EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000002202 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8595 bases
Position: chrGL873767.1:1167780-1176374
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000001971	Tap-RNA_bind	PF09162.10	7.8e-36	1	1
ENSOGAP00000001971	TAP_C	PF03943.13	6.8e-18	1	1
ENSOGAP00000001971	NTF2	PF02136.20	6.9e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000002206	-	1695	-	ENSOGAP00000001971	565 (aa)	-	H0WK93

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000002202	-	82	74.034	ENSOGAG00000029761	-	96	74.034
ENSOGAG00000002202	-	98	50.265	ENSOGAG00000008901	NXF1	91	50.265
ENSOGAG00000002202	-	99	47.203	ENSOGAG00000000476	-	93	47.203
ENSOGAG00000002202	-	69	70.437	ENSOGAG00000025402	-	89	70.437
ENSOGAG00000002202	-	76	56.140	ENSOGAG00000027312	-	84	55.682
ENSOGAG00000002202	-	94	49.168	ENSOGAG00000029188	-	96	49.168

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000002202	-	99	50.436	ENSG00000269405	NXF2	91	50.436	Homo_sapiens
ENSOGAG00000002202	-	99	51.053	ENSG00000162231	NXF1	99	54.386	Homo_sapiens
ENSOGAG00000002202	-	65	44.444	ENSG00000126952	NXF5	90	49.342	Homo_sapiens
ENSOGAG00000002202	-	99	50.436	ENSG00000269437	NXF2B	91	50.436	Homo_sapiens
ENSOGAG00000002202	-	91	59.923	ENSG00000147206	NXF3	94	61.580	Homo_sapiens
ENSOGAG00000002202	-	86	42.400	ENSAPOG00000016723	zgc:153681	90	39.931	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000002202	-	78	49.217	ENSAMEG00000011550	-	90	49.217	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000002202	-	99	49.828	ENSAMEG00000006237	NXF1	92	49.828	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000002202	-	86	42.886	ENSACIG00000022505	zgc:153681	91	40.345	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000002202	-	86	42.200	ENSAOCG00000016998	zgc:153681	91	39.826	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000002202	-	86	42.400	ENSAPEG00000009821	zgc:153681	89	40.104	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000002202	-	86	42.886	ENSATEG00000014432	zgc:153681	91	39.551	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000002202	-	86	46.076	ENSACAG00000015804	-	82	46.076	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000002202	-	99	50.526	ENSANAG00000024600	NXF1	92	50.526	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000002202	-	91	58.108	ENSANAG00000027929	NXF3	92	58.108	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000002202	-	99	47.993	ENSANAG00000027370	-	93	47.993	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000002202	-	65	41.711	ENSANAG00000027180	-	87	41.711	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000002202	-	85	42.308	ENSACLG00000017015	zgc:153681	75	42.308	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000002202	-	86	42.972	ENSAMXG00000042571	nxf1	90	39.328	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000002202	-	88	42.885	ENSAMXG00000005752	zgc:153681	91	39.831	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000002202	-	85	51.919	ENSBTAG00000032787	-	88	51.919	Bos_taurus
ENSOGAG00000002202	-	67	46.475	ENSBTAG00000022502	-	85	46.475	Bos_taurus
ENSOGAG00000002202	-	97	51.071	ENSBTAG00000009488	NXF1	90	51.071	Bos_taurus
ENSOGAG00000002202	-	67	41.192	ENSCJAG00000009652	-	98	41.192	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000002202	-	50	40.614	ENSCJAG00000019686	-	82	40.614	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000002202	-	98	51.068	ENSCJAG00000018635	NXF1	91	51.068	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000002202	-	91	59.459	ENSCJAG00000003435	NXF3	92	59.459	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000002202	-	99	51.138	ENSCAFG00000031569	-	99	51.005	Canis_familiaris
ENSOGAG00000002202	-	99	51.138	ENSCAFG00000028462	-	93	51.138	Canis_familiaris
ENSOGAG00000002202	-	100	58.988	ENSCAFG00000014031	NXF3	99	58.988	Canis_familiaris
ENSOGAG00000002202	-	95	50.457	ENSCAFG00000005653	-	89	50.457	Canis_familiaris
ENSOGAG00000002202	-	95	60.075	ENSCAFG00000017721	-	89	60.075	Canis_familiaris
ENSOGAG00000002202	-	99	49.913	ENSCAFG00000015594	NXF1	92	49.913	Canis_familiaris
ENSOGAG00000002202	-	65	44.819	ENSCAFG00020007291	-	81	44.819	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000002202	-	85	48.441	ENSCAFG00020016392	-	84	48.649	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000002202	-	97	44.071	ENSCAFG00020007236	-	94	44.071	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000002202	-	94	50.717	ENSCAFG00020007169	-	97	50.717	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000002202	-	94	50.717	ENSCAFG00020007156	-	97	50.717	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000002202	-	68	39.898	ENSCAFG00020007216	-	84	39.898	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000002202	-	72	41.050	ENSCAFG00020007326	-	84	41.050	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000002202	-	99	51.053	ENSCAFG00020013149	NXF1	92	51.053	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000002202	-	97	50.714	ENSCHIG00000010065	NXF1	90	50.714	Capra_hircus
ENSOGAG00000002202	-	95	49.729	ENSCHIG00000019200	-	98	49.729	Capra_hircus
ENSOGAG00000002202	-	78	51.435	ENSCHIG00000018407	-	91	51.435	Capra_hircus
ENSOGAG00000002202	-	85	53.484	ENSCHIG00000020751	-	92	53.484	Capra_hircus
ENSOGAG00000002202	-	85	48.671	ENSCHIG00000010744	-	88	48.671	Capra_hircus
ENSOGAG00000002202	-	70	52.239	ENSTSYG00000037237	-	99	52.239	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000002202	-	92	60.653	ENSTSYG00000034446	NXF3	92	60.653	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000002202	-	99	51.579	ENSTSYG00000027468	NXF1	92	51.579	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000002202	-	93	47.858	ENSCAPG00000012814	-	95	47.858	Cavia_aperea
ENSOGAG00000002202	-	93	43.942	ENSCAPG00000011755	NXF1	90	44.872	Cavia_aperea
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ENSOGAG00000002202	-	93	47.955	ENSCPOG00000003136	-	89	47.955	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000002202	-	91	58.880	ENSCCAG00000024028	NXF3	92	58.880	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000002202	-	99	47.183	ENSCCAG00000027842	-	98	45.844	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000002202	-	88	58.052	ENSCSAG00000009527	NXF3	90	58.052	Chlorocebus_sabaeus
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ENSOGAG00000002202	-	64	43.280	ENSCANG00000037396	NXF5	86	43.280	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000002202	-	69	50.498	ENSCANG00000029631	-	100	50.498	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000002202	-	99	51.053	ENSCANG00000043190	NXF1	92	51.053	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSOGAG00000002202	-	97	42.783	ENSCGRG00001012829	Nxf7	90	42.783	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000002202	-	94	44.544	ENSCGRG00000007264	Nxf2	89	44.544	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000002202	-	98	50.534	ENSCGRG00000013649	Nxf1	91	50.534	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000002202	-	97	44.207	ENSCGRG00000008112	Nxf7	89	44.207	Cricetulus_griseus_crigri
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