EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000003021 (Gene tree)
Gene ID: 100945579
Gene Symbol: URB2
Alias: -
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30763 bases
Position: chrGL873564.1:7923156-7953918
Accession: 100945579
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000002703	Urb2	PF10441.9	1.2e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000003022	URB2-201	4578	XM_003791017	ENSOGAP00000002703	1525 (aa)	XP_003791065	H0WLY6

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.446	ENSG00000135763	URB2	100	89.286	Homo_sapiens
ENSOGAG00000003021	URB2	89	35.139	ENSAPOG00000000608	urb2	95	34.859	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	78.098	ENSAMEG00000009206	URB2	100	78.098	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000003021	URB2	100	35.412	ENSAOCG00000019961	urb2	100	34.762	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000003021	URB2	100	34.859	ENSAPEG00000005263	urb2	100	34.586	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000003021	URB2	100	34.088	ENSATEG00000020930	urb2	100	33.934	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000003021	URB2	97	49.434	ENSAPLG00000002998	URB2	99	49.599	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000003021	URB2	99	47.142	ENSACAG00000001285	URB2	99	47.142	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.906	ENSANAG00000033963	URB2	99	80.709	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000003021	URB2	90	34.151	ENSACLG00000009254	urb2	95	33.902	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000003021	URB2	99	35.733	ENSAMXG00000003474	urb2	99	35.733	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	69.568	ENSBTAG00000010180	URB2	100	69.568	Bos_taurus
ENSOGAG00000003021	URB2	95	90.000	ENSCJAG00000010968	URB2	99	80.249	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	77.034	ENSCAFG00000012118	URB2	99	77.034	Canis_familiaris
ENSOGAG00000003021	URB2	93	75.913	ENSCAFG00020027217	URB2	99	75.913	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000003021	URB2	100	69.377	ENSCHIG00000014513	URB2	100	69.377	Capra_hircus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	79.279	ENSTSYG00000006924	URB2	100	79.279	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000003021	URB2	64	81.481	ENSCPOG00000020777	-	99	78.161	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.315	ENSCCAG00000023932	URB2	99	80.118	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.577	ENSCATG00000043366	URB2	99	80.577	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000003021	URB2	99	74.016	ENSCLAG00000006268	URB2	99	74.016	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.643	ENSCSAG00000010599	URB2	99	80.643	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000003021	URB2	69	79.048	ENSCHOG00000010163	URB2	71	79.048	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000003021	URB2	99	53.491	ENSCPBG00000006191	URB2	99	53.599	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.118	ENSCANG00000023711	URB2	99	80.118	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	71.625	ENSCGRG00001009591	Urb2	99	71.625	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000003021	URB2	99	71.625	ENSCGRG00000011259	Urb2	99	71.625	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000003021	URB2	100	33.113	ENSCSEG00000000299	urb2	100	32.853	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000003021	URB2	100	33.899	ENSCVAG00000011011	urb2	100	33.738	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	35.935	ENSDARG00000003217	urb2	98	59.223	Danio_rerio
ENSOGAG00000003021	URB2	97	59.476	ENSDNOG00000043064	URB2	99	59.838	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	72.721	ENSDORG00000014975	Urb2	99	72.721	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000003021	URB2	95	71.734	ENSETEG00000002869	URB2	95	71.734	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000003021	URB2	100	77.049	ENSEASG00005012060	URB2	100	77.049	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000003021	URB2	93	86.620	ENSECAG00000012338	URB2	100	86.620	Equus_caballus
ENSOGAG00000003021	URB2	92	81.429	ENSEEUG00000002669	URB2	92	81.429	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	39.704	ENSELUG00000014647	urb2	100	39.640	Esox_lucius
ENSOGAG00000003021	URB2	99	76.671	ENSFCAG00000007662	URB2	99	76.671	Felis_catus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	47.969	ENSFALG00000003385	URB2	99	47.969	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000003021	URB2	99	73.885	ENSFDAG00000021079	URB2	99	73.885	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000003021	URB2	100	34.305	ENSFHEG00000010357	urb2	100	34.468	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000003021	URB2	91	39.227	ENSGMOG00000012459	urb2	100	35.728	Gadus_morhua
ENSOGAG00000003021	URB2	99	49.775	ENSGALG00000011101	URB2	99	49.711	Gallus_gallus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	36.626	ENSGACG00000016179	urb2	100	36.754	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	53.436	ENSGAGG00000021879	URB2	99	53.436	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.577	ENSGGOG00000025643	URB2	99	80.577	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000003021	URB2	100	51.829	ENSHBUG00000018469	urb2	97	51.829	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000003021	URB2	97	73.500	ENSHGLG00000016561	URB2	99	73.500	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000003021	URB2	99	71.588	ENSHGLG00100001838	URB2	99	71.588	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000003021	URB2	100	35.321	ENSIPUG00000020315	urb2	100	35.321	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	73.425	ENSSTOG00000025323	URB2	99	73.425	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	72.346	ENSJJAG00000011998	Urb2	99	72.215	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	33.196	ENSKMAG00000020129	urb2	100	32.841	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	45.109	ENSLACG00000002038	URB2	99	45.209	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000003021	URB2	99	40.695	ENSLOCG00000015462	urb2	99	40.296	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	74.081	ENSLAFG00000012484	URB2	100	74.081	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.052	ENSMFAG00000039905	URB2	99	80.052	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.184	ENSMMUG00000009509	URB2	99	80.184	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.249	ENSMNEG00000038762	URB2	99	80.249	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.512	ENSMLEG00000043252	URB2	99	80.512	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	33.587	ENSMAMG00000020365	urb2	100	33.470	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	51.829	ENSMZEG00005011027	urb2	97	51.829	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000003021	URB2	94	47.216	ENSMGAG00000012073	URB2	99	47.216	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000003021	URB2	95	87.143	ENSMAUG00000017980	Urb2	99	73.446	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	82.426	ENSMICG00000033302	URB2	100	82.426	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	70.334	ENSMOCG00000020369	Urb2	99	70.334	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000003021	URB2	100	34.732	ENSMALG00000006529	urb2	100	34.732	Monopterus_albus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	69.961	ENSMUSG00000031976	Urb2	99	69.961	Mus_musculus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	76.494	ENSMPUG00000012438	URB2	99	76.362	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000003021	URB2	99	71.644	ENSNGAG00000016524	Urb2	99	71.644	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.709	ENSNLEG00000014450	URB2	99	80.709	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000003021	URB2	91	60.068	ENSMEUG00000016434	URB2	94	59.812	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000003021	URB2	92	73.366	ENSOPRG00000009906	URB2	92	72.996	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000003021	URB2	99	72.835	ENSODEG00000005593	URB2	99	72.835	Octodon_degus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	36.946	ENSONIG00000017078	urb2	100	36.795	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	50.391	ENSOANG00000013732	URB2	99	50.911	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	77.115	ENSOCUG00000010700	URB2	100	77.115	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	34.785	ENSORLG00000010915	urb2	100	34.927	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000003021	URB2	100	35.127	ENSORLG00020003361	urb2	100	35.209	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000003021	URB2	100	34.946	ENSORLG00015001534	urb2	100	34.967	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000003021	URB2	100	34.407	ENSOMEG00000010076	urb2	100	34.367	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000003021	URB2	100	69.024	ENSOARG00000003102	URB2	100	69.024	Ovis_aries
ENSOGAG00000003021	URB2	99	81.102	ENSPPAG00000040629	URB2	99	81.102	Pan_paniscus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	76.378	ENSPPRG00000012767	URB2	99	76.378	Panthera_pardus
ENSOGAG00000003021	URB2	95	89.231	ENSPTIG00000012577	URB2	99	89.231	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.906	ENSPTRG00000002092	URB2	99	80.906	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000003021	URB2	99	78.150	ENSPANG00000002245	URB2	99	78.150	Papio_anubis
ENSOGAG00000003021	URB2	99	39.465	ENSPKIG00000005787	urb2	99	39.274	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000003021	URB2	99	52.726	ENSPSIG00000002690	URB2	99	52.726	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000003021	URB2	96	71.018	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	71.018	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000003021	URB2	99	61.715	ENSPCIG00000030071	URB2	99	61.518	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	35.116	ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.089	Poecilia_formosa
ENSOGAG00000003021	URB2	100	33.862	ENSPLAG00000014654	urb2	100	34.010	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000003021	URB2	100	34.169	ENSPMEG00000012356	urb2	100	33.990	Poecilia_mexicana
ENSOGAG00000003021	URB2	100	33.743	ENSPREG00000010268	urb2	100	33.989	Poecilia_reticulata
ENSOGAG00000003021	URB2	100	80.525	ENSPPYG00000000123	URB2	100	80.525	Pongo_abelii
ENSOGAG00000003021	URB2	100	83.803	ENSPCOG00000023537	URB2	100	83.803	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000003021	URB2	99	63.434	ENSPVAG00000002108	URB2	99	63.368	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000003021	URB2	90	34.151	ENSPNYG00000016840	urb2	95	33.902	Pundamilia_nyererei
ENSOGAG00000003021	URB2	99	35.967	ENSPNAG00000013684	urb2	99	35.838	Pygocentrus_nattereri
ENSOGAG00000003021	URB2	99	70.569	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	70.569	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.184	ENSRBIG00000037937	URB2	99	80.184	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.052	ENSRROG00000039854	URB2	99	80.052	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000003021	URB2	99	80.052	ENSSBOG00000023055	URB2	99	79.856	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000003021	URB2	99	62.238	ENSSHAG00000014735	URB2	99	62.107	Sarcophilus_harrisii
ENSOGAG00000003021	URB2	98	39.567	ENSSFOG00015015432	urb2	99	39.304	Scleropages_formosus
ENSOGAG00000003021	URB2	89	33.908	ENSSMAG00000004984	urb2	95	33.732	Scophthalmus_maximus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	34.182	ENSSDUG00000000902	urb2	100	34.224	Seriola_dumerili
ENSOGAG00000003021	URB2	99	52.090	ENSSPUG00000018549	URB2	99	52.154	Sphenodon_punctatus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	36.272	ENSSPAG00000013632	urb2	100	36.174	Stegastes_partitus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	71.410	ENSSSCG00000010186	URB2	100	71.410	Sus_scrofa
ENSOGAG00000003021	URB2	99	48.013	ENSTGUG00000009990	URB2	99	48.013	Taeniopygia_guttata
ENSOGAG00000003021	URB2	100	33.373	ENSTRUG00000008173	urb2	100	33.373	Takifugu_rubripes
ENSOGAG00000003021	URB2	100	35.581	ENSTNIG00000017689	urb2	100	35.641	Tetraodon_nigroviridis
ENSOGAG00000003021	URB2	100	64.440	ENSTTRG00000014864	URB2	100	64.375	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	77.967	ENSUAMG00000015022	URB2	100	77.967	Ursus_americanus
ENSOGAG00000003021	URB2	100	78.098	ENSUMAG00000004728	URB2	100	78.098	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000003021	URB2	63	86.525	ENSVPAG00000001750	-	63	86.525	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000003021	URB2	99	76.903	ENSVVUG00000006747	URB2	99	76.903	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000003021	URB2	99	40.777	ENSXETG00000023331	urb2	99	40.712	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000003021	URB2	100	33.993	ENSXMAG00000015059	urb2	100	33.684	Xiphophorus_maculatus