EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000002111 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 58354 bases
Position: chrGL873548.1:15671268-15729621
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000001887	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-77	1	12
ENSOGAP00000001887	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-77	2	12
ENSOGAP00000001887	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-77	3	12
ENSOGAP00000001887	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-77	4	12
ENSOGAP00000001887	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-77	5	12
ENSOGAP00000001887	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-77	6	12
ENSOGAP00000001887	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-77	7	12
ENSOGAP00000001887	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-77	8	12
ENSOGAP00000001887	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-77	9	12
ENSOGAP00000001887	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-77	10	12
ENSOGAP00000001887	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-77	11	12
ENSOGAP00000001887	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-77	12	12
ENSOGAP00000001887	zf-met	PF12874.7	0.00011	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000002113	-	1725	-	ENSOGAP00000001887	575 (aa)	-	H0WK22

Gene Model

Click here to download ENSOGAG00000002111's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOGAG00000002111's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000002111	-	89	50.201	ENSOGAG00000015980	-	99	50.201
ENSOGAG00000002111	-	91	58.140	ENSOGAG00000001912	ZNF233	71	58.140
ENSOGAG00000002111	-	99	38.626	ENSOGAG00000014983	ZNF81	97	47.253
ENSOGAG00000002111	-	96	41.420	ENSOGAG00000009996	PRDM5	83	36.386
ENSOGAG00000002111	-	83	43.925	ENSOGAG00000000419	SNAI3	83	40.323
ENSOGAG00000002111	-	87	30.435	ENSOGAG00000027905	PATZ1	56	30.435
ENSOGAG00000002111	-	88	49.363	ENSOGAG00000025131	ZNF121	99	49.837
ENSOGAG00000002111	-	86	50.000	ENSOGAG00000033980	ZNF768	55	49.701
ENSOGAG00000002111	-	99	53.846	ENSOGAG00000029343	-	99	53.846
ENSOGAG00000002111	-	100	46.824	ENSOGAG00000011129	ZNF317	90	47.487
ENSOGAG00000002111	-	87	50.943	ENSOGAG00000031681	SALL3	63	43.137
ENSOGAG00000002111	-	100	51.054	ENSOGAG00000007268	ZSCAN2	92	47.189
ENSOGAG00000002111	-	87	41.071	ENSOGAG00000001561	ZNF425	99	41.071
ENSOGAG00000002111	-	90	45.714	ENSOGAG00000027487	ZNF236	76	45.714
ENSOGAG00000002111	-	86	38.565	ENSOGAG00000034080	ZNF408	61	38.565
ENSOGAG00000002111	-	86	44.444	ENSOGAG00000030944	ZNF574	94	44.444
ENSOGAG00000002111	-	95	52.083	ENSOGAG00000024538	-	66	52.083
ENSOGAG00000002111	-	99	46.021	ENSOGAG00000001902	ZFP1	98	42.683
ENSOGAG00000002111	-	99	50.302	ENSOGAG00000001907	-	99	50.545
ENSOGAG00000002111	-	86	35.094	ENSOGAG00000034730	ZNF628	59	35.838
ENSOGAG00000002111	-	87	37.662	ENSOGAG00000003269	ZNF319	88	37.662
ENSOGAG00000002111	-	87	37.888	ENSOGAG00000031877	ZNF526	82	36.913
ENSOGAG00000002111	-	99	53.333	ENSOGAG00000025289	-	99	50.575
ENSOGAG00000002111	-	87	52.452	ENSOGAG00000004779	ZNF564	98	52.577
ENSOGAG00000002111	-	81	33.761	ENSOGAG00000014589	GTF3A	81	34.831
ENSOGAG00000002111	-	87	35.057	ENSOGAG00000029101	ZNF784	72	34.659
ENSOGAG00000002111	-	87	34.896	ENSOGAG00000012893	ZBTB41	61	34.896
ENSOGAG00000002111	-	89	39.241	ENSOGAG00000030325	OVOL2	64	39.241
ENSOGAG00000002111	-	88	38.272	ENSOGAG00000029813	ZNF423	98	38.272
ENSOGAG00000002111	-	99	43.452	ENSOGAG00000029163	-	73	43.452
ENSOGAG00000002111	-	99	54.491	ENSOGAG00000029772	-	99	54.491
ENSOGAG00000002111	-	99	56.701	ENSOGAG00000014360	ZNF829	100	62.048
ENSOGAG00000002111	-	81	35.556	ENSOGAG00000013799	SALL4	58	35.556
ENSOGAG00000002111	-	88	43.796	ENSOGAG00000011347	-	56	42.143
ENSOGAG00000002111	-	99	47.708	ENSOGAG00000012069	ZNF225	98	47.708
ENSOGAG00000002111	-	86	46.341	ENSOGAG00000030111	SNAI1	64	46.341
ENSOGAG00000002111	-	84	37.500	ENSOGAG00000016496	OVOL1	54	37.500
ENSOGAG00000002111	-	83	46.729	ENSOGAG00000010500	-	53	46.729
ENSOGAG00000002111	-	99	48.035	ENSOGAG00000003693	ZNF205	75	48.035
ENSOGAG00000002111	-	98	42.857	ENSOGAG00000008879	GFI1B	76	42.857
ENSOGAG00000002111	-	91	49.342	ENSOGAG00000013758	ZNF774	73	49.342
ENSOGAG00000002111	-	86	40.351	ENSOGAG00000029406	ZNF865	86	38.991
ENSOGAG00000002111	-	84	42.683	ENSOGAG00000027913	GFI1	50	42.683

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000002111	-	99	56.263	ENSG00000196757	ZNF700	99	56.263	Homo_sapiens
ENSOGAG00000002111	-	99	58.476	ENSAMEG00000012006	-	99	57.715	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000002111	-	90	47.112	ENSBTAG00000049339	-	94	46.885	Bos_taurus
ENSOGAG00000002111	-	87	59.252	ENSBTAG00000016721	-	100	59.252	Bos_taurus
ENSOGAG00000002111	-	84	52.227	ENSCJAG00000005453	-	99	52.227	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000002111	-	100	57.955	ENSCAFG00000031471	-	96	59.145	Canis_familiaris
ENSOGAG00000002111	-	99	57.483	ENSCAFG00000032123	-	99	57.483	Canis_familiaris
ENSOGAG00000002111	-	86	55.621	ENSCAFG00020005065	-	98	56.996	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000002111	-	90	57.350	ENSCAFG00020005083	-	100	58.462	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000002111	-	100	55.772	ENSCHIG00000008992	-	99	54.886	Capra_hircus
ENSOGAG00000002111	-	100	52.551	ENSCHIG00000020779	-	99	52.551	Capra_hircus
ENSOGAG00000002111	-	100	59.585	ENSCCAG00000027336	ZNF791	99	59.585	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000002111	-	90	54.688	ENSCCAG00000024419	-	97	54.688	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000002111	-	100	60.449	ENSCATG00000041735	ZNF791	99	60.449	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000002111	-	99	56.968	ENSCATG00000025335	ZNF700	97	53.441	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000002111	-	93	60.037	ENSCSAG00000006632	ZNF791	100	60.037	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000002111	-	99	58.772	ENSCSAG00000006686	ZNF700	97	56.522	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000002111	-	99	52.381	ENSCGRG00001001639	Zfp882	100	52.381	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000002111	-	100	49.265	ENSCGRG00000013919	Zfp709	99	49.265	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000002111	-	87	57.303	ENSEASG00005011546	-	100	57.303	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000002111	-	88	57.432	ENSEASG00005004242	-	85	57.432	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000002111	-	89	53.819	ENSEASG00005014394	-	92	53.819	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000002111	-	89	60.684	ENSEASG00005004288	-	99	58.281	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000002111	-	99	54.274	ENSEASG00005004284	-	100	54.023	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000002111	-	93	56.024	ENSEASG00005004229	-	96	56.024	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000002111	-	87	54.035	ENSEASG00005004237	-	83	54.035	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000002111	-	87	56.061	ENSEASG00005004225	-	100	56.061	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000002111	-	94	53.118	ENSEASG00005022060	-	94	55.593	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000002111	-	88	56.533	ENSECAG00000005497	-	99	56.533	Equus_caballus
ENSOGAG00000002111	-	94	53.349	ENSECAG00000032997	-	99	50.089	Equus_caballus
ENSOGAG00000002111	-	90	56.505	ENSECAG00000018881	-	99	56.505	Equus_caballus
ENSOGAG00000002111	-	89	53.020	ENSECAG00000024804	-	99	51.681	Equus_caballus
ENSOGAG00000002111	-	99	54.444	ENSECAG00000000636	-	97	54.208	Equus_caballus
ENSOGAG00000002111	-	89	60.684	ENSECAG00000009346	-	99	58.281	Equus_caballus
ENSOGAG00000002111	-	86	56.329	ENSECAG00000034536	-	90	56.329	Equus_caballus
ENSOGAG00000002111	-	97	52.113	ENSECAG00000036480	-	96	54.098	Equus_caballus
ENSOGAG00000002111	-	99	53.435	ENSECAG00000031831	-	99	53.435	Equus_caballus
ENSOGAG00000002111	-	89	53.707	ENSECAG00000018175	-	100	53.955	Equus_caballus
ENSOGAG00000002111	-	99	46.135	ENSEEUG00000009480	-	100	53.365	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000002111	-	90	53.548	ENSEEUG00000013556	-	99	53.548	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000002111	-	84	53.425	ENSEEUG00000008954	-	94	53.425	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000002111	-	99	59.792	ENSFCAG00000039667	-	100	59.792	Felis_catus
ENSOGAG00000002111	-	99	54.656	ENSGGOG00000038420	ZNF700	97	55.731	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000002111	-	99	54.881	ENSGGOG00000011661	ZNF878	99	59.233	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000002111	-	99	53.398	ENSJJAG00000014350	Zfp961	100	53.398	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000002111	-	100	52.505	ENSJJAG00000012972	Zfp709	100	52.505	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000002111	-	99	55.597	ENSMFAG00000034497	ZNF700	97	54.251	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000002111	-	100	60.449	ENSMFAG00000036181	ZNF791	99	60.449	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000002111	-	99	56.724	ENSMMUG00000012587	ZNF700	97	54.251	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000002111	-	100	60.104	ENSMMUG00000016862	ZNF791	99	60.104	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000002111	-	99	56.707	ENSMNEG00000030711	ZNF700	99	57.055	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000002111	-	93	59.701	ENSMNEG00000045545	ZNF791	99	59.701	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000002111	-	100	60.276	ENSMLEG00000034449	ZNF791	100	60.276	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000002111	-	99	53.474	ENSMAUG00000010647	Zfp882	99	53.474	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000002111	-	99	45.846	ENSMAUG00000007713	Zfp868	97	45.846	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000002111	-	99	56.219	ENSMICG00000042598	-	99	48.387	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000002111	-	99	52.802	ENSMICG00000044274	-	99	52.802	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000002111	-	99	55.689	ENSMICG00000033630	-	99	55.689	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000002111	-	99	58.850	ENSMICG00000027210	-	96	58.850	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000002111	-	99	48.082	ENSMOCG00000020165	Zfp101	98	48.082	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000002111	-	99	47.248	ENSMOCG00000014774	Zfp961	96	48.810	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000002111	-	99	52.083	MGP_CAROLIEiJ_G0031203	Zfp882	99	52.083	Mus_caroli
ENSOGAG00000002111	-	99	57.895	MGP_CAROLIEiJ_G0016437	Zfp867	96	57.895	Mus_caroli
ENSOGAG00000002111	-	100	52.083	ENSMUSG00000089857	Zfp882	99	52.083	Mus_musculus
ENSOGAG00000002111	-	99	55.110	ENSMUSG00000056019	Zfp709	99	55.809	Mus_musculus
ENSOGAG00000002111	-	99	56.140	ENSMUSG00000054519	Zfp867	96	56.140	Mus_musculus
ENSOGAG00000002111	-	99	53.351	MGP_PahariEiJ_G0017567	Zfp867	95	51.710	Mus_pahari
ENSOGAG00000002111	-	99	52.381	MGP_PahariEiJ_G0021668	Zfp882	99	52.381	Mus_pahari
ENSOGAG00000002111	-	99	55.263	MGP_SPRETEiJ_G0017272	Zfp867	96	55.263	Mus_spretus
ENSOGAG00000002111	-	100	57.886	ENSMPUG00000004877	-	99	56.423	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000002111	-	99	57.143	ENSMPUG00000004901	-	99	57.143	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000002111	-	90	55.263	ENSMLUG00000003693	-	100	52.860	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000002111	-	99	56.057	ENSNLEG00000012661	ZNF700	97	56.057	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000002111	-	93	51.447	ENSOCUG00000029755	-	97	51.447	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000002111	-	99	47.386	ENSOARG00000012765	-	99	47.386	Ovis_aries
ENSOGAG00000002111	-	100	55.285	ENSOARG00000012703	-	98	55.049	Ovis_aries
ENSOGAG00000002111	-	99	56.000	ENSPPRG00000011201	-	100	54.059	Panthera_pardus
ENSOGAG00000002111	-	86	54.734	ENSPTIG00000009517	-	98	55.647	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000002111	-	90	52.520	ENSPTIG00000009499	-	100	52.520	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000002111	-	99	57.949	ENSPTIG00000012277	-	99	58.537	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000002111	-	99	56.468	ENSPTRG00000010515	ZNF700	97	56.468	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000002111	-	99	55.597	ENSPANG00000004914	ZNF700	97	53.846	Papio_anubis
ENSOGAG00000002111	-	100	56.017	ENSPEMG00000022834	Zfp709	99	56.017	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000002111	-	86	43.284	ENSPMAG00000006708	-	98	44.444	Petromyzon_marinus
ENSOGAG00000002111	-	99	55.852	ENSPPYG00000009590	ZNF700	97	55.852	Pongo_abelii
ENSOGAG00000002111	-	99	59.005	ENSPPYG00000029413	-	99	55.993	Pongo_abelii
ENSOGAG00000002111	-	100	58.377	ENSPPYG00000009596	ZNF791	100	58.377	Pongo_abelii
ENSOGAG00000002111	-	88	51.335	ENSPCAG00000007476	-	97	50.100	Procavia_capensis
ENSOGAG00000002111	-	86	56.478	ENSPCOG00000014758	-	96	53.776	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000002111	-	99	50.779	ENSPCOG00000025734	-	100	50.779	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000002111	-	99	60.900	ENSPCOG00000015720	ZNF791	99	60.900	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000002111	-	99	56.901	ENSPCOG00000024437	-	99	56.209	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000002111	-	92	52.303	ENSPVAG00000001626	-	99	47.059	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000002111	-	95	62.903	ENSPVAG00000002257	-	86	62.903	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000002111	-	99	57.117	ENSPVAG00000015563	-	99	56.835	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000002111	-	99	51.622	ENSRNOG00000022431	Zfp867	97	50.602	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000002111	-	99	51.488	ENSRNOG00000016417	Zfp136	100	51.488	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000002111	-	89	54.670	ENSRBIG00000041827	ZNF878	99	54.670	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000002111	-	99	57.471	ENSRBIG00000043636	ZNF700	99	57.471	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000002111	-	99	55.970	ENSRROG00000030540	ZNF700	99	53.846	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000002111	-	100	59.931	ENSRROG00000031644	ZNF791	99	59.931	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000002111	-	100	58.031	ENSSBOG00000024486	ZNF791	99	58.031	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000002111	-	99	58.879	ENSSSCG00000029347	-	99	58.048	Sus_scrofa
ENSOGAG00000002111	-	99	52.619	ENSSSCG00000036608	-	99	52.619	Sus_scrofa
ENSOGAG00000002111	-	99	53.307	ENSSSCG00000022634	-	94	54.795	Sus_scrofa
ENSOGAG00000002111	-	100	77.812	ENSSSCG00000039774	-	99	77.812	Sus_scrofa
ENSOGAG00000002111	-	100	51.670	ENSTTRG00000000768	-	99	51.670	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000002111	-	91	57.494	ENSTTRG00000003482	-	100	56.770	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000002111	-	90	57.143	ENSUAMG00000017817	-	100	57.143	Ursus_americanus
ENSOGAG00000002111	-	93	56.173	ENSUAMG00000019652	-	88	52.030	Ursus_americanus
ENSOGAG00000002111	-	90	57.713	ENSUMAG00000007577	-	100	59.038	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000002111	-	90	57.143	ENSUMAG00000019496	-	100	57.143	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000002111	-	99	58.317	ENSVPAG00000009652	-	99	58.235	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000002111	-	86	55.621	ENSVVUG00000023811	-	98	56.996	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000002111	-	90	57.169	ENSVVUG00000023819	-	100	58.269	Vulpes_vulpes