EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000003118 (Gene tree)
Gene ID: 100961190
Gene Symbol: APOBEC4
Alias: -
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1092 bases
Position: chrGL873535.1:10216592-10217683
Accession: 100961190
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000002791	APOBEC_N	PF08210.11	5.9e-30	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000003120	APOBEC4-201	1092	XM_012802577	ENSOGAP00000002791	363 (aa)	XP_012658031	H0WM53

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	78.273	ENSG00000173627	APOBEC4	98	78.273	Homo_sapiens
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	81.894	ENSAMEG00000002503	APOBEC4	94	81.894	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	95	51.966	ENSACAG00000015192	APOBEC4	99	51.404	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	96	79.096	ENSBTAG00000047395	APOBEC4	98	79.387	Bos_taurus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	79.387	ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	79.387	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	79.387	ENSCAFG00000013349	APOBEC4	98	79.387	Canis_familiaris
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	79.387	ENSCAFG00020015526	APOBEC4	98	79.387	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	96	76.836	ENSCHIG00000011987	APOBEC4	93	76.045	Capra_hircus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	76.602	ENSCSAG00000000243	APOBEC4	98	76.602	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	77.994	ENSCHOG00000012387	APOBEC4	98	77.994	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	99	54.396	ENSCPBG00000015714	APOBEC4	95	53.221	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	94	63.401	ENSCGRG00001004553	Apobec4	97	63.584	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	99	79.837	ENSDNOG00000044664	APOBEC4	98	79.666	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	67.688	ENSDORG00000007335	Apobec4	99	67.688	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	81.742	ENSEASG00005006513	APOBEC4	97	81.742	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	81.742	ENSECAG00000019734	APOBEC4	97	81.742	Equus_caballus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	82.173	ENSFCAG00000010909	APOBEC4	98	82.173	Felis_catus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	83	80.328	ENSFDAG00000018185	APOBEC4	96	80.328	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	90	50.448	ENSGALG00000053078	APOBEC4	95	49.699	Gallus_gallus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	78.830	ENSGGOG00000042217	APOBEC4	98	78.830	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	99	50.273	ENSLACG00000014504	APOBEC4	97	50.559	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	64	39.407	ENSLOCG00000010326	-	88	39.837	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	77.994	ENSMMUG00000031303	APOBEC4	98	77.994	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	87	50.769	ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	50.309	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	99	63.587	MGP_CAROLIEiJ_G0014701	Apobec4	94	64.444	Mus_caroli
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	99	62.500	ENSMUSG00000055547	Apobec4	94	63.333	Mus_musculus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	99	61.957	MGP_PahariEiJ_G0027937	Apobec4	94	62.778	Mus_pahari
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	99	61.685	MGP_SPRETEiJ_G0015508	Apobec4	94	62.500	Mus_spretus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	96	78.249	ENSMPUG00000011756	APOBEC4	95	78.552	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	96	77.684	ENSMLUG00000002458	APOBEC4	98	77.159	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	97	60.446	ENSNGAG00000017599	Apobec4	97	60.278	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	79.944	ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	79.944	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	88	73.620	ENSODEG00000009778	APOBEC4	93	73.006	Octodon_degus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	95	57.593	ENSOANG00000001000	APOBEC4	98	56.983	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	96	77.119	ENSOARG00000005287	APOBEC4	98	76.880	Ovis_aries
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	76.323	ENSPPAG00000038272	APOBEC4	98	76.323	Pan_paniscus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	82.451	ENSPPRG00000014706	APOBEC4	98	82.451	Panthera_pardus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	82.451	ENSPTIG00000005518	APOBEC4	98	82.451	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	78.273	ENSPTRG00000047181	APOBEC4	98	78.273	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	96	67.887	ENSPEMG00000019164	Apobec4	98	68.056	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	59	36.555	ENSPMAG00000006156	APOBEC4	70	35.659	Petromyzon_marinus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	97	65.642	ENSPCIG00000003817	APOBEC4	95	64.903	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	79.666	ENSPPYG00000000424	APOBEC4	98	79.666	Pongo_abelii
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	97	61.003	ENSPCAG00000015174	APOBEC4	98	60.833	Procavia_capensis
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	81.894	ENSPVAG00000001100	APOBEC4	98	81.894	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	99	64.499	ENSRNOG00000028089	Apobec4	91	65.097	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	96	65.254	ENSSHAG00000013804	APOBEC4	98	64.722	Sarcophilus_harrisii
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	99	52.186	ENSSPUG00000010884	APOBEC4	95	51.923	Sphenodon_punctatus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	99	78.904	ENSSSCG00000015561	APOBEC4	98	79.109	Sus_scrofa
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	76.880	ENSTBEG00000006476	APOBEC4	98	76.880	Tupaia_belangeri
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	97	80.726	ENSTTRG00000014784	APOBEC4	98	80.501	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	96	81.818	ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	81.894	Ursus_americanus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	96	81.534	ENSUMAG00000016285	APOBEC4	98	81.616	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	79.387	ENSVVUG00000009054	APOBEC4	98	79.387	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000003118	APOBEC4	99	46.774	ENSXETG00000017441	apobec4	94	44.772	Xenopus_tropicalis