1	98	97.822	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	59.078	ENSCING00000009149	-	100	59.004	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000000543	CNOT1	89	63.160	ENSCSAVG00000002414	-	99	63.335	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	97.534	ENSCANG00000040534	CNOT1	100	97.534	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.327	ENSCGRG00001016365	Cnot1	100	99.327	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.327	ENSCGRG00000001714	Cnot1	100	99.327	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	83.153	ENSCVAG00000018930	cnot1	100	82.986	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	89.816	ENSDARG00000004174	cnot1	100	89.858	Danio_rerio
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	97.139	ENSDNOG00000013250	CNOT1	100	97.139	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	99	46.151	FBgn0085436	Not1	99	48.431	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000000543	CNOT1	84	97.590	ENSETEG00000012806	CNOT1	84	97.590	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000000543	CNOT1	81	76.831	ENSEBUG00000011534	cnot1	95	76.831	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000000543	CNOT1	97	99.259	ENSEASG00005005819	CNOT1	100	98.802	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.747	ENSECAG00000009889	CNOT1	100	99.747	Equus_caballus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	90	99.295	ENSEEUG00000006015	CNOT1	90	99.295	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	89.942	ENSELUG00000014085	cnot1	100	89.657	Esox_lucius
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.454	ENSFCAG00000025155	CNOT1	100	99.454	Felis_catus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	97.643	ENSFALG00000007285	CNOT1	100	97.643	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.537	ENSFDAG00000013399	CNOT1	100	99.537	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	90.382	ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.340	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	91	89.588	ENSGMOG00000012864	cnot1	100	89.866	Gadus_morhua
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	97.685	ENSGALG00000002301	CNOT1	100	97.685	Gallus_gallus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	89.211	ENSGAFG00000015005	cnot1	100	89.211	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000000543	CNOT1	91	90.194	ENSGACG00000002606	cnot1	100	95.874	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	97.770	ENSGAGG00000022646	CNOT1	100	97.770	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.579	ENSGGOG00000009547	CNOT1	100	99.579	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000000543	CNOT1	97	97.055	ENSHBUG00000001729	cnot1	100	97.055	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.453	ENSHGLG00000014322	CNOT1	100	99.453	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	89.507	ENSHCOG00000006501	cnot1	100	89.645	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	88.926	ENSIPUG00000011915	cnot1	100	89.388	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.537	ENSSTOG00000005490	CNOT1	100	99.537	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	98.948	ENSJJAG00000000633	Cnot1	100	98.948	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	90.293	ENSKMAG00000006149	cnot1	100	90.335	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	95	96.407	ENSLBEG00000004740	cnot1	100	96.407	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	95.076	ENSLACG00000010869	CNOT1	100	95.076	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	92.953	ENSLOCG00000006324	cnot1	100	92.953	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.495	ENSLAFG00000000098	CNOT1	100	99.495	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.411	ENSMFAG00000035888	CNOT1	100	99.411	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.621	ENSMMUG00000014625	CNOT1	100	99.621	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	96.853	ENSMNEG00000031820	CNOT1	100	99.673	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	98.232	ENSMLEG00000040933	CNOT1	100	98.232	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	89.215	ENSMAMG00000016524	cnot1	100	89.253	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	97	97.055	ENSMZEG00005016210	cnot1	100	97.055	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	97.433	ENSMGAG00000001908	CNOT1	100	97.433	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.663	ENSMICG00000007071	CNOT1	100	99.663	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.327	ENSMOCG00000017969	Cnot1	100	99.327	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000000543	CNOT1	97	93.689	ENSMMOG00000019134	cnot1	100	93.689	Mola_mola
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	97.939	ENSMODG00000014199	CNOT1	100	97.939	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	90.298	ENSMALG00000008645	cnot1	100	90.298	Monopterus_albus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	95	99.777	MGP_CAROLIEiJ_G0031430	Cnot1	92	99.777	Mus_caroli
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.369	ENSMUSG00000036550	Cnot1	100	99.369	Mus_musculus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.327	MGP_PahariEiJ_G0023028	Cnot1	100	99.327	Mus_pahari
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.369	MGP_SPRETEiJ_G0032549	Cnot1	100	99.369	Mus_spretus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.747	ENSMPUG00000004830	CNOT1	100	99.747	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.158	ENSMLUG00000003728	CNOT1	100	99.158	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.579	ENSNGAG00000018628	Cnot1	100	99.579	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000000543	CNOT1	94	97.055	ENSNBRG00000019358	cnot1	100	97.055	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.537	ENSNLEG00000003566	CNOT1	100	99.537	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000000543	CNOT1	86	98.658	ENSMEUG00000006145	CNOT1	88	98.658	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000000543	CNOT1	86	100.000	ENSOPRG00000005604	CNOT1	86	100.000	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.495	ENSODEG00000016337	CNOT1	100	99.495	Octodon_degus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	90.620	ENSONIG00000007358	cnot1	100	90.536	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	91	98.001	ENSOANG00000012109	CNOT1	100	98.307	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.663	ENSOCUG00000006911	CNOT1	100	99.663	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	90.273	ENSORLG00000013734	cnot1	100	90.356	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	88.758	ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.633	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	88.674	ENSORLG00015007091	cnot1	100	88.381	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	88.240	ENSOMEG00000015124	cnot1	100	88.497	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.705	ENSOARG00000001567	CNOT1	100	99.705	Ovis_aries
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.621	ENSPPAG00000022013	CNOT1	100	99.621	Pan_paniscus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.747	ENSPPRG00000004867	CNOT1	100	99.747	Panthera_pardus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.747	ENSPTIG00000012589	CNOT1	100	99.747	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.329	ENSPTRG00000008183	CNOT1	100	99.329	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	96.102	ENSPANG00000020901	CNOT1	100	96.102	Papio_anubis
ENSOGAG00000000543	CNOT1	97	93.258	ENSPKIG00000002914	CNOT1	99	93.258	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	92.069	ENSPKIG00000023538	CNOT1	100	92.237	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	97.643	ENSPSIG00000005499	CNOT1	100	97.643	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	81.082	ENSPMAG00000009381	cnot1	100	80.982	Petromyzon_marinus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	96.829	ENSPCIG00000007343	CNOT1	100	98.204	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000000543	CNOT1	99	89.852	ENSPFOG00000003497	cnot1	100	89.937	Poecilia_formosa
ENSOGAG00000000543	CNOT1	95	96.008	ENSPLAG00000014018	cnot1	100	96.008	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000000543	CNOT1	95	96.008	ENSPMEG00000005868	cnot1	100	96.008	Poecilia_mexicana
ENSOGAG00000000543	CNOT1	95	96.008	ENSPREG00000018793	cnot1	100	96.008	Poecilia_reticulata
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.663	ENSPPYG00000007410	CNOT1	100	99.663	Pongo_abelii
ENSOGAG00000000543	CNOT1	90	97.445	ENSPCAG00000003241	CNOT1	90	97.445	Procavia_capensis
ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.329	ENSPCOG00000027139	CNOT1	100	99.329	Propithecus_coquereli
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